多个SNP位点的PCR检测方法技术

技术编号:39275344 阅读:26 留言:0更新日期:2023-11-07 10:52
本发明专利技术公开了一种多个SNP位点的PCR检测方法,属于基因检测技术领域。该方法采用N个通用探针来同时检测M个不同靶标,M=N*K;通用探针包括空间子、标签序列和两段互补的信号序列,每个通用探针采用不同的荧光基团标示,每个靶标对应一个上游引物和一个下游引物;每K个上游引物分别对应一个通用探针的标签序列,每个通用探针对应的K个下游引物的浓度不同以让扩增产物的浓度能明显区分开,每个通用探针对应的K个上游引物的浓度相同。微滴数字PCR扩增时,在终点对产物进行荧光信号扫描,对微滴的荧光信号进行频率和信号强弱分类,从而分析出该位点对应的SNP靶标。实施列中只使用2个通用探针便可对多个SNP靶标进行分型。用探针便可对多个SNP靶标进行分型。用探针便可对多个SNP靶标进行分型。

【技术实现步骤摘要】
多个SNP位点的PCR检测方法


[0001]本专利技术属于基因检测方法
,特别涉及一种多个SNP位点的PCR检测方法。

技术介绍

[0002]申请号为CN202111292384.5的专利公开了一种发夹结构的标签荧光探针,包括空间子、标签序列和两段互补的信号序列,两段信号序列配对形成发夹结构且其分别被相互作用的荧光报告基团和淬灭基团所修饰;一条信号序列的3

端与标签序列的5

端连接,其上修饰有淬灭基团或荧光报告基团,其5

端通过空间子与另一条信号序列的3

端连接;另一条信号序列的5

端修饰有荧光报告基团或淬灭基团且其上的荧光报告基团或淬灭基团能在taq DNA聚合酶的作用下切除,所述标签序列的3

端封闭或不封闭。
[0003]采用前述发夹结构的标签荧光探针的荧光检测方法包括:(1)制备退火引物F:在包含检测位点的上游引物的5

端连接标签序列得到退火引物F。
[0004](2)制备模板N本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.多个SNP位点的PCR检测方法,其特征在于,该方法采用N个通用探针来同时检测M个不同靶标,M=N*K,M、N和K均为大于等于1的整数;所述通用探针包括空间子、标签序列和两段互补的信号序列,每个通用探针采用不同的荧光基团标示,每个靶标对应一个上游引物和一个下游引物;每K个上游引物分别对应一个通用探针的标签序列,每个通用探针对应的K个下游引物的浓度不同以让扩增产物的浓度能明显区分开,每个通用探针对应的K个上游引物的浓度相同。2.根据权利要求1所述的多个SNP位点的PCR检测方法,其特征在于,不同通用探针对应的上游引物的浓度相同或不同,所述通用探针的浓度大于对应上游引物的浓度。3.根据权利要求1所述的多个SNP位点的PCR检测方法,其特征在于,M个上游引物的浓度相同。4.根据权利要求1所述的多个SNP位点的PCR检测方法,其特征在于,每个通用探针对应的K个下游引物的浓度形成浓度梯度。5.根据权利要求1所述的多个SNP位点的PCR检测方法,其特征在于,用于SNP位点分型时,对于每个SNP位点,不同分型对应的下游引物相同。6.根据权利要求1所述的多个SNP位点的PCR检测方法,其特征在于,用于SNP位点分型时,N=2,K为SNP位点的个数,每个SNP位点有两种分型;对于每个SNP位点,对应的2个下游引物相同;M个上游引物的浓度相同,K个下游引物的浓度形成浓度梯度。7.根据权利要求6所述的多个SNP位点的PCR检测方法,其特征在于,两个通用探针分别为ROX

CCGAGGCCGC/iSp18/GCGGCC/iBHQ2dT/CGGTAGCATCGACCTCC/iXNA_...

【专利技术属性】
技术研发人员:钟京曾丰波杨功达朱峰
申请(专利权)人:上海蓝沙生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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