一种乳腺癌肿瘤特异性甲基化标签的鉴定方法、甲基化标签和探针位点技术

技术编号:40711176 阅读:16 留言:0更新日期:2024-03-22 11:12
本申请涉及乳腺癌筛查诊断的技术领域,具体公开了一种乳腺癌肿瘤特异性甲基化标签的鉴定方法、甲基化标签和探针位点。鉴定方法包括以下步骤:步骤1、甲基化探针位点和乳腺癌样本初筛;步骤2、对符合要求的甲基化探针位点进行非参数置换检验,得到差异性的甲基化探针位点(DMPs);步骤3、获得高甲基化探针位点和低甲基化探针位点;步骤4、得到显著性差异的高甲基化探针位点和显著性差异的低甲基化探针位点;步骤5、得到高甲基化标签和低甲基化标签;进一步筛选得到和免疫应答相关的23个甲基化探针位点。本申请探针位点可用于免疫应答效力预测,其具有准确率高的优点。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及乳腺癌筛查诊断的,更具体地说,它涉及一种乳腺癌肿瘤特异性甲基化标签的鉴定方法、甲基化标签和探针位点


技术介绍

1、乳腺癌是全球女性最常见的恶性肿瘤之一。相关研究表明,乳腺癌在诊断和原发肿瘤治疗后约20%-30%的死亡主要是由于肿瘤的远处转移造成的。乳房x光检查的筛查虽然使乳腺癌死亡率降低了28%-45%,但是乳房x光对年轻女性乳腺癌的检查灵敏度不高,尤其是在高密度乳腺组织中检测乳腺癌时,其检测灵敏度较低。因此我们需要新的更加精准的检测方法以弥补乳腺x光检查的不足。

2、目前市场上对乳腺肿瘤早期诊断和筛查的无穿刺液体活检方法非常少,主要的检测方法还是针对结肠癌血液游离dna的sept9甲基化进行检测,以实现乳腺癌的早期诊断,但是该方法的乳腺癌早期筛查诊断的准确率也不到80%,因此早期乳腺癌诊断筛查面临很大的挑战。目前的乳腺癌早期筛查方法和产品中,其中的血液游离dna甲基化的检测试剂盒还没有应用于临床;目前诊断乳腺癌的诊断方法还有ca153抗原检测法,但是这种检测抗原一般在乳腺癌晚期患者血清中会明显升高,因此其针对乳腺癌早期筛查来讲,容本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.乳腺癌肿瘤特异性甲基化标签的鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的乳腺癌肿瘤特异性甲基化标签的鉴定方法,其特征在于,步骤2中进行非参数检验时,参照的模型公式如式(1)所示:

3.根据权利要求2所述的乳腺癌肿瘤特异性甲基化标签的鉴定方法,其特征在于,步骤3中Δβ的计算公式如式(2)所示:

4.根据权利要求1所述的乳腺癌肿瘤特异性甲基化标签的鉴定方法,其特征在于,显著性差异的高甲基化位点阈值的获取方法包括以下步骤:

5.根据权利要求1所述的乳腺癌肿瘤特异性甲基化标签的鉴定方法,其特征在于,步骤5中进行非负矩阵分解时的...

【技术特征摘要】

1.乳腺癌肿瘤特异性甲基化标签的鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的乳腺癌肿瘤特异性甲基化标签的鉴定方法,其特征在于,步骤2中进行非参数检验时,参照的模型公式如式(1)所示:

3.根据权利要求2所述的乳腺癌肿瘤特异性甲基化标签的鉴定方法,其特征在于,步骤3中δβ的计算公式如式(2)所示:

4.根据权利要求1所述的乳腺癌肿瘤特异性甲基化标签的鉴定方法,其特征在于,显著性差异的高甲基化位点阈值的获取方法包括以下步骤:

5.根据权利要求1所述的乳腺癌肿瘤特异性甲基化标签的鉴定方法,其特征在于,步骤5中进行非负矩阵分解时的矩阵公示如式(3)所示:

6.与乳腺癌肿瘤早/晚分期相关的甲基化标签,其特征在于,所述与乳腺癌肿瘤早/晚分期相关的甲基化标签的筛选方法包括以下步骤:

7.与乳腺癌血液异常dna甲基化相关的探针位点,其特征在于,所述与乳腺癌血液异常dna甲基化相关的探针位点的筛选方法包括以下步骤:

8.根据权利要求7所述的与乳腺癌血液异常甲基化相关的探针位点,其特征在于,以wilcoxon rank- sum test方法鉴定与肿瘤早/晚...

【专利技术属性】
技术研发人员:李奇渊秦青青周颖郭金涛
申请(专利权)人:厦门渊智博健基因科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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