与大豆籽粒油分含量相关的制造技术

本发明专利技术属于大豆分子生物学及分子育种技术领域，具体涉及一种与大豆籽粒油分含量相关的

【技术实现步骤摘要】
Wm82.a2.v1)
，该
SNP
位点属于共显性的标记，可靠且使用方便，这为大豆高产及品质改良育种工作提供了极大的便利
。
[0008]本专利技术提供的具体技术方案如下：本专利技术第一方面，提供一种与大豆籽粒油分含量相关的
SNP
位点，所述
SNP
位点位于
18
号染色体的
57242007
位，多态性为
T/C。
[0009]本专利技术第二方面，提供一种含有所述
SNP
位点的分子标记
。
[0010]本专利技术第三方面，提供一种扩增所述分子标记的引物对，所述引物对包括正向引物及反向引物，所述正向引物为：5’‑ꢀ
GATTGCCTGCTCTCTCTGATG
ꢀ‑3’
，所述反向引物为：5’‑ꢀ
ACCTGCAGCAGAAAAAGGAA
ꢀ‑3’
。
[0011]本专利技术第四方面，提供一种试剂盒，其包括所述引物对
。
[0012]本专利技术第五方面，提供一种所述
SNP
位点
、
所述分子标记
、
所述引物对或所述试剂盒在鉴定大豆油分含量高低中的用途
。
[0013]优选地，鉴定大豆油分含量高低是按照以下步骤进行：提取待测材料基因组
DNA
；以所述大豆基因组
DNA
为模版，利用所述引物对进行
PCR
扩增，得到扩增产物；将所述扩增产物进行测序分析，根据所述测序分析的结果判断大豆油分含量的高低
。
[0014]优选地，
PCR
扩增体系为：总体积为
20
μ
L
，包括
10~50ng
基因组模板
DNA 3
μ
L
，
10
μ
L Quick Taq HS DyeMix
，
10 pmol
的引物各2μ
L
和
ddH2O 3
μ
L。
[0015]优选地，
PCR
扩增条件为：
94℃
预变性
30s
，
94℃
变性
30s
，
57℃
退火
30s
，
72℃
延伸
1min
；循环
30
次；
72℃
终延伸
10min。
[0016]优选地，当扩增产物自5’
端第
105
位为
T
，判定为高油分含量大豆品种；当扩增产物自5’
端第
105
位为
C
，判定为低油分含量大豆品种
。
[0017]对比现有技术，本专利技术的有益效果为：本专利技术的
18
号染色体的
57242
±
50kb
的区间都是调控大豆油分含量的理想标记区间，其中
57242007
位
SNP
的油分含量遗传贡献率为 13.09~16.22%
，加性效应为
0.86~0.87%。2020
年有
75.45 %
在该位点为
T
的品系的油分含量高于在该位点为
C
的品系中油分含量，
2022
年有
73.65%
在该位点为
T
的品系的油分含量高于在该位点为
C
的品系中油分含量，精确度可达
73.65%
，大大减少了选择成本，提高了品质改良的效率
。
附图说明
[0018]图1为基于
SNP
并通过
admixture
软件得到的关联群体的群体结构图；图2为
334
份关联群体2年
(E1:2020
年，
E2
：
2022
年
) 油分含量
(Oil)
，横坐标表示大豆籽粒油分含量，纵坐标表示样品个体数；图3为
334
份自然群体2年
(E1:2020
年，
E2
：
2022
年
) 大豆油分含量的
MLM
关联分析结果曼哈顿图；图4为
334
份自然群体2年
(E1:2020
年，
E2
：
2022
年
)
大豆油分含量的分子标记对应的大豆油分含量差异
Box
图
。
具体实施方式
[0019]下面结合具体实施方式对本专利技术进行进一步的详细描述，给出的实施例仅为了阐明本专利技术，而不是为了限制本专利技术的范围
。
下述实施例中的实验方法，如无特殊说明，均为常规方法，下述实施例中所用的材料
、
试剂等，如无特殊说明，均可从商业途径得到
。
[0020]本专利技术中收集测定我国
40
°
N
以北的大豆种质资源
3000
份，均由吉林省农业科学院大豆研究所栽培大豆种质资源研究团队组收集
、
评价，并保存于吉林省农业科学院种质资源库
。
[0021]若未特别指明，实施例中所用的技术手段为本领域技术人员所熟知的常规手段
。
[0022]实施例1大豆种子油分含量关联群体的构建及性状测定使用大豆种质资源库内
3000
份种质资源，其来源地涵盖我国高纬度大豆主产区的大部分，包括黑龙江省
、
吉林省
、
辽宁省
、
内蒙古
、
新疆等
。
田间种植
3000
份资源，待种子完全成熟后，收获种子，每个品种随机选取
20
粒有代表性的种子进行测量
。3000
份资源的油分含量在群体内符合正态分布，遗传多样指数为
1.95。
从中抽取
334
份资源，油分含量遗传多样指数仍为
1.95
，将
334
资源作为关联群体
。
其操作步骤如下：根据群体油分含量平均值（
X
）和标准差（
δ
）分为
10
类群，1类
<X
‑2δ
，
10
类
≥X+2
δ
，中间每类相差
0.5
δ
。
各性状的遗传多样性采用
Shannon's
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种与大豆籽粒油分含量相关的
SNP
位点，其特征在于，所述
SNP
位点位于
18
号染色体的
57242007
位，多态性为
T/C。2.
一种含有权利要求1所述
SNP
位点的分子标记
。3.
一种扩增权利要求2所述分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对包括正向引物及反向引物，所述正向引物为：5’‑ꢀ
GATTGCCTGCTCTCTCTGATG
ꢀ‑3’
，所述反向引物为：5’‑ꢀ
ACCTGCAGCAGAAAAAGGAA
ꢀ‑3’
。4.
一种试剂盒，其特征在于，其包括权利要求3所述引物对
。5.
一种权利要求1所述
SNP
位点
、
权利要求2所述分子标记
、
权利要求3所述引物对或权利要求4所述试剂盒在鉴定大豆油分含量高低中的用途
。6.
根据权利要求5所述的用途，其特征在于，鉴定大豆油分含量高低是按照以下步骤进行：提取待测材料基因组
DNA
；以所述大豆基因组
DNA
为模版，利用所述引物对进行
PCR
扩增，得到扩增产物；将所述扩增产物进行测序分析，根据所述测序分析的结果判断大豆油分含量的高低
。7....

【专利技术属性】
技术研发人员：刘德泉，郝文媛，王跃强，王新风，马晓萍，崔正果，候云龙，陈健，聂波涛，
申请(专利权)人：吉林省农业科学院中国农业科技东北创新中心，
类型：发明
国别省市：