【技术实现步骤摘要】
一种用于宫颈癌甲基化检测的引物探针组合、试剂盒及其使用方法
[0001]本专利技术属于肿瘤基因检测
,具体涉及一种用于宫颈癌甲基化检测的引物探针组合、试剂盒及其使用方法。
技术介绍
[0002]宫颈癌一直位居妇科恶性肿瘤的前列,是发生在子宫颈部位的恶性肿瘤,是女性生殖道最常见的妇科恶性肿瘤。高危型人乳头瘤病毒(HPV)持续感染是宫颈癌的主要危险因素。
[0003]目前,主要靠定期筛查和注射疫苗预防宫颈癌,早期宫颈癌治愈率高,预后好。在还没有发展到宫颈癌的时候发现问题,进行宫颈癌及其癌前病变的早期诊断和治疗,从而降低宫颈癌的发病率及死亡率。宫颈癌筛查技术最早主要依靠细胞学筛查,可有效发现早期宫颈癌。细胞学筛查由妇科医师采用宫颈刮板或宫颈刷收集宫颈脱落细胞,其准确性受取材、涂片、染色和读片等因素影响较大,对妇科或细胞病理医师的水平依赖程度较高。HPV DNA检测也是宫颈癌筛查的主要手段之一,具有客观、可靠及易于重复,且短时间内可获得结果等优势,提高了筛查效率,但HPV DNA检测特异性低(假阳性高),易造成过度治疗 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种用于宫颈癌甲基化检测的引物探针组合,其特征在于,所述引物探针组合包括用于检测基因FAM19A4、EPB41L3和PAX1的引物探针组合,所述引物探针组合包括:所述基因FAM19A4的正向引物F1、反向引物R1、探针P1,所述基因EPB41L3的正向引物F3、反向引物R3、探针P3,所述基因PAX1的正向引物F5、反向引物R5、探针P5;所述基因FAM19A4的正向引物F2、反向引物R2、探针P2,所述基因EPB41L3的正向引物F4、反向引物R4、探针P4,所述基因PAX1的正向引物F6、反向引物R6、探针P6;所述基因FAM19A4的正向引物F1、反向引物R1、探针P1,所述基因EPB41L3的正向引物F4、反向引物R4、探针P4,所述基因PAX1的正向引物F5、反向引物R5、探针P5;所述基因FAM19A4的正向引物F1、反向引物R1、探针P1,所述基因EPB41L3的正向引物F4、反向引物R4、探针P4,所述基因PAX1的正向引物F6、反向引物R6、探针P6;所述基因FAM19A4的正向引物F1、反向引物R1、探针P1,所述基因EPB41L3的正向引物F3、反向引物R3、探针P3,所述基因PAX1的正向引物F6、反向引物R6、探针P6;所述基因FAM19A4的正向引物F2、反向引物R2、探针P2,所述基因EPB41L3的正向引物F3、反向引物R3、探针P3,所述基因PAX1的正向引物F5、反向引物R5、探针P5;所述基因FAM19A4的正向引物F2、反向引物R2、探针P2,所述基因EPB41L3的正向引物F3、反向引物R3、探针P3,所述基因PAX1的正向引物F6、反向引物R6、探针P6;或所述基因FAM19A4的正向引物F2、反向引物R2、探针P2,所述基因EPB41L3的正向引物F4、反向引物R4、探针P4,所述基因PAX1的正向引物F5、反向引物R5、探针P5;所述正向引物F1、所述反向引物R1、所述探针P1、所述正向引物F2、所述反向引物R2、所述探针P2、所述正向引物F3、所述反向引物R3、所述探针P3、所述正向引物F4、所述反向引物R4、所述探针P4、所述正向引物F5、所述反向引物R5、所述探针P5、所述正向引物F6、所述反向引物R6、所述探针P6的核苷酸序列分别为SEQ ID NO:1
‑
SEQ ID NO:18。2.根据权利要求1所述的用于宫颈癌甲基化检测的引物探针组合,其特征在于,其中,所述基因FAM19A的所述探针P1和所述探针P2、所述基因EPB41L3的所述探针P3和所述探针P4、所述基因PAX1的所述探针P5和所述探针P6的5
’
端采用FAM标记作为发光基团、3
’
端采用BHQ1标记作为淬灭基团。3.一种用于宫颈癌甲基化检测的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括如权利要求1或2所述的用于宫颈癌甲基化检测的引物探针组合中的引物探针组合:所述基因FAM19A4的正向引物F1、反向引物R1、探针P1,所述基因EPB41L3的正向引物F3、反向引物R3、探针P3,所述基因PAX1的正向引物F5、反向引物R5、探针P5;或所述基因FAM19A4的正向引物F2、反向引物R2、探针P2,所述基因EPB41L3的正向引物F4、反向引物R4、探针P4,所述基因PAX1的正向引物F6、反向引物R6、探针P6。4.根据权利要求3所述的用于宫颈癌甲基化检测的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括:β
‑
actin正向引物F、β
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actin反向引物R和β
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actin探针P;所述β
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actin正向引物F、所述β
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actin反向引物R和所述β
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actin探针P的核苷酸序列分别为SEQ ID NO:19
‑
SEQ ID NO:21。5.根据权利要求4所述的用于宫颈癌甲基化检测的试剂盒,其特征在于,其中,所述βactin探针P的5
’
端采用VIC标记作为发光基团、3
’
端采用BHQ1标记作为淬
灭基团。6.根据权利要求3
‑
5中任一项所述的用于宫颈癌甲基化检测的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括:2
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PCR预混液、dNTPs、无核酸酶水、阳性对照和阴性对照。7.根据权利要求6所述的用于宫颈癌甲基化检测的试剂盒,其特征在于,其中,所述阳性对照为来自人子宫颈鳞癌细胞株siha的DNA;所述阴性对照为来自人胚肾细胞株293a的DNA。8.一种如权利要求3
‑
7中任一项所述的用于宫颈癌甲基化检测的试剂盒的使用方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤1,提取待测样本的DNA;步骤2,重亚硫酸盐转化处理所述DNA,得转化后DNA;步骤3,以所述转化后DNA为模板,利用所述试剂盒中的用于宫颈癌甲基化检测的引物探针组合进行PCR扩增反应,得荧光检测结果;步骤4,利用所述荧光检测结果,对所述待测样本进行判定,所述判定的方法如下:FAM的阈值为0.12,VIC的阈值为0.12,ΔCt=FAM Ct
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V...
【专利技术属性】
技术研发人员:张腾,宋文文,罗卫峰,
申请(专利权)人:浙江自贸区锐赛生物医药科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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