【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
技术介绍
1、质谱(ms)可用于识别组成样本的化合物。例如，在其他应用中，ms可用于识别组成dna或rna样本的寡核苷酸(“寡”)；其还可用于多种其他目的。因为当经受ms时分子以可预测的方式碎片化，所以在一些情况下，可能建立已知碎片化模式的库以与实验中观察到的碎片化模式匹配。该库可以例如基于建模或先前的实验结果来构建。专家用户通常基于图形用户界面上的输出来解释匹配的结果，以便确定一组实验结果是否匹配存储在库中的碎片化模型。
技术实现思路
1、示例性实施方案涉及计算机实现的方法，以及存储用于执行该方法的指令的非暂态计算机可读介质、被配置为执行该方法的设备等。
2、在一个方面，一种计算机实现的方法包括：接收表示将分子碎片化成多个实验碎片的输入数据；将该碎片化与建模碎片化的库进行比较以识别包括多个建模碎片的候选匹配；以及显示该候选匹配的图形表示，该图形表示包括对应于每个建模碎片的图形元素，其中每个图形元素能够处于开启状态或关闭状态，并且如果该图形元素的建模碎片与该输入数据中的对应实验碎片匹配，则相应的图形元素处于开启状态。
3、分子可以是寡核苷酸并且实验碎片可以表示寡核苷酸中的单体。
4、该计算机实现的方法还可以包括：接收表示将该分子第二碎片化成第二多个实验碎片的第二输入数据；以及将至少该多个实验碎片和该第二多个实验碎片聚合成累积输入数据，其中如果对应于该图形元素的建模碎片与该输入数据中的对应实验碎片或来自该第二输入数据的第二对应实验碎片中的至少一个
5、该计算机实现的方法还可以包括：识别第二候选匹配；以及显示与该候选匹配的图形表示对齐的该第二候选匹配的图形表示。
6、该计算机实现的方法还可以包括：识别指定的实验碎片与一种或多种变体配置相关联；以及用变体标识符修改对应于指定的实验碎片的图形元素。
7、该计算机实现的方法还可以包括：接收对该候选匹配的该图形表示中选择的图形元素的选择；以及显示来自对应于与该选择的图形元素相关联的实验碎片的输入数据的质谱。对于本领域的技术人员来说，从下列图、描述和权利要求可以很容易地看出其他技术特征。
8、在一些实施方案中，每个图形元素可以显示表示在累积输入数据中找到对应于该图形元素的建模碎片的频率的分数。
9、该计算机实现的方法还可以包括：接收对该候选匹配的该图形表示中选择的图形元素的选择；以及突出该累积输入数据的图形表示中的对应图形元素。
10、该计算机实现的方法还可以包括：识别多个实验碎片各自与一种或多种变体配置相关联，并且这些实验碎片中的至少一个实验碎片处于变体状态；以及用潜在变体标识符修改对应于与该变体配置相关联的该多个实验碎片的该图形元素。
11、该计算机实现的方法还可以包括：接收对与指定的实验碎片相对应的图形元素的选择；接收对选择的变体配置的选择；以及基于该选择的变体配置来修改该图形表示的显示。
12、对于本领域的技术人员来说，从下列图、描述和权利要求会很容易地看出其他技术特征。
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1.一种计算机实现的方法，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的计算机实现的方法，其中所述分子是寡核苷酸并且所述实验碎片表示所述寡核苷酸中的单体。
3.根据权利要求1所述的计算机实现的方法，所述方法还包括：
4.根据权利要求3所述的计算机实现的方法，其中每个图形元素显示表示在所述累积输入数据中找到对应于所述图形元素的所述建模碎片的频率的分数。
5.根据权利要求3所述的计算机实现的方法，所述方法还包括：
6.根据权利要求1所述的计算机实现的方法，所述方法还包括：
7.根据权利要求1所述的计算机实现的方法，所述方法还包括：
8.根据权利要求7所述的计算机实现的方法，所述方法还包括：
9.根据权利要求7所述的计算机实现的方法，所述方法还包括：
10.根据权利要求1所述的计算机实现的方法，所述方法还包括：
11.一种非暂态计算机可读存储介质，所述计算机可读存储介质包括指令，所述指令在被计算机执行时使得所述计算机执行以下操作：
12.根据权利要求11所述的计
13.根据权利要求11所述的计算机可读存储介质，其中所述指令还将所述计算机配置为：
14.根据权利要求13所述的计算机可读存储介质，其中每个图形元素显示表示在所述累积输入数据中找到对应于所述图形元素的所述建模碎片的频率的分数。
15.根据权利要求13所述的计算机可读存储介质，其中所述指令还将所述计算机配置为：
16.根据权利要求11所述的计算机可读存储介质，其中所述指令还将所述计算机配置为：
17.根据权利要求11所述的计算机可读存储介质，其中所述指令还将所述计算机配置为：
18.根据权利要求17所述的计算机可读存储介质，其中所述指令还将所述计算机配置为：
19.根据权利要求17所述的计算机可读存储介质，其中所述指令还将所述计算机配置为：
20.根据权利要求11所述的计算机可读存储介质，其中所述指令还将所述计算机配置为：
...【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种计算机实现的方法，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的计算机实现的方法，其中所述分子是寡核苷酸并且所述实验碎片表示所述寡核苷酸中的单体。
3.根据权利要求1所述的计算机实现的方法，所述方法还包括：
4.根据权利要求3所述的计算机实现的方法，其中每个图形元素显示表示在所述累积输入数据中找到对应于所述图形元素的所述建模碎片的频率的分数。
5.根据权利要求3所述的计算机实现的方法，所述方法还包括：
6.根据权利要求1所述的计算机实现的方法，所述方法还包括：
7.根据权利要求1所述的计算机实现的方法，所述方法还包括：
8.根据权利要求7所述的计算机实现的方法，所述方法还包括：
9.根据权利要求7所述的计算机实现的方法，所述方法还包括：
10.根据权利要求1所述的计算机实现的方法，所述方法还包括：
11.一种非暂态计算机可读存储介质，所述计算机可读存储介质包括指令，所述指令在被计算机执行时使得所述计算机执行以下操作：<...
【专利技术属性】
技术研发人员：M·戈顿，M·布劳顿，C·诺尔斯，
申请(专利权)人：沃特世科技爱尔兰有限公司，
类型：发明
国别省市：
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