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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于基因检测,具体涉及用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1-01:01分型检测扩增引物组、试剂、试剂盒。
技术介绍
1、奈韦拉平是一类治疗hiv-1感染的非核苷逆转录酶抑制剂,与hiv-1的逆转录酶直接连接,使此酶的催化端破裂来阻断rna依赖/dna依赖的dna聚合酶活性。使用此药物后,最严重的药物不良反应是stevens-johnson综合征,毒性表皮坏死溶离,重症肝炎/肝衰竭和过敏反应,其特征为皮疹,伴全身症状,如发热、关节痛、肌痛和淋巴结病,以及内脏损害,如肝炎、嗜酸细胞增多、粒细胞缺乏症和肾功能损害。临床研究表明:患者使用奈韦拉平片后,约48%的患者会出现全身反应或皮肤反应,4.9%的患者会引发肝毒,0.3%的患者则会出现sjs/ten等严重皮肤反应。不同个体对药物的耐受力不同,临床医师不能预先判定疾病的复发频度以及侵袭性,以及对奈韦拉平药物不良反应的顾虑,很难决定针对某个患者是否采用奈韦拉平药物进行辅助治疗,而研究表明,奈韦拉平所致的药物不良反应与人hla基因的hla-drb1*01:01亚型密切相关,通过对人hla-drb1*01:01亚型携带者进行检测,将有效避免在临床上出现的肝脏毒性等不良反应,提高患者疗效。
2、人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,hla)是目前所知人体最复杂的多态系统,hla复合体位于人类第6号染色体短臂6p21.31上,占人类整个基因组的1/3000。自jean dausset于1958年发现第1个hla抗原以来,hla已成为免疫遗传学、免
3、目前,常用的hla基因分型方法有直接测序法、pcr-rflp(限制性片段长度多态性分析)、pcr-sso(序列特异性寡核苷酸探针)、pcr-ssp(序列特异性引物pcr技术)和pcr-sscp(单链构象多态性分析)等。其中直接测序法在所有snp的检测方法中,是最为准确的方法,但是,存在操作繁琐、耗时长、成本高昂的缺点;pcr-rflp是通过电泳观察结果,尚不能检出所有的hla等位基因;pcr-sso是以同位素或非放射性标记的探针与pcr扩增的目标片断产物杂交,根据阳性斑点判断个体基因型,但是需要不同探针的杂交条件严格统一,易出现误差,不能检测新等位基因,分辨率低;pcr-ssp借助pcr技术获得hla型特异的扩增产物,通过电泳直接分析带型,但是不易自动化,且无法检测新的等位基因;pcr-sscp是一种简单、高效地检测dna或rna序列中点突变的技术,需要进一步测序去确定突变的位置和类型,容易出现重叠峰。这些方法均是针对全部或特定hla基因所有可能的型或亚型的全面性检测方法,对于奈韦拉平的精准快速用药指导没有指导意义,难以满足临床的需求,因此亟需一种精准快速的hla-drb1*01:01基因型检测方法。
技术实现思路
1、有鉴于此,一方面,一些实施例公开了用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测扩增引物组,包括:
2、hla-drb1*01:01-f,其序列为:
3、5’-cytgtggcagcttaagtttgaa-3’;其中,y为简并碱基,代表c/t;
4、hla-drb1*01:01-r,其序列为:
5、5’-cactgtgaagctctcacaaac-3’;
6、hla-drb1*01:01-p,其序列为:
7、5’-fam-catctataaccaagaggagtccgtgcg-3’-bhq1。
8、进一步,一些实施例公开的用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测扩增引物组,还包括内标基因特异性扩增引物组,内标基因特异性扩增引物组包括:
9、cftr-f,其序列为:
10、5’-gtaggaagtcaccaaagcagtaca-3’;
11、cftr-r,其序列为:
12、5’-agctattctcatctgcattcca-3’;
13、cftr-p,其序列为:
14、5’-cy5-ctatgacccggataacaaggaggaacgc-3’-bhq2。
15、再一方面,一些实施例公开了用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测试剂,包括用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测扩增引物组。
16、一些实施例公开的用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测试剂,分型检测试剂用于对人体dna样本进行检测。
17、一些实施例公开的用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测试剂,其进行检测的人体dna样本为血清样本。
18、一些实施例公开的用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测试剂,利用分型检测试剂对人体dna样本的检测过程包括:
19、处理人体dna样本;
20、利用分型检测试剂、人体dna样本配置扩增反应体系;
21、扩增反应体系进行扩增反应;
22、根据扩增反应结果判定人体dna样本是否携带有hla-drb1*01:01等位基因。
23、另一方面,一些实施例公开了用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测试剂盒,包括用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测试剂。
24、一些实施例公开的用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测试剂盒,分型检测试剂盒用于对人体dna样本进行检测。
25、一些实施例公开的用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测试剂盒,其进行检测的人体dna样本为血清样本。
26、一些实施例公开的用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测试剂盒,利用分型检测试剂盒对人体dna样本的检测过程包括:
27、处理人体dna样本;
28、利用分型检测试剂、人体dna样本配置扩增反应体系;
29、扩增反应体系进行扩增反应;
30、根据扩增反应结果判定人体dna样本是否携带有hla-drb1*01:01等位基因。
31、本专利技术实施例公开的用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测扩增引物组、试剂和试剂盒,包括针对hla-drb1*01:01进行pcr扩增的上下游特异性引物组和一种特异性探针,采用荧光定量arms-pcr的方法,能够准确、快速、简便地检测待测样本是否具有hla-drb1*01:01的基因,具有高通量、特异性高的优点,可用于指导奈韦拉平的合理化用药。
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1.用于指导奈韦拉平用药的HLA-DRB1*01:01分型检测扩增引物组,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的用于指导奈韦拉平用药的HLA-DRB1*01:01分型检测扩增引物组,其特征在于,还包括内标基因特异性扩增引物组,所述内标基因特异性扩增引物组包括:
3.用于指导奈韦拉平用药的HLA-DRB1*01:01分型检测试剂,其特征在于,包括权利要求1或2所述的扩增引物组。
4.根据权利要求3所述的用于指导奈韦拉平用药的HLA-DRB1*01:01分型检测试剂,其特征在于,所述分型检测试剂用于对人体DNA样本进行检测。
5.根据权利要求4所述的用于指导奈韦拉平用药的HLA-DRB1*01:01分型检测试剂,其特征在于,所述人体DNA样本为血清样本。
6.根据权利要求4所述的用于指导奈韦拉平用药的HLA-DRB1*01:01分型检测试剂,其特征在于,利用分型检测试剂对人体DNA样本的检测过程包括:
7.用于指导奈韦拉平用药的HLA-DRB1*01:01分型检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求3所述的分型
8.根据权利要求7所述的用于指导奈韦拉平用药的HLA-DRB1*01:01分型检测试剂盒,其特征在于,所述分型检测试剂盒用于对人体DNA样本进行检测。
9.根据权利要求7所述的用于指导奈韦拉平用药的HLA-DRB1*01:01分型检测试剂盒,其特征在于,所述人体DNA样本为血清样本。
10.根据权利要求7所述的用于指导奈韦拉平用药的HLA-DRB1*01:01分型检测试剂盒,其特征在于,利用分型检测试剂盒对人体DNA样本的检测过程包括:
...【技术特征摘要】
1.用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测扩增引物组,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测扩增引物组,其特征在于,还包括内标基因特异性扩增引物组,所述内标基因特异性扩增引物组包括:
3.用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测试剂,其特征在于,包括权利要求1或2所述的扩增引物组。
4.根据权利要求3所述的用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测试剂,其特征在于,所述分型检测试剂用于对人体dna样本进行检测。
5.根据权利要求4所述的用于指导奈韦拉平用药的hla-drb1*01:01分型检测试剂,其特征在于,所述人体dna样本为血清样本。
6.根据权利要求...
【专利技术属性】
技术研发人员:郭建成,占闽宁,史健翔,尚文俊,冯帅升,朱丹丹,柳丹华,王丙顺,张静,李英英,
申请(专利权)人:郑州大学,
类型:发明
国别省市:
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