流通池和方法技术

流通池的示例包括基底和在该基底的表面的至少一部分上的两种不同硅烷的图案

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】流通池和方法
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求
2021
年4月
30
日提交的美国临时申请序列号
63/182,370
的权益，该美国临时申请的内容全文以引用方式并入本文
。
[0003]序列表的参考
[0004]通过
EFS
‑
Web
提交的序列表在此以引用的方式整体并入本文
。
文件名称是
ILI214BPCT_IP
‑
2090
‑
PCT_Sequence_Listing_ST25.txt
，文件的大小为
3,011
字节，并且文件的创建日期为
2022
年4月
12
日
。

技术介绍

[0005]聚合物或水凝胶涂覆的基底用于许多技术应用中
。
在一个示例中，植入式医疗装置可涂覆有生物惰性聚合物
。
在另一个示例中，伤口敷料可涂覆有薄的水凝胶层
。
在又一个示例中，涂覆有聚合物或水凝胶的基底可用于生物分子的制备和
/
或分析
。
一些分子分析，诸如某些核酸测序方法，涉及将核酸链附接到基底的涂覆有聚合物或水凝胶的表面
。

技术实现思路

[0006]本文公开了一种流通池，该流通池包括基底和在该基底上呈一定图案的正交聚合物
。
如本文所用，术语“正交聚合物”是指两种不同的聚合物，这些聚合物中的每一者具有用于附接到基底和附接到不同引物组的不同官能团
。
因此，聚合物具有正交官能度
。
在一些情况下，每种聚合物具有不同类型的官能团，这些官能团能够附接基底和引物组两者
。
在其他情况下，每种聚合物具有至少两种不同类型的官能团，其中一种能够附接基底，并且其中另一种能够附接引物组
。
聚合物的正交性可在聚合物合成期间得到控制，因此使得聚合物能够被设计用于特定的流通池应用
。
此外，聚合物的正交性使得不同的聚合物能够同时地并且以期望的图案施加在整个基底上
。
同时应用可导致流通池制造中更流线型的工作流
。
附图说明
[0007]通过参考以下具体实施方式和附图，本公开的示例的特征将变得显而易见，其中类似的附图标号对应于类似但可能不相同的部件
。
为了简洁起见，具有先前描述的功能的附图标号或特征可结合或可不结合它们出现的其他附图来描述
。
[0008]图1是正交聚合物和分别附接到正交聚合物的不同引物组的一个示例的示意图，其中不同引物组使得两条不同模板链能够被扩增并聚集在相邻的正交聚合物上；
[0009]图
2A
至图
2D
是附接到正交聚合物的第一引物组和第二引物组的不同示例的示意图，其中不同的引物组能够在相邻的正交聚合物上产生正向链和反向链；
[0010]图
3A
是流通池的示例的顶视图；
[0011]图
3B
和图
3C
是描绘流通池的流动通道中的凹入部以及该凹入部内的正交聚合物的不同示例的放大顶视图；
[0012]图
4A
至图
4H
是一起示出了用于制备本文所公开的流通池的示例的方法的示例的
示意图；
[0013]图
5A
至图
5H
是一起示出了用于制备本文所公开的流通池的示例的方法的另一个示例的示意图；
[0014]图6是示出了用于制备本文所公开的流通池的示例的方法的另一个示例的流程图；并且
[0015]图7是描绘使用本文所公开的两个示例性聚合物的
Cal Fluor
红
(CFR)
测定的结果的图
。
具体实施方式
[0016]本文所公开的流通池的示例包括在基底表面上图案化的正交聚合物
。
正交聚合物具有正交官能团，例如用于附接到基底表面和用于附接到不同引物组的不同官能团
。
不同的基底附接机制允许聚合物以期望的图案同时施加和附接在基底表面上
。
不同的引物组附接机制扩展了流通池的测序能力，因为不同的引物组附接在基底表面上的不同位置处
。
这使得能够同时进行配对末端测序
。
更进一步地，每种聚合物的官能度在其合成期间是可控制的，这使得最终聚合物能够具有多个靶向和调节的官能度
。
[0017]定义
[0018]应当理解，除非另外指明，否则本文所用的术语将理解为具有其在相关领域中的普通含义
。
下面列出本文所用的若干术语及其含义
。
[0019]除非上下文另有明确指示，否则单数形式“一个”、“一种”和“该”包括复数指代
。
[0020]术语包含
、
包括
、
容纳和这些术语的各种形式彼此同义，并且意在是同样宽泛的
。
[0021]术语顶部
、
底部
、
下部
、
上部
、
上等在本文中用于描述流通池和
/
或流通池的各个部件
。
应当理解，这些方向术语并非意在暗示特定取向，而是用于指定部件之间的相对取向
。
方向术语的使用不应被解释为将本文所公开的示例限制于任何特定取向
。
[0022]术语第一
、
第二等也并非意在暗示特定的取向或顺序，而是用于将一个部件与另一个部件区分开来
。
[0023]应当理解，本文提供的范围包括规定范围和规定范围内的任何值或子范围，如同此类值或子范围被明确列举一样
。
例如，约
400nm
至约1μ
m(1000nm)
的范围应被解释为不仅包括明确列举的约
400nm
至约1μ
m
的限值，而且包括单个值，诸如约
708nm、
约
945.5nm
等，以及子范围，诸如约
425nm
至约
825nm、
约
550nm
至约
940nm
等
。
另外，当利用“约”和
/
或“基本上”来描述值时，它们意在涵盖与该值的微小变化
(
高达
+/
‑
10
％
)。
[0024]“丙烯酰胺”是具有以下结构的官能团：其中每个
H
可以另选地是烷基
、
烷基氨基
、
烷基酰氨基
、
烷基硫基...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.
一种流通池，所述流通池包括：基底；在所述基底的表面的至少一部分上的两种不同硅烷的图案；附接到所述两种不同硅烷中的第一硅烷的第一聚合物；附接到所述两种不同硅烷中的第二硅烷的第二聚合物，所述第一聚合物和所述第二聚合物分别包含官能团对的第一官能团和第二官能团，所述官能团对选自活化酯官能团和叠氮化物官能团
、
四嗪官能团和活化酯官能团，以及四嗪官能团和叠氮化物官能团；接枝到所述第一聚合物的第一引物组；和接枝到所述第二聚合物的第二引物组，其中所述第一引物组和所述第二引物组是不同的
。2.
根据权利要求1所述的流通池，其中：所述第一聚合物是第一均聚物并且所述第一官能团是所述活化酯官能团；并且所述第二聚合物是第二均聚物并且所述第二官能团是所述叠氮化物官能团
。3.
根据权利要求1所述的流通池，其中：所述第一聚合物是第一均聚物并且所述第一官能团是所述四嗪官能团；并且所述第二聚合物是第二均聚物并且所述第二官能团是所述活化酯官能团
。4.
根据权利要求1所述的流通池，其中：所述第一聚合物是第一均聚物并且所述第一官能团是所述四嗪官能团；并且所述第二聚合物是第二均聚物并且所述第二官能团是所述叠氮化物官能团
。5.
根据权利要求1所述的流通池，其中：所述第一聚合物是第一共聚物，所述第一官能团是所述四嗪官能团，并且所述第一共聚物还包含附加官能团，所述附加官能团包括叠氮化物；并且所述第二聚合物是第二共聚物，所述第二官能团是所述活化酯官能团，并且所述第二共聚物还包含附加官能团，所述附加官能团包括芳基碘化物
。6.
根据权利要求1所述的流通池，其中：所述第一聚合物是第一共聚物，所述第一官能团是所述叠氮化物官能团，并且所述第一共聚物还包含附加官能团，所述附加官能团包括丙烯酰胺；并且所述第二聚合物是第二共聚物，所述第二官能团是所述活化酯官能团，并且所述第二共聚物还包含附加官能团，所述附加官能团包括丙烯酰胺
。7.
根据权利要求1所述的流通池，其中：所述第一聚合物是第一三元共聚物，所述第一官能团是所述四嗪官能团并且所述第一三元共聚物还包含两个附加官能团，所述附加官能团包括叠氮化物和丙烯酰胺；并且所述第二聚合物是第二三元共聚物，所述第二官能团是所述活化酯官能团并且所述第二三元共聚物包含两个附加官能团，所述附加官能团包括芳基碘化物和丙烯酰胺
。8.
根据权利要求1所述的流通池，其中所述两种不同的硅烷选自氨基硅烷和炔基硅烷
、
降冰片烯硅烷和氨基硅烷，以及降冰片烯硅烷和炔基硅烷
。9.
一种方法，所述方法包括：在基底的表面的至少一部分上产生两种不同硅烷的图案；同时沉积第一聚合物和第二聚合物，由此所述第一聚合物附接到所述两种不同硅烷中
的第一硅烷，并且所述第二聚合物附接到所述两种不同硅烷中的第二硅烷；以及同时将第一引物组接枝到所述第一聚合物并将第二引物组接枝到所述第二聚合物，其中所述第一引物组和所述第二引物组是不同的
。10.
根据权利要求9所述的方法，其中产生所述两种不同硅烷的所述图案涉及：将所述两种不同硅烷中的所述第一硅烷沉积在所述基底的所述表面的至少所述部分上；在所述两种不同硅烷中的所述第一硅烷上施加光刻胶；使所述光刻胶显影，以限定包括所述两种不同硅烷中的所述第一硅烷的暴露部分和所述两种不同硅烷中的所述第一硅烷的覆盖部分的图案；转化所述两种不同硅烷中的所述第一硅烷的所述暴露部分的官能团以形成所述两种不同硅烷中的所述第二硅烷；以及去除所述光致抗蚀剂
。11.
根据权利要求9所述的方法，其中产生所述两种不同硅烷的所述图案涉及：将所述两种不同硅烷中的所述第一硅烷沉积在所述基底的所述表面的至少所述部分上；在所述两种不同硅烷中的所述第一硅烷上施加光刻胶；使所述光刻胶显影，以限定包括所述两种不同硅烷中的所述第一硅烷的暴露部分和所述两种不同硅烷中的所述第一硅烷的覆盖部分的图案；去除所述两种不同硅烷中的所述第一硅烷的所述暴露部分，以露出对应的暴露基底部分；将所述两种不同硅烷中的所述第二硅烷沉积在所述对应的暴露基底部分上；以及去除所述光致抗蚀剂
。12.
根据权利要求9所述的方法，还包括合成所述第一聚合物和所述第二聚合物，使得所述第一聚合物和所述第二聚合物分别包含官能团对的第一官能团和第二官能团，所述官能团对选自活化酯官能团和叠氮化物官能团
、
四嗪官能团和活化酯官能团，以及四嗪官能团和叠氮化物官能团
。13.
根据权利要求
12
所述的方法，其中所述合成涉及可逆加成
‑
断裂链转移聚合
。14.
根据权利要求
12
所述的方法，其中：所述第一聚合物的所述合成涉及包含所述活化酯官能团的第一单体的聚合，并且所述第一单体选自丙烯酸五氟苯酯
、
甲基丙烯酸五氟苯酯和乙烯基二甲基吖内酯；并且所述第二聚合物的所述合成涉及包含所述叠氮化物官能团的第二单体的聚合，并且所述第二单体具有结构
I
：
其中
R1为氢或烷基；
R2为氢或烷基；
L
为包括直链的接头，所述直链具有2至
20
个选自碳
、
氧和氮的原子以及链中的碳和任何氮原子上的任选取代基；
A
为具有以下结构
II
的
N
取代的酰胺：其中
R3为氢或烷基；
E
为直链，所述直链具有1至4个选自碳
、
氧和氮的原子以及链中的碳和任何氮原子上的任选取代基；并且
Z
为任选的含氮杂环
。15.
根据权利要求
14
所述的方法，其中：所述第一聚合物的所述合成涉及所述第一单体和具有以下结构
III
的第一丙烯酰胺单体的聚合：其中
R4和
R5独立地选自氢
、
烷基
、
烷基氨基
、
烷基酰氨基
、
烷硫基
、
芳基
、
二醇以及它们任选取代的变体；所述第二聚合物的所述合成涉及所述第二单体和具有以下结构
III'
的第二丙烯酰胺单体的聚合：其中
R4和
R5独立地选自氢
、
烷基
、
烷基氨基
、
烷基酰氨基
、
烷硫基
、
芳基
、
二醇以及它们任选取代的变体；并且所述第一丙烯酰胺单体和所述第二丙烯酰胺单体是相同或不同的
。16.
根据权利要求
12
所述的方法，其中：所述第一聚合物的所述合成涉及包含所述四嗪官能团的第一单体的聚合，并且所述第一单体选自结构
IV
：和结构
V
：
其中
R6为
H
或甲基；并且所述第二聚合物的所述合成涉及包含所述活化酯官能团的第二单体的聚合，并且所述第二单体选自丙烯酸五氟苯酯
、
甲基丙烯酸五氟苯酯和乙烯基二甲基吖内酯
。17.
根据权利要求
16
所述的方法，其中：所述第一聚合物的所述合成涉及所述第一单体和具有以下结构
I
的第一附加单体的聚合：其中
R1为氢或烷基；
R2为氢或烷基；
L
为包括直链的接头，所述直链具有2至
20
个选自碳
、
氧和氮的原子以及链中的碳和任何氮原子上的任选取代基；
A
为具有以下结构
II
的
N
取代的酰胺：其中
R3为氢或烷基；
E
为直链，所述直链具有1至4个选自碳
、
氧和氮的原子以及链中的碳和任何氮原子上的任选取代基；并且
Z
为任选的含氮杂环；并且所述第二聚合物的所述合成涉及所述第二单体和第二附加单体的聚合，所述第二附加单体包括芳基碘化物
。18.
根据权利要求
16
所述的方法，其中：所述第一聚合物的所述合成涉及所述第一单体
、
第一附加单体和第二附加单体的聚合，所述第一附加单体具有结构
I
：其中
R1为氢或烷基；
R2为氢或烷基；
L
为包括直链的接头，所述直链具有2至
20
个选自碳
、
氧和氮的原子以及链中的碳和任何氮原子上的任选取代基；
A
为具有以下结构
II
的
N
取代的酰胺：其中
R3为氢或烷基；
E
为直链，所述直链具有1至4个选自碳
、
氧和氮的原子以及链中的碳和任何氮原子上的任选取代基；并且
Z
为任选的含氮杂环；并且所述第二附加单体具有结构
III
：其中
R4和
R5独立地选自氢
、
烷基
、
烷基氨基
、
烷基酰氨基
、
烷硫基
、
芳基
、
二醇以及它们任选取代的变体；所述第二聚合物的所述合成涉及所述第二单体
、
第三附加单体和第四附加单体的聚合，所述第三附加单体包括芳基碘化物，并且所述第四附加单体具有结构
III'
：其中
R4和
R5独立地选自氢
、
烷基
、
烷基氨基
、
烷基酰氨基
、
烷硫基
、

【专利技术属性】
技术研发人员：W，
申请(专利权)人：伊鲁米纳剑桥有限公司，
类型：发明
国别省市：