一种与猪达115公斤体重日龄相关的SNP分子标记及应用制造技术

本发明专利技术公开了一种与猪达115公斤体重日龄相关的分子标记，该分子标记为位于国际猪基因组Sscrofa11.1版本第1号染色体第160284793bp位点处的G>A突变或位于如SEQ ID NO：1所示的第131位点的M表示的G>A突变，该分子标记与猪达115公斤体重日龄性状显著相关，通过使用该分子标记可以建立高效准确的分子标记辅助育种技术，将其应用于降种猪达115公斤体重日龄的遗传改良中，从而提高猪群体的生长速度，提高企业经济利润，增加核心竞争力。通过优选该SNP分子标记的优势等位基因，能够逐代增加优势等位基因频率，降低核心群种猪达115公斤体重日龄，加快种猪相关生长性状的改良进展从而有效提高种猪育种的经济效益。有效提高种猪育种的经济效益。有效提高种猪育种的经济效益。

【技术实现步骤摘要】
一种与猪达115公斤体重日龄相关的SNP分子标记及应用


[0001]本专利技术涉及动物遗传育种领域，特别涉及一种与猪达115公斤体重日龄相关的SNP分子标记及应用。

技术介绍

[0002]猪达115公斤体重日龄和猪的生长性能直接相关。猪的生长速度越慢，意味着猪达到115公斤上市体重的日龄越大，从而增加饲养成本并降低猪场经济效益。因此，研究猪的达115公斤体重日龄，具有重要的育种研究意义和现实意义。
[0003]相较于基于表型选择的传统选育方式，利用分子标记进行全基因组关联分析(Genome
‑
wide Association Study，GWAS)的检测方法更加高效、快速、低成本。GWAS通过检测猪全基因组中的单核苷酸多肽位点，利用全基因组关联分析方法，挖掘与猪达115公斤体重日龄性状相关的遗传变异标记。最终，利用挖掘出的分子标记，进行分子标记辅助选择和基因组选择技术，提高猪的生长速度，提升猪生长性状改良的遗传进展。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的是提供一种与猪达115公斤体重日龄相关的SNP分子标记及应用，以解决上述问题。
[0005]根据本专利技术的第一个方面，提供了一种与猪达115公斤体重日龄相关的SNP分子标记，该SNP分子标记位于国际猪基因组Sscrofa11.1版本第1号染色体第160284793bp位点处的G>A碱基突变。该分子标记与猪达115公斤体重日龄性状显著相关，通过使用该分子标记可以建立高效准确的分子标记辅助育种技术，将其应用于降低种猪达115公斤体重日龄的遗传改良中，从而提高猪群体的生长性能，提高企业经济利润，增加核心竞争力。通过优选该SNP分子标记的优势等位基因，能够逐代增加优势等位基因频率，降低核心群种猪的达115公斤体重日龄，加快种猪相关生长性状的改良进展从而有效提高种猪育种的经济效益。
[0006]在某些实施方式中，该SNP分子标记上下游基因序列如SEQ ID NO：1所示，所述SNP分子标记位于该SEQ ID NO：1所示的第131位点的M表示的G>A碱基突变。
[0007]根据本专利技术的第二个方面，提供了一种SNP分子标记在培育低达115公斤体重日龄猪品种上的应用。该分子标记为位于国际猪基因组Sscrofa11.1版本第1号染色体第160284793bp位点处的G>A突变或位于如SEQ ID NO：1所示的第131位点的M表示的G>A突变。通过对后备种猪的基因型进行筛选，并选留GG或AG的种猪个体进行扩繁，以逐代提高后代猪群体中等位基因G的频率，从而培育出低达115公斤体重日龄的猪品种。由此，可以降低种猪达115公斤体重日龄，从而提高后代猪群体的生长性能，提高企业经济利润，增加核心竞争力。
[0008]在某些实施方式中，该应用包括如下步骤：
[0009]1)检测后备种猪中第1号染色体第160284793bp位点处的G>A突变或位于如SEQ ID NO：1所示的第131位点的M表示的G>A突变；
[0010]2)选留步骤1)中分子标记基因型为GG或AG的种猪个体，淘汰AA基因型个体；
[0011]3)以步骤2)中筛选出的个体作为种猪，进行繁育，在后代中继续选留步骤1)中分子标记基因型为GG或AG的种猪个体，淘汰AA基因型个体；以逐代提高后代猪群体中等位基因G的频率，从而培育出低达115公斤体重日龄的猪品种。
[0012]根据本专利技术的第三个方面，提供了一种SNP分子标记在筛选低达115公斤体重日龄遗传性状的仔猪上的应用，该SNP分子标记为位于国际猪基因组Sscrofa11.1版本第1号染色体第160284793bp位点处的T>C突变。通过筛选待测仔猪所述分子标记的基因型，就可以在仔猪阶段选留具备低达115公斤体重日龄遗传性状的仔猪进行饲养，由此可以在仔猪阶段就对猪群进行分选，对GG或AG基因个体仔猪作为后备猪进行养殖，可以高效地降低该后备猪群体的达115公斤体重日龄，实现更好的经济价值。
[0013]在某些实施方式中，该应用包括如下步骤：
[0014]1)检测待筛选仔猪中第1号染色体第160284793bp位点处的G>A突变或位于如SEQ ID NO：1所示的第131位点处M表示的G>A突变；
[0015]2)步骤1)中检测出的分子标记的基因型为GG或AG时，该待筛选仔猪具有低达115公斤体重日龄遗传性状，予以保留；基因型为AA时，该待筛选仔猪具有高达115公斤体重日龄遗传性状，予以淘汰。
[0016]根据本专利技术的第四个方面，提供了一种降低猪达115公斤体重日龄的遗传改良方法，其中，该方法包括如下步骤：
[0017]1)检测后备种猪中第1号染色体第160284793bp位点处的G>A突变或位于如SEQ ID NO：1所示的第131位点的M表示的G>A突变；
[0018]2)选留步骤1)中分子标记基因型为GG或AG的种猪个体，淘汰AA基因型个体；
[0019]3)以步骤2)中筛选出的个体作为种猪，进行繁育，在后代中继续选留步骤1)中分子标记基因型为GG或AG的种猪个体，淘汰AA基因型个体；以逐代提高后代猪群体中等位基因G的频率，从而降低后代猪的达115公斤体重日龄。
[0020]通过该方法可以有效降低猪的达115公斤体重日龄性状，提高猪生长速度，提高猪种的市场竞争力和市场经济价值。
[0021]根据本专利技术的第五个方面，提供了用于检测猪中位于第1号染色体第160284793bp位点处的G>A突变或位于如SEQ ID NO：1所示的第131位点的M表示的G>A突变的SNP分子标记的引物对，其中，该引物对核苷酸序列如下所示：
[0022]P001
‑
F：5
’‑
GAGAGAGCACAGTAGATGGTGTCAG
‑3’
，
[0023]P002
‑
R：5
’‑
GCTTCTTCCTGAGTTCCAGGTCAC
‑3’
。
[0024]通过该引物对，可以高效检测与猪达115公斤体重日龄相关的SNP分子标记，可建立高效准确的分子标记辅助育种技术，快速准确地对种猪低达115公斤体重日龄进行提高性选育改良，加快育种进展。
[0025]根据本专利技术的第六个方面，提供了一种用于检测猪中位于第1号染色体第160284793bp位点处的G>A突变或位于如SEQ ID NO：1所示的第131位点的M表示的G>A突变的SNP分子标记的试剂盒，其中，该试剂盒含有如下引物对：
[0026]P001
‑
F：5
’‑
GAGAGAGCACAGTAGATGGTGTCAG
‑3’
，
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与猪达115公斤体重日龄相关的SNP分子标记，其中，所述SNP分子标记位于国际猪基因组Sscrofa11.1版本第1号染色体第160284793bp位点处的G>A碱基突变。2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其中，所述SNP分子标记上下游基因序列如SEQ ID NO：1所示，所述SNP分子标记位于该SEQ IDNO：1所示的第131位点处M表示的G>A碱基突变。3.权利要求1或2中所述的SNP分子标记在培育达115公斤体重日龄低的猪品种上的应用。4.根据权利要求3所述的应用，其中，所述应用包括如下步骤：1)检测后备种猪中如权利要求1或2中所述的分子标记；2)选留步骤1)中分子标记基因型为GG或AG的种猪个体，淘汰AA基因型个体；3)以步骤2)中筛选出的个体作为种猪，进行繁育，在后代中继续选留步骤1)中分子标记基因型为GG或AG的种猪个体，淘汰AA基因型个体；以逐代提高后代猪群体中等位基因G的频率，从而培育出达115公斤体重日龄低的猪品种。5.权利要求1或2中所述的SNP分子标记在筛选低达115公斤体重日龄性状的仔猪上的应用。6.根据权利要求5所述的应用，其中，所述应用包括如下步骤：1)检测待筛选仔猪中如权利要求1或2中所述的分子标记；2)步骤1)中检测出的分子标记的基因型为GG或AG时，该待筛选仔猪具有低达115公斤体重日龄遗传性状，予以保留；基因型为AA时，该待筛选仔猪具有高达115公...

【专利技术属性】
技术研发人员：李结，黄如渠，路鹏云，叶勇，李绍云，关翔，吴业明，王文洲，杨杰，
申请(专利权)人：广东广垦畜牧工程研究院有限公司，
类型：发明
国别省市：