一种与猪背膘厚相关的SNP分子标记及应用制造技术

本发明专利技术公开了一种与猪背膘厚相关的SNP分子标记，该SNP分子标记为位于国际猪基因组Sscrofa11.1版本第5号染色体第66885632bp位点处的T>C突变或位于如SEQ ID NO：1所示的第106位点的M表示的T>C突变，该分子标记与猪背膘厚性状显著相关，通过使用该分子标记可以建立高效准确的分子标记辅助育种技术，将其应用于降低种猪背膘厚的遗传改良中，从而提高猪群体的产肉(瘦肉)性能，提高企业经济利润，增加核心竞争力。通过优选该SNP分子标记的优势等位基因，能够逐代增加优势等位基因频率，降低核心群种猪的背膘厚，加快种猪相关胴体性状的改良进展从而有效提高种猪育种的经济效益。改良进展从而有效提高种猪育种的经济效益。改良进展从而有效提高种猪育种的经济效益。

【技术实现步骤摘要】
一种与猪背膘厚相关的SNP分子标记及应用


[0001]本专利技术涉及动物遗传育种领域，特别涉及一种与猪背膘厚相关的SNP分子标记及应用。

技术介绍

[0002]在生猪生产过程中，背膘厚是评价生猪育肥效果和猪脂肪沉积能力的关键指标。降低背膘厚和提高胴体瘦肉率是国内外猪育种工作的重要育种目标。此外，背膘厚还对母猪初情期的出现和繁殖性能有一定的影响，因此，通过猪背膘厚预测其他性状具有重要意义。猪的背膘厚属于中高等遗传力性状，遗传力约为0.45，且较为容易度量，所以通过常规的育种方法进行改良可以取得非常显著的成效。
[0003]目前，随着猪全基因组序列的公布和高密度芯片的研发，通过全基因组关联分析(Genome
‑
wide association study,GWAS)鉴定与猪经济性状相关的分子标记和候选基因得到广泛使用。因此，采用GWAS分析策略可以鉴定得到与猪背膘厚相关的分子标记，从而加快猪背膘性状的遗传改良进展，从而提高猪场经济效益。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的是提供一种与猪背膘厚相关的SNP分子标记及应用，以解决上述问题。
[0005]根据本专利技术的第一个方面，提供了一种与猪背膘厚相关的SNP分子标记，该分子标记位于国际猪基因组Sscrofa11.1版本第5号染色体第66885632bp位点处的T>C碱基突变。该分子标记与猪背膘厚性状显著相关，通过使用该分子标记可以建立高效准确的分子标记辅助育种技术，将其应用于降低种猪背膘厚的遗传改良中，从而提高猪群体的产肉(瘦肉)性能，提高企业经济利润，增加核心竞争力。通过优选该SNP分子标记的优势等位基因，能够逐代增加优势等位基因频率，降低核心群种猪的背膘厚，加快种猪相关胴体性状的改良进展从而有效提高种猪育种的经济效益。
[0006]在某些实施方式中，该SNP分子标记位点上下游基因序列如SEQ ID NO：1所示，所述SNP分子标记位于该SEQ ID NO：1所示的第106位点的M表示的T>C碱基突变。
[0007]根据本专利技术的第二个方面，提供了一种SNP分子标记在培育低背膘厚猪品种上的应用。该分子标记为位于国际猪基因组Sscrofa11.1版本第5号染色体第66885632bp位点处的T>C突变或位于如SEQ IDNO：1所示的第106位点的M表示的T>C突变。通过对后备种猪的基因型进行筛选，并选留TT或TC的种猪个体进行扩繁，以逐代提高后代猪群体中等位基因T的频率，从而培育出低背膘厚的猪品种。由此，可以降低种猪背膘厚，从而提高后代猪群体的产肉性能，提高企业经济利润，增加核心竞争力。
[0008]在某些实施方式中，该应用包括如下步骤：
[0009]1)检测后备种猪中第5号染色体第66885632bp位点处的T>C突变或位于如SEQ ID NO：1所示的第106位点的M表示的T>C突变；
[0010]2)选留步骤1)中分子标记基因型为TT或TC的种猪个体，淘汰CC基因型个体；
[0011]3)以步骤2)中筛选出的个体作为种猪，进行繁育，在后代中继续选留步骤1)中分子标记基因型为TT或TC的种猪个体，淘汰CC基因型个体；以逐代提高后代猪群体中等位基因T的频率，从而培育出低背膘厚的猪品种。
[0012]根据本专利技术的第三个方面，提供了一种SNP分子标记在筛选低背膘厚遗传性状的仔猪上的应用，该SNP分子标记为位于国际猪基因组Sscrofa11.1版本第5号染色体第66885632bp位点处的T>C突变。通过筛选待测仔猪所述分子标记的基因型，就可以在仔猪阶段选留具备低背膘厚遗传性状的仔猪进行饲养，由此可以在仔猪阶段就对猪群进行分选，对TT或TC基因个体仔猪作为后备猪进行养殖，可以高效地降低该后备猪群体的背膘厚，实现更好的经济价值。
[0013]在某些实施方式中，该应用包括如下步骤：
[0014]1)检测待筛选仔猪中第5号染色体第66885632bp位点处的T>C突变或位于如SEQ ID NO：1所示的第106位点处M表示的T>C突变；
[0015]2)步骤1)中检测出的分子标记的基因型为TT或TC时，该待筛选仔猪具有低背膘厚遗传性状，予以保留；基因型为CC时，该待筛选仔猪具有高背膘厚遗传性状，予以淘汰。
[0016]根据本专利技术的第四个方面，提供了一种降低猪背膘厚的遗传改良方法，其中，该方法包括如下步骤：
[0017]1)检测后备种猪中第5号染色体第66885632bp位点处的T>C突变或位于如SEQ ID NO：1所示的第106位点的M表示的T>C突变；
[0018]2)选留步骤1)中分子标记基因型为TT或TC的种猪个体，淘汰CC基因型个体；
[0019]3)以步骤2)中筛选出的个体作为种猪，进行繁育，在后代中继续选留步骤1)中分子标记基因型为TT或TC的种猪个体，淘汰CC基因型个体；以逐代提高后代猪群体中等位基因T的频率，从而降低后代猪的背膘厚。
[0020]通过该方法可以有效降低猪的背膘厚性状，提高胴体瘦肉率，提高猪种的市场竞争力和市场经济价值。
[0021]根据本专利技术的第五个方面，提供了用于检测猪中位于第5号染色体第66885632bp位点处的T>C突变或位于如SEQ ID NO：1所示的第106位点的M表示的T>C突变的SNP分子标记的引物对，其中，该引物对核苷酸序列如下所示：
[0022]P001
‑
F：5
’‑
CGCAGGCACAGAGAAGCACAAG
‑3’
，
[0023]P002
‑
R：5
’‑
CCATCATCTCGCTTGCAGGAATCC
‑3’
。
[0024]通过该引物对，可以高效检测与猪背膘厚相关的SNP分子标记，可建立高效准确的分子标记辅助育种技术，快速准确地对种猪低背膘厚进行提高性选育改良，加快育种进展。
[0025]根据本专利技术的第六个方面，提供了一种用于检测猪中位于第5号染色体第66885632bp位点处的T>C突变或位于如SEQ ID NO：1所示的第106位点的M表示的T>C突变的SNP分子标记的试剂盒，其中，该试剂盒含有如下引物对：
[0026]P001
‑
F：5
’‑
CGCAGGCACAGAGAAGCACAAG
‑3’
，
[0027]P002
‑
R：5
’‑
CCATCATCTCGCTTGCAGGAATCC
‑3’
。
[0028]通过该试剂盒，可以高效检测与猪背膘厚相关的SNP分子标记，可建立高效准确的分子标记辅助育种技术，快速准本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与猪背膘厚相关的SNP分子标记，其中，所述分子标记位于国际猪基因组Sscrofa11.1版本第5号染色体第66885632bp位点处的T>C碱基突变。2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其中，所述SNP分子标记位点上下游基因序列如SEQ ID NO：1所示，所述SNP分子标记位于该SEQ ID NO：1所示的第106位点处M表示的T>C碱基突变。3.权利要求1或2中所述的SNP分子标记在培育低背膘厚猪品种上的应用。4.根据权利要求3所述的应用，其中，所述应用包括如下步骤：1)检测后备种猪中如权利要求1或2中所述的分子标记；2)选留步骤1)中分子标记基因型为TT或TC的种猪个体，淘汰CC基因型个体；3)以步骤2)中筛选出的个体作为种猪，进行繁育，在后代中继续选留步骤1)中分子标记基因型为TT或TC的种猪个体，淘汰CC基因型个体；以逐代提高后代猪群体中等位基因T的频率，从而培育出低背膘厚的猪品种。5.权利要求1或2中所述的SNP分子标记在筛选低背膘厚遗传性状的仔猪上的应用。6.根据权利要求5所述的应用，其中，所述应用包括如下步骤：1)检测待筛选仔猪中如权利要求1或2中所述的分子标记；2)步骤1)中检测出的分子标记的基因型为TT或TC时，该待筛选仔猪具有低背膘厚遗传性状，予以保留；基因型为CC时，该待筛选...

【专利技术属性】
技术研发人员：叶勇，李绍云，黄如渠，简运华，李结，杨杰，路鹏云，关翔，
申请(专利权)人：广东广垦畜牧工程研究院有限公司，
类型：发明
国别省市：