一种用于甲醛固定及石蜡包埋样本的细胞核提取方法技术

本发明专利技术公开了用于甲醛固定及石蜡包埋样本的细胞核提取方法，包括(1)提取细胞核：将PA/PFA固定或者FFPE样本切块，加入细胞核提取溶液，孵育，取上清液、离心，弃上清；(2)清洗细胞核：1)中细胞核沉淀物用PBS mix混合液清洗，离心后弃上清，用PBS mix溶液重悬细胞核。该方法提取的细胞核具备形貌完整性好、纯度高，RNA完整性好，RNA得率高等优点，对于PA/PFA固定以及FFPE样本的转录组学研究有重要意义。及FFPE样本的转录组学研究有重要意义。及FFPE样本的转录组学研究有重要意义。

【技术实现步骤摘要】
一种用于甲醛固定及石蜡包埋样本的细胞核提取方法


[0001]本专利技术涉及生物技术，特别涉及一种用于甲醛固定及石蜡包埋样本的细胞核提取方法。

技术介绍

[0002]PA/PFA固定和FFPE样品是临床上组织保存的首选方法。然而，在固定过程中样本的RNA和其他生物分子间进行交联导致对核酸完整性有负面影响。目前，FFPE样本的转录组学研究仅限于样本直接进行RNA
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Seq，微区采样转录组学和空间转录组学等方面。FFPE样本的细胞核目前只应用于荧光免疫杂交(FISH)和全基因组研究，还未应用于转录组学的研究。
[0003]目前报道的FFPE细胞核全部在37℃条件下进行提取，但是37℃条件下提取的细胞核不适用于后续的转录组研究。

技术实现思路

[0004]专利技术目的：本专利技术的目的在于提供用于甲醛/多聚甲醛(PA/PFA)及石蜡包埋(FFPE)样本的细胞核提取方法。
[0005]技术方案：本专利技术的用于甲醛固定及石蜡包埋样本的细胞核提取方法，包括如下步骤：
[0006](1)提取细胞核：将本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于甲醛固定及石蜡包埋样本的细胞核提取方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)提取细胞核：将PA/PFA固定或者FFPE样本切块，加入细胞核提取溶液，孵育，取上清液、离心，弃上清；(2)清洗细胞核：1)中细胞核沉淀物用PBS mix混合液清洗，离心后弃上清，用PBS mix溶液重悬细胞核。2.根据权利要求1所述的用于甲醛固定及石蜡包埋样本的细胞核提取方法，其特征在于，细胞核提取溶液的成份包括：表面活性剂、蛋白酶和TE缓...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵祥伟，郭云霞，许济涛，
申请(专利权)人：东南大学，
类型：发明
国别省市：