使用生物标志物确定骨髓抽吸物的血液稀释制造技术

本发明专利技术公开了用于确定骨髓样品的血液稀释的方法、系统和机器可读介质。在一个示例中，方法包括：分析所述骨髓样品以确定所述骨髓样品中表达一种或多种细胞表面标志物(例如，CD13和互补标志物)的细胞的数量。所述方法进一步包括：将表达所述一种或多种细胞表面标志物(例如，CD13和所述互补标志物)的细胞的所述数量与所述骨髓样品的血液稀释的水平相关。数量与所述骨髓样品的血液稀释的水平相关。数量与所述骨髓样品的血液稀释的水平相关。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】使用生物标志物确定骨髓抽吸物的血液稀释
[0001]专利技术人：
[0002]Alberto Jose Hidalgo Robert,Cherie Louise Green,Shadi Toghi Eshghi,Darya Yuryevna Orlova
[0003]相关申请的交叉引用
[0004]本申请要求2020年7月24日提交的美国临时专利申请号63/056,504的优先权，该美国临时专利申请全文以引用方式并入本文。


[0005]本文提供用于确定或测量来自受试者的骨髓抽吸物或骨髓样品中的血液稀释的方法、系统和试剂盒。更具体地，本说明书提供用于通过测量或确定一种或多种蛋白质或细胞表面标志物的量[或水平]来确定或测量骨髓样品中的血液稀释的方法、系统和试剂盒。

技术介绍

[0006]骨髓抽吸是经由针头从骨头去除(抽出)少量液体骨髓。骨髓抽吸对于诊断、检测和研究至关重要，包括诊断癌症或监测恶性血液病患者的治疗反应。通常，出于各种目的，在一次就诊中会抽吸多个骨髓样品。例如，可以执行第一次抽吸以提供用于形态学评定的骨髓样品，同时可以执行第二次抽吸以提供用于流式细胞术的骨髓样品。然而，连续抽取骨髓可能会逐渐增加这些骨髓样品中的血液污染量，从而血液稀释这些骨髓样品。这种类型的血液稀释可能会降低从使用骨髓样品执行的分析获得的数据的可靠性。在某些情况下，可能需要从分析中排除具有大量血液稀释的骨髓样品。因此，需要准确测量骨髓样品中血液稀释的量的方法、系统和试剂盒。

技术实现思路

[0007]本文所述的实施例提供用于确定骨髓样品中的血液稀释水平的各种方法、系统和计算机程序产品。
[0008]在一些实施例中，提供一种用于确定骨髓样品的血液稀释的方法。该方法包括：分析骨髓样品以确定骨髓样品中表达CD13和互补标志物的细胞的数量。该方法进一步包括：将表达CD13和互补标志物的细胞的数量与骨髓样品的血液稀释的水平相关。
[0009]在一些实施例中，提供一种存储用于确定骨髓样品的血液稀释的计算机指令的非暂态计算机可读介质。一个或多个处理器接收从骨髓样品获得的数据。一个或多个处理器分析数据，以确定骨髓样品中表达CD13和互补标志物的细胞的数量。一个或多个处理器将表达CD13和互补标志物的细胞的数量与骨髓样品的血液稀释的水平相关。
[0010]在一些实施例中，提供一种用于通过分析从受试者获得的骨髓样品来监测受试者的疾病或病症的进展的方法。该方法包括：确定骨髓样品中表达CD13和互补标志物的细胞的数量。该方法包括：将表达CD13和互补标志物的细胞的数量与骨髓样品的血液稀释的水平相关。该方法进一步包括：评定血液稀释水平是否通过预设的血液稀释标准，并且响应于
通过预设的血液稀释标准的血液稀释的水平，执行对骨髓样品的评定或分析。
[0011]在一些实施例中，提供一种用于通过分析从受试者获得的骨髓样品来监测受试者的疾病或病症的进展的方法。该方法包括：从骨髓样品提取与CD13和互补标志物相关联的靶向mRNA分子。该方法包括：对从骨髓样品提取的靶向mRNA分子进行测序。该方法包括：使用从靶向mRNA分子获得的序列数据来确定在骨髓样品中CD13和互补标志物的表达水平。该方法包括：评定CD13和互补标志物的表达水平是否通过预设的互补标志物表达标准。并且该方法包括：响应于CD13和互补标志物的表达水平通过预设的互补标志物表达标准，执行对骨髓样品的评定或分析。
[0012]在一些实施例中，提供一种用于通过分析从正在用治疗方案进行治疗的受试者获得的骨髓样品来监测该治疗方案在治疗疾病或病症中的效果的方法。该方法包括：确定骨髓样品中表达CD13和互补标志物的细胞的数量。该方法包括：将细胞的数量与骨髓样品的血液稀释的水平相关。该方法包括：评定血液稀释的水平是否通过预设的血液稀释标准。并且该方法包括：响应于血液稀释的水平通过预设的血液稀释标准，执行对骨髓样品的评定或分析以进行以下中的至少一项：监测或验证治疗方案的治疗效果。
[0013]在一些实施例中，提供一种用于通过分析从正在用治疗方案进行治疗的受试者获得的骨髓样品来监测该治疗方案在治疗疾病或病症中的效果的方法。该方法包括：从骨髓样品提取与CD13和互补标志物相关联的靶向mRNA分子。该方法包括：对从骨髓样品提取的靶向mRNA分子进行测序。该方法包括：使用从靶向mRNA分子获得的序列数据来确定在骨髓样品中CD13和互补标志物的表达水平。该方法包括：评定CD13和互补标志物的表达水平是否通过预设的互补标志物表达标准。并且该方法包括：响应于CD13和互补标志物的表达水平通过预设的互补标志物表达标准，执行对骨髓样品的评定或分析以进行以下中的至少一项：监测或验证治疗方案的治疗效果。
[0014]在一些实施例中，提供一种用于确定骨髓样品的血液稀释的方法。该方法包括：分析骨髓样品以鉴定骨髓样品中表达一种或多种细胞表面标志物的细胞的细胞分布。该方法包括：计算细胞分布的统计距离分数。并且该方法包括：将统计距离分数与骨髓样品的血液稀释的水平相关。
[0015]在一些实施例中，提供一种存储用于确定骨髓样品的血液稀释的计算机指令的非暂态计算机可读介质。一个或多个处理器接收从骨髓样品获得的数据。一个或多个处理器分析数据，以鉴定骨髓样品中表达一种或多种细胞表面标志物的细胞的细胞分布。一个或多个处理器计算细胞分布的统计距离分数。一个或多个处理器将统计距离分数与骨髓样品的血液稀释的水平相关。
[0016]在一些实施例中，提供一种用于通过分析从受试者获得的骨髓样品来监测受试者的疾病或病症的进展的方法。该方法包括：计算骨髓样品中表达一种或多种细胞表面标志物的细胞的细胞分布的统计距离分数。该方法包括：将统计距离分数与骨髓样品的血液稀释的水平相关。该方法包括：评定血液稀释的水平是否通过预设的血液稀释标准。并且该方法包括：如果血液稀释的水平通过预设的血液稀释标准，则用骨髓样品确定受试者的疾病或病症的进展。
[0017]在一些实施例中，提供一种用于通过分析从正在用治疗方案进行治疗的受试者获得的骨髓样品来监测该治疗方案在治疗疾病或病症中的效果的方法。该方法包括：计算骨
髓样品中表达一种或多种细胞表面标志物的细胞的细胞分布的统计距离分数。该方法包括：将统计距离分数与骨髓样品的血液稀释的水平相关。该方法包括：评定血液稀释的水平是否通过预设的血液稀释标准。并且该方法包括：如果血液稀释的水平通过预设的血液稀释标准，则验证受试者的疾病或病症的改善。
[0018]在一些实施例中，提供一种用于确定骨髓样品的血液稀释的方法。该方法包括：分析骨髓样品，以鉴定表达至少一种目的细胞表面标志物的细胞亚群的细胞分布。该方法包括：相对于没有血液稀释的对照骨髓样品中的细胞亚群的对照细胞分布，计算细胞分布的统计距离分数。并且该方法包括：将统计距离分数与骨髓样品的血液稀释的水平相关。
[0019]在一个或多个实施例中，提供一种试剂盒以执行上文或本文其他地方所述的方法中的一种或多种方法本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于确定骨髓样品的血液稀释的方法，其包括：分析所述骨髓样品，以确定所述骨髓样品中表达CD13蛋白质和包括一组细胞表面标志物的互补标志物的细胞的数量；以及将表达所述CD13蛋白质和所述互补标志物的细胞的所述数量与所述骨髓样品的血液稀释的水平相关。2.根据权利要求1所述的方法，其中所述互补标志物包括CD11c，并且其中所述骨髓样品中为CD13+和CD11c
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的细胞的减少的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释。3.根据权利要求1所述的方法，其中所述互补标志物包括CD15，并且其中所述骨髓样品中为CD13+和CD15+的细胞的减少的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释。4.根据权利要求1所述的方法，其中所述互补标志物包括CD16，并且其中所述骨髓样品中为CD13+和CD16+的细胞的减少的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释。5.根据权利要求1所述的方法，其中所述互补标志物包括人类白细胞抗原
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DR同种型(HLA
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DR)蛋白质，并且其中所述骨髓样品中为CD13
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和HLA
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DR
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的细胞的增加的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释。6.根据权利要求1所述的方法，其中所述互补标志物包括HLA
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DR蛋白质，并且其中所述骨髓样品中为CD13+和HLA
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DR
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的细胞的减少的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释。7.根据权利要求2至6中任一项所述的方法，其中表达所述CD13蛋白质和所述互补标志物的细胞的所述数量与所述骨髓样品中的血液稀释之间存在线性相关性。8.根据权利要求2至6中任一项所述的方法，其中使用2种、3种、4种、5种或更多种互补标志物的表达来确定细胞的所述数量。9.根据权利要求1至8中任一项所述的方法，其中使用流式细胞仪来测量表达所述CD13蛋白质和所述互补标志物的细胞的所述数量。10.根据权利要求9所述的方法，其中所述互补标志物包括一种或多种选自由CD11c、CD15、CD16和HLA
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DR组成的组的细胞表面标志物。11.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中表达所述CD13蛋白质和所述互补标志物的细胞的所述数量通过以下来确定：利用用于与所述CD13蛋白质和所述互补标志物互补结合的荧光团缀合抗体来对所述骨髓样品进行染色；将激发能施加到所述骨髓样品；以及测量来自所述骨髓样品的荧光发射水平，以确定细胞的所述数量。12.根据权利要求11所述的方法，其中所述互补标志物包括一种或多种选自由CD11c、CD15、CD16和HLA
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DR组成的组的细胞表面标志物。13.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中表达所述CD13蛋白质和所述互补标志物的细胞的所述数量通过以下来确定：分离所述骨髓样品中的每种细胞；提取与所述CD13蛋白质和所述互补标志物的表达相关联的靶向mRNA分子；对从每种分离的细胞提取的所述靶向mRNA分子进行测序以获得测序数据；使用从所述靶向mRNA分子获得的序列数据来确定每种分离的细胞的所述CD13蛋白质和所述互补标志物的表达水平；以及
对表达所述CD13蛋白质和所述互补标志物的细胞与不表达所述CD13蛋白质和所述互补标志物的细胞进行分组。14.根据权利要求13所述的方法，其中所述互补标志物包括一种或多种选自由CD11c、CD15、CD16和HLA
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DR组成的组的细胞表面标志物。15.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中表达所述CD13蛋白质和所述互补标志物的细胞的所述数量通过以下来确定：从所述骨髓样品提取与所述CD13蛋白质和所述互补标志物的表达相关联的靶向mRNA分子；对从所述骨髓样品提取的所述靶向mRNA分子进行测序；以及使用从所述靶向mRNA分子获得的序列数据来确定在所述骨髓样品中所述CD13蛋白质和所述互补标志物的表达水平，以确定细胞的所述数量。16.根据权利要求15所述的方法，其中所述互补标志物包括一种或多种选自由CD11c、CD15、CD16和HLA
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DR组成的组的细胞表面标志物。17.根据权利要求1至16中任一项所述的方法，其进一步包括：确定所述骨髓样品的血液稀释百分比。18.根据权利要求17所述的方法，其中所述血液稀释百分比被计算为相对于在所述骨髓样品中计数的细胞总数量的所述骨髓样品中的表达所述CD13蛋白质和所述互补标志物的细胞的所述数量。19.根据权利要求18所述的方法，其进一步包括：如果所述血液稀释百分比小于约25％，则称为所述骨髓样品的低血液稀释状态。20.根据权利要求18所述的方法，其进一步包括：如果所述血液稀释百分比小于约50％，则称为所述骨髓样品的低血液稀释状态。21.根据权利要求18所述的方法，其进一步包括：如果所述血液稀释百分比小于约75％，则称为所述骨髓样品的低血液稀释状态。22.根据权利要求18所述的方法，其进一步包括：如果所述血液稀释百分比小于约100％，则称为所述骨髓样品的低血液稀释状态。23.根据权利要求17至22中任一项所述的方法，其进一步包括：与所述骨髓样品的所述血液稀释百分比成比例地调整从所述骨髓样品取得的一个或多个分析测量值。24.根据权利要求1至16中任一项所述的方法，其进一步包括：与所述CD13蛋白质和所述互补标志物在所述骨髓样品中的所述表达水平成比例地调整从所述骨髓样品取得的一个或多个分析测量值。25.根据权利要求1至24中任一项所述的方法，其进一步包括：基于表达所述CD13蛋白质和所述互补标志物的细胞的所述数量所与之相关的所述血液稀释的水平来生成报告。26.根据权利要求25所述的方法，其中所述报告包括对所述骨髓样品的质量的评定。27.根据权利要求25或权利要求26所述的方法，其中所述报告包括待由操作人员基于所述血液稀释的水平而采取的建议行动。28.根据权利要求25至27中任一项所述的方法，其进一步包括：
在显示系统上显示所述报告，以允许操作人员同时查看对所述骨髓样品的所述质量的评定和待由操作人员基于所述血液稀释的水平而采取的建议行动。29.一种试剂盒，其包含用于执行根据权利要求1至12或17至28中任一项所述的方法的两种或更多种结合剂。30.根据权利要求29所述的试剂盒，其中所述两种或更多种结合剂用于标记CD13，并且互补标志物包括一种或多种选自由CD11c、CD15、CD16和HLA
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DR组成的组的细胞表面标志物。31.一种试剂盒，其包含用于执行根据权利要求13至28中任一项所述的方法的两种或更多种靶向mRNA捕获试剂。32.根据权利要求31所述的试剂盒，其中所述两种或更多种靶向mRNA捕获试剂用于捕获与CD13的表达相关联的mRNA分子，并且互补标志物包括一种或多种选自由CD11c、CD15、CD16和HLA
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DR组成的组的细胞表面标志物。33.一种用于通过分析从受试者获得的骨髓样品来监测所述受试者的疾病或病症的进展的方法，其包括：确定所述骨髓样品中表达CD13蛋白质和互补标志物的细胞的数量；将表达所述CD13蛋白质和互补标志物的细胞的所述数量与所述骨髓样品的血液稀释的水平相关；评定所述血液稀释的水平是否通过预设的血液稀释标准；以及响应于所述血液稀释的水平通过所述预设的血液稀释标准，执行对所述骨髓样品的评定或分析。34.根据权利要求33所述的方法，其中所述互补标志物选自由CD11c、CD15、CD16和HLA
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DR组成的组，并且其中以下中的至少一项：所述骨髓样品中为CD13+和CD11c
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的细胞的减少的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释；所述骨髓样品中为CD13+和CD15+的细胞的减少的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释；所述骨髓样品中为CD13+和CD16+的细胞的减少的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释；所述骨髓样品中为CD13
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和HLA
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DR
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的细胞的增加的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释；或所述骨髓样品中为CD13+和HLA
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DR
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的细胞的减少的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释。35.一种用于通过分析从受试者获得的骨髓样品来监测所述受试者的疾病或病症的进展的方法，其包括：从所述骨髓样品提取与CD13蛋白质和互补标志物相关联的靶向mRNA分子；对从所述骨髓样品提取的所述靶向mRNA分子进行测序；使用从所述靶向mRNA分子获得的序列数据来确定在所述骨髓样品中所述CD13蛋白质和所述互补标志物的表达水平；评定所述CD13蛋白质和所述互补标志物的所述表达水平是否通过预设的互补标志物
表达标准；以及响应于所述CD13蛋白质和所述互补标志物的所述表达水平通过所述预设的互补标志物表达标准，执行对所述骨髓样品的评定或分析。36.根据权利要求35所述的方法，其中所述互补标志物选自由CD11c、CD15、CD16和HLA
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DR组成的组，并且其中以下中的至少一项：所述骨髓样品中为CD13+和CD11c
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的细胞的减少的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释；所述骨髓样品中为CD13+和CD15+的细胞的减少的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释；所述骨髓样品中为CD13+和CD16+的细胞的减少的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释；所述骨髓样品中为CD13
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和HLA
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DR
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的细胞的增加的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释；或所述骨髓样品中为CD13+和HLA
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DR
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的细胞的减少的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释。37.一种用于通过分析从正在用治疗方案进行治疗的受试者获得的骨髓样品来监测所述治疗方案在治疗疾病或病症中的效果的方法，其包括：确定所述骨髓样品中表达CD13蛋白质和互补标志物的细胞的数量；将细胞的所述数量与所述骨髓样品的血液稀释的水平相关；评定所述血液稀释的水平是否通过预设的血液稀释标准；以及响应于所述血液稀释的水平通过所述预设的血液稀释标准，执行对所述骨髓样品的评定或分析以进行以下中的至少一项：监测或验证所述治疗方案的治疗效果。38.根据权利要求37所述的方法，其进一步包括：在确定所述骨髓中表达所述CD13蛋白质和互补标志物的细胞的数量之前，向所述受试者施用治疗药物。39.根据权利要求36或权利要求37所述的方法，其中所述互补标志物选自由CD11c、CD15、CD16和HLA
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DR组成的组，并且其中以下中的至少一项：所述骨髓样品中为CD13+和CD11c
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的细胞的减少的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释；所述骨髓样品中为CD13+和CD15+的细胞的减少的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释；所述骨髓样品中为CD13+和CD16+的细胞的减少的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释；所述骨髓样品中为CD13
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和HLA
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的细胞的增加的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释；或所述骨髓样品中为CD13+和HLA
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的细胞的减少的数量指示所述骨髓样品中增加的血液稀释。40.一种用于通过分析...

【专利技术属性】
技术研发人员：A，
申请(专利权)人：基因泰克公司，
类型：发明
国别省市：