四倍体月季花青素含量连锁的制造技术

本发明专利技术涉及分子标记技术领域，尤其涉及四倍体月季花青素含量连锁的

【技术实现步骤摘要】
四倍体月季花青素含量连锁的SNP分子标记及其应用


[0001]本专利技术涉及分子标记
，尤其涉及四倍体月季花青素含量连锁的
SNP
分子标记及其应用
。

技术介绍

[0002]类黄酮包括花青素和黄酮醇，其广泛存在于月季花瓣中
。
月季花瓣中的红色主要由花青素所赋予，黄酮醇在所有颜色的花瓣中均有存在
。
相关研究结果发现月季花瓣中的花青素苷元主要有三种，分别是天竺葵素
、
矢车菊素和芍药素，主要在
3,5
‑
位或3‑
位发生葡萄糖糖基化
(Biolley and Jay,1993
；
Mikanagi et al.,2000
；
Valentina et al.,2009
；
Lee et al.,2011)。
借助于基因组学研究的高速发展，
Schulz
等
(2016)
对月季花瓣中的花青素和类胡萝卜素进行了全基因组关联分析，以野草莓
(Fragaria vesca)
和桃
(Prunus persica)
的基因组为参考，将色素合成途径上的关键基因定位在野草莓4号染色体和桃1号染色体上
。Raymond
等
(2018)
挖掘基因组数据并结合深入的生理生化分析，确定了与月季色香代谢相关的萜类途径中的部分生物合成通路，类黄酮合成通路上的关键基因被成功注释
。
接下来，基于多组学技术进行月季类胡萝卜素代谢相关基因的精细定位成为可能
。
[0003]因二倍体月季基因组的破译，二倍体遗传图谱的构建相对于四倍体来说更为简单
、
完整，在基因定位过程中可保证结果相对准确
。
月季节段异源多倍体的遗传背景，在四倍体水平的研究相对二倍体较为缺乏，然而，现代月季的育种和生产主要集中在四倍体水平下进行，倍性的差异造成了基于二倍体图谱的研究结果转化效率低
。
因此，在测序技术和分析手段高速发展的当下，四倍体水平的
QTL
定位研究对于月季的生产和应用具有更大的帮助
。
[0004]虽然控制月季花色形成的一些基因被成功克隆及验证，但因缺乏高效的遗传转化体系，目前仍利用传统杂交育种进行品种改良，进程相对较慢且具有不确定性
。
对于花色创新性育种来说，仅靠传统杂交育种远远无法达到更高的育种目标，因此需要借助分子标记辅助育种，以精准
、
高效的手段培育更多新优品种
。
目前缺少一种四倍体月季花青素含量连锁的
SNP
分子标记
。

技术实现思路

[0005]本专利技术提供四倍体月季花青素含量连锁的
SNP
分子标记及其应用
。
[0006]本专利技术提供与月季花瓣花青素含量相关的
SNP
标记，所述
SNP
标记位于月季第
2A
号染色体第
255039
位，该处碱基为
T
或
C。SNP
位点参考基因组为月季
‘
云蒸霞蔚
’
参考基因组
(ID:PRJNA946887)。
[0007]优选的，所述
SNP
标记含有如
SEQ ID NO.5
所示的核苷酸序列；多态性位点位于如
SEQ ID NO.5
所示序列的第
40
位；
[0008]SEQ ID NO.5
：
[0009][0010]进一步优选的，所述
SNP
标记含有如
SEQ ID NO.6
所示的核苷酸序列；多态性位点位于如
SEQ ID NO.6
所示序列的第
50
位；
[0011]SEQ ID NO.6
：
[0012][0013]再优选的，所述
SNP
标记含有如
SEQ ID NO.7
所示的核苷酸序列；多态性位点位于如
SEQ ID NO.7
所示序列的第
60
位；
[0014]SEQ ID NO.7
：
[0015][0016]更优选的，所述
SNP
标记含有如
SEQ ID NO.8
所示的核苷酸序列；多态性位点位于如
SEQ ID NO.8
所示序列的第
70
位；
[0017]SEQ ID NO.8
：
[0018][0019]更进一步的，所述
SNP
标记含有如
SEQ ID NO.1
所示的核苷酸序列；多态性位点位于如
SEQ ID NO.1
所示序列的第
101
位，多态性为
T/C。
[0020]根据所述
SNP
标记，
TT
基因型对应的月季花瓣具有较低的花青素含量；
CT
基因型对应的月季花瓣具有较高的花青素含量
。
[0021]本专利技术还提供一种引物，用于扩增所述
SNP
标记
。
[0022]根据所述引物，包括：
SEQ ID NO.2
‑
4。
[0023]本专利技术还提供含有所述引物的检测产品，所述检测产品为检测试剂
、
试剂盒或基因芯片
。
[0024]本专利技术还提供所述
SNP
标记
、
所述引物
、
或所述检测产品在鉴定和
/
或筛选月季花瓣花青素含量性状中的应用
。
[0025]根据所述应用，
TT
基因型对应的月季花瓣具有较低的花青素含量；
CT
基因型对应的月季花瓣具有较高的花青素含量；
[0026]优选的，
TT
基因型月季花瓣的花青素含量在0～
23.62ug/g
之间，
CT
基因型月季花瓣的花青素含量在
139.02ug/g
～
3509.9ug/g
之间
。
[0027]根据所述应用，包括以下步骤：
1)
提取待测月季花瓣的基因组
DNA
；
[0028]2)
以待测月季花瓣的基因组
DNA
为模板，利用所述引物进行
PCR
扩增反应；
[0029]3)
分析
PCR
扩增产物
。
[0030]根据所述
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
与月季花瓣花青素含量相关的
SNP
标记，其特征在于，所述
SNP
标记位于月季第
2A
号染色体第
255039
位，该处碱基为
T
或
C
；优选的，所述
SNP
标记含有如
SEQ ID NO.5
所示的核苷酸序列；多态性位点位于如
SEQ ID NO.5
所示序列的第
40
位；进一步优选的，所述
SNP
标记含有如
SEQ ID NO.6
所示的核苷酸序列；多态性位点位于如
SEQ ID NO.6
所示序列的第
50
位；再优选的，所述
SNP
标记含有如
SEQ ID NO.7
所示的核苷酸序列；多态性位点位于如
SEQ ID NO.7
所示序列的第
60
位；更优选的，所述
SNP
标记含有如
SEQ ID NO.8
所示的核苷酸序列；多态性位点位于如
SEQ ID NO.8
所示序列的第
70
位；更进一步的，所述
SNP
标记含有如
SEQ ID NO.1
所示的核苷酸序列；多态性位点位于如
SEQ ID NO.1
所示序列的第
101
位
。2.
根据权利要求1所述
SNP
标记，其特征在于，
TT
基因型对应的月季花瓣具有较低的花青素含量；
CT
基因型对应的月季花瓣具有较高的花青素含量
。3.
一种引物，其特征在于，用于扩增权利要求1‑2任一项所述
SNP
标记
。4.
根据权利要求3所述引物，其特征在于，包括：
SEQ ID NO.2
‑
4。5.
含有权利要求3或4所述引物的检测产品，所述检测产品为检测试剂
、
试剂盒或基因芯片
。6.
权利要求1或2所述
SNP
标记
、
权利要求3或4所述引物
、
或权利要求5所述检测产品在鉴定和
/
...

【专利技术属性】
技术研发人员：于超，程璧瑄，罗乐，潘会堂，张启翔，
申请(专利权)人：北京林业大学，
类型：发明
国别省市：