一种髓系血液肿瘤检测基因panel的捕获探针及其设计方法、检测方法技术

本发明专利技术提供了一种髓系血液肿瘤检测基因panel的捕获探针及其设计方法、检测方法，属于基因检测技术领域。本发明专利技术的探针包括panelADNA捕获探针和panel B cDNA捕获探针；所述panelADNA捕获探针包括如SEQ ID NO.1～2400所示的核苷酸序列，所述panel B cDNA捕获探针包括如SEQ ID NO.2401～10559所示的核苷酸序列。本发明专利技术的探针可用于检测髓系血液肿瘤检测的全部类型基因，能够一站式解决髓系血液肿瘤基因突变、拷贝数变异、融合基因、基因表达的检测，可以用于临床各个阶段的检测，可移植性强，能够适用于多个检测平台。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及基因检测，尤其涉及一种髓系血液肿瘤检测基因panel的捕获探针及其设计方法、检测方法。

技术介绍

1、髓系血液肿瘤是一类起源于造血干细胞或早期造血祖细胞的恶性肿瘤，包括急性髓系白血病(aml)、慢性髓性白血病(cml)、骨髓增生异常综合征(mds)和骨髓增殖性肿瘤(mpn)等。这些肿瘤的发病率、预后和治疗方案各有不同，但都与髓系细胞的基因异常有关。

2、根据国际癌症研究机构(iarc)的数据，2018年全球有约40.6万人患有髓系血液肿瘤，其中aml占47.6％，cml占19.9％，mds占16.7％，mpn占15.8％。髓系血液肿瘤的发病率随年龄增加而升高，男性高于女性，发达国家高于发展中国家。髓系血液肿瘤的五年生存率因类型和分期而异，一般低于50％。

3、髓系血液肿瘤的诊断主要依赖于临床表现、实验室检查和分子生物学检测。实验室检查包括外周血常规、骨髓涂片、细胞形态学、免疫表型、细胞遗传学和分子生物学等。分子生物学检测是指对髓系细胞中存在的基因突变或融合基因进行分析，以确定肿瘤的类型、分期、预后和治疗方案。现有的分子本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种髓系血液肿瘤检测基因panel的捕获探针，其特征在于，所述捕获探针包括panelADNA捕获探针和panel B cDNA捕获探针；所述panelADNA捕获探针包括如SEQ IDNO.1～2400所示的核苷酸序列，所述panel B cDNA捕获探针包括如SEQ ID NO.2401～10559所示的核苷酸序列。

2.一种权利要求1所述捕获探针在制备髓系血液肿瘤基因的检测试剂或试剂盒中的应用。

3.一种权利要求1所述髓系血液肿瘤检测基因panel的捕获探针的设计方法，其特征在于，包括如下步骤：

4.根据权利要求3所述的设计方法，其特征在于，所...

【技术特征摘要】

1.一种髓系血液肿瘤检测基因panel的捕获探针，其特征在于，所述捕获探针包括paneladna捕获探针和panel b cdna捕获探针；所述paneladna捕获探针包括如seq idno.1～2400所示的核苷酸序列，所述panel b cdna捕获探针包括如seq id no.2401～10559所示的核苷酸序列。

2.一种权利要求1所述捕获探针在制备髓系血液肿瘤基因的检测试剂或试剂盒中的应用。

3.一种权利要求1所述髓系血液肿瘤检测基因panel的捕获探针的设计方法，其特征在于，包括如下步骤：

4.根据权利要求3所述的设计方法，其特征在于，所述panela为髓系血液肿瘤相关突变基因；所述panel b为髓系血液肿瘤相关融合基因、基因表达。

5.根据权利要求4所述的设计方法，其特征在于，所述panela中的基因包括abcb1、ccnd1、dkc1、gfi1、kmt2c、pdgfra、runx1、terc、ankrd26、cdkn2a、dnmt3a、gskip、kras、pdgfrb、samd9、tert、asxl1、cebpa、elane、gstp1、mbd4、phf6、samd9l、tet2、atg2b、crebbp、ep300、hax1、mpl、piga、setbp1、tp53、atrx、csf1r、etnk1、idh1、mthfr、pml、sf3b1、tpmt、bcor、csf3r、etv6、idh2、nf1、ppm1d、sh2b3、u2af1、bc...

【专利技术属性】
技术研发人员：郭珍，吕晓东，李扬威，邹喆，朱广超，张辉，周玲，王军亮，
申请(专利权)人：河南省肿瘤医院，
类型：发明
国别省市：