SARS-CoV-2受体结合结构域的特异性抗体及治疗方法技术

提供了针对冠状病毒受体结合结构域(SARS

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】SARS
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CoV
‑
2受体结合结构域的特异性抗体及治疗方法
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]这是根据《专利合作条约》提交的国际申请，要求于2020年10月15日提交的美国临时专利申请号63/092,350的优先权，并要求于2021年7月23日提交的美国临时专利申请号63/225,248的优先权，这些美国临时专利申请的内容以引用方式全文并入本文。
[0003]对以电子方式提交的序列表的引用
[0004]根据EFS
‑
Web法律框架和37CFR
§§
1.821
‑
825(参见MPEP
§
2442.03(a))，与本申请同时提交了符合ASCII的文本文件形式的序列表(名称为“3000093
‑
004977_Sequence_Listing_ST25.txt”，创建于2021年10月7日，并且大小为24,425字节)，并且该序列表的全部内容以引用方式并入本文。
[0005]专利技术背景
1.

[0006]本公开涉及特异性结合SARS
‑
CoV
‑
2受体结合结构域(COVID RBD)的抗体。所述抗体对SARS
‑
CoV
‑
2病毒的作用及其生物学功能具有中和活性，并且可用于治疗呈现冠状病毒感染及其并发症的症状的患者。
2.
技术介绍

[0007]病毒感染是公共卫生的持续问题。在20世纪和21世纪，已经由新颖病毒引起了流行病。
[0008]冠状病毒
[0009]冠状病毒病(COVID
‑
19)是由新发现的冠状病毒严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2(SARS
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CoV
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2)引起的传染病。SARS
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CoV
‑
2于2020年1月12日被世界卫生组织命名。其与2003年鉴定的SARS冠状病毒(SARS CoV)和2012年鉴定的MERS冠状病毒(MERS CoV)一起，属于2003年鉴定的冠状病毒科(Coronaviridae)的β属。SARS
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CoV
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2基因组与SARS CoV病毒共享约70％的序列同一性，并且与MERS CoV病毒共享约40％的序列相似性。WHO网站(2020)。
[0010]大多数感染COVID
‑
19病毒的人会体验到轻度至中度呼吸道疾病，并且无需特殊治疗即可康复。年龄较大的患者，例如大于60岁的患者，以及患有例如心血管疾病、糖尿病、慢性呼吸道疾病和癌症的潜在医学问题的患者，更有可能发展成严重的疾病。疾病控制中心网站(2020)。在易感群体中，严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2(SARS
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CoV
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2)可能导致致命的人类呼吸系统疾病。SARS
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CoV
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2患者往往表现出急性肺损伤(acute lung injury,ALI)的特性，包括弥漫性肺泡损伤(diffuse alveolar damage,DAD)、上皮坏死以及纤维蛋白和透明素沉积。许多死于SARS
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CoV
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2的患者会发展出急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome,ARDS)，一种严重形式的急性肺损伤。Li&Ma Critical Care(2020)24:198.新兴病毒(包括中东呼吸系统综合征CoV(MERS
‑
CoV)和新颖冠状病毒(SARS
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CoV
‑
2，也称为“COVID
‑
19”))的严重急性呼吸系统感染的爆发表明本领域需要有效的用于治疗和/或预防冠状病毒感染的药剂。

技术实现思路

[0011]本专利技术涵盖免疫特异性结合SARS
‑
CoV
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2受体结合结构域(COVID RBD)的多肽或多肽片段的抗体(包括包含或替代地由抗体片段或其变体组成的抗原结合分子)、组合物、及其使用方法。具体地，本专利技术提供了免疫特异性结合冠状病毒的受体结合结构域(RBD)(SEQ ID NO:2和/或SEQ ID NO:3)，优选地SARS
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CoV
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2的受体结合结构域(SEQ ID NO:1和/或SEQ ID NO:4)的多肽或多肽片段的抗体(包括包含或替代地由抗体片段或其变体组成的抗原结合分子)。本专利技术进一步提供了用于预防、治疗或改善与冠状病毒感染相关联的疾病或疾患的方法和组合物，所述冠状病毒感染优选为动物(优选地哺乳动物，最优选地人类)中的SARS
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CoV
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2(COVID
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19)，所述方法和组合物包括或替代地由以下步骤组成：向所述动物施用有效量的一种或多种免疫特异性结合冠状病毒RBD的抗体(包括包含或替代地由抗体片段或其变体组成的抗原结合分子)。可以通过施用有效量的本文所述的抗体来预防、治疗或改善的疾病和疾患包括但不限于冠状病毒感染，包括但不限于SARS
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CoV、MERS
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CoV、SARS
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CoV
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2(COVID
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19)病毒，或它们的组合。
[0012]本专利技术人鉴定出了免疫特异性结合冠状病毒RBD，特别是冠状病毒RBD，包括完整的刺突胞外结构域三聚体的抗体。本文所述的抗体具有由四个多肽、两条重链和两条轻链组成的一般“Y”结构。每条重链和轻链由恒定区和可变区(例如重链可变区(HV)和轻链可变区(LH))组成。每条重链和轻链在可变区中包含一组三(3)个互补决定区(complementarity
‑
determining region,CDR)。本专利技术还涵盖免疫特异性结合冠状病毒RBD(SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4或它们的组合)的抗原结合分子，所述抗原结合分子包含或替代地由这些抗体的片段或变体(例如，包括具有本文所述的氨基酸序列中的任何氨基酸序列的VH结构域、VH CDR、VL结构域或VH CDR)组成，还涵盖编码这些抗体的核酸分子、包含所述核酸分子和/或抗原结合分子的载体和宿主细胞。
[0013]在一个实施方式中，抗体可包含重链恒定区，所述重链恒定区包含SEQ ID NO:5的氨基酸序列。还描述了免疫特异性结合冠状病毒RBD的抗原结合分子，所述抗原结合分子包含或替代地由这些单克隆抗体的片段或变体(例如，包括VH结构域、VH CDR、VL结构域或VH CDR)组成，还描述了编码这些抗体的核酸分子、包含所述核酸分子和/或抗原结合分子的载体和宿主细胞。
[0014]在一个实施方式中，抗体可包含轻链本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种分离的抗冠状病毒受体结合结构域(RBD)的抗体或其抗原结合片段，所述抗体或其抗原结合片段包含重链可变(VH)区和轻链可变(VL)区，所述抗体或其抗原结合片段特异性结合冠状病毒受体结合结构域多肽。2.根据权利要求1所述的抗体或其抗原结合片段，其中重链恒定区包含与SEQ ID NO:5的氨基酸序列共享至少约80％序列同源性的氨基酸序列。3.根据权利要求1或2所述的抗体或其抗原结合片段，其中轻链恒定区包含与SEQ ID NO:6的氨基酸序列共享至少约80％序列同源性的氨基酸序列。4.根据权利要求1
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3中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述轻链可变区包含与SEQ ID NO:23的氨基酸序列共享至少约80％序列同源性的氨基酸序列。5.根据权利要求1
‑
4中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述重链可变区包含与SEQ ID NO:24的氨基酸序列共享至少约80％序列同源性的氨基酸序列。6.根据权利要求1
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5中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述轻链可变区包含含有SEQ ID NO:10的氨基酸序列的CDR1、含有SEQ ID NO:12的氨基酸序列的CDR2、和含有SEQ ID NO:14的氨基酸序列的CDR3。7.根据权利要求1
‑
6中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述重链可变区包含含有SEQ ID NO:17的氨基酸序列的CDR1、含有SEQ ID NO:19的氨基酸序列的CDR2、和含有SEQ ID NO:21的氨基酸序列的CDR3。8.根据权利要求1
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7中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述轻链可变区包含骨架区段，所述骨架区段包含SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:15的氨基酸序列。9.根据权利要求1
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8中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述重链可变区包含骨架区段，所述骨架区段包含SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:20和SEQ ID NO:22的氨基酸序列。10.根据权利要求1
‑
9中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述抗体特异性结合包含SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4或它们的组合的氨基酸序列的冠状病毒RBD。11.根据权利要求1
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10中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述抗体特异性结合包含SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4或它们的组合的氨基酸序列的冠状病毒RBD上的表位。12.根据权利要求1
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11中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述序列同源性为至少约85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％的序列同源性。13.根据权利要求1
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12中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述抗原结合片段是Fab、Fab'或F(ab')2。14.根据权利要求1
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13中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述抗体是IgG、IgM、IgE、IgD或IgA抗体。15.根据权利要求1
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14中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述抗体为IgA抗体。16.根据权利要求1
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15中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述抗体为分泌
型IgA(sIgA)抗体。17.根据权利要求1
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16中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述抗体是单克隆的。18.根据权利要求1
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17中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述抗体是人源化抗体。19.根据权利要求1
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18中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述抗体是嵌合抗体。20.根据权利要求1
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19中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述抗体或其抗原结合片段缀合至标记、细胞毒剂、免疫抑制剂。21.根据权利要求20所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述标记是可检测标记。22.根据权利要求21所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述可检测标记是荧光标记、发光标记、生物发光标记、放射性标记、化学发光标记、比色标记、荧光标记、酶标记，或它们的组合。23.根据权利要求1
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22中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述冠状病毒为SARS
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CoV
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1、MERS
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CoV、SARS
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CoV
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2(COVID
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19)、HCoV
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OC43、HCoV
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HKU1、HCoV
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NL63、HCoV
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229E，或它们的组合。24.根据权利要求1
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23中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述冠状病毒是SARS
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CoV
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2(COVID
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19)。25.根据权利要求1
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24中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其中所述抗体选择性结合在SARS
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CoV
‑
2刺突蛋白的氨基酸331
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524(SEQ ID NO:1)、SARS
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CoV刺突蛋白的氨基酸残基318
‑
510(SEQ ID NO:2)、MERS
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CoV刺突蛋白的氨基酸残基377
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588(SEQ ID NO:3)、SARS
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CoV刺突蛋白的氨基酸残基318
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510、MERS
‑
CoV刺突蛋白的氨基酸残基377
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588；SARS CoV
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2刺突受体结合结构域的氨基酸319
‑
541(SEQ ID NO:4)或它们的组合内所包含的表位。26.一种抗冠状病毒RBD的抗体，所述抗体与根据权利要求1
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25中任一项所述的抗体竞争结合冠状病毒RBD。27.一种组合物，所述组合物包含根据权利要求1
‑
26中任一项所述的抗体或其抗原结合片段。28.根据权利要求27所述的组合物，其中所述组合物是进一步包含药物赋形剂、载体、稀释剂、佐剂或它们的组合的药物组合物。29.根据权利要求27或28所述的组合物，其中所述组合物被配制用于通过吸入施用，任选地鼻内施用。30.一种分离的核苷酸，所述分离的核苷酸包含与编码SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24的氨基酸序列的核酸序列具有至少约80％序列同源性的核酸序列。31.根据权利要求30所述的分离的核苷酸，其中所述序列同源性为至少约85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％序列同源性。
32.一种载体，所述载体包含根据权利要求30或31所述的分离的核苷酸。33.一种宿主细胞，所述宿主细胞包含根据权利要求32所述的载体。34...

【专利技术属性】
技术研发人员：凯特琳，
申请(专利权)人：美国卫生及公众服务部代表，
类型：发明
国别省市：