导致鳃-耳-肾综合征的致病基因、检测及应用制造技术

本发明专利技术提供了一种导致鳃

【技术实现步骤摘要】
导致鳃
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耳
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肾综合征的致病基因、检测及应用


[0001]本专利技术涉及检测试剂领域，尤其涉及一种导致鳃
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耳
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肾综合征的致病基因、检测及应用。

技术介绍

[0002]鳃耳综合征(branchio
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otosyndrome，BOS)/鳃
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耳
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肾综合征(branchio
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oto
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renalsyndrome，BORS)是一种不常见的常染色体显性遗传综合征型疾病，人群发病率约为1/40000，以听力障碍及耳的表现为最主要特征，并伴有肾脏畸形及鳃裂囊肿或瘘管等症状。耳畸形是BOS/BORS最明显的临床表现之一，包括外耳、中耳、内耳畸形和听力障碍。听力障碍又分为传导性、感音神经性或混合性，程度可轻可重。
[0003]BOS/BORS的临床表现具有以下特征：1)高达90％的患者存在不同程度的听力障碍，听力障碍最常见的表现是混合性聋(50％)，其次是传导性聋(30％)和感音神经性聋(20％)；其中约有25％的患者表现为随年龄增长的进展性耳聋。2)约50％的患者颈部外侧可见鳃裂囊肿、窦道或瘘管。3)约65％的患者出现肾脏异常，包括肾发育不全、肾发育不良、肾盂输尿管梗阻等。除了上述典型的耳、鳃、肾的临床表现，亦有许多研究陆续报道了BOS/BORS的其他伴随症状，该病可出现发育迟缓、智力障碍、尿道下裂、骨骼缺陷、远端关节挛缩、继发肾性骨营养不良等。
[0004]BOS/BORS呈常染色体显性遗传，患者的子女有50％的遗传风险，且外显率接近100％。致病基因的鉴定对于发现BOS/BORS家系的遗传学病因至关重要，基因诊断为妊娠女性是否需要进行产前检测和胚胎植入前分子遗传诊断提供了依据。已知的BOS/BORS相关致病基因中最为常见的3个基因为EYA1、SIX1和SIX5。其中，EYA1基因(MIM601653)定位于染色体8q13.3，包括18个外显子和17个内含子，基因长350.7kb，编码含有592个氨基酸的蛋白质EYA1，包括位于氨基末端的反式激活结构域和羧基末端的EYA结构域(ED)。EYA1基因突变是BOS/BORS最常见的致病原因。目前约有一百多种EYA1基因突变与BOS/BORS相关，这些突变包括大片段或小片段的缺失突变、框移突变、无义突变、剪接突变和错义突变，其中框移突变和无义突变最常见，其次便是剪接突变和错义突变。EYA1是脊椎动物和无脊椎动物器官发生的关键调节基因，在耳和肾及其他器官早期发育的EYASIX调控网络中起转录共激活作用。人类EYA1基因的突变可导致BOS/BORS。EYA1基因在咽部器官(甲状腺、甲状旁腺和胸腺)、心血管系统、颌面形态部位的发生中发挥重要作用。EYA1发挥着多种功能，如形成EYA1
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SIX1转录激活复合物和多个EYA1调节网络(EYA1
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Noth、SNAI2
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EYA1
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SIX1、DACH
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EYASIX等)、调节磷酸酶活性。除导致BOS/BORS之外，EYA1基因还与干细胞癌、黑色素瘤、乳腺癌等多种肿瘤的发生和发展紧密相关。EYA1基因突变可导致常染色体显性遗传的耳
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面
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颈综合征1型、鳃裂
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耳
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肾综合征1型、鳃裂
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耳综合征1型。耳
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面
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颈综合征1型表现为面部异常、杯型低位耳、耳廓前瘘、听力损失、鳃缺陷、骨骼畸形及轻微的智力障碍等；鳃裂
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耳
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肾综合征1型临床症状为鳃裂瘘或鳃裂囊肿、感音神经性或传导性耳聋、外耳/中耳/内耳结构缺陷、肾畸形；鳃裂
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耳综合征1型临床表现为双侧鳃裂瘘管或囊肿、感觉神经性和/或传
导性听力丧失、耳前凹及外耳/中耳/内耳结构缺陷。
[0005]因此，基因突变是导致疾病发生发展的重要遗传基础，基因诊断是确诊鳃
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耳
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肾综合征的重要遗传学标准。临床上需要针对不同突变建立相应的检测技术并用于明确病因和疾病诊断，本专利技术首次发现EYA1一种新型杂合突变，可导致鳃
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耳
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肾综合征，并据此研制相应的诊断试剂盒，助力鳃
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耳
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肾综合征基因突变的筛查和诊断，并为其药物筛选、药效评价及靶向治疗提供新的技术支持。

技术实现思路

[0006]本专利技术的主要目的是提供一种导致鳃
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耳
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肾综合征的致病基因、检测及应用，以解决鳃
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耳
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肾综合征的筛查和诊断的技术问题。
[0007]为实现上述目的，本专利技术提供了一种导致鳃
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耳
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肾综合征的致病基因，所述致病基因相比于野生型EYA1基因，在所述野生型EYA1基因的第11号外显子的第986位碱基发生碱基T突变为碱基A。
[0008]本专利技术还提供一种由如上述任意所述致病基因引发的鳃
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耳
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肾综合征的检测试剂，所述检测试剂包括针对所述致病基因发生突变的位点设计的特异性扩增引物。
[0009]进一步地，所述特异性扩增引物包括EYA1
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1F、EYA1
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1R，所述EYA1
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1F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述EYA1
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1R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
[0010]本专利技术还提供一种鳃
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耳
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肾综合征的检测试剂盒，包括如上述任意所述检测试剂。
[0011]进一步地，还包括PCR扩增反应的试剂，和/或DNA测序时所需的试剂和测序引物。
[0012]进一步地，所述测序引物包括EYA1
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Seq1F和EYA1
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Seq1R，所述EYA1
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Seq1F的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，所述EYA1
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Seq1R的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。
[0013]本专利技术还提供如上述任意所述检测试剂或如上述任意所述检测试剂盒在鳃
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耳
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肾综合征的检测方法中的应用。
[0014]进一步地，所述检测试剂的检测样本包括血液和/或羊水。
[0015]本次申请提出导致鳃
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耳
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肾综合征的致病基因，可以有效将鳃
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耳
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肾综合征患者和正常人群区分开，因此，本专利技术的致病基因突变可以作为诊断鳃
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耳
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肾综合征的生物标志物。本本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种导致鳃
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耳
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肾综合征的致病基因，其特征在于，所述致病基因相比于野生型EYA1基因，在所述野生型EYA1基因的第11号外显子的第986位碱基发生碱基T突变为碱基A。2.一种由权利要求1所述致病基因引发的鳃
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耳
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肾综合征的检测试剂，其特征在于，所述检测试剂包括针对所述致病基因发生突变的位点设计的特异性扩增引物。3.根据权利要求2所述检测试剂，其特征在于，所述特异性扩增引物包括EYA1
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1F、EYA1
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1R，所述EYA1
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1F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述EYA1
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1R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。4.一种鳃
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耳

【专利技术属性】
技术研发人员：曾桥，罗娇娇，刘亚宁，刘鑫林，
申请(专利权)人：湖南家辉生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：