SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用及引物序列制造技术

本发明专利技术公开了一种SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用及引物序列。本发明专利技术提供的SNP标记包括8个SNP位点中的多个或全部，能够对选自DBA/2、FVB、BALB/cJ、C57BL/6、C57BL/6

【技术实现步骤摘要】
SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用及引物序列


[0001]本专利技术属于小鼠品系鉴定的
，具体涉及一种SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用及引物序列。

技术介绍

[0002]实验动物是指经人工饲育且对其携带的微生物实行控制、遗传背景明确或者来源清楚、用于科学研究、教学、生产、检定以及其他科学实验的动物。常见的实验动物有实验大鼠和实验小鼠，包括有数千种封闭群、近交系、重组同类系、重组近交系和突变系等品系。
[0003]在常见的、历史比较久的多种近交系小鼠品系中，各小鼠品系之间的遗传差异较大。但是，在表观遗传学性状上差异却并不大，几乎无法单纯从外观上来鉴定近交系小鼠品系。随着生命医学的发展，科研人员和商业对实验动物质量的要求越来越高。因此，对近交系小鼠品系的鉴定成了亟待解决的问题。
[0004]专利文献CN114507744A(以下称文献1)公开一种SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用以及鉴定引物序列，其采用15个SNP位点能够同时鉴定出C57BL/6J、C57BL/6N、BALB/c、FVB、DBA/2、CBA/Ca本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种SNP标记在近交系小鼠品系鉴定中的应用，其特征在于，利用8个SNP位点中的多个或全部对10种近交系小鼠品系中的部分或全部进行鉴定，所述8个SNP位点分别命名为：SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8，所述近交系小鼠品系选自DBA/2Nifdc、FVB/NJNjuNifdc、BALB/cJNifdc、C57BL/6JNifdc、C57BL/6JNifdc
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bg、NPI、NCPC/2Nifdc、NU/JNifdc、C3H/HeJNifdc、和T739/Nifdc；其中：所述SNP1的Ensembl rs编号为rs3023039，其等位基因为T或C；所述SNP2的Ensembl rs编号为rs3089109，其等位基因为C或G；所述SNP3的Ensembl rs编号为rs3712692，其等位基因为G或T；所述SNP4的Ensembl rs编号为rs3022977，其等位基因为C或T；所述SNP5的Ensembl rs编号为rs3709624，其等位基因为T或C；所述SNP6的Ensembl rs编号为rs3022825，其等位基因为T或C；所述SNP7的Ensembl rs编号为rs3089984，其等位基因为A或C；所述SNP8的Ensembl rs编号为rs3023436，其等位基因为T或A。2.权利要求1所述的SNP标记在制备用于鉴定近交系小鼠品系的试剂盒或液相芯片中的应用，其特征在于，所述试剂盒或液相芯片用于检测所述近交系小鼠品系的8个SNP位点的等位基因；其中所述8个SNP位点分别为：SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8，所述近交系小鼠品系选自DBA/2Nifdc、FVB/NJNjuNifdc、BALB/cJNifdc、C57BL/6JNifdc、C57BL/6JNifdc
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bg、NPI、NCPC/2Nifdc、NU/JNifdc、C3H/HeJNifdc、T739/Nifdc。3.一种用于扩增权利要求1所述的SNP标记的引物组合，其特征在于，所述引物组合用于鉴定近交系小鼠品系，包括用于扩增SNP1位点的第一引物、用于扩增SNP2位点的第二引物、用于扩增SNP3位点的第三引物、用于扩增SNP4位点的第四引物、用于扩增SNP5位点的第五引物、用于扩增SNP6位点的第六引物、用于扩增SNP7位点的第七引物、用于扩增SNP8位点的第八引物，且所述近交系小鼠品系选自DBA/2Nifdc、FVB/NJNjuNifdc、BALB/cJNifdc、C57BL/6JNifdc、C57BL/6JNifdc
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bg、NPI、NCPC/2Nifdc、NU/JNifdc、C3H/HeJNifdc、T739/Nifdc；可选地，所述第一引物包括SNP1
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F和SNP1
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R，其中所述SNP1
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F的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，所述SNP1
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示；所述第二引物包括SNP2
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F和SNP2
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R，其中所述SNP2
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F的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示，所述SNP2
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示；所述第三引物包括SNP3
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F和SNP3
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R，其中所述SNP3
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F的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示，所述SNP3
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示；所述第四引物包括SNP4
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F和SNP4
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R，其中所述SNP4
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F的核苷酸序列如SEQ ID NO:7所示，所述SNP4
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO:8所示；所述第五引物包括SNP5
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F和SNP5
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R，其中所述SNP5
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F的核苷酸序列如SEQ ID NO:9所示，所述SNP5
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO:10所示；所述第六引物包括SNP6
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F和SNP6
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R，其中所述SNP6
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F的核苷酸序列如SEQ ID NO:11所示，所述SNP6
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO:12所示；所述第七引物包括SNP7
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F和SNP7
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R，其中所述SNP7
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F的核苷酸序列如SEQ ID NO:13所
示，所述SNP7
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO:14所示；所述第八引物包括SNP8
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F和SNP8
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R，其中所述SNP8
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F的核苷酸序列如SEQ ID NO:15所示，所述SNP8
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO:16所示。4.权利要求3所述的引物组合在制备用于鉴定近交系小鼠品系的试剂盒或液相芯片中的应用，其特征在于，所述近交系小鼠品系选自DBA/2Nifdc、FVB/NJNjuNifdc、BALB/cJNifdc、C57BL/6JNifdc、C57BL/6JNifdc
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bg、NPI、NCPC/2Nifdc、NU/JNifdc、C3H/HeJNifdc、T739/Nifdc。5.一种用于鉴定近交系小鼠品系的试剂盒或液相芯片，其特征在于，所述试剂盒或液相芯片包括：A.权利要求3所述的引物组合。6.根据权利要求5所述的试剂盒或液相芯片，其特征在于，所述试剂盒或液相芯片还包括：B.分别针对SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8位点的野生型和突变型特异性ASPE引物，其中每种ASPE引物由5
’
端的tag序列和3
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端的针对SNP位点的特异性引物序列组成；可选地，所述特异性引物序列包括：针对SNP1位点的SEQ ID NO:17和SEQ ID NO:18、针对SNP2位点的SEQ ID NO:19和SEQ ID NO:20、针对SNP3位点的SEQ ID NO:21和SEQ ID NO:22、针对SNP4位点的SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:24、针对SNP5位点的SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26、针对SNP6位点的SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:28、针对SNP7位点的SEQ ID NO:29和SEQ ID NO:30、针对SNP8位点的SEQ ID NO:31和SEQ ID NO:32；进一步可选地，所述tag序列为选自SEQ ID NO:33...

【专利技术属性】
技术研发人员：魏杰，王洪，周佳琪，赵蓝，李欢，岳秉飞，
申请(专利权)人：中国食品药品检定研究院，
类型：发明
国别省市：