用于石竹花序分枝数量性状鉴定的制造技术

本发明专利技术公开了用于石竹花序分枝数量性状鉴定的

【技术实现步骤摘要】
用于石竹花序分枝数量性状鉴定的InDel分子标记、引物及其应用


[0001]本专利技术涉及分子生物学及遗传育种
，具体涉及用于石竹花序分枝数量性状鉴定的
InDel
分子标记
、
引物及其应用
。

技术介绍

[0002]石竹属
(Dianthus spp.)
植物色彩艳丽，花型丰富，广泛应用于花坛
、
花境等园林绿化当中，具有很高的园林观赏价值
。
花序分枝作为重要的农艺性状，直接影响石竹属花卉的观赏品质，培育花序分枝多的石竹品种是石竹属植物重要的育种目标之一
。
石竹属中的须苞石竹
(D.barbatus)
因其花序分枝多而花量大，色彩艳丽，花姿优美，近年来备受人们喜爱；而中国石竹
(D.chinensis)
的花序多为单生或成数朵聚伞花序，单枝上的花量远不及须苞石竹
。
[0003]石竹属植物的育种方法以杂交优势育种和常规杂交育种为主，而根据杂交后代的表型性状进行筛选的传统育种方法耗时3‑6年不等，严重限制了育种效率和新品种的研发
。
[0004]DNA
分子标记是继传统的表型标记
、
细胞学标记
、
生化标记之后发展起来的以
DNA
为基础的遗传标记技术，因其准确性强
、
多态性高等的技术特点，
DNA
分子标记技术已经迅速广泛应用在各领域中
(
陈星，高子厚
.DNA
分子标记技术的研究与应用
.
分子植物育种，
2019
，
17:1970
‑
1977)。InDel
是指在相同物种或者近缘物种之间，在基因组相同位点上，有不同长度
DNA
片段的插入或缺失的差异
(
杨洁，赫佳，王丹碧，施恩，杨文宇，耿其芳，王中生
.InDel
标记的研究和应用进展
.
生物多样性，
2016
，
24:237
‑
243)。InDel
的多态性可以通过在基因组的
InDel
位点两侧设计特异引物进行扩增来展现，其本质仍属于长度多态性标记
。InDel
在基因组中密度大
、
分布广，同时
InDel
标记准确性高
、
稳定性好，能够对
DNA
样品进行有效分型，已被广泛应用于遗传分析
、
分子辅助育种
、
基因精细定位
、
筛选功能基因等研究中
。
[0005]此前石竹花序分枝性状的研究不多，相关分子标记报道较少，无可靠方法对石竹杂交后代的花序分枝数量性状进行早期鉴定
。
因此，有必要进一步开发与石竹花序分枝性状连锁的分子标记，辅助
、
加速石竹育种工作
。

技术实现思路

[0006]本专利技术的目的是提供用于石竹花序分枝数量性状鉴定的
InDel
分子标记，本专利技术的分子标记位于基因组版本为
ASM2309106v1
的香石竹
13
号染色体
33,550,079
～
33,55,081bp
处
。
[0007]本专利技术的另一个目的在于提供了用于石竹花序分枝数量性状鉴定的
InDel
分子标记的检测引物
。
[0008]本专利技术的最后一个目的在于提供了上述引物在石竹花序分枝数量性状鉴定中的应用
。
为了达到上述目的，申请人采取以下技术措施：
[0009]申请人选取亲本材料为花序分枝多的须苞石竹
(D.barbatus)
‘
XB
’
，序分枝少的中国石竹
(D.chinensis)
‘
MH
’
，以及
‘
XB
’ב
MH
’
获得的
F2代分离群体作为筛选群体，通过混合群体分离法
(BSA)
全基因组重测序，
BSA
分析，定位区间内
InDel
标记的开发，最终获得了一种用于石竹花序分枝多
、
少性状鉴定的
InDel
分子标记，其为
Indel
‑
29
，位于基因组版本为
ASM2309106v1
的香石竹
13
号染色体
33,550,079
～
33,55,081bp
处，当石竹
13
号染色体
33,550,079
～
33,55,081bp
为
CTA
时，对应于石竹为花序多分枝性状，当石竹
13
号染色体
33,550,079
～
33,55,081bp
为
CTAGACATTAATTTATATAATTAATGGATCATA
时，对应于石竹为花序少分枝性状
。
[0010]进一步的，申请人根据上述分子标记，设计了一组检测引物，如下：
[0011]正向引物
Indel
‑
29 F
：5’‑
TGTATCTCAATCGGTCCTAAC
‑3’
[0012]反向引物
Indel
‑
29 R
：5’‑
TTTACCACGACACCTTTATCT
‑3’
[0013]利用上述引物，对待测样品的
DNA
进行扩增，若产物片段大小只为
208bp
，则待测石竹为花序多分枝性状；若产物片段大小存在
238bp
，则待测石竹为花序少分枝性状
。
[0014]本专利技术的保护范围包括：
[0015]检测分子标记的引物在石竹花序分枝多少判定中的应用，所述的分子标记位于基因组版本为
ASM2309106v1
的香石竹
13
号染色体
33,550,079
～
33,55,081bp
处
。
[0016]以上所述的应用中，优选的，所述的引物为：
[0017]正向引物
Indel
‑
29 F
：5’‑
TGTATCTCAATCGGTCCTAAC
‑3’
[0018]反向引物
Indel
‑
29 R
：5’‑
TTTACCACGAC本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
检测分子标记的引物在石竹花序分枝多少判定中的应用，所述的分子标记位于基因组版本为
ASM2309106v1
的香石竹
13
号染色体
33,550,079
～
33,55,081bp
处
。2.
检测分子标记的引物在石竹花序分枝性状育种中的应用，所述的分子标记位于基因组版本为
ASM2309106v1
的香石竹
13
号染色体
33...

【专利技术属性】
技术研发人员：傅小鹏，王泽浩，周雯洁，林胜男，柳建宜，刘维超，包满珠，
申请(专利权)人：华中农业大学，
类型：发明
国别省市：