新型冠状病毒全基因组捕获试剂盒制造技术

技术编号:39495429 阅读:9 留言:0更新日期:2023-11-24 11:22
本发明专利技术公开了新型冠状病毒全基因组捕获试剂盒,本发明专利技术通过

【技术实现步骤摘要】
新型冠状病毒全基因组捕获试剂盒


[0001]本专利技术属于生物医药领域,具体涉及新型冠状病毒全基因组捕获试剂盒


技术介绍

[0002]新型冠状病毒作为
RNA
病毒,本身容易发生变异,并且随着在新冠病毒感染的一次次大爆发,感染的人数越来越多,变异也越来越频繁,不同的类型的毒株有着不同的免疫逃逸能力,为了能够更好预防下一次的新冠感染爆发,对于免疫逃逸能力较强的新型冠状病毒类型进行监测越来也有必要,研究发现新型冠状病毒不仅仅可以通过飞沫和接触传播,同时也可以通过排泄物进入排水系统,许多地区也都在废水中检测到了新型冠状病毒,表明在废水中幸存下来的病毒可能是接下来最大的传播源,然而人们对于污水系统中分布特征知之甚少,这些信息对于追踪病毒传播的来源,以及评估基于废水的流行病学以监测社区感染比较重要


技术实现思路

[0003]为弥补现有技术的不足,本专利技术提供了新型冠状病毒全基因组捕获试剂盒

[0004]为实现上述目的,本专利技术采用如下技术方案:
[0005]本专利技术的第一方面提供了一种用于检测新型冠状病毒全基因组的引物组,所述引物组包括长度为
15

40
个核苷酸的核酸序列;
[0006]进一步,所述引物组的序列如
SEQ ID NO
:1‑
181
中的任意几组所示

[0007]进一步,所述引物组包括使用标记物质标记

[0008]进一步,所述标记物质包括荧光物质

放射性同位素或酶

[0009]进一步,所述荧光物质包括
TAMRAT
TM
、Alexa555、Alexa647、
花青染料系列的
Cy3、Cy5、
荧光素

[0010]进一步,所述放射性同位素包括
32
P、
33
P、
35
S。
[0011]进一步,所述酶包括碱性磷酸酶

辣根过氧化物酶

[0012]进一步,所述引物组包括至少一个修饰核苷酸

[0013]进一步,所述修饰核苷酸包括
2'

修饰核苷酸或5‑
甲基胞嘧啶

[0014]进一步,所述
2'

修饰核苷酸包括
2'

O

甲基修饰核苷酸或
2'

氟修饰核苷酸

[0015]进一步,所述5‑
甲基胞嘧啶包括5‑
甲基

脱氧胞嘧啶

[0016]进一步,所述5‑
甲基

脱氧胞嘧啶包括5‑
Me

dC、5

甲基

2'

脱氧胞嘧啶

[0017]进一步,所述引物组中如果存在除了
3'
末端胞嘧啶以外的胞嘧啶,则每个胞嘧啶都是5‑
甲基

2'

脱氧胞嘧啶

[0018]本专利技术的第二方面提供了一种用于检测新型冠状病毒全基因组扩增引物组,所述引物组是在本专利技术第一方面所述的引物组的基础上,将其中一个或多个引物中的一个或多个碱基替换为简并碱基

[0019]本专利技术的第三方面提供了一种扩增新型冠状病毒核酸序列的引物组,所述引物组
包括:
[0020](1)
与本专利技术第一方面

第二方面所述的引物组互补的核酸序列;
[0021](2)
在严格条件下与
(1)
所述的核酸序列杂交的核酸序列

[0022]本专利技术的第四方面提供了一种检测新型冠状病毒全基因组的产品,所述产品包括本专利技术第一方面

第二方面

第三方面所述的引物组

[0023]进一步,所述产品包括芯片

核酸膜条

试剂盒

[0024]进一步,所述试剂盒还包括
PCR
扩增缓冲液

扩增酶

[0025]进一步,所述扩增酶包括
DNA
聚合酶和
/

RNA
聚合酶

[0026]进一步,所述试剂盒还包括反转录的反应体系

[0027]进一步,所述反转录的反应体系包括引物

[0028]进一步,所述引物为随机引物

[0029]进一步,所述试剂盒还包括荧光色素

[0030]进一步,所述试剂盒还包括说明书

[0031]本专利技术的第五方面提供了一种新型冠状病毒核酸序列的扩增方法,所述方法包括使用本专利技术第一方面

第二方面

第三方面所述的引物组,或本专利技术第四方面所述的产品进行扩增反应

[0032]进一步,所述扩增反应通过包括
LCR、NASBA、SDA、TMA、bDNA、PCR
方法进行

[0033]进一步,所述扩增反应通过
PCR
方法进行

[0034]进一步,所述扩增反应在相似的扩增条件下进行

[0035]本专利技术的第六方面提供了一种检测样品中新型冠状病毒的方法,所述方法包括使用本专利技术第一方面

第二方面

第三方面所述的引物组

本专利技术第四方面所述的产品或根据本专利技术第五方面所述的方法进行扩增,获得扩增产物,使用扩增产物进行测序

[0036]进一步,所述样品包括人体样品

环境样品,所述人体样品为离体的人体样品

[0037]进一步,所述人体样品包括血液

唾液

尿液

[0038]进一步,所述环境样品包括水源

[0039]进一步,所述水源包括污水

[0040]进一步,所述污水包括废水处理厂

河道

下水道系统中的污水

[0041]进一步,所述方法为非诊断目的的方法

[0042]本专利技术的第七方面提供了一种检测新型冠状病毒的文库,所述文库包括本专利技术第一方面

第二方面

第三方面所述的引物组

[0043]本专利技术的第八方面提供了本专利技术第一方面

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...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种用于检测新型冠状病毒全基因组的引物组,其特征在于,所述引物组包括长度为
15

40
个核苷酸的核酸序列;优选的,所述引物组的序列如
SEQ ID NO
:1‑
181
中的任意几组所示
。2.
根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述引物组包括使用标记物质标记;优选的,所述标记物质包括荧光物质

放射性同位素或酶;优选的,所述荧光物质包括
TAMRAT
TM
、Alexa555、Alexa647、
花青染料系列的
Cy3、Cy5、
荧光素;优选的,所述放射性同位素包括
32
P、
33
P、
35
S
;优选的,所述酶包括碱性磷酸酶

辣根过氧化物酶;优选的,所述引物组包括至少一个修饰核苷酸;优选的,所述修饰核苷酸包括
2'

修饰核苷酸或5‑
甲基胞嘧啶;优选的,所述
2'

修饰核苷酸包括
2'

O

甲基修饰核苷酸或
2'

氟修饰核苷酸;优选的,所述5‑
甲基胞嘧啶包括5‑
甲基

脱氧胞嘧啶;优选的,所述5‑
甲基

脱氧胞嘧啶包括5‑
Me

dC、5

甲基

2'

脱氧胞嘧啶;优选的,所述引物组中如果存在除了
3'
末端胞嘧啶以外的胞嘧啶,则每个胞嘧啶都是5‑
甲基

2'

脱氧胞嘧啶
。3.
一种用于检测新型冠状病毒全基因组扩增引物组,其特征在于,所述引物组是在权利要求1或2所述的引物组的基础上,将其中一个或多个引物中的一个或多个碱基替换为简并碱基
。4.
一种扩增新型冠状病毒核酸序列的引物组,其特征在于,所述引物组包括:
(1)
与权利要求...

【专利技术属性】
技术研发人员:张岚王小敏张晓陈文兵
申请(专利权)人:北京微未来科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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