System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 预测未来时间段内患代谢综合征概率的蛋白标志物及应用制造技术_技高网
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预测未来时间段内患代谢综合征概率的蛋白标志物及应用制造技术

技术编号:40002808 阅读:10 留言:0更新日期:2024-01-09 04:07
本发明专利技术提供一种预测未来时间段内患代谢综合征概率的蛋白标志物及其应用,结合基于夏普利值的递归特征消除算法和基于夏普利值的Bourta特征选择法筛选出具有的代表性含义的11种蛋白标志物;另外将受试者的年龄特征和性别特征输入到LGBM模型中,利用基于特征重要性的RFE进行特征选择选择年龄特征,结合年龄特征和11种蛋白标志物的任意组合的相对表达量预测受试者未来时间段内患代谢综合征的概率,若概率越高的话则意味着该受试者未来时间段患有代谢综合征的可能性越高,此时可针对该受试者提早做出针对性的干预策略,起到防范于未然的效果。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物医药领域,特别涉及一种预测未来时间段内患代谢综合征概率的蛋白标志物及其应用。


技术介绍

1、代谢综合征(metabolic syndrome)又称胰岛素抵抗综合征,是一种复杂的代谢紊乱状态,以腹部肥胖、致动脉粥样硬化性血脂异常、血压升高、胰岛素抵抗、促血栓形成和促炎症状态为特征。根据目前的成人血脂异常管理指南规定,达到以下5个指标中3个指标的可被确诊为代谢综合症:1)腰围(waist)>90cm(男性)或者>85cm(女性);2)空腹血糖(fbg)≥6.1mmol/l(110mg/dl);3)甘油三脂(tg)≥1.7mmol/l(150mg/dl);4)高密度脂蛋白(hdl)<1.04mmol/l(40mg/dl);5)收缩压/舒张压(sbp/dbp)≥130/85mmhg或有高血压病史。代谢综合征患者的比例非常高,约占全世界成年人的20-25%。据报道,代谢综合征容易诱发糖尿病、心血管疾病(脑卒中,心肌梗塞等)、冠心病、非酒精性脂肪性肝病(nafld)、非酒精性脂肪性肝炎(nash)、多囊卵巢综合征(pcos)和各种癌症,比如男性的结直肠癌,膀胱癌,女性的胰腺癌,乳腺癌等。因此,早期识别和干预代谢综合征是有必要的,这将帮助把全球医疗系统的负担降至最低。

2、目前临床上有明确诊断代谢综合征的指标,比如北京大学第三医院申请的cn112763570b公开了一种用于诊断或检测pcos并发代谢征的试剂盒,再比如黑龙江中医药大学申请的cn112763570b公开了一种早期诊断多囊卵巢综合征患者合并代谢综合征的标志物及用途,但这些蛋白质标记物仅能用于当下检测是否已经患有代谢综合征,而无法提前对未来时间段的患病概率进行预测,如果能够提前预测代谢综合征患病风险则更有利于提早进行干预,降低代谢综合征的发病率,及时调整个体的代谢紊乱状态。


技术实现思路

1、本专利技术的目的在于提供一种预测未来时间段内患代谢综合征概率的蛋白标志物及其应用,筛选可用于预测未来时间段内是否会患上代谢综合征的11种蛋白标记物的组合,可以及早对个体的代谢状态进行评估与风险预测,有利于尽早进行个体健康干预,通过食物摄入,运动等及时调整个体的代谢状态。

2、本方案可通过对受试者的血清样本中蛋白质进行检测,获取11种特定蛋白质标记物的相对表达量,基于相对表达量并结合受试者的年龄特征预测该受试者在未来时间段内患代谢综合征的概率。在本方案的实施例中,可预测受试者10年内是否会患上代谢综合征。对于患上代谢综合征概率偏高的受试者,可以提早对其进行药物或者饮食方式的干预,提示受试者改善生活状态并提早做好预防工作,进而减小受试者未来患代谢综合征的概率。

3、第一方面,本方案提供一种预测未来时间段内患代谢综合征概率的蛋白标志物,包括:选自血清样本的蛋白标志物,其中蛋白标志物选自:p02647_apoa1、p04278_shbg、p05090_apod、p04004_vtn、o75882_atrn、p10909_clu、p05546_serpind1、p04217_a1bg、p02655_apoc2、p01824_ighv4-39、p04114_apob的一种或其组合,所述蛋白标志物结合受试者的年龄用于预测未来时间段患有代谢综合征的概率。

4、优选地,所述蛋白标志物选择11种蛋白质的组合,此时其预测受试者未来时间段患有代谢综合征的概率的精准度高。

5、在一优选实施例中,所述蛋白标志物结合受试者的年龄预测受试者未来10年是否会患有代谢综合征。需要说明的是,本方案提供的蛋白标志物的用途是预测未来患有代谢综合征的患病概率,以非诊断的用途用于临床。

6、本方案基于以上蛋白标记物搭建对应的未来时间段代谢综合征概率预测模型,将受试者的蛋白标志物的相对表达量和受试者的年龄输入到已训练得到的未来时间段代谢综合征概率预测模型中得到预测概率。

7、第二方面,本方案提供了一种预测未来时间段内患代谢综合征概率的试剂盒,包括:检测受试者血清中蛋白标志物含量的试剂,其中蛋白标志物选自:p02647_apoa1、p04278_shbg、p05090_apod、p04004_vtn、o75882_atrn、p10909_clu、p05546_serpind1、p04217_a1bg、p02655_apoc2、p01824_ighv4-39、p04114_apob的一种或其组合。

8、关于该试剂盒的使用方法如下:将受试者的蛋白标志物的相对表达量和受试者的年龄输入到已训练得到的未来时间段代谢综合征概率预测模型中得到预测概率,预测概率越高代表患病概率越高。

9、优选地,所述蛋白标志物选择11种蛋白质的组合,此时其预测受试者未来时间段患有代谢综合征的概率的精准度高。

10、第三方面,本方案提供一种预测未来时间段内患代谢综合征概率的蛋白标志物的应用,包括:通过试剂盒检测受试者血清样本中蛋白标志物的相对表达量,蛋白标志物组合的相对表达量结合受试者的年龄预测未来时间段患代谢综合征的概率,其中蛋白标志物组合选自:p02647_apoa1、p04278_shbg、p05090_apod、p04004_vtn、o75882_atrn、p10909_clu、p05546_serpind1、p04217_a1bg、p02655_apoc2、p01824_ighv4-39、p04114_apob的一种或其组合。

11、优选地,所述蛋白标志物选择11种蛋白质的组合,此时其预测受试者未来时间段患有代谢综合征的概率的精准度高。

12、第四方面,本方案提供一种未来时间段内患代谢综合征概率预测模型的构建方法,包括:以未来时间段患代谢综合征的受试者和未来时间段未患代谢综合征的受试者的血清样本中蛋白标志物的相对表达量以及受试者的年龄作为训练样本训练机器学习模型,其中蛋白标志物组合选自:apoa1、shbg、apod、vtn、atrn、clu、serpind1、a1bg、apoc2、ighv4-39、apob的一种或其组合。

13、优选地,所述蛋白标志物选择11种蛋白质的组合,此时其预测受试者未来时间段患有代谢综合征的概率的精准度高。

14、第五方面,本方案提供一种未来时间段内患代谢综合征概率预测模型,根据上述的未来时间段代谢综合征概率预测模型的构建方法构建得到。

15、本专利基于血清蛋白组学的数据,结合基于夏普利值的递归特征消除算法和基于夏普利值的bourta特征选择法筛选出具有的代表性含义的11种蛋白标志物;另外将受试者的年龄特征和性别特征输入到lgbm模型中,利用基于特征重要性的rfe进行特征选择选择年龄特征,结合年龄特征和11种蛋白标志物的任意组合的相对表达量预测受试者未来时间段内患代谢综合征的概率,若概率越高的话则意味着该受试者未来时间段患有代谢综合征的可能性越高,此时可针对该受试者提早做出针对性的干预策略,起到防范于未然的效果。...

【技术保护点】

1.一种预测未来时间段内患代谢综合征概率的试剂盒,其特征在于,包含检测受试者血清中蛋白标志物相对表达量的试剂,其中蛋白标志物选自:P02647_APOA1、P04278_SHBG、P05090_APOD、P04004_VTN、O75882_ATRN、P10909_CLU、P05546_SERPIND1、P04217_A1BG、P02655_APOC2、P01824_IGHV4-39、P04114_APOB的一种或其组合。

2.根据权利要求1所述的预测未来时间段内患代谢综合征概率的试剂盒,其特征在于,将蛋白标志物的相对表达量和受试者的年龄特征输入到已训练的未来时间段代谢综合征概率预测模型中输出预测结果。

3.一种预测未来时间段内患代谢综合征概率的蛋白标志物,其特征在于,包括:P02647_APOA1、P04278_SHBG、P05090_APOD、P04004_VTN、O75882_ATRN、P10909_CLU、P05546_SERPIND1、P04217_A1BG、P02655_APOC2、P01824_IGHV4-39、P04114_APOB的一种或其组合,用于结合受试者的年龄特征预测受试者未来时间段患上代谢综合征的概率。

4.根据权利要求3所述的预测未来时间段内患代谢综合征概率的蛋白标志物的应用,其特征在于,将蛋白标志物的相对表达量和受试者的年龄特征输入到已训练的未来时间段代谢综合征概率预测模型中输出预测结果。

5.一种预测未来时间段内患代谢综合征概率的蛋白标志物的应用,其特征在于,包括:通过试剂盒检测受试者蛋白标志物的相对表达量,蛋白标志物的相对表达量与未来时间段内患代谢综合征的概率相关联,其中蛋白标志物选自:P02647_APOA1、P04278_SHBG、P05090_APOD、P04004_VTN、O75882_ATRN、P10909_CLU、P05546_SERPIND1、P04217_A1BG、P02655_APOC2、P01824_IGHV4-39、P04114_APOB的一种或其组合。

6.根据权利要求5所述的预测未来时间段内患代谢综合征概率的蛋白标志物的应用,其特征在于,将蛋白标志物的相对表达量和受试者的年龄特征输入到已训练的未来时间段代谢综合征概率预测模型中输出预测结果。

7.一种未来时间段内患代谢综合征概率预测模型的构建方法,其特征在于,包括:以未来时间段患代谢综合征的受试者和未来时间段未患代谢综合征的受试者的血清样本中的蛋白标志物的相对表达量和受试者的年龄特征作为训练样本训练机器学习模型得到,其中蛋白标志物选自:P02647_APOA1、P04278_SHBG、P05090_APOD、P04004_VTN、O75882_ATRN、P10909_CLU、P05546_SERPIND1、P04217_A1BG、P02655_APOC2、P01824_IGHV4-39、P04114_APOB的一种或其组合,用于预测受试者未来时间段内患患上代谢综合征的概率。

8.一种未来时间段内患代谢综合征概率预测模型,其特征在于,根据权利要求6所述的未来时间段内患代谢综合征概率预测模型的构建方法构建得到。

9.一种根据权利要求1-2所述的预测未来时间段内患代谢综合征概率的试剂盒的用途,其特征在于,对预测结果高于设定阈值的受试者进行健康干预。

10.一种根据权利要求3-4所述的预测未来时间段内患代谢综合征概率的蛋白标志物的用途,其特征在于,对预测结果高于设定阈值的受试者进行健康干预。

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【技术特征摘要】

1.一种预测未来时间段内患代谢综合征概率的试剂盒,其特征在于,包含检测受试者血清中蛋白标志物相对表达量的试剂,其中蛋白标志物选自:p02647_apoa1、p04278_shbg、p05090_apod、p04004_vtn、o75882_atrn、p10909_clu、p05546_serpind1、p04217_a1bg、p02655_apoc2、p01824_ighv4-39、p04114_apob的一种或其组合。

2.根据权利要求1所述的预测未来时间段内患代谢综合征概率的试剂盒,其特征在于,将蛋白标志物的相对表达量和受试者的年龄特征输入到已训练的未来时间段代谢综合征概率预测模型中输出预测结果。

3.一种预测未来时间段内患代谢综合征概率的蛋白标志物,其特征在于,包括:p02647_apoa1、p04278_shbg、p05090_apod、p04004_vtn、o75882_atrn、p10909_clu、p05546_serpind1、p04217_a1bg、p02655_apoc2、p01824_ighv4-39、p04114_apob的一种或其组合,用于结合受试者的年龄特征预测受试者未来时间段患上代谢综合征的概率。

4.根据权利要求3所述的预测未来时间段内患代谢综合征概率的蛋白标志物的应用,其特征在于,将蛋白标志物的相对表达量和受试者的年龄特征输入到已训练的未来时间段代谢综合征概率预测模型中输出预测结果。

5.一种预测未来时间段内患代谢综合征概率的蛋白标志物的应用,其特征在于,包括:通过试剂盒检测受试者蛋白标志物的相对表达量,蛋白标志物的相对表达量与未来时间段内患代谢综合征的概率相关联,其中蛋白标志物选自:p02647_apoa1、p0427...

【专利技术属性】
技术研发人员:郭天南郑钜圣陈裕明蔡雪王博
申请(专利权)人:西湖大学
类型:发明
国别省市:

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