一种流式细胞仪输出去细胞团信号的方法技术

本发明专利技术提供了一种流式细胞仪输出去细胞团信号的方法

【技术实现步骤摘要】
一种流式细胞仪输出去细胞团信号的方法、介质及系统


[0001]本专利技术属于流式细胞仪
，具体而言，涉及一种流式细胞仪输出去细胞团信号的方法
、
介质及系统
。

技术介绍

[0002]流式细胞术是一种快速
、
高通量的单细胞分析技术
,
广泛应用于基础研究和临床检测中
。
在流式细胞术测量中
,
单个细胞通过流体排成细线
,
逐个通过激光与探测器间截相交的视野区域
,
并记录下各种光学信号
。
根据前向散射光
(FSC)、
侧向散射光
(SSC)
以及荧光信号
,
可以分析每一个细胞的大小
、
内质和表面标记等特征
。
[0003]与单个细胞相比
,
细胞团对流式细胞术的定量分析造成严重干扰
。
细胞团由多个细胞聚集形成
,
其体积更大
,
会产生比单个细胞更强的光学信号
。
这会严重影响后续的定量分析和细胞分类
。
所以
,
识别和去除细胞团是流式细胞数据分析的重要预处理步骤
。
[0004]目前识别细胞团的方法主要有以下两类
:
[0005](1)
基于脉冲形状的方法
。
利用每个细胞或细胞团通过检测区域时产生的脉冲波形信息/>,
如脉冲面积
、
宽度
、
峰值比等
,
设置阈值进行识别
。
这类方法依赖参数设定和经验判定
。
[0006](2)
基于快照图像的方法
。
首先捕获每个事件的微小图像
,
然后通过图像处理技术识别细胞团
。
但这需要存储大量图像
,
运算复杂，成本高适用范围不广
。
[0007]总体来说
,
现有的细胞团识别和去除方法依赖手工设定阈值和参数
,
针对不同样品需要人工调节识别规则
,
无法实现自动化
。

技术实现思路

[0008]有鉴于此，本专利技术提供一种流式细胞仪输出去细胞团信号的方法
、
介质及系统，能够解决现有的细胞团识别和去除方法依赖手工设定阈值和参数
,
针对不同样品需要人工调节识别规则
,
无法实现自动化的技术问题
。
[0009]本专利技术是这样实现的：
[0010]本专利技术的第一方面提供一种流式细胞仪输出去细胞团信号的方法，其中，包括以下步骤：
[0011]S10、
采集流式细胞仪的光电转换器采集的电脉冲信号集合，包括前向散射光生成的电脉冲信号集合
、
侧向散射光生成的电脉冲信号集合以及荧光信号生成的电脉冲信号集合，分别记为
FSC
脉冲集
、SSC
脉冲集以及荧光脉冲集；其中所述电脉冲信号包括时刻
、
长度
、
宽度和面积；
[0012]S20、
根据电脉冲信号将得到的
FSC
脉冲集
、SSC
脉冲集以及荧光脉冲集分别建立
FSC
矩阵
、SSC
脉冲矩阵以及荧光脉冲矩阵；
[0013]S30、
遍历
FSC
脉冲集中的每个电脉冲信号，获取通道值大于第一阈值的电脉冲信号，形成
FSC
大脉冲集；
[0014]S40、
根据
FSC
大脉冲集对
FSC
矩阵
、SSC
脉冲矩阵以及荧光脉冲矩阵进行筛选，得到筛选
FSC
矩阵
、
筛选
SSC
脉冲矩阵以及筛选荧光脉冲矩阵；
[0015]S50、
将得到的筛选
FSC
矩阵
、
筛选
SSC
脉冲矩阵以及筛选荧光脉冲矩阵建立聚合矩阵；
[0016]S60、
利用预先训练好的细胞团分析模型对聚合矩阵进行分析，得到所述聚合矩阵中的对应细胞团的电脉冲信号；
[0017]S70、
在所述电脉冲信号集合中删除对应细胞团的电脉冲信号，并将得到的电脉冲信号集合输出给流式细胞仪的数据处理系统
。
[0018]本专利技术提供的一种流式细胞仪输出去细胞团信号的方法的技术效果如下：由于对于每个细胞或细胞团
FSC、SSC、
荧光信号之间存在一定联系，比如细胞团相对体积大，内部结构也更为复杂，因此，
FSC、SSC
会产生一定的关联，同时细胞团的荧光信号会由于细胞团的荧光染料相对较多，也会产生与普通细胞不一样的通道值，简单的采用人工判断，由于数据量太大，选取的阈值也会不够精准，因此，利用多通道融合的办法，利用聚合矩阵进行多特征提取分析，能够更好的确定细胞团信号
。
[0019]在上述技术方案的基础上，本专利技术的一种流式细胞仪输出去细胞团信号的方法还可以做如下改进
:
[0020]其中，所述根据电脉冲信号将得到的
FSC
脉冲集
、SSC
脉冲集以及荧光脉冲集分别建立
FSC
矩阵
、SSC
脉冲矩阵以及荧光脉冲矩阵的步骤中，还包括对电脉冲信号进行消除噪声点的步骤
。
[0021]其中，所述遍历
FSC
脉冲集中的每个电脉冲信号，获取通道值大于第一阈值的电脉冲信号，形成
FSC
大脉冲集的步骤，具体包括：
[0022]遍历
FSC
脉冲集
,
提取
FSC
通道值大于第一阈值的脉冲信号作为第一脉冲集；
[0023]计算第一脉冲集的脉冲间距离
,
合并相邻脉冲；
[0024]对合并相邻脉冲后的第一脉冲集进行平滑滤波处理；
[0025]对平滑滤波处理后的第一脉冲集采用
PCA
的方法降维
[0026]以降维后的第一脉冲集座位
FSC
大脉冲集
。
[0027]默认的，所述第一阈值设置为
FSC
基线噪声的3倍
。
[0028]其中，所述根据
FSC
大脉冲集对
FSC
矩阵
、SSC
脉冲矩阵以及荧光脉冲矩阵进行筛选，得到筛选
FSC
矩阵
、
筛选
SSC
脉冲矩阵以及筛选荧光脉冲矩阵的步骤，具体包括：...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种流式细胞仪输出去细胞团信号的方法，其特征在于，包括以下步骤：
S10、
采集流式细胞仪的光电转换器采集的电脉冲信号集合，包括前向散射光生成的电脉冲信号集合
、
侧向散射光生成的电脉冲信号集合以及荧光信号生成的电脉冲信号集合，分别记为
FSC
脉冲集
、SSC
脉冲集以及荧光脉冲集；其中所述电脉冲信号包括时刻
、
长度
、
宽度和面积；
S20、
根据电脉冲信号将得到的
FSC
脉冲集
、SSC
脉冲集以及荧光脉冲集分别建立
FSC
矩阵
、SSC
脉冲矩阵以及荧光脉冲矩阵；
S30、
遍历
FSC
脉冲集中的每个电脉冲信号，获取通道值大于第一阈值的电脉冲信号，形成
FSC
大脉冲集；
S40、
根据
FSC
大脉冲集对
FSC
矩阵
、SSC
脉冲矩阵以及荧光脉冲矩阵进行筛选，得到筛选
FSC
矩阵
、
筛选
SSC
脉冲矩阵以及筛选荧光脉冲矩阵；
S50、
将得到的筛选
FSC
矩阵
、
筛选
SSC
脉冲矩阵以及筛选荧光脉冲矩阵建立聚合矩阵；
S60、
利用预先训练好的细胞团分析模型对聚合矩阵进行分析，得到所述聚合矩阵中的对应细胞团的电脉冲信号；
S70、
在所述电脉冲信号集合中删除对应细胞团的电脉冲信号，并将得到的电脉冲信号集合输出给流式细胞仪的数据处理系统
。2.
根据权利要求1所述的一种流式细胞仪输出去细胞团信号的方法，其特征在于，所述根据电脉冲信号将得到的
FSC
脉冲集
、SSC
脉冲集以及荧光脉冲集分别建立
FSC
矩阵
、SSC
脉冲矩阵以及荧光脉冲矩阵的步骤中，还包括对电脉冲信号进行消除噪声点的步骤
。3.
根据权利要求1所述的一种流式细胞仪输出去细胞团信号的方法，其特征在于，所述遍历
FSC
脉冲集中的每个电脉冲信号，获取通道值大于第一阈值的电脉冲信号，形成
FSC
大脉冲集的步骤，具体包括：遍历
FSC
脉冲集
,
提取
FSC
通道值大于第一阈值的脉冲信号作为第一脉冲集；计算第一脉冲集的脉冲间距离
,
合并相邻脉冲；对合并相邻脉冲后的第一脉冲...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵国强，纪存朋，孙树梁，王硕硕，孙谧，
申请(专利权)人：青岛瑞斯凯尔生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：