分析山羊有无角性状的分子标记组合及应用制造技术

本发明专利技术公开一种分析山羊有无角性状的分子标记组合及其应用，涉及生物技术领域，本发明专利技术提供了能够分析山羊有无角性状特征的

【技术实现步骤摘要】
分析山羊有无角性状的分子标记组合及应用


[0001]本专利技术涉及生物
，具体涉及生物检测
，更具体的涉及山羊有无角
SNP
位点组合及其应用
。

技术介绍

[0002]物种在经历自然环境选择或人工选育的过程中，会逐渐形成独有的外貌形态和体型特征
。
据统计，目前我国现有山羊品种
69
个，其中地方品种
58
个
。
而山羊的角形态具有遗传多态性
(
有角或无角，存在遗传变异
),
确定角性状的遗传基础将为理解自然选择中不同形态的维持提供重要的理论基础
。
而且，山羊角作为山羊重要性状之一，还因其具有清热
、
镇惊
、
明目
、
解毒作用的药用价值
。
同时，角作为有蹄类动物的防卫武器，是头部表皮及真皮特化形成的产物
。
山羊大多无角，少部分品种有角
。
一般认为无角对有角为显性
。
角对野生动物非常重要，但在现代密集饲养条件下，角易对家畜造成撞伤，从而影响家畜的胴体
、
毛皮质量，且容易发生感染
。
从饲料转化率来讲，角也需要很多的营养物质转化而成
。
因此无角动物不仅便于管理而且更具经济价值，深受人们喜爱
。
随着目前高通量测序技术的飞速发展与完善，为从全基因组层面筛选经济性状候选基因成为可能<br/>。
在品种筛选
、
品种溯源及种质资源的保护
、
开发利用也具有重要意义
。
[0003]针对于目前品种多样且性状多变的山羊，如何快速筛选出有角或无角的山羊品种，分辨山羊角类型成为急需解决的问题，因此，设计一款适用于中国山羊群体且能对有无角性状进行快速有效检测的
SNP
芯片，有着十分重要的意义
。

技术实现思路

[0004]为满足我国当前山羊品种研究以及农业生产上对山羊有无角性状检测的需求，本专利技术提供了一种分析山羊有无角性状的分子探针组合
、
基因芯片
、
试剂盒及应用，利用本专利技术提供的位点信息，能够快速准确的实现山羊有无角评价
、
品种筛选
、
品种鉴定
、
品种溯源
、
山羊育种，有利于种质资源保护以及种质资源改良，耗时短
、
成本低
、
市场效益广阔
。
[0005]为实现本专利技术的技术目的，本专利技术提供以下技术方案：第一方面，本专利技术提供一种
1720
个
SNP
位点组合在分析山羊有无角的应用，所述
1720
个
SNP
位点组合的物理位置如表1所示：表
1 1720
个位点组合的位置信息
[0006][0007][0008][0009][0010][0011][0012][0013][0014][0015][0016][0017][0018][0019]其物理位置基于山羊参考基因组
ARS1
基因组序列比对确定
。
[0020]第二方面提供一种分析山羊有无角的方法，将待测山羊的基因组
DNA
的
1720
个
SNP
位点基因型与对照山羊基因组
DNA
的所述
1720
个
SNP
位点基因型进行比较；其中，所述
1720
个
SNP
位点为表1所述的
1720
个
SNP
位点
。
[0021]第三方面提供一种分析山羊有无角的分子探针组合，所述分子探针组合检测待测样品中如表1所示的
SNP
位点组合，所述表1中的位点组合的物理位置信息基于山羊参考基因组
ARS1
基因组序列比对确定
。
[0022]第四方面
、
分析山羊有无角的基因芯片，所述基因芯片负载有第三方面所述的分子探针组合
。
[0023]第五方面
、
分析山羊有无角的试剂盒，其具有第三方面所述的分子探针组合或第四方面所述的基因芯片
。
[0024]第六方面
、
分析山羊有无角的方法，应用第三方面所述的分子探针组合或第四方面所述的基因芯片或第五方面所述的试剂盒对待测样品进行检测
。
[0025]第七方面
、
第三方面所述的分子探针组合或第四方面所述的基因芯片或第五方面所述的试剂盒具有如下任一所述的用途：（1）在山羊有无角评价中的应用；（2）在山羊有无角品种筛选的应用；（3）在山羊有无角品种鉴定中的应用；（4）在山羊有无角品种溯源中的应用；（5）在山羊育种中的应用；（6）在种质资源保护中的应用；（7）在种质资源改良中的应用；（8）在山羊系谱重构中的应用
。
[0026]有益效果：
1、
本专利技术基于对国内外众多山羊的遗传资源研究，提供一种仅由
1720
个
SNP
位点组成的分析山羊有无角的
SNP
位点组合，本专利技术提供的
SNP
位点组合不仅具有国内外通用性
好，还能快速从基因水平上对早期不能显现的山羊有无角性状进行评价，获取更准确的育种评估信息，控制育种进程，利用上述位点组合还能对山羊品种进行筛选
、
鉴定和溯源，为种质资源保护和种质资源的改良提供技术支持
。
[0027]2、
本专利技术提供的分析山羊有无角的探针组合
、
基因芯片
、
试剂盒还具有通量小
、
成本低，分析更容易的特点，普适性广，市场前景广阔
。
附图说明
[0028]图1是有角山羊品种和无交山羊品种组的曼哈顿图；图2是本申请对群体阈值分析的判定结果进行了显著性检验的结果图
。
具体实施方式
[0029]下面参考具体实施方式的详细描述来进一步阐明本专利技术，但这些实施例仅仅是说明性的，而不能理解为对本专利技术的限制
。
若未特别指明，实施例中所采用的技术手段为本领域技术人员所熟知的常规手段，可以参照
《
生物信息学与功能基因组学
》
原著第三版或者相关书籍进行，所采用的生物信息软件和产品也均为可商业获得的
。
未详细描述的各种过程和方法是本领域中公知的常规方法，所用材料来源
、
商品名以及有必要列出其组成成分者，均在首次出现时标明，其后所用相同试剂如无特殊说明，均以首次标明的内容相同
。
[003本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.1720
个
SNP
位点组合在分析山羊有无角的应用，所述
1720
个
SNP
位点组合的物理位置如下表所示：
；其物理位置基于山羊参考基因组
ARS1
的基因组序列比对确定
。2.
分析山羊有无角的方法，将待测山羊的基因组
DNA
的
1720
个
SNP
位点基因型与对照山羊基因组
DNA
的所述
1720
个
SNP
位点基因型进行比较；其中，所述
1720
个
SNP
位点为权利要求1所述的
1720
个
SNP
位点
。3.
分析山羊有无角的分子探针组合，所述分子探针组合检测待测样品中如表1所示的

【专利技术属性】
技术研发人员：吕锋骅，李孟华，景佳男，
申请(专利权)人：中国农业大学，
类型：发明
国别省市：