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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物医药领域,涉及鼻咽癌菌群辅助诊断标志物。
技术介绍
1、鼻咽癌是起源于鼻咽上皮的恶性肿瘤,高发于我国华南地区及东南亚等国。尽管近年来随着诊疗技术的发展,鼻咽癌死亡率有所下降,但发病率仍居高不下。且鼻咽癌高发于40-55岁、好发于男性,该肿瘤的青壮年高发及区域性高发的特点。此外,由于鼻咽癌发病的隐匿性,患者发现时肿瘤分期通常较晚,给华南等高发地区带来了较大的卫生经济负担。早期发现、早期治疗将有望改善患者的长期预后及提升治疗后生活质量。
2、鼻咽经口、鼻与外环境相通,定植有丰富多样的细菌,它们是局部微环境的关键成员。在健康个体中,鼻咽部菌群主要由来自棒状杆菌属、链球菌属、莫拉氏菌属及狡诈球菌属的需氧细菌构成。这些定植于鼻咽黏膜的常驻菌群在维持局部微生态稳定、抵御机会致病菌定植及调节黏膜免疫平衡中发挥着重要作用,是维持鼻咽健康的基石。鼻咽常常是呼吸道病原体进入机体的第一站,目前我们对鼻咽部菌群的理解多集中于其与病毒或细菌感染、哮喘等呼吸道炎症性疾病的关联。菌群失调已被大量研究证实是推动肿瘤发生发展的关键病因,部分菌群特征在结直肠癌等肿瘤中已展现出其明确的标志物价值。因此,寻找可区分鼻咽癌患者与对照的菌群特征,将有望开发出适用于鼻咽癌早期诊断、治疗检测及干预的新途径。
技术实现思路
1、一方面,本专利技术提供了检测菌种标志物的试剂在制备鼻咽癌的诊断、监测或预后判断产品中的应用;所述菌种标志物包括:cutibacterium acnes、corynebacter
2、在一些实施方案中,所述菌种标志物包括:cutibacterium acnes;corynebacterium accolens;或cutibacterium granulosum。
3、在一些实施方案中,所述菌种标志物包括:cutibacterium acnes和streptococcus mitis。
4、在一些实施方案中,所述菌种标志物包括第一菌种标志物和第二菌种标志物;所述第一菌种标志物包括:cutibacterium acnes和streptococcus mitis;所述第二菌种标志物包括:corynebacterium accolens、cutibacterium granulosum、limnobacterthiooxidans、peptostreptococcus stomatis、gemella haemolysans、gemellamorbillorum、klebsiellapneumoniae、neisseria sicca、ralstonia insidiosa和granulicatella adiacens中的一种或多种。
5、在一些实施方案中,所述第二菌种标志物包括:limnobacter thiooxidans;在一些实施方案中,所述第二菌种标志物包括:limnobacter thiooxidans和peptostreptococcus stomatis;在一些实施方案中,所述第二菌种标志物包括:limnobacter thiooxidans、peptostreptococcus stomatis和corynebacteriumaccolens;在一些实施方案中,所述第二菌种标志物包括:limnobacter thiooxidans、peptostreptococcus stomatis、corynebacterium accolens和klebsiella pneumoniae;在一些实施方案中,所述第二菌种标志物包括:limnobacter thiooxidans、peptostreptococcus stomatis、corynebacterium accolens、klebsiella pneumoniae和gemella haemolysans;或limnobacter thiooxidans、peptostreptococcus stomatis、corynebacterium accolens、klebsiellapneumoniae和gemella morbillorum;在一些实施方案中,所述第二菌种标志物包括:limnobacter thiooxidans、peptostreptococcusstomatis、corynebacterium accolens、klebsiellapneumoniae、gemella haemolysans和gemella morbillorum;在一些实施方案中,所述第二菌种标志物包括:corynebacteriumaccolens、limnobacter thiooxidans、peptostreptococcus stomatis、gemellahaemolysans、gemella morbillorum、klebsiella pneumoniae、neisseria sicca、ralstonia insidiosa及granulicatella adiacens。
6、在一些实施方案中,所述检测菌种标志物的试剂为定量检测菌种标志物丰度的试剂;在一些实施方案中,所述检测菌种标志物的试剂为引物、探针、反义寡核苷酸、适配体、和/或抗体;在一些实施方案中,所述检测菌种标志物的试剂为16s rrna检测用试剂、pcr检测用试剂、rnaseq检测用试剂、高通量测序用试剂、和/或宏基因组测序用试剂;在一些实施方案中,所述菌种的取样部位包括鼻咽部或鼻腔;在一些实施方案中,所述产品为试剂、试剂盒、试纸、芯片和/或电子装置。
7、一方面,本专利技术提供了一种鼻咽癌的诊断、监测或预后判断的试剂盒,所述试剂盒包括检测菌种标志物的检测试剂,所述菌种标志物包括:cutibacterium acnes、corynebacterium accolens、cutibacterium granulosum、limnobacter thiooxidans、peptostreptococcus stomatis、streptococcus mitis、gemella haemolysans、gemellamorbillorum、klebsiellapneumoniae、neisseria sicca、ralstonia insidiosa和granulicatella adiacens中的一种或多种。
8、在一些实施方案中,所述检测试剂包括本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.检测菌种标志物的试剂在制备鼻咽癌的诊断、监测或预后判断产品中的应用;其特征在于,所述菌种标志物包括:
2.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述菌种标志物包括:
3.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述菌种标志物包括:Cutibacterium acnes和Streptococcus mitis。
4.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述菌种标志物包括第一菌种标志物和第二菌种标志物;
5.如权利要求1-4任一所述的应用,其特征在于,所述检测菌种标志物的试剂为定量检测菌种标志物丰度的试剂;
6.一种鼻咽癌的诊断、监测或预后判断的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括检测菌种标志物的检测试剂,所述菌种标志物包括:
7.如权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述菌种标志物包括:
8.如权利要求6或7任一所述的试剂盒,其特征在于,所述检测试剂包括检测所述菌种标志物含量的检测试剂;
9.一种鼻咽癌的诊断、监测或预后判断的电子装置,其特征在于,所述电子装置包括:
10.如权利
11.一种诊断、监测或预后判断鼻咽癌的菌种标志物的筛选方法,其特征在于,所述筛选方法包括:
12.如权利要求11所述的筛选方法,其特征在于,所述菌种标志物包括:
13.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述存储介质包括存储的程序,其中,在所述程序运行时,控制所述存储介质所在设备执行权利要求9或10所述电子装置中的模型、或权利要求11或12所述的诊断、监测或预后判断鼻咽癌的菌种标志物的筛选方法。
...【技术特征摘要】
1.检测菌种标志物的试剂在制备鼻咽癌的诊断、监测或预后判断产品中的应用;其特征在于,所述菌种标志物包括:
2.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述菌种标志物包括:
3.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述菌种标志物包括:cutibacterium acnes和streptococcus mitis。
4.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述菌种标志物包括第一菌种标志物和第二菌种标志物;
5.如权利要求1-4任一所述的应用,其特征在于,所述检测菌种标志物的试剂为定量检测菌种标志物丰度的试剂;
6.一种鼻咽癌的诊断、监测或预后判断的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括检测菌种标志物的检测试剂,所述菌种标志物包括:
7.如权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,...
【专利技术属性】
技术研发人员:贾卫华,廖颖,吴艳霞,
申请(专利权)人:中山大学肿瘤防治中心中山大学附属肿瘤医院,中山大学肿瘤研究所,
类型:发明
国别省市:
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