微流控芯片、空间组学测序芯片及编码阵列位置标定方法技术

本发明专利技术涉及芯片测序技术领域，公开了微流控芯片、空间组学测序芯片及编码阵列位置标定方法，微流控芯片包括：第一预设数量的第一编码试剂通道，沿第一方向延伸；第二预设数量的第二编码试剂通道，沿第二方向延伸；第一方向与第二方向交叉设置；第一基准框试剂通道，设置在第一编码试剂通道的一侧，并与第一编码试剂通道平行；第二基准框试剂通道，设置在第一编码试剂通道的另一侧，并与第一编码试剂通道平行；第三基准框试剂通道，设置在第二编码试剂通道的一侧，并与第二编码试剂通道平行；第四基准框试剂通道，设置在第二编码试剂通道的另一侧，并与第二编码试剂通道平行。本发明专利技术实现了对编码阵列位置的准确标定。现了对编码阵列位置的准确标定。现了对编码阵列位置的准确标定。

【技术实现步骤摘要】
微流控芯片、空间组学测序芯片及编码阵列位置标定方法


[0001]本专利技术涉及芯片测序
，具体涉及微流控芯片、空间组学测序芯片及编码阵列位置标定方法。

技术介绍

[0002]空间基因表达芯片，设有标定Spot(捕获信使核糖核酸的单个空间区域)捕获阵列位置的基准框，通过HE.扫描图关联组织位置，可实现Spot捕获基因分布图与HE.扫描图的对齐，以评估实验的准确性；
[0003]组织空间组学测序芯片，也叫编码芯片，其编码区域可通过微流控芯片，在功能化基片上依次进行X方向、Y方向垂直交叉进样被制作出来；然而，现有方法加工出来的编码芯片，由于缺少基准框，无法准确标定编码阵列的位置，无法有效实现Spot捕获基因分布图与HE.扫描图的对齐，导致无法评估实验结果准确性、所获取的实验结果缺少可信度。

技术实现思路

[0004]有鉴于此，本专利技术提供了一种空间组学测序芯片及其编码阵列位置标定方法，以解决现有方法加工出来的编码芯片，无法准确标定编码阵列的位置问题。
[0005]第一方面，本专利技术提供一种微流控芯片，包括：
[0006]第一预设数量的第一编码试剂通道，沿第一方向延伸；
[0007]第二预设数量的第二编码试剂通道，沿第二方向延伸；第一方向与第二方向交叉设置；
[0008]第一基准框试剂通道，设置在第一编码试剂通道的一侧，并与第一编码试剂通道平行；
[0009]第二基准框试剂通道，设置在第一编码试剂通道的另一侧，并与第一编码试剂通道平行；
[0010]第三基准框试剂通道，设置在第二编码试剂通道的一侧，并与第二编码试剂通道平行；
[0011]第四基准框试剂通道，设置在第二编码试剂通道的另一侧，并与第二编码试剂通道平行；其中，第一基准框试剂通道、第二基准框试剂通道、第三基准框试剂通道和第四基准框试剂通道合围形成基准框，基准框用于标定编码阵列的位置。
[0012]本实施例中，通过在第一编码试剂通道和第二编码试剂通道的两侧分别设置第一基准框试剂通道、第二基准框试剂通道、第三基准框试剂通道和第四基准框试剂通道，进而将第一基准框试剂通道、第二基准框试剂通道、第三基准框试剂通道和第四基准框试剂通道合围形成的基准框作为准确校对编码阵列位置的参照，实现了对编码阵列位置的准确标定，进而提高了实验结果的准确性与可信度。
[0013]在一种可选的实施方式中，基准框非中心对称，以表征编码阵列的方向。
[0014]本可选实施方式中，通过非中心对称的基准框确定编码阵列的方向，当图像发生
反转或镜像时，可以通过该非中心对称的基准框识别编码阵列的方向，进而准确还原编码阵列的位置，实现对编码阵列的方向与位置的准确标定，保证了实验结果的准确性。
[0015]在一种可选的实施方式中，第一方向与第二方向垂直交叉。
[0016]本可选实施方式中，第一方向和第二方向垂直交叉保证了脱氧核糖核酸(DNA)在微流控芯片中具有良好分离的发送通道。
[0017]在一种可选的实施方式中，第一方向为横向，第二方向为纵向。
[0018]第二方面，本专利技术提供了一种空间组学测序芯片，其特征在于，包括第一方面或第一方面任一可选实施方式的一种微流控芯片。
[0019]第三方面，本专利技术提供了一种空间组学测序芯片的编码阵列位置标定方法，应用于第一方面的空间组学测序芯片，方法包括：
[0020]获取第一编码试剂通道和第二编码试剂通道的通道参数；其中，第一编码试剂通道的数量为第一预设数量，第二编码试剂通道的数量为第二预设数量；
[0021]根据第一编码试剂通道和第二编码试剂通道的通道参数，绘制第一基准框试剂通道、第二基准框试剂通道、第三基准框试剂通道和第四基准框试剂通道；其中，第一基准框试剂通道设置在第一编码试剂通道的一侧，并与第一编码试剂通道平行；第二基准框试剂通道设置在第一编码试剂通道的另一侧，并与第一编码试剂通道平行；第三基准框试剂通道设置在第二编码试剂通道的一侧，并与第二编码试剂通道平行；第四基准框试剂通道设置在第二编码试剂通道的另一侧，并与第二编码试剂通道平行；
[0022]获取第一基准框试剂通道、第二基准框试剂通道、第三基准框试剂通道和第四基准框试剂通道合围形成的基准框，并利用基准框标定编码阵列的位置。
[0023]本实施例中，通过在第一编码试剂通道和第二编码试剂通道的两侧分别设置第一基准框试剂通道、第二基准框试剂通道、第三基准框试剂通道和第四基准框试剂通道，能够准确地对编码阵列的位置进行标定，使得空间转录组芯片产品更有可信度，保证了实验结果的准确性。
[0024]在一种可选的实施方式中，根据第一编码试剂通道和第二编码试剂通道的通道参数，绘制第一基准框试剂通道、第二基准框试剂通道、第三基准框试剂通道和第四基准框试剂通道，包括：
[0025]将第一编码试剂通道的通道参数和第二编码试剂通道的通道参数分别与第一预设阈值和第二预设阈值进行比较；其中，第一预设阈值小于第二预设阈值；第一编码试剂通道的通道参数和第二编码试剂通道的通道参数包括第一编码试剂通道的线宽和第二编码试剂通道的线宽，第一编码试剂通道的线宽和第二编码试剂通道的线宽相同；
[0026]基于比较结果确定第一基准框试剂通道的通道参数、第二基准框试剂通道的通道参数、第三基准框试剂通道的通道参数和第四基准框试剂通道的通道参数；其中，第一基准框试剂通道的通道参数包括第一基准框试剂通道的线宽和数量，第二基准框试剂通道的通道参数包括第二基准框试剂通道的线宽和数量，第三基准框试剂通道的通道参数包括第三基准框试剂通道的线宽和数量，第四基准框试剂通道的通道参数包括第四基准框试剂通道的线宽和数量；第一基准框试剂通道的通道参数、第二基准框试剂通道的通道参数、第三基准框试剂通道的通道参数和第四基准框试剂通道的通道参数用于确定编码阵列的方向。
[0027]本可选实施方式中，根据第一编码试剂通道和第二编码试剂通道的线宽确定第一
基准框试剂通道、第二基准框试剂通道、第三基准框试剂通道和第四基准框试剂通道对应的线宽与数量，保证了第一编码试剂通道和第二编码试剂通道的流阻与第一基准框试剂通道、第二基准框试剂通道、第三基准框试剂通道和第四基准框试剂通道的流阻一致或相似，并且，控制基准框试剂通道的线宽与数量不完全一致，使得基准框非中心对称，与编码阵列相对位置是准确的保证了实验结果的准确性。
[0028]在一种可选的实施方式中，基于比较结果确定第一基准框试剂通道的通道参数、第二基准框试剂通道的通道参数、第三基准框试剂通道的通道参数和第四基准框试剂通道的通道参数，包括：
[0029]当第一编码试剂通道的线宽和第二编码试剂通道的线宽小于或等于第一预设阈值时，则设置第一基准框试剂通道的线宽、第二基准框试剂通道的线宽、第三基准框试剂通道的线宽和第四基准框试剂通道的线宽与第一编码试剂通道的线宽和第二编码试剂通道的线宽相同，第一基准框试剂通道的数量、第二基准框试剂通道的数量、第三基准框试剂本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种微流控芯片，其特征在于，包括：第一预设数量的第一编码试剂通道，沿第一方向延伸；第二预设数量的第二编码试剂通道，沿第二方向延伸；所述第一方向与所述第二方向交叉设置；第一基准框试剂通道，设置在所述第一编码试剂通道的一侧，并与所述第一编码试剂通道平行；第二基准框试剂通道，设置在所述第一编码试剂通道的另一侧，并与所述第一编码试剂通道平行；第三基准框试剂通道，设置在所述第二编码试剂通道的一侧，并与所述第二编码试剂通道平行；第四基准框试剂通道，设置在所述第二编码试剂通道的另一侧，并与所述第二编码试剂通道平行；其中，所述第一基准框试剂通道、所述第二基准框试剂通道、所述第三基准框试剂通道和所述第四基准框试剂通道合围形成基准框，所述基准框用于标定编码阵列的位置。2.根据权利要求1所述的一种微流控芯片，其特征在于，所述基准框非中心对称，以表征编码阵列的方向。3.根据权利要求1所述的一种微流控芯片，其特征在于，所述第一方向与所述第二方向垂直交叉。4.根据权利要求1或3所述的一种微流控芯片，其特征在于，所述第一方向为横向，所述第二方向为纵向。5.一种空间组学测序芯片，其特征在于，包括如权利要求1至4中任一项所述的一种微流控芯片。6.一种空间组学测序芯片的编码阵列位置标定方法，其特征在于，应用于如权利要求5中所述的空间组学测序芯片，所述方法包括：获取第一编码试剂通道和第二编码试剂通道的通道参数；其中，所述第一编码试剂通道的数量为第一预设数量，所述第二编码试剂通道的数量为第二预设数量；根据所述第一编码试剂通道和第二编码试剂通道的通道参数，绘制第一基准框试剂通道、第二基准框试剂通道、第三基准框试剂通道和第四基准框试剂通道；其中，所述第一基准框试剂通道设置在第一编码试剂通道的一侧，并与所述第一编码试剂通道平行；所述第二基准框试剂通道设置在所述第一编码试剂通道的另一侧，并与所述第一编码试剂通道平行；所述第三基准框试剂通道设置在第二编码试剂通道的一侧，并与所述第二编码试剂通道平行；所述第四基准框试剂通道设置在所述第二编码试剂通道的另一侧，并与所述第二编码试剂通道平行；获取所述第一基准框试剂通道、所述第二基准框试剂通道、所述第三基准框试剂通道和所述第四基准框试剂通道合围形成的基准框，并利用所述基准框标定编码阵列的位置。7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述根据所述第一编码试剂通道和第二编码试剂通道的通道参数，绘制第一基准框试剂通道、第二基准框试剂通道、第三基准框试剂通道和第四基准框试剂通道，包括：将所述第一编码试剂通道的通道参数和第二编码试剂通道的通道参数分别与第一预
设阈值和第二预设阈值进行比较；其中，所述第一预设阈值小于所述第二预设阈值；所述第一编码试剂通道的通道参数和第二编码试剂通道的通道参数包括第一编码试剂通道的线宽和第二编码试剂通道的线宽，所述第一编码试剂通道的线宽和所述第...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨海波，方星，王震，赵志，顾志鹏，沈洪飞，
申请(专利权)人：苏州德运康瑞生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：