一种PolyA检测方法技术

技术编号:38473491 阅读:27 留言:0更新日期:2023-08-11 14:50
本发明专利技术公开了一种PolyA检测方法,包括以下步骤:在PolyA聚合酶反应体系中对待测靶mRNA进行加尾反应;将加尾后的mRNA加入反转录反应体系,以特异性反转引物进行反转录形成cDNA;于待测PolyA上游位置设计的特异性正向引物和反向引物对反转录形成的cDNA进行聚合酶链式反应得到聚合酶链式反应产物;对所述聚合酶链式反应产物进行分离及大小分析,得到PolyA尾长。本发明专利技术解决了现有技术中PolyA检测操作过程繁复、准确性不高等缺陷,提供了准确检测不同mRNA PolyA尾长及占比的方法,能够适用模板编码polyT转录PolyA尾长检测,有效定义IVT mRNA的理论PolyA长度的占比。mRNA的理论PolyA长度的占比。mRNA的理论PolyA长度的占比。

【技术实现步骤摘要】
一种PolyA检测方法


[0001]本专利技术涉及分子生物学
,尤其涉及一种PolyA检测方法。

技术介绍

[0002]细胞信使RNA(mRNA)在真核生物细胞中广泛存在,负责传递遗传信息,指导蛋白质合成。mRNA是一种近来备受关注的基因治疗手段,在肿瘤学、传染病学、蛋白疗法等领域有广泛前景。mRNA的PolyA尾是体外合成mRNA(IVT mRNA)的重要结构元件,通常由两种途径加入:一种由模板编码polyT转录形成;另一种由多聚腺苷酸聚合酶在转录mRNA 3端将腺苷酸催化聚合形成。由于mRNA PolyA尾对IVT mRNA的翻译效率及胞内稳定性起着至关重要的作用,因此PolyA尾长及占比是IVT mRNA的关键工艺质量参数,对mRNA PolyA尾长及占比的有效及准确的表征是非常必要且重要的。
[0003]当前PolyA尾长的检测方法主要为:1)酶切法将PolyA尾通过一定酶切前处理从mRNA中切除并分离后进行液相色谱-质谱联用分析,该方法一方面对PolyA的结构及内部序列有一定限制,例如利用RNase T1酶对mRNA进行本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种PolyA检测方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤1:在PolyA聚合酶反应体系中对待测靶mRNA进行加尾反应;步骤2:将加尾后的mRNA加入反转录反应体系,以特异性反转引物进行反转录形成cDNA;步骤3:于待测PolyA上游位置设计的特异性正向引物与反向引物,对反转录形成的cDNA进行聚合酶链式反应得到聚合酶链式反应产物;步骤4:对所述聚合酶链式反应产物进行分离及大小分析,得到PolyA尾长。2.根据权利要求1所述的PolyA检测方法,其特征在于:所述步骤1中,以GTP及ITP的混合溶液作为底物对待测靶mRNA进行加尾反应,使待测靶mRNA在3端加入G/I尾。3.根据权利要求2所述的PolyA检测方法,其特征在于:所述步骤1中,取1μg mRNA加入所述PolyA聚合酶反应体系,所述PolyA聚合酶反应体系包括,在1
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缓冲液下,使用5U PolyA聚合酶,GTP溶液与ITP溶液各为10pmol,于37℃反应60min,得到加尾后mRNA。4.根据权利要求1所述的PolyA检测方法,其特征在于:所述步骤2中,所述特异性反转引物序列如SEQ ID NO .1所示。5.根据权利要求4所述的PolyA检测方法,其特征在于:取5μL加尾后mRNA加入反转录反应体系,所述反转录反应体系包括,在1
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【专利技术属性】
技术研发人员:贾明明陈立朱伟萍
申请(专利权)人:北京立康生命科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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