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一种小肽miPEP166i及其在植物组织培养中的应用制造技术

技术编号:40626712 阅读:6 留言:0更新日期:2024-03-13 21:13
本发明专利技术公开了一种小肽miPEP166i及其在植物组织培养中的应用,涉及植物基因工程技术领域,本发明专利技术通过一个完整的肽原组学流程,系统地鉴定了84K杨树的三个组织中的miP EP,并以识别到的miRNA166i的初级转录本中的序列进一步翻译得到根特异性表达的小肽miPEP166i,所述miPEP166i的氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示;经验证,人工合成miPEP166i的外源应用能够促进84K杨不定根的形成和伸长,本发明专利技术针对84K杨树miPEP的综合注释和功能分析为其在杨树等林木中的应用提供了宝贵的遗传资源。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及植物基因工程,具体涉及一种小肽mipep166i及其在植物组织培养中的应用。


技术介绍

1、肽是植物蛋白质组中的小生物分子。自1991年首次报道植物中的信号肽以来,已经鉴定出数百种由小开放阅读框(sorf)编码的短肽(spep,2-100个氨基酸残基),它们涉及植物生长发育、信号转导、生物反应,和非生物反应。然而,与经典基因编码的蛋白质相比,spep的多样性和功能仍不太清楚。

2、最近,质谱技术的进步加上各种生物信息学工具的开发,促进了一些模式植物(如拟南芥、玉米和葡萄)在全基因组范围内的spep鉴定。这些研究表明,约44.04-91.20%的spep由位于“非编码”区域的sorf编码,如基因间和内含子dna、非编码rna和假基因。当随机选择的sorf在拟南芥中过表达时,约10%(49/473)的编码sorf诱导了可见的表型效应,这是随机选择的已知基因的7倍。spep也可以由微小rna基因座的转录物产生,这些基因座被命名为微小rna编码肽(mipep),由于其在改善农艺性状方面的关键功能而受到相当大的关注。

3、微小rna(mirna)是内源性小的非编码rna,通过切割靶mrna在转录后水平调节基因表达。成熟的mirna是其初级转录物(pri-mirna)的加工产物,同时,pri-mi rna具有编码mipep的潜力。mipep与其orf物理相互作用,并积极调节相关mirna的积累。大多数保守的mirna在植物生长、发育和胁迫反应中发挥着重要作用,因此,mipep是操纵植物表型的生物分子工具的有力候选者。例如,据报道,大豆中的mipep172c、拟南芥中的mipe858a和葡萄中的mipe164c分别调节结瘤、根系生长和花青素积累。外源应用mipep不仅可以避免转基因过程的技术挑战,而且可以最大限度地减少环境污染,因为mipep具有高度的生物降解性。然而,mipep尚未在大多数高等植物中进行大规模鉴定,其功能需要深入探索,尤其是对森林树木。

4、作为一种木本模式植物,杨属物种拥有大量可供公众使用的基因组资源,可用于功能基因组研究。此外,杨树mirna的鉴定、起源、进化和生物学功能也得到了深入研究。例如,mir165/166可以通过抑制ptrhb7的表达,以剂量依赖的方式控制毛果次生生长过程中次生木质部和韧皮部组织之间的平衡分化;mir167a能够通过抑制靶转录物(pearf)来改善杂交杨(p.deltoides×p.euramericana)的侧根发育。mirna在杨树中的功能多样性为通过应用mipep干扰杨树的发育和生长提供了可能。


技术实现思路

1、本专利技术的目的在于提供一种小肽mipep166i及其在植物组织培养中的应用,旨在通过研究mipep166i的生物学功能和潜在的调控机制,为其在杨树等林木中的应用提供了宝贵的遗传资源。

2、本专利技术通过以下技术方案来实现上述目的:

3、本专利技术的第一目的在于,提供了一种小肽mipep166i,所述小肽mipep166i的氨基酸序列如seq id no.3所示。

4、进一步改进在于,所述小肽mipep166i是通过对mirna166i的初级转录本序列的第236位至第307位翻译获得,所述mirna166i的初级转录本序列如seq id no.2所示。

5、本专利技术的第二目的在于,还提供了一种如上述任一所述的小肽mipep166i在植物组织培养中的应用。

6、进一步改进在于,所述植物为84k杨树。

7、进一步改进在于,所述应用具体为,在84k杨树组织培养过程中,将mipep166i外源添加至生长培养基中,以促进84k杨不定根的形成和伸长。

8、进一步改进在于,所述mipep166i的添加浓度为5μm。

9、进一步改进在于,所述mipep166i通过增强mir166i的表达或降低mir166i的靶标基因的表达以促进84k杨不定根的形成和伸长。

10、进一步改进在于,所述mir166i的靶标基因包括paghb8和pagrev。

11、本专利技术提具有如下有益效果:

12、本专利技术通过一个完整的肽原组学流程,系统地鉴定了84k杨树的三个组织中的mipep,并以识别到的mirna166i的初级转录本中的序列进一步翻译得到根特异性表达的mipep166i,经验证,外源应用mipep166i能够以序列特异性的方式促进84k杨不定根的形成和伸长,本专利技术针对84k杨树mipep的综合注释和功能分析为其在杨树等林木中的应用提供了宝贵的遗传资源。

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【技术保护点】

1.一种小肽miPEP166i,其特征在于,所述小肽miPEP166i的氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示。

2.根据权利要求1所述的小肽miPEP166i,其特征在于,所述小肽miPEP166i是通过对miRNA166i的初级转录本序列的第236位至第307位翻译获得,所述miRNA166i的初级转录本序列如SEQ ID NO.2所示。

3.一种如权利要求1-2任一所述的小肽miPEP166i在植物组织培养中的应用。

4.根据权利要求3所述的一种小肽miPEP166i在植物组织培养中的应用,其特征在于,所述植物为84K杨树。

5.根据权利要求4所述的一种小肽miPEP166i在植物组织培养中的应用,其特征在于,所述应用具体为,在84K杨树组织培养过程中,将miPEP166i外源添加至生长培养基中,以促进84K杨不定根的形成和伸长。

6.根据权利要求5所述的一种小肽miPEP166i在植物组织培养中的应用,其特征在于,所述miPEP166i的添加浓度为5μM。

7.根据权利要求3所述的一种小肽miPEP166i在植物组织培养中的应用,其特征在于,所述miPEP166i通过增强miR166i的表达或降低miR166i的靶标基因的表达以促进84K杨不定根的形成和伸长。

8.根据权利要求3所述的一种小肽miPEP166i在植物组织培养中的应用,其特征在于,所述miR166i的靶标基因包括PagHB8和PagREV。

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【技术特征摘要】

1.一种小肽mipep166i,其特征在于,所述小肽mipep166i的氨基酸序列如seq id no.3所示。

2.根据权利要求1所述的小肽mipep166i,其特征在于,所述小肽mipep166i是通过对mirna166i的初级转录本序列的第236位至第307位翻译获得,所述mirna166i的初级转录本序列如seq id no.2所示。

3.一种如权利要求1-2任一所述的小肽mipep166i在植物组织培养中的应用。

4.根据权利要求3所述的一种小肽mipep166i在植物组织培养中的应用,其特征在于,所述植物为84k杨树。

5.根据权利要求4所述的一种小肽mipep166i在植物组织培养中的应用...

【专利技术属性】
技术研发人员:薛良交国颖杨港归祁永力
申请(专利权)人:南京林业大学
类型:发明
国别省市:

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