具有衔接子二聚体检测的核酸文库测序技术制造技术

本发明专利技术描述了具有文库质量控制指标的文库测序技术

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】具有衔接子二聚体检测的核酸文库测序技术
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求于
2021
年3月
31
日提交的名称为“NUCLEIC ACID LIBRARY SEQUENCING TECHNIQUES WITH ADAPTER DIMER DETECTION”的美国临时申请号
63/168,762
的优先权和权益，其公开内容全文据此以引用方式并入本文以用于所有目的
。

技术介绍

[0003]所公开的技术整体涉及核酸测序技术
。
特别地，所公开的技术涉及用于核酸测序的测序工作流程，其包括在文库制备期间形成的衔接子二聚体的检测和
/
或表征
。
[0004]本部分中讨论的主题不应仅因为在本部分中有提及就被认为是现有技术
。
类似地，在本部分中提及的或与作为
技术介绍
提供的主题相关联的问题不应被认为先前在现有技术中已被认识到
。
本部分中的主题仅表示不同的方法，这些方法本身也可对应于受权利要求书保护的技术的本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.
一种表征核酸文库的方法，所述方法包括：使用测序引物对核酸文库进行测序以生成代表所述核酸文库的片段和衔接子二聚体测序数据的样品测序数据，其中所述核酸文库的单独片段包括侧接有第一衔接子的样品插入物；其中所述核酸文库的单独衔接子二聚体包括在连接处直接连接到彼此的第二衔接子，其中所述第一衔接子和所述第二衔接子具有相同序列，其中所述测序引物与所述相同序列的一部分相同，并且其中所述单独衔接子二聚体在所述连接处包括错配区，并且其中当结合至所述单独衔接子二聚体的链时，所述测序引物具有
3'
末端，即所述连接处的
5'
；以及基于所述衔接子二聚体测序数据确定所述核酸文库的质量指标
。2.
根据权利要求1所述的方法，其中对所述核酸文库进行测序包括使用错配不耐受聚合酶
。3.
根据权利要求2所述的方法，其中所述错配不耐受聚合酶是具有
SEQ ID NO:1
的序列的聚合酶
。4.
根据权利要求2所述的方法，其中所述错配不耐受聚合酶是
pol812。5.
根据权利要求1所述的方法，所述方法包括接收所述核酸文库被测序以生成所述质量指标的输入；以及选择生成所述质量指标的测序装置的操作模式
。6.
根据权利要求1所述的方法，其中所述测序引物具有
SEQ ID NO:2
的序列
。7.
根据权利要求6所述的方法，其中所述测序引物不具有
SEQ ID NO:2
的任何核苷酸
3'。8.
根据权利要求1所述的方法，其中所述测序引物具有
SEQ ID NO:3
的序列
。9.
根据权利要求8所述的方法，其中所述测序引物不具有
SEQ ID NO:3
的任何核苷酸
3'。10.
根据权利要求1所述的方法，其中对所述核酸文库进行测序包括使用附加测序引物，其中所述测序引物用于对所述单独片段的第一链进行测序，并且其中所述附加测序引物用于对所述单独片段的反向链进行测序
。11.
根据权利要求1所述的方法，其中对所述核酸文库进行测序包括使用附加测序引物，其中所述附加测序引物与所述相同序列的不同部分相同
。12.
根据权利要求1所述的方法，其中所述测序引物与所述第一衔接子上的与所述样品插入物间隔至少一个核苷酸的位置互补
。13.
根据权利要求
12
所述的方法，其中所述测序引物与所述第一衔接子上的与所述样品插入物间隔一至三个核苷酸的位置互补
。14.
一种表征核酸...

【专利技术属性】
技术研发人员：C，
申请(专利权)人：因美纳剑桥有限公司，
类型：发明
国别省市：