【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
技术介绍
0、技术背景
1、个性化医疗保健的现状绝大多数是以基因组为中心，主要集中于对个体体内存在的基因进行定量。虽然这种方法已被证明是极其有效的，但它并不能为临床医生提供个人健康的全貌。这是因为基因是个体的“蓝图”，并且它仅仅告知患上疾病的可能性。在个体体内，这些“蓝图”首先需要转录成rna，然后翻译成各种蛋白质分子(细胞中的“作用者”)才能对个体的健康产生影响。
2、蛋白质的浓度、蛋白质之间的相互作用(蛋白质-蛋白质相互作用或ppi)以及蛋白质与其他分子之间的相互作用与不同器官的健康、自稳调节机制以及这些系统与外部环境的相互作用有着错综复杂的联系。因此，有关蛋白质和蛋白质相互作用(诸如ppi)的定量信息对于构建给定时间点处的个人健康的全貌以及预测任何新出现的健康问题来说是必不可少的。这些蛋白质的存在和这些蛋白质之间的相互作用对于药物开发来说也是至关重要的，并且越来越成为备受追捧的用于捕获单独蛋白质组以及蛋白质组响应于环境或其他系统事件的变化的数据集。对给定样品内的蛋白质以及蛋白质与其他分子的相互作用进行检测和定量的能力是这种医疗保健发展的不可或缺的组成部分。
技术实现思路
1、本公开总体上涉及用于对样品中的分析物分子进行检测和定量的系统、结构和方法。
2、在一些实施方案中，本文提供了用于检测样品中存在的分析物分子的基于溶液的技术。所述技术包括样品制备步骤，其中溶液中的分析物由相应的超分子结构捕获或以其他方式与所述相应的超分子结构缔合。例如，
3、大小排除型超分子结构在溶液中与分析物复合，这为制备用于检测复合分析物的衬底创造了较大的灵活性。与被设计成使单一亲和结合剂与每个结合位点缔合的制造起来很复杂的系统相比，所公开的技术在每个结合位点处包括多种固定的亲和结合剂的更为宽松的结合位点制备下生效。因此，超分子结构可为单分子结合实体，而衬底可被布置成准许在每个结合位点处进行多分子结合。每个结合位点处低数量或单分子结合的性质(受助于空间上限制每个位点处的结合的超分子结构)准许在单个检测平台上对多种蛋白质相互作用进行高通量并行表征。此外，相对于基于衬底的样品制备，基于溶液的样品制备更加简化。
4、如本文所提供，一种用于检测样品中存在的分析物分子的方法可包括：提供包含分析物分子的样品；以及使所述样品在溶液中与超分子结构集合体接触以形成分析物分子-超分子结构复合物。所述超分子结构可包括包含多个核心分子的核心结构和连接到所述核心结构的亲和结合剂。单独的分析物分子-超分子结构复合物可包含：核心结构，所述核心结构包含多个核心分子；亲和结合剂，所述亲和结合剂连接到所述核心结构；以及所述分析物分子中结合到所述亲和结合剂的分析物分子，其中所述超分子结构集合体的不同超分子结构包含对所述分析物分子中的其他分析物分子具有不同结合亲和力的不同亲和结合剂。所述方法还包括：使所述分析物分子-超分子结构复合物与阵列接触，其中所述阵列的结合位点包含对不同分析物分子具有结合亲和力的相应的固定的亲和结合剂；以及检测所述分析物分子-超分子结构复合物与所述阵列的结合位点的结合。
5、如本文所提供，一种用于检测样品中存在的分析物分子的方法可包括提供超分子结构阵列，其中每个单独超分子结构固定在衬底的相应结合位点上。所述阵列的单独超分子结构包含：核心结构，所述核心结构包含多个核心分子；以及多个核酸捕获分子，所述多个核酸捕获分子连接到所述核心结构，其中所述核酸捕获分子各自包含可与所述阵列的其他超分子结构的鉴定序列区分开的相同鉴定序列。所述方法包括使所述阵列与连接到对不同鉴定序列具有结合特异性的单链核酸标签的亲和结合剂集合体接触，以使不同亲和结合剂结合到所述阵列的不同结合位点，使得每个结合位点包含所述亲和结合剂集合体的不同子集。所述方法还包括：使所述样品与所述阵列接触，使得所述分析物分子结合到所述亲和结合剂集合体中的单独亲和结合剂，其中所述分析物分子与超分子结构检测组装体复合；以及检测所述分析物分子与所述单独结合位点的结合。
6、如本文所提供，一种用于检测样品中存在的分析物分子的方法可包括提供包含单链核酸的阵列，所述单链核酸被固定在所述阵列上，使得所述阵列的单独结合位点包含多个单链核酸，所述多个单链核酸包含可与固定在所述阵列的不同结合位点上的其他单链核酸的序列区分开的相同序列。所述方法包括：使所述阵列与亲和结合剂集合体接触，以使固定的单链寡核苷酸在所述阵列的结合位点处捕获所述亲和结合剂的子集，并且使得所述捕获的亲和结合剂形成固定在相应结合位点处的捕获分子；以及使所述样品与所述阵列接触，使得所述分析物分子结合到单独捕获分子，其中所述分析物分子与超分子结构检测组装体复合。所述方法还包括检测所述分析物分子与所述单独结合位点的结合。
7、如本文所提供，一种用于检测样品中存在的分析物分子的方法可包括形成纳米球或功能化纳米结构。所述纳米球或功能化纳米结构包括多个单独寡核苷酸，所述多个单独寡核苷酸中的每个寡核苷酸连接到化学部分并且每个寡核苷酸结合到所述纳米球或功能化纳米结构的互补核酸。所述方法包括：提供包括多个活性位点的图案化阵列；用所述图案化阵列孵育所述纳米球或功能化纳米结构，以使单独活性位点的活性基团共价地连接到所述多个单独寡核苷酸的化学部分，从而将单独纳米球或功能化纳米结构偶联到所述单独活性位点；使所述多个单独寡核苷酸从所述纳米球或功能化纳米结构的所述互补核酸变性；从所述阵列中洗涤所述纳米球或功能化纳米结构以留下固定在所述单独结合位点上的所述多个单独寡核苷酸，其中所述多个单独寡核苷酸是单链的；以及使所述阵列与亲和结合剂集合体接触以使所述固定的多个单独寡核苷酸在所述单独结合位点处捕获所述亲和结合剂的子集。
8、如本文所提供，一种用于检测样品中存在的分析物分子的方法可包括：提供包含分析物分子的样品；以及使所述样品在溶液中与超分子结构集合体接触以形成分析物分子-超分子结构复合物。单独的分析物分子-超分子结构复合物包含：核心结构，所述核心结构包含多个核心分子；亲和结合剂，本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种用于检测样品中存在的分析物分子的方法，所述方法包括：
2.如权利要求1所述的方法，所述方法包括鉴定结合到所述阵列的单独结合位点的所述单独分析物分子-超分子结构的单独分析物分子。
3.如权利要求2所述的方法，其中所述鉴定包括：从所述超分子结构产生可检测信号并且将所述可检测信号与所述单独结合位点相关联。
4.如权利要求3所述的方法，其中所述可检测信号是指示所述单独结合位点处存在所述单独分析物分子-超分子结构的光、磁或电信号。
5.如权利要求2所述的方法，其中所述鉴定包括：使所述超分子结构的引发剂扩增并且检测所述扩增。
6.如权利要求5所述的方法，其中所述引发剂是核酸。
7.如权利要求2所述的方法，其中所述鉴定包括：使固定在所述单独结合位点上的引发剂扩增并且检测所述扩增。
8.如权利要求7所述的方法，其中所述引发剂是核酸。
9.如权利要求1所述的方法，其中所述亲和结合剂和所述固定的亲和结合剂是抗体分子或抗体分子的部分。
10.如权利要求1所述的方法，其中所述分析物分子-超
11.如权利要求1所述的方法，其中所述固定的亲和结合剂经由核酸捕获分子连接到每个单独结合位点。
12.如权利要求11所述的方法，其中每个单独结合位点包含多个核酸捕获分子。
13.如权利要求12所述的方法，其中单独结合位点处的所述多个核酸捕获分子都具有相同的核酸序列。
14.如权利要求12所述的方法，其中所述多个核酸捕获分子偶联到固定的超分子结构。
15.如权利要求1所述的方法，其中每个单独结合位点包含多种固定的亲和结合剂，所述多种固定的亲和结合剂都对所述分析物分子中的相同分析物分子具有亲和力。
16.如权利要求1所述的方法，其中每个结合位点的直径是在20至500纳米之间。
17.如权利要求1所述的方法，其中所述集合体的每个超分子结构是纳米结构。
18.如权利要求14所述的方法，其中每个核心结构是纳米结构。
19.如权利要求1所述的方法，其中所述集合体的每个超分子结构被排列成预定义形状和/或具有规定的分子量。
20.如权利要求1所述的方法，所述方法还包括在使所述样品与所述阵列接触之后去除未结合到所述阵列的结合位点的分析物分子-超分子结构。
21.如权利要求1所述的方法，其中所述分析物分子包括蛋白质、肽、肽片段、脂质、DNA、RNA、有机分子、无机分子、其复合物或其任何组合。
22.一种用于检测样品中存在的分析物分子的方法，所述方法包括：
23.如权利要求20所述的方法，其中所述超分子结构检测组装体的大小被设计成使得仅一个分析物分子能够结合到每个结合位点。
24.如权利要求20所述的方法，其中所述核酸捕获分子是单链的。
25.如权利要求20所述的方法，其中所述超分子结构检测组装体偶联到亲和结合剂，所述亲和结合剂结合所述分析物分子以形成复合物。
26.如权利要求20所述的方法，其中所述超分子结构检测组装体仅包含单一的亲和结合剂，所述单一的亲和结合剂结合所述分析物分子以形成复合物。
27.一种用于检测样品中存在的分析物分子的方法，所述方法包括：
28.如权利要求27所述的方法，其中所述单链寡核苷酸被印刷在所述阵列上。
29.如权利要求27所述的方法，其中所述阵列的每个结合位点包括孔，并且其中单链核酸被固定在位于所述孔内的珠粒上。
30.如权利要求27所述的方法，其中每个结合位点处的所述亲和结合剂的所述子集包括多种亲和结合剂。
31.如权利要求27所述的方法，其中固定所述单链寡核苷酸包括：在所述单独结合位点处捕获滚环扩增产物，所述滚环扩增产物包含多个互补探针；以及将所述多个互补探针锚定到结合位点。
32.如权利要求27所述的方法，其中固定所述单链寡核苷酸包括：在所述单独结合位点处捕获功能化纳米颗粒，功能化纳米颗粒包含多种双链核酸；以及将所述双链核酸的一条链锚定到所述单独结合位点。
33.一种用于检测样品中存在的分析物分子的方法，所述方法包括：
34.如权利要求33所述的方法，其中形成所述纳米球包括产生滚环扩增产物，所述滚环扩增产物与所述多个单独寡核苷酸杂交。
35.如权利要求33所述的方法，...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种用于检测样品中存在的分析物分子的方法，所述方法包括：
2.如权利要求1所述的方法，所述方法包括鉴定结合到所述阵列的单独结合位点的所述单独分析物分子-超分子结构的单独分析物分子。
3.如权利要求2所述的方法，其中所述鉴定包括：从所述超分子结构产生可检测信号并且将所述可检测信号与所述单独结合位点相关联。
4.如权利要求3所述的方法，其中所述可检测信号是指示所述单独结合位点处存在所述单独分析物分子-超分子结构的光、磁或电信号。
5.如权利要求2所述的方法，其中所述鉴定包括：使所述超分子结构的引发剂扩增并且检测所述扩增。
6.如权利要求5所述的方法，其中所述引发剂是核酸。
7.如权利要求2所述的方法，其中所述鉴定包括：使固定在所述单独结合位点上的引发剂扩增并且检测所述扩增。
8.如权利要求7所述的方法，其中所述引发剂是核酸。
9.如权利要求1所述的方法，其中所述亲和结合剂和所述固定的亲和结合剂是抗体分子或抗体分子的部分。
10.如权利要求1所述的方法，其中所述分析物分子-超分子结构与单独结合位点处的固定的亲和结合剂的结合包括所述超分子结构的所述亲和结合剂与所述分析物分子的第一部分的结合以及所述固定的亲和结合剂与所述分析物分子的第二部分的结合。
11.如权利要求1所述的方法，其中所述固定的亲和结合剂经由核酸捕获分子连接到每个单独结合位点。
12.如权利要求11所述的方法，其中每个单独结合位点包含多个核酸捕获分子。
13.如权利要求12所述的方法，其中单独结合位点处的所述多个核酸捕获分子都具有相同的核酸序列。
14.如权利要求12所述的方法，其中所述多个核酸捕获分子偶联到固定的超分子结构。
15.如权利要求1所述的方法，其中每个单独结合位点包含多种固定的亲和结合剂，所述多种固定的亲和结合剂都对所述分析物分子中的相同分析物分子具有亲和力。
16.如权利要求1所述的方法，其中每个结合位点的直径是在20至500纳米之间。
17.如权利要求1所述的方法，其中所述集合体的每个超分子结构是纳米结构。
18.如权利要求14所述的方法，其中每个核心结构是纳米结构。
19.如权利要求1所述的方法，其中所述集合体的每个超分子结构被排列成预定义形状和/或具有规定的分子量。
20.如权利要求1所述的方法，所述方法还包括在使所述样品与所述阵列接触之后去除未结合到所述阵列的结合位点的分析物分子-超分子结构。
21.如权利要求1所述的方法，其中所述分析物分子包括蛋白质、肽、肽片段、脂质、dna、rna、有机分子、无机分子、其复合物或其任何组合。
22.一种用于检测样品中存在的分析物分子的方法，所述方法包括：
23.如权利要求20所述的方法，其中所述超分子结...
【专利技术属性】
技术研发人员：阿什温·戈比纳特，保罗·罗特蒙德，里沙布·谢蒂，肖恩·鲍文，雷切尔·加利米迪，袁大军，
申请(专利权)人：私募蛋白质体操作有限公司，
类型：发明
国别省市：
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