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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物基因、生物信息学及医学诊断,尤其涉及一种用于早期肝癌术后复发风险预测的方法及系统。
技术介绍
1、肝癌是全球范围内最常见的恶性肿瘤之一,尤其在亚洲地区有着较高的发病率和死亡率。对于早期肝癌患者,即ajcc(美国癌症联合委员会)分型的第一期和第二期病人,尽管手术切除是首选的治疗方式,但高复发风险仍然是一个严峻的挑战。报道显示,对于早期肝癌患者,最主要的治疗手段就是手术切除病灶,手术切除后不再配合相关的辅助治疗。但是早期肝癌患者两年内的复发率达到了30%。如果能够准确预测早期患者里面易复发的患者,在手术后,帮助医生决策是否需要配合辅助治疗,这样会大大提高这部分患者的生存率。目前,大多数早期肝癌患者在手术切除后并未接受术后辅助治疗,这可能导致高复发风险的患者错失治疗最佳时机,进而增加复发和进展的风险,严重影响患者的预后和生存率。准确预测早期肝癌患者的术后复发风险,对于其是否采取术后辅助治疗具有至关重要的意义。
2、目前,肝癌患者的预后预测仍主要依赖于传统的临床和病理学指标,如包括肿瘤的大小和数量、组织学类型、组织学分级、组织学分期等。尽管这些病理学指标在肝癌预后中具有一定的参考价值,但由于肝癌的异质性和复杂性,单一病理学指标往往无法全面评估肿瘤的生物学特征和预测患者的预后。此外,还有一些临床上常用的用于肝癌术后复发的监测的血清肿瘤标志物,如甲胎蛋白(afp)、异常凝血酶原(dcp)、循环肿瘤细胞(ctcs)等。尽管这些指标对肝癌术后早期复发的监测有一定的参考价值,但由于其敏感性和特异性有限,其预测效果还不
3、总之,现有技术的主要缺点包括:
4、1、现有的医疗条件存在局限。
5、传统的临床和病理学指标虽然被广泛应用于早期肝癌患者的预后评估,但由于肝癌的复杂性和异质性,这些指标往往无法全面评估肿瘤的生物学特征和预测患者的术后复发风险,导致预测结果不够准确。目前在肝癌预后预测中常用的血清肿瘤标志物,如afp和dcp,虽然有一定的预测意义,但其敏感性和特异性有限,存在一定程度的误诊和漏诊风险,影响预后评估的可靠性,主要体现在:
6、(1)有限的准确性:现有技术主要依赖传统的临床和病理学指标,以及少数常用的血清肿瘤标志物。这些指标往往无法充分评估肝癌的复杂生物学特征。肝癌患者的疾病发展受多种因素影响,如基因变异、蛋白质异常、肿瘤微环境等,这些因素往往难以被单一指标所反映。
7、(2)敏感性和特异性不足:血清肿瘤标志物如afp和dcp被用于肝癌术后复发的监测,虽然具有一定预测意义,但敏感性和特异性不足,可能导致误诊和漏诊。高假阴性或假阳性率可能导致患者错失治疗时机或不必要的治疗。生物标志物敏感性和特异性的局限性是另一个需要解决的技术问题。
8、(3)基于基因突变的预测模型不够全面:缺乏细分和个体化:现有技术往往未能将早期肝癌患者细分为更精细的亚组,以便更好地预测个体患者的预后风险。不同患者可能具有不同的病理学特征和分子特征,需要个体化的预测模型。尽管基因突变作为重要的预后判断标记物,在肝癌预后中具有重要作用,但目前的方法往往未能充分利用多个生物学特征的综合影响,缺乏个体化预测模型,导致预测效果有限。
9、(4)缺乏统一标准:血清肿瘤标志物的测量方法缺乏统一标准化,不同实验室或医院之间的结果可能存在差异。这使得不同研究或临床实践之间的比较和验证变得复杂。
10、(5)公共数据库中积累了大量早期肝癌患者的临床和基因组数据,但现有技术未能充分利用这些宝贵资源,限制了预后预测的全面性和可靠性。
11、2、大部分现有技术针对的都是所有肝癌患者的预后复发情况,而并没有针对早期肝癌患者(ajcc分期第一期和第二期)的特有方案,而这正是临床中急需的。这是由于早期肝癌患者的治疗手段就是手术切除病灶,切除后不再配合相关的辅助治疗,但是早期患者2年内的复发率达到了30%。如果能够预测出早期患者里面易复发的患者,在手术过后,帮助医生决策是否需要配合辅助治疗,这样会大大提高这部分患者的生存率。
12、3、肝癌预后的大部分现有技术目前仍然只能采用临床的病理数据。这些指标固然有参考价值,但分析问题不够全面。分子数据涉及到具体的基因是肝癌复发的关键因素。同类型现有技术中,只有1个是用的突变数据,但他用的也不是全基因组测序,而是选了一些候选位点,不能概括全部。
13、4、经过检索,cn113345589a、wo2023071877a1和cn112768060a采用的都是生存模型作为预测模型,并且cn112768060a采用的是非线性的随机生存森林模型属于不适宜推广和应用的非线性模型,不适合临床样本的实际应用。此外,cn113345589a采用cox模型,但是具体采用了lasso-cox模型,将lasso特征选择和cox结合,防止过拟合的情况,但是同时这样会缩小特征值,采用lasso-cox构建的模型只能获得三个关键基因特征,从而使得预测效果不够全面。wo2023071877a1将位点信息用lasso-cox建模后只能得到一个特征,然后再结合其他12个临床特征进行回归算法确定最后的模型,因此也无法提高预测的效率和效果。
14、因此,需要进一步寻找更精确、可靠的预测方法,来提高肝癌预后预测的准确性和临床应用价值。
技术实现思路
1、为了解决现有技术中存在的问题,本专利技术提供了如下技术方案,一种用于早期肝癌术后复发风险预测的方法及系统,属于一种创新的综合预测方法和系统,通过全面评估患者的生物学特征,包括基因突变、临床指标afp和病理学特征,以及充分利用公共数据库的wes测序突变特征,建立个体化的预后预测模型;通过分析临床、病理、生物标志物等多种信息建立的预测模型能够协助医生评估患者的疾病进展、复发风险和生存期等指标,从而为临床治疗提供辅助决策和个体化治疗方案的方法。
2、本专利技术一方面提供了一种用于早期肝癌术后复发风险预测的方法,所述复发风险预测基于建立早期肝癌术后复发风险预测模型以及基于所述早期肝癌术后复发风险预测模型进行预测从而获得风险级别分类实现;
3、所述建立早期肝癌术后复发风险预测模型包括:
4、s1,通过本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种用于早期肝癌术后复发风险预测的方法,其特征在于,所述复发风险预测基于建立早期肝癌术后复发风险预测模型以及基于所述早期肝癌术后复发风险预测模型进行预测从而获得风险级别分类实现;
2.根据权利要求1所述的一种用于早期肝癌术后复发风险预测的方法,其特征在于,所述S1包括:
3.根据权利要求2所述的一种用于早期肝癌术后复发风险预测的方法,其特征在于,所述S11中所述临床数据包含病理学指标和早期肝癌患者的临床特征;所述临床数据还包括与早期肝癌患者预后相关的信息,所述突变数据包括早期肝癌患者肿瘤组织中的基因突变信息。
4.根据权利要求3所述的一种用于早期肝癌术后复发风险预测的方法,其特征在于,所述S12包括:
5.根据权利要求4所述的一种用于早期肝癌术后复发风险预测的方法,其特征在于,所述S2包括:
6.根据权利要求5所述的一种用于早期肝癌术后复发风险预测的方法,其特征在于,所述S3包括:
7.根据权利要求6所述的一种用于早期肝癌术后复发风险预测的方法,其特征在于,所述生存分析包括:
8.一种用于早期
9.一种电子设备,其特征在于,包括处理器和存储器,所述存储器存储有多条指令,所述处理器用于读取所述指令并执行如权利要求1-7任一项所述的用于早期肝癌术后复发风险预测的方法。
10.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述计算机可读存储介质存储有多条指令,所述多条指令可被处理器读取并执行如权利要求1-7任一项所述的用于早期肝癌术后复发风险预测的方法。
...【技术特征摘要】
1.一种用于早期肝癌术后复发风险预测的方法,其特征在于,所述复发风险预测基于建立早期肝癌术后复发风险预测模型以及基于所述早期肝癌术后复发风险预测模型进行预测从而获得风险级别分类实现;
2.根据权利要求1所述的一种用于早期肝癌术后复发风险预测的方法,其特征在于,所述s1包括:
3.根据权利要求2所述的一种用于早期肝癌术后复发风险预测的方法,其特征在于,所述s11中所述临床数据包含病理学指标和早期肝癌患者的临床特征;所述临床数据还包括与早期肝癌患者预后相关的信息,所述突变数据包括早期肝癌患者肿瘤组织中的基因突变信息。
4.根据权利要求3所述的一种用于早期肝癌术后复发风险预测的方法,其特征在于,所述s12包括:
5.根据权利要求4所述的一种用于早期肝癌术后复发风险预测的方法,其特征在于,所述s...
【专利技术属性】
技术研发人员:朱燕萍,杭雨晴,谢剑邦,黎旺长,
申请(专利权)人:南京普恩瑞生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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