检测新型冠状病毒的组合物制造技术

本发明专利技术属于分子生物学检测领域；具体地，涉及

【技术实现步骤摘要】
检测新型冠状病毒的组合物、试剂盒、方法及用途


[0001]本专利技术属于分子生物学检测领域；具体地，涉及
SARS
‑
CoV
‑2的检测；更具体地，涉及
SARS
‑
CoV
‑2奥密克戎
(Omicron)
变异株的检测以及
BA.4、BA.5
的分型
。

技术介绍

[0002]新型冠状病毒
(2019
‑
nCoV
，
SARS
‑
CoV
‑
2)
，在
2020
年2月
11
日国际病毒分类委员会将该病毒命名为
SARS
‑
CoV
‑
2。
冠状病毒是一个大型病毒家族，在此之前已知有6种可以感染到人类，如可引起感冒以及中东呼吸综合征
(MERS)
和严重急性呼吸综合征
(SARS)
等，而
SARS
‑
CoV
‑2是以前从未在人体中发现的冠状病毒新毒株，该病毒在分类学上属于冠状病毒科
(Coronaviridae)
冠状病毒属
(Coronavirus)
中的
β
类型冠状病毒，具有囊膜和刺突细胞学特征基因组为线性单股正链的
RNA((+)ssRNA)
病毒
。
[0003]据世界卫生组织官网显示，目前全世界已经发现数百种新冠病毒的变种，迄今为止，出现的奥密克戎变异株
BF.7、BQ.1、BQ.1.1、XBB、BN.1
同时具有包括细胞受体亲和力
、
病毒复制能力和免疫逃逸能力增强的位点
。
突变的叠加可能降低部分抗体药物对奥密克戎变异株的保护效力
。
奥密克戎毒力明显较其余毒株减弱
。
[0004]因此，本领域需求一种能够准确检测奥密克戎变异株以及区分
BF.7、BQ.1、BQ.1.1、XBB、BN.1
的试剂，以便针对性采取防疫和治疗措施，使得应对更为效率
。
同时，检测所需时间短，灵敏度高
。

技术实现思路

[0005]有鉴于此，第一方面，本专利技术提供了一种能够检测
SARS
‑
CoV
‑2奥密克戎变异株并分型的组合物，所述组合物同时包括：
[0006]如
SEQ ID NO:1
所示的突变
F490S
上游引物
、
如
SEQ ID NO:2
所示的突变
F490S
下游引物，和如
SEQ ID NO:3
所示的突变
F490S
探针；
[0007]如
SEQ ID NO:4
所示的突变
K356T
上游引物
、
如
SEQ ID NO:5
所示的突变
K356T
下游引物，和如
SEQ ID NO:6
所示的突变
K356T
探针；
[0008]如
SEQ ID NO:7
所示的突变
R346T
上游引物
、
如
SEQ ID NO:8
所示的突变
R346T
下游引物，和如
SEQ ID NO:9
所示的突变
R346T
探针；以及
[0009]如
SEQ ID NO:10
所示的突变
K444T
上游引物
、
如
SEQ ID NO:11
所示的突变
K444T
下游引物，和如
SEQ ID NO:12
所示的突变
K444T
探针
。
[0010]本专利技术提供的检测
SARS
‑
CoV
‑2奥密克戎变异株并分型的试剂盒，主要利用多重荧光
PCR
方法，通过检测
SARS
‑
CoV
‑2奥密克戎变异株上的4不同的特征功能变异位点，对奥密克戎变异株
BF.7、BQ.1、BQ.1.1、XBB、BN.1
进行分型，从而在单管反应体系中同时实现
SARS
‑
CoV
‑2病毒奥密克戎5种变异株分型的检测
。
使得不同毒株能够得到区别对待，从而使得治疗和预防更效率
。
本专利技术的组合物，成本低，通量高
。
并且操作简便
。
检测全过程均在单管封闭条件下进行，避免了由于样本间交叉引起的假阳性和环境污染
。
[0011]进一步地，在一些实施方案中，本专利技术的组合物可以同时包括上述引物和探针中的一对或多对
。
在本专利技术中，“对”是指检测一个突变的互相匹配的上游
、
下游引物和探针
。
[0012]进一步地，组合物中各探针的荧光基团彼此互不相同且互不干扰
。
[0013]在本文中，“互不相同且互不干扰”是指组合物中每个探针所用的荧光基团是不一样的，并且不会影响彼此的检测，即可以利用不同的通道进行检测
。
例如可以使用
FAM、HEX、ROX
和
CY5
，这些基团吸光值不接近，能选择不同的通道，因而不会互相干扰
。
[0014]在一个具体的实施方案中，
SEQ ID NO:3
荧光报告基团为
FAM
；
SEQ IDNO:6
的荧光报告基团为
HEX
；
SEQ ID NO:9
的荧光报告基团为
ROX
；
SEQ IDNO:12
的荧光报告基团为
CY5。
[0015]进一步地，所述组合物包括通用引物
。
[0016]在一个具体的实施方案中，所述组合物还包括：如
SEQ ID NO:13
所示的通用上游引物，和如
SEQ ID NO:14
所示的通用下游引物
。
[0017]“包括通用引物”指通用引物连接在每个引物片段的5’
端，例如，
SEQ IDNO:13
连接通用引物序列变为：
[0018]TCGGCATCAATCGGTCCCT。
[0019]SEQ ID NO:14
连接通用引物序列变为：
[0020]CCGCTCCAGCTCTGCTCTC。
[0021]通过引入通用引物序列片段，可使不同靶标均使用相同本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种能够检测
SARS
‑
CoV
‑2奥密克戎变异株并分型的组合物，所述组合物同时包括：如
SEQ ID NO:1
所示的突变
F490S
上游引物
、
如
SEQ ID NO:2
所示的突变
F490S
下游引物，和如
SEQ ID NO:3
所示的突变
F490S
探针；如
SEQ ID NO:4
所示的突变
K356T
上游引物
、
如
SEQ ID NO:5
所示的突变
K356T
下游引物，和如
SEQ ID NO:6
所示的突变
K356T
探针；如
SEQ ID NO:7
所示的突变
R346T
上游引物
、
如
SEQ ID NO:8
所示的突变
R346T
下游引物，和如
SEQ ID NO:9
所示的突变
R346T
探针；以及如
SEQ ID NO:10
所示的突变
K444T
上游引物
、
如
SEQ ID NO:11
所示的突变
K444T
下游引物，和如
SEQ ID NO:12
所示的突变
K444T
探针
。2.
根据权利要求1所述的组合物，其中，所述组合物中各探针的荧光基团彼此互不相同且互不干扰
。3.
根据权利要求2所述的组合物，其中，
SEQ ID NO:3
荧光报告基团为
FAM
；
SEQ ID NO:6
的荧光报告基团为<...

【专利技术属性】
技术研发人员：谭爱女，郭永超，王艳平，蔡锦刚，徐露，
申请(专利权)人：深圳联合医学科技有限公司，
类型：发明
国别省市：