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【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
技术介绍
技术实现思路
【技术保护点】
1.一种组合物,包含多于一种蛋白质复合物,其中所述多于一种蛋白质复合物中的每一种包含转座体和可编程DNA结合单元,所述可编程DNA结合单元能够特异性结合靶双链DNA(dsDNA)上的结合位点,其中所述转座体包含转座酶、第一衔接子和第二衔接子,并且其中所述多于一种蛋白质复合物中的每一种的结合位点彼此不同。
2.根据权利要求1所述的组合物,其中所述多于一种蛋白质复合物中的至少两种包含相同的转座体。
3.根据权利要求1所述的组合物,其中所述多于一种蛋白质复合物全部包含相同的转座体。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的组合物,其中所述多于一种蛋白质复合物全部包含相同的转座酶。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的组合物,其中所述相同的转座体中的所述第一衔接子和所述第二衔接子是相同的。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的组合物,其中不同的转座体中的所述第一衔接子、所述第二衔接子或两者是不同的。
7.根据权利要求1-6中任一项所述的组合物,其中所述第一衔接子、所述第二衔接子或两者是dsDNA或RNA/DNA双链体。<
...【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种组合物,包含多于一种蛋白质复合物,其中所述多于一种蛋白质复合物中的每一种包含转座体和可编程dna结合单元,所述可编程dna结合单元能够特异性结合靶双链dna(dsdna)上的结合位点,其中所述转座体包含转座酶、第一衔接子和第二衔接子,并且其中所述多于一种蛋白质复合物中的每一种的结合位点彼此不同。
2.根据权利要求1所述的组合物,其中所述多于一种蛋白质复合物中的至少两种包含相同的转座体。
3.根据权利要求1所述的组合物,其中所述多于一种蛋白质复合物全部包含相同的转座体。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的组合物,其中所述多于一种蛋白质复合物全部包含相同的转座酶。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的组合物,其中所述相同的转座体中的所述第一衔接子和所述第二衔接子是相同的。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的组合物,其中不同的转座体中的所述第一衔接子、所述第二衔接子或两者是不同的。
7.根据权利要求1-6中任一项所述的组合物,其中所述第一衔接子、所述第二衔接子或两者是dsdna或rna/dna双链体。
8.根据权利要求1-7中任一项所述的组合物,其中所述衔接子的长度为约3-200个碱基对。
9.根据权利要求1-8中任一项所述的组合物,其中所述第一衔接子、所述第二衔接子或两者是测序衔接子。
10.根据权利要求9所述的组合物,其中所述测序衔接子包含p5或p7引物序列。
11.根据权利要求1-10中任一项所述的组合物,其中所述多于一种蛋白质复合物中的至少两种的结合位点位于同一靶dsdna上。
12.根据权利要求11所述的组合物,其中所述多于一种蛋白质复合物中的至少两种的结合位点在同一靶dsdna上相距约1-50000个核苷酸。
13.根据权利要求11所述的组合物,其中一对所述多于一种蛋白质复合物的结合位点之间的距离与另一对所述多于一种蛋白质复合物的结合位点之间的距离基本相同。
14.根据权利要求11所述的组合物,其中一对所述多于一种蛋白质复合物的结合位点之间的距离与另一对所述多于一种蛋白质复合物的结合位点之间的距离不同。
15.根据权利要求1-11中任一项所述的组合物,其中所述多于一种蛋白质复合物中的至少两种的结合位点位于靶dsdna的不同链上。
16.根据权利要求1-15中任一项所述的组合物,其中所述多于一种蛋白质复合物中的至少两种能够特异性结合不同的靶dsdna。
17.根据权利要求1-15中任一项所述的组合物,其中所述多于一种蛋白质复合物能够特异性结合约2-5000种靶dsdna。
18.根据权利要求1-17中任一项所述的组合物,其中所述转座酶是tn5转座酶、tn7转座酶、mariner tc1-样转座酶、himar1c9转座酶或睡美人转座酶。
19.根据权利要求1-18中任一项所述的组合物,其中所述转座酶是超活性转座酶。
20.根据权利要求1-19中任一项所述的组合物,其中所述可编程dna结合单元包含核酸酶缺陷型crispr相关蛋白(dcas蛋白)和能够特异性结合所述靶dsdna的结合位点的指导rna。
21.根据权利要求20所述的组合物,其中所述转座体通过连接所述转座酶和所述dcas蛋白的接头与所述可编程dna结合单元相关联。
22.根据权利要求21所述的组合物,其中所述接头包括肽接头、化学接头或两者。
23.根据权利要求20所述的组合物,其中所述转座酶以包含所述dcas蛋白的融合蛋白存在。
24.根据权利要求20-23中任一项所述的组合物,其中所述dcas蛋白是dcas9、dcas12、dcas13、dcas14或spry dcas。
25.根据权利要求24所述的组合物,其中所述dcas13蛋白是dcas13a、dcas13b、dcas13c或dcas13d。
26.根据权利要求1-19中任一项所述的组合物,其中所述可编程dna结合单元包含能够特异性结合所述靶dsdna上的结合位点的蛋白质组分,其中所述蛋白质组分包含核酸内切酶缺陷型锌指核酸酶(zfn)、核酸内切酶缺陷型转录激活因子样效应核酸酶(talen)、argonaute蛋白、核酸内切酶缺陷型兆核酸酶、重组酶或其组合。
27.根据权利要求26所述的组合物,其中所述转座体通过连接所述转座酶和所述蛋白质组分的接头与所述可编程dna结合单元相关联。
28.根据权利要求27所述的组合物,其中所述接头包括肽接头、化学接头或两者。
29.根据权利要求28所述的组合物,其中所述肽接头包含多于一个甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸、丙氨酸、赖氨酸、谷氨酰胺或其组合。
30.根据权利要求29所述的组合物,其中所述肽接头包含gs接头。
31.根据权利要求28所述的组合物,其中所述肽接头是xten接头。
32.根据权利要求26所述的组合物,其中所述蛋白质组分以包含所述转座酶的融合蛋白存在。
33.一种反应混合物,包含
34.根据权利要求33所述的反应混合物,还包含dna聚合酶、dntp或其组合。
35.根据权利要求33-34中任一项所述的反应混合物,其中所述衔接子共价附接至所述靶dsdna或其片段。
36.根据权利要求33-35中任一项所述的反应混合物,包含多于一种dsdna片段,每种片段分别在每个末端包含所述多于一种蛋白质复合物之一的所述第一衔接子和所述第二衔接子。
37.根据权利要求33-36中任一项所述的反应混合物,其中所述样品核酸包含真核dna、细菌dna、病毒dna、真...
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