一种单细胞藻类总RNA提取试剂盒及提取方法技术

技术编号:38471270 阅读:7 留言:0更新日期:2023-08-11 14:48
本发明专利技术公开了一种单细胞藻类总RNA提取试剂盒及提取方法,提取试剂盒包括裂解液、绑定液、漂洗液1、漂洗液2以及洗脱液,其中:所述裂解液包括盐酸胍、乙二胺四乙酸、吐温20、二硫苏糖醇和聚乙烯吡咯烷酮;所述绑定液包括氯化锂和乙醇;所述漂洗液1包括异硫氰酸胍、三羟甲基氨基甲烷盐酸盐和乙二胺四乙酸;所述漂洗液2包括三羟甲基氨基甲烷盐酸盐和乙醇;所述洗脱液为无核酸酶水。该提取试剂盒及提取方法,采用裂解液裂解藻类细胞,整个提取过程中无需用到酚、氯仿等有机物抽提和盐沉淀步骤,操作简单、安全、快捷,提取效果稳定良好,适配多种类的单细胞藻,可以适配多类磁棒法全自动核酸提取设备,样本处理通量高。样本处理通量高。样本处理通量高。

【技术实现步骤摘要】
一种单细胞藻类总RNA提取试剂盒及提取方法


[0001]本专利技术属于藻类RNA提取
,具体涉及一种单细胞藻类总RNA提取试剂盒及提取方法。

技术介绍

[0002]藻类是原生生物中一类能够进行光合作用的水生生物,藻类中成员广泛,形态各异,既有微小的微单胞菌,也有长达60米的大型藻类。藻类细胞中的光合作用元件相对于植物而言更为多样,其细胞也有区别于动植物细胞的独立特点。藻类在生态系统中通常是氧气制造者,并作为大多数水生生物捕食的场所,同时,藻类也是原油和人类食物的来源,其加工品是药品和工业的重要原料。微藻是藻类中一类单细胞藻,藻体为单个细胞或多细胞群体,其细胞类型为原核或双核,有文献将微藻等同于浮游生物。人类发现、开发单细胞藻类已有上千年历史,其在多个领域具有巨大的潜在利用价值,除作为人类和动物的食品外,单细胞藻类富含类胡萝卜素、藻胆蛋白等物质,被用来作为药品、生物染料、化肥等生产的原料,同时,因其在营养丰富的环境中较强的养分吸收、积累金属离子的能力,也被用于水域治废治污和固碳降碳。
[0003]蓝藻、绿藻、小球藻等单细胞藻类长期以来是发育生物学、分子生态学等基础研究学科重要的研究材料,对单细胞藻类的基因表达研究手段,包括Northern杂交、芯片杂交、RT

PCR和cDNA文库构建等,首先需要从材料中获取高质量的总RNA。单细胞藻富含酚类、脂质、多糖和内生的RNA酶等,有文献表明在低盐离子浓度的缓冲液中多糖容易和RNA共同聚沉,这使得分离提取高纯度、高完整度的总RNA十分困难。/>[0004]传统的提取方法针对性不强,效果不佳,RNA得率较低,且样本处理通量有限;目前市面上针对单细胞藻类的总RNA提取试剂盒较少,中国专利CN102807978一种藻类RNA提取剂及使用方法和中国专利CN115678891一种微藻菌细胞总RNA的提取方法,这两种藻类RNA的提取方案中都要用到氯仿,存在一定的试验安全隐患。因此,开发一种安全系数高,提取效率高而且提取效果好的单细胞藻类总RNA提取试剂盒及提取方法是很有必要。

技术实现思路

[0005]针对目前所存在的技术问题,本专利技术的目的在于提供一种单细胞藻类总RNA提取试剂盒及提取方法,无需机械研磨和高温孵育裂解,无需用到酚、氯仿等有机物抽提和盐沉淀步骤,提高实验安全性,操作简单快捷,提取效果稳定良好,适用于多种类的单细胞藻。
[0006]为了达到上述目的,本专利技术采用如下技术手段:
[0007]本专利技术的第一方面在于提供一种单细胞藻类总RNA提取试剂盒,包括裂解液、绑定液、漂洗液1、漂洗液2以及洗脱液,其中:
[0008]所述裂解液包括盐酸胍、乙二胺四乙酸、吐温20、二硫苏糖醇和聚乙烯吡咯烷酮;
[0009]所述绑定液包括氯化锂和乙醇;
[0010]所述漂洗液1包括异硫氰酸胍、三羟甲基氨基甲烷盐酸盐和乙二胺四乙酸;
[0011]所述漂洗液2包括三羟甲基氨基甲烷盐酸盐和乙醇;
[0012]所述洗脱液为无核酸酶水。
[0013]进一步地,所述裂解液中,盐酸胍终浓度为4

8mol/L、乙二胺四乙酸终浓度为25

100mmol/L、吐温20终浓度为1

2.5%、二硫苏糖醇终浓度为20

50mmol/L和聚乙烯吡咯烷酮终浓度为1

2.5%。
[0014]进一步地,所述绑定液中,氯化锂终浓度为6

12mol/L,乙醇终浓度为50

85%。
[0015]进一步地,所述漂洗液1中,异硫氰酸胍终浓度为1

5mol/L,三羟甲基氨基甲烷盐酸盐终浓度为10

20mmol/L,乙二胺四乙酸终浓度为5

20mmol/L。
[0016]进一步地,所述漂洗液2中,三羟甲基氨基甲烷盐酸盐终浓度为10

20mmol/L,乙醇终浓度为50

85%。
[0017]本专利技术的第二方面在于提供一种前文所述的单细胞藻类总RNA提取试剂盒进行RNA提取的方法,包括如下步骤:
[0018]S1,取藻类样本置于样本管a中,加入裂解液,涡旋振荡混匀3

5分钟,将藻体细胞分散悬浮至无结块;
[0019]S2,室温静置3

7分钟,随后4℃,12000g,高速离心2

5min;离心后移取上清液到样本管b中;
[0020]S3,向样本管b中加入5

15μL磁珠悬液和350

450μL绑定液,置于混匀仪上,室温振荡混匀5

7min,随后将样本管b放置在磁力架上,静置,磁珠完全吸附后,弃上清;
[0021]S4,向完成S3的容器b中加入550

650μL漂洗液1,将容器b从磁力架上转移到混匀仪上,振荡混匀30

90s,在磁力架上静置,磁珠完全吸附后,弃上清;
[0022]S5,向完成S4的容器b中加入550

650μL漂洗液2,将容器b从磁力架上转移到混匀仪上,振荡混匀30

90s,在磁力架上静置,磁珠完全吸附后,弃上清,室温下晾干;
[0023]S6,向晾干的容器b中加入40

60μL洗脱液,放置在磁力架上静置2

4min,然后转移到混匀仪上,振荡混匀3

7min;
[0024]S7,将完成S6的容器b置于磁力架上静置2

5min,磁珠完全吸附后,将上清溶液转至容器c中,容器c中的上清液即为提取得到的RNA产物,

80℃保存。
[0025]进一步地,所述藻类样本为单细胞藻类样本。
[0026]此方法中,藻体经过富集收集,通过裂解液裂解的方式将RNA从藻类细胞中释放出来,并与含量丰富的次级代谢物分离,离心去除难溶的杂质,吸取上清液使用醇类绑定液聚沉其中的RNA,并与硅基磁珠结合,随后进入全自动化RNA制备流程,经过两次漂洗除去盐类、酚类等杂质,最终使用无核酸酶水洗脱,得到提纯的RNA产物。
[0027]本专利技术的有益效果
[0028]相对于现有技术,本专利技术具有以下有益效果:本专利技术该方法不经机械研磨和高温孵育裂解,而是采用裂解液裂解藻类细胞,整个提取过程中无需用到酚、氯仿等有机物抽提和盐沉淀步骤,操作简单、安全、快捷,提取效果稳定良好,适配多种类的单细胞藻;并且该藻类RRNA提取试剂盒和提取方法是基于磁珠纯化的方式,可以适配多类磁棒法全自动核酸提取设备,能够实现更高的样本处理通量,提取效率高。
附图说明
[0029]图1示出了本专利技术对比例1样本1

12的DNA凝胶电泳图;
[0030]本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种单细胞藻类总RNA提取试剂盒,其特征在于:包括裂解液、绑定液、漂洗液1、漂洗液2以及洗脱液,其中:所述裂解液包括盐酸胍、乙二胺四乙酸、吐温20、二硫苏糖醇和聚乙烯吡咯烷酮;所述绑定液包括氯化锂和乙醇;所述漂洗液1包括异硫氰酸胍、三羟甲基氨基甲烷盐酸盐和乙二胺四乙酸;所述漂洗液2包括三羟甲基氨基甲烷盐酸盐和乙醇;所述洗脱液为无核酸酶水。2.根据权利要求1所述的一种单细胞藻类总RNA提取试剂盒,其特征在于:所述裂解液中,盐酸胍终浓度为4

8mol/L、乙二胺四乙酸终浓度为25

100mmol/L、吐温20 终浓度为1

2.5%、二硫苏糖醇终浓度为20

50mmol/L和聚乙烯吡咯烷酮终浓度为1

2.5%。3.根据权利要求1所述的一种单细胞藻类总RNA提取试剂盒,其特征在于:所述绑定液中,氯化锂终浓度为6

12mol/L,乙醇终浓度为50

85%。4.根据权利要求1所述的一种单细胞藻类总RNA提取试剂盒,其特征在于:所述漂洗液1中,异硫氰酸胍终浓度为1

5mol/L,三羟甲基氨基甲烷盐酸盐终浓度为10

20mmol/L,乙二胺四乙酸终浓度为5

20mmol/L。5.根据权利要求1所述的一种单细胞藻类总RNA提取试剂盒,其特征在于:所述漂洗液2中,三羟甲基氨基甲烷盐酸盐终浓度为10

20mmol/L,乙醇终浓度为50

85%。6.一种利用权利要求1

5任一项所述的单细胞藻类总RNA提取试剂...

【专利技术属性】
技术研发人员:蔡霖霖邓阳红殷楠楠陈雪莲
申请(专利权)人:杭州联川基因诊断技术有限公司
类型:发明
国别省市:

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