【技术实现步骤摘要】
一种延长秀丽线虫健康寿命的转基因质粒构建方法及应用
[0001]本专利技术属于生物科学
,具体涉及一种延长秀丽线虫健康寿命的转基因质粒构建方法及应用。
技术介绍
[0002]健康长寿是人类历来追求的目标,我国虽已进入了长寿时代,但长寿而不健康的问题依然突出。健康长寿的调控机制一直是医学与生命科学领域中的研究热点。
[0003]秀丽线虫因其具有生命周期短、易于培养与观察、完整的细胞谱系、强大的遗传分析手段以及高度保守的基因组等优点,已被广泛作为模式生物用于寿命调控机制的研究,许多调控寿命的信号通路都是首先在秀丽线虫中被发现并阐明的。秀丽线虫寿命受多种因素影响:遗传因素、环境因素以及多种保守的信号转导途径,如IIS、TGF
‑
β、TOR、AMPK等。目前,延长秀丽线虫寿命的方法主要包括:低温培养、限饲、基因遗传操作等。其中基因遗传操作是通过遗传因素影响秀丽线虫寿命的方法,主要是对特定基因进行敲除或沉默,如daf
‑
2、hcf
‑
1、let
‑
3
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种延长秀丽线虫健康寿命的转基因质粒的构建方法,其特征在于,该方法为:S1、构建pMD18
‑
T simple
‑
pU6::shRNA(RPS
‑
30
UbL
)质粒:S101、以pLKO.1puro质粒为模板,通过PCR扩增U6启动子序列,并通过TA克隆,将U6启动子PCR产物克隆到pMD18
‑
T simple质粒中,构建pMD18
‑
T simple
‑
pU6质粒,然后对得到的pMD18
‑
T simple
‑
pU6质粒进行AgeI/EcoRI限制性内切酶双酶切,得到AgeI/EcoRI双酶切产物,并对AgeI/EcoRI双酶切产物进行胶回收,具体的步骤包括:S1011、以pLKO.1puro质粒为模板,以上游引物U6P1和下游引物U6P2进行PCR反应扩增U6启动子,得到U6启动子PCR产物;所述上游引物U6P1的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述下游引物U6P2的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;PCR反应体系为:pLKO.1puro质粒0.2μL、上游引物U6P1 1μL、下游引物U6P2 1μL、LA Taq 0.25μL、10
×
LA Taq buffer 2.5μL、ddH2O补至25μL;PCR反应程序为:95℃预变性2min;94℃变性30s,50℃退火30s,72℃延伸30s,循环25次;72℃延伸5min;4℃保存;S1012、在16℃的温度条件下,通过TA克隆,将S1011中得到的U6启动子PCR产物过夜连接到pMD18
‑
T simple质粒中,得到TA克隆连接产物pMD18
‑
T simple
‑
pU6;连接反应体系:U6启动子PCR产物4μL、pMD18
‑
T simple质粒0.5μL、DNA连接缓冲液Solution I 4.5μL、ddH2O补至10μL;S1013、转化涂板:在
‑
80℃的保存温度中取出Escherichia coli TOP10感受态细菌,加入S1012中得到的TA克隆连接产物pMD18
‑
T simple
‑
pU6,混合均匀,冰浴30min然后在42℃温度下热应激90s,再冰浴2min,加入1mL LB液体培养基培养,于温度为37℃、摇床转速为250rpm/min的条件下培养1h,经离心得到转化后的残留菌液,将转化后的残留菌液滴加至含氨苄青霉素抗性的固体LB培养板中,并涂布均匀,置于温度为37℃的细菌培养箱中过夜培养;S1014、测序鉴定:在S1013中过夜培养的固体LB培养板中挑取单克隆菌落,分别置于3mL含氨苄青霉素抗性的LB液体培养基中,于温度为37℃、摇床转速为250rpm/min的条件下培养10h,分别取得到的菌液进行测序鉴定,筛选得到的测序结果正确的单克隆菌落;S1015、提取pMD18
‑
T simple
‑
pU6质粒:将S1014中得到的测序正确的单克隆菌落使用AxyPrep Plasmid Miniprep Kit质粒提取试剂盒提取,得到pMD18
‑
T simple
‑
pU6质粒;S1016、AgeI/EcoRI限制性内切酶双酶切;在37℃的温度条件下,对S1015中得到的pMD18
‑
T simple
‑
pU6质粒进行5h AgeI/EcoRI限制性内切酶双酶切反应,得到AgeI/EcoRI双酶切产物;反应体系:pMD18
‑
T simple
‑
pU6质粒1.5μg、10
×
FastDigest Green buffer 2μL、AgeI限制性内切酶1μL、EcoRI限制性内切酶1μL、ddH2O补至20μL;S1017、胶回收AgeI/EcoRI双酶切产物:将S1016中得到的AgeI/EcoRI双酶切产物进行1%琼脂糖凝胶电泳,切下270bp大小的目的DNA条带,使用AxyPrep DNA Gel Extraction Kit胶回收试剂盒回收,得到AgeI/EcoRI双酶切后胶回收产物;
S102、将引物UbLshR1和引物UbLshR2退火,得到退火产物,即针对RPS
‑
30
UbL
区域的短发夹RNA:shRNA(RPS
‑
30
UbL
);所述引物UbLshR1的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,所述引物UbLshR2的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示;退火体系:引物UbLshR1 1.5μL、引物UbLshR2 1.5μL、10
×
NEB buffer II 5μL、ddH2O补至50μL;退火程序:95℃预变性5min;70℃变性15min;以每秒降低0.1℃的速度降至22℃;
‑
40℃保存;S103、将S101中得到的AgeI/EcoRI双酶切后胶回收产物与S102中得到的退火产物连接,构建得到pMD18
‑
T simple
‑
pU6::shRNA(RPS
‑
30
UbL
)质粒,具体的步骤包括:S1031、在16℃的温度条件下,将S101中得到的AgeI/EcoRI双酶切后胶回收产物和S102中得到的退火产物过夜连接,得到连接产物pMD18
‑
T simple
‑
pU6::shRNA(RPS
‑
30
UbL
);连接反应体系:AgeI/EcoRI双酶切后胶回收产物100ng、退火产物500ng、Ligation Mix 8μL、ddH2O补至25μL;S1032、转化涂板:在
‑
80℃的保存温度中取出E.coli Stbl3感受态细菌,加入S1031中得到的连接产物pMD18
‑
T simple
‑
pU6::shRNA(RPS
‑
30
UbL
),混合均匀,冰浴30min然后在42℃温度下热应激90s,再冰浴2min,加入1mL LB液体培养基培养,于温度为37℃、摇床转速为250rpm/min的条件下培养1h,经离心得到转化后的残留菌液,将转化后的残留菌液滴加至含氨苄青霉素(Amp)抗性的固体LB培养板中,并涂布均匀,置于温度为37℃的细菌培养箱中过夜培养;S1033、测序鉴定:在S1032中过夜培养转化后的固体LB培养板中挑取单克隆菌落,分别置于3mL含氨苄青霉素抗性的LB液体培养基中,于温度为37℃、摇床转速为250rpm/min的条件下培养10h,分别取得到的菌液进行测序鉴定,筛选出得到的测序结果正确的单克隆菌落;S1034、提取pMD18
‑
T simple
‑
pU6::shRNA(RPS
‑
30
UbL
)质粒;将S1033中得到的测序正确的单克隆菌落使用AxyPrep Plasmid Miniprep Kit质粒提取试剂盒提取,得到pMD18
‑
T simple
‑
pU6::shRNA(RPS
‑
30
UbL
)质粒;S2、构建pMD18
‑
T simple
‑
pRPS
‑
30::GFP::RPS
‑
30
S30
质粒:S201、以秀丽线虫基因组DNA序列为模板,通过PCR扩增rps
‑
30启动子序列,得到rps
‑
30启动子PCR产物;以pEGFP
‑
c2质粒为模板,通过PCR扩增GFP核酸序列,得到GFP PCR产物;以秀丽线虫RNA序列反转录获得的cDNA为模板,通过PCR扩增RPS
‑
30
S30
核酸序列,得到RPS
‑
30
S30 PCR产物,具体的步骤包括:S2011、提取秀丽线虫基因组DNA:使用提取基因组DNA的试剂盒TaKaRa MiniBEST Universal Genomic DNA Extraction Kit Ver.5.0进行提取,得到秀丽线虫基因组DNA;S2012、以S2011中得到的秀丽线虫基因组DNA为模板,PCR扩增rps
‑
30启动子序列:以秀丽线虫基因组DNA为模板,以上游引物rps30P1和下游引物rps30P2进行PCR反应扩增rps
‑
30启动子序列,得到rps
‑
30启动子PCR产物;所述上游引物rps30P1的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示,所述下游引物rps30P2的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示;PCR反应体系:秀丽线虫基因组DNA 2μL、上游引物rps30P1 1μL、下游引物rps30P2 1μ
L、LA Taq 0.25μL、10
×
LA Taq buffer 2.5μL、ddH2O补至25μL;PCR反应程序:95℃预变性4min;94℃变性1min,50℃退火1min,72℃延伸2min,循环28次;72℃延伸10min;4℃保存;S2013、以pEGFP
‑
c2质粒为模板,PCR扩增GFP核酸序列:以pEGFP
‑
c2质粒为模板,以上游引物GFP1和下游引物GFP2进行PCR反应扩增GFP核酸序列,得到GFP PCR产物;所述上游引物GFP1的核苷酸序列如SEQ ID NO:7所示,所述下游引物GFP2的核苷酸序列如SEQ ID NO:8所示;PCR反应体系:pEGFP
‑
c2质粒0.2μL、上游引物GFP1 1μL、下游引物GFP2 1μL、LA Taq 0.25μL、10
×
LA Taq buffer 2.5μL、ddH2O补至25μL;PCR反应程序:95℃预变性2min;94℃变性30s,50℃退火30s,72℃延伸30s,循环25次;72℃延伸5min;4℃保存;S2014、提取秀丽线虫总RNA;S2015、秀丽线虫RNA序列反转录获得cDNA;S2016、以S2015中得到的cDNA为模板,PCR扩增RPS
‑
30
S30
核酸序列,具体方法为:以S2015中得到的cDNA为模板,以上游引物s30F和下游引物s30R进行PCR反应扩增RPS
‑
30
S30
核酸序列,得到RPS
‑
30
S30 PCR产物;所述上游引物s30F的核苷酸序列如SEQ ID NO:9所示,所述下游引物s30R的核苷酸序列如SEQ ID NO:10所示;PCR反应体系:cDNA 2μL、上游引物s30F 1μL、下游引物s30R 1μL、LA Taq 0.25μL、10
×
LA Taq buffer 2.5μL、ddH2O补至25μL;PCR反应程序:95℃预变性4min;94℃变性30s,50℃退火30s,72℃延伸30s,循环25次;72℃延伸5min;4℃保存;S202、通过TA克隆分别将S2012中得到的rps
‑
30启动子PCR产物、GFP PCR产物和RPS
‑
30
S30 PCR产物连接到pMD18
‑
T simple质粒中,并进行测序鉴定,提取得到pMD18
‑
T simple
‑
pRPS
‑
30质粒、pMD18
‑
T simple
‑
GFP质粒和pMD18
‑
T simple
‑
RPS
‑
30
S30
质粒,具体的步骤包括:S2021、在16℃的温度条件下,通过TA克隆将S201中得到的rps
‑
30启动子PCR产物过夜连接到pMD18
‑
T simple质粒中,得到连接产物pMD18
‑
T simple
‑
pRPS
‑
30;在16℃的温度条件下,通过TA克隆将S2013中得到的GFP PCR产物过夜连接到pMD18
‑
T simple质粒中,得到连接产物pMD18
‑
T simple
‑
GFP;在16℃的温度条件下,通过TA克隆将S2016中得到的RPS
‑
30
S30 PCR产物分别过夜连接到pMD18
‑
T simple质粒中,得到连接产物pMD18
‑
T simple
‑
RPS
‑
30
S30
;连接反应体系:PCR产物4μL、pMD18
‑
T simple质粒0.5μL、DNA连接缓冲液Solution
Ⅰꢀ
4.5μL、ddH2O补至10μL;所述PCR产物为rps
‑
30启动子PCR产物或GFP PCR产物或RPS
‑
30
S30 PCR产物;S2022、转化涂板:在
‑
80℃的保存温度中取出3支Escherichia coli TOP10感受态细菌,第一支Escherichia coli TOP10感受态细菌中加入S2021中得到的连接产物pMD18
‑
T simple
‑
pRPS
‑
30,第二支Escherichia coliTOP10感受态细菌中加入S2021中得到的连接产物pMD18
‑
T simple
‑
GFP,第三支E.coli TOP10感受态细菌中加入S2021中得到的连接产物
pMD18
‑
T simple
‑
RPS
‑
30
S30
,分别混合均匀后,冰浴30min,然后在42℃温度下热应激90s,再冰浴2min,加入1mL LB液体培养基培养,于温度为37℃、摇床转速为250rpm/min的条件下培养1h,经离心得到转化后的残留菌液,将转化后的残留菌液滴加至含氨苄青霉素抗性的固体LB培养板中,并涂布均匀,置于温度为37℃的细菌培养箱中过夜培养;S2023、测序鉴定:在S2022中过夜培养的固体LB培养板中分别挑取单克隆菌落,然后分别置于3mL含氨苄青霉素抗性的LB液体培养基中,于温度为37℃、摇床转速为250rpm/min的条件下培养10h,分别取得到的菌液进行测序鉴定,筛选出得到的测序结果正确的单克隆菌落;S2024、提取pMD18
‑
T simple
‑
pRPS
‑
30质粒、pMD18
‑
T simple
‑
GFP质粒和pMD18
‑
T simple
‑
RPS
‑
30
S30
质粒:将S2023中得到的测序正确的单克隆菌落使用AxyPrep Plasmid Miniprep Kit质粒提取试剂盒提取,分别得到pMD18
‑
T simple
‑
pRPS
‑
30质粒、pMD18
‑
T simple
‑
GFP质粒和pMD18
‑
T simple
‑
RPS
‑
30
S30
质粒;S203、将S2024中得到的pMD18
‑
T simple
‑
pRPS
‑
30质粒和pMD18
‑
T simple
‑
RPS
‑
30
S30
质粒分别进行NheI/EcoRI限制性内切酶双酶切,胶回收得到NheI/EcoRI双酶切后胶回收产物,连接NheI/EcoRI双酶切胶回收产物,构建得到pMD18
‑
T simple
‑
pRPS
‑
30::RPS
‑
30
S30
质粒,具体的步骤包括:S2031、NheI/EcoRI限制性内切酶双酶切;在37℃的温度条件下,用NheI/EcoRI限制性内切酶对S2024中得到的pMD18
‑
T simple
‑
pRPS
‑
30质粒进行5h的双酶切反应,得到pMD18
‑
T simple
‑
pRPS
‑
30质粒NheI/EcoRI双酶切产物;在37℃的温度条件下,用NheI/EcoRI限制性内切酶对S2024中得到的pMD18
‑
T simple
‑
RPS
‑
30
S30
质粒进行5h的双酶切反应,得到pMD18
‑
T simple
‑
RPS
‑
30
S30
质粒NheI/EcoRI双酶切产物;反应体系:pMD18
‑
T simple
‑
pRPS
‑
30质粒或pMD18
‑
T simple
‑
RPS
‑
30
S30
质粒1.5μg、10
×
FastDigest Green buffer 2μL、NheI限制性内切酶1μL、EcoRI限制性内切酶1μL、ddH2O补至20μL;S2032、胶回收NheI/EcoRI双酶切产物:将S2031中得到的pMD18
‑
T simple
‑
pRPS
‑
30质粒NheI/EcoRI双酶切产物进行1%琼脂糖凝胶电泳,切下4400bp大小的目的DNA条带,并使用AxyPrep DNA Gel Extraction Kit胶回收试剂盒回收,得到pMD18
‑
T simple
‑
pRPS
‑
30质粒NheI/EcoRI双酶切后胶回收产物;将S2031中得到的pMD18
‑
T simple
‑
RPS
‑
30
S30
质粒NheI/EcoRI双酶切产物进行1%琼脂糖凝胶电泳,切下180bp大小的目的DNA条带,并使用AxyPrep DNA Gel Extraction Kit胶回收试剂盒回收,得到pMD18
‑
Tsimple
‑
RPS
‑
30
S30
质粒NheI/EcoRI双酶切后胶回收产物;S2033、在16℃的温度条件下,将S2032中得到的pMD18
‑
T simple
‑
pRPS
‑
30质粒NheI/EcoRI双酶切后胶回收产物和pMD18
‑
T simple
‑
RPS
‑
30
S30
质粒NheI/EcoRI双酶切后胶回收产物过夜连接,得到NheI/EcoRI双酶切后胶回收产物的连接产物:连接反应体系:pMD18
‑
T simple
‑
pRPS
‑
30质粒NheI/EcoRI双酶切后胶回收产物100ng、pMD18
‑
T simple
‑
RPS
‑
30
S30
质粒NheI/EcoRI双酶切后胶回收产物500ng、Ligation Mix 8μ
L、ddH2O补至25μL;S2034、转化涂板:在
‑
80℃的保存温度中取出Escherichia coli TOP10感受态细菌,加入S2033中得到的NheI/EcoRI双酶切后胶回收产物的连接产物,混合均匀,冰浴30min然...
【专利技术属性】
技术研发人员:闫宝龙,孙委委,梁韶晖,黄慧聪,姜婷,周坤铮,
申请(专利权)人:温州医科大学,
类型:发明
国别省市:
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。