一种基于细胞异质性功能的内分泌疾病基因特征融合方法技术

技术编号:40050143 阅读:43 留言:0更新日期:2024-01-16 21:04
一种基于细胞异质性功能的内分泌疾病基因特征融合方法,它涉及一种内分泌疾病基因特征融合方法。本发明专利技术为了解决现有细胞异质性基因特征提取方法存在局限性的问题。本发明专利技术的步骤包括步骤1、获取细胞基因关联数据;步骤2、细胞关联基因特征表示;步骤3、融合细胞关联基因特征。本发明专利技术属于内分泌疾病细胞异质性基因特征融合技术领域。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种内分泌疾病基因特征融合方法,属于内分泌疾病细胞异质性基因特征融合。


技术介绍

1、细胞具有独立有序的自控代谢体系,是人体内一切代谢活动的基本单位,细胞功能失调会直接导致疾病的发生。单细胞测序技术通过对单个细胞的基因表达进行测量和分析,可以提供更准确和细致的细胞功能信息。通过对这些细胞异质性的解析,能够更好地理解内分泌疾病的发病机制和病理过程,为精准医学和个体化治疗提供更多的信息和依据。

2、目前细胞异质性基因特征提取是基于基因测序所得到的基因表达谱数据对细胞进行注释分析。例如,deepep,一种利用cnn提取基因表达谱特征的细胞异质性基因特征提取方法。scgan,一种利用生成对抗网络模型进行基因表达谱矫正的细胞异质性基因特征提取方法。然而,该方法仍然存在着一定局限性:1)由于单细胞测序技术的壁垒导致的批次效应以及基因组转录表达过程的随机性,目前单细胞测序结果存在着无法忽略的偏差;2)受测序深度影响,一些具有重要调控功能但表达量较低的基因仍无法被捕获到。

3、除细胞异质性基因的差异表达外,基因与疾病的关联程度,在组织本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于细胞异质性功能的内分泌疾病基因特征融合方法,其特征在于:所述一种基于细胞异质性功能的内分泌疾病基因特征融合方法的步骤包括:

2.根据权利要求1所述的一种基于细胞异质性功能的内分泌疾病基因特征融合方法,其特征在于:步骤1中为了能够有效利用细胞功能相关的基因数据准确预测细胞异质性基因,需要对基因数据进行预处理;首先根据单细胞测序数据的差异表达倍数和统计显著性进行筛选,获取细胞显著差异表达基因;为了提取影响细胞功能的多种基因特征,用到的相关数据包括:

3.根据权利要求1所述的一种基于细胞异质性功能的内分泌疾病基因特征融合方法,其特征在于:步骤2中根据内分疾病...

【技术特征摘要】

1.一种基于细胞异质性功能的内分泌疾病基因特征融合方法,其特征在于:所述一种基于细胞异质性功能的内分泌疾病基因特征融合方法的步骤包括:

2.根据权利要求1所述的一种基于细胞异质性功能的内分泌疾病基因特征融合方法,其特征在于:步骤1中为了能够有效利用细胞功能相关的基因数据准确预测细胞异质性基因,需要对基因数据进行预处理;首先根据单细胞测序数据的差异表达倍数和统计显著性进行筛选,获取细胞显著差异表达基因;为了提取影响细胞功能的多种基因特征,用到的相关数据包括:

3.根据权利要求1所述的一种基于细胞异质性功能的内分泌疾病基因特征融合方法,其特征在于:步骤2中根据内分疾病基因的位置信息,将其与疾病突变位点数据、组织特异性差异表达数据进行比对,每个基因选取最显著关联的5个突变位点的显著性p值作为细胞关联基因的疾病突变位点信息;然后,根据位置信息将匹配到的snp与内分泌组织的eqtl数据进行比对,将匹配到的snp的p值和log2fc值作为基因在该组织中的差异表达信息,为了更多的利用内分泌组织特异性信息;细胞关联基因涉及的通路数据来源于kegg通路库,将基因的关联通路信息表示为一个343维的二元向量,每一维度表示该基因与通路的关联关系;基因的亚细胞定位信息表示...

【专利技术属性】
技术研发人员:张凝一臧天仪赵飞
申请(专利权)人:哈尔滨工业大学
类型:发明
国别省市:

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