一组用于预测头颈鳞癌预后的标志物及其应用制造技术

技术编号:37216908 阅读:30 留言:0更新日期:2023-04-20 23:04
本发明专利技术公开了一组用于预测头颈鳞癌预后的标志物及其应用。所述的标志物由基因PYGL、DARS2、YARS2、DNAJC19、ISCA1、IRAK1、SPP1、SLC25A4、FLI1、TANGO2、UQCRC2、USB1、LDHA、LDHB、HIBCH、CHCHD10组成。本发明专利技术通过COX生存分析筛选出了乳酸代谢相关基因集中与头颈鳞癌预后相关的基因,并通过LASSO回归分析构建了预测头颈鳞癌患者预后的生存模型,K

【技术实现步骤摘要】
一组用于预测头颈鳞癌预后的标志物及其应用


[0001]本专利技术属于生物医学
,具体涉及一组用于预测头颈鳞癌预后的标志物及其应用。

技术介绍

[0002]头颈鳞癌是全球第七大常见恶性肿瘤,复发转移率高达65%,5年总生存率不到50%,但是由于现有技术缺乏足够的生物标志物以便对头颈癌患者的预后做出预测,尤其是对于晚期的患者,不管是传统的治疗方法包括手术和根治性放疗,还是新兴的靶向治疗等收到了限制,因此,新型生物标志物的探索对于头颈癌的治疗靶点至关重要。生物信息学是以公共数据库为基础从基因层面研究肿瘤,最终目标是发现新的治疗和/或诊断癌症的方案。
[0003]有研究表明乳酸是许多致癌过程的关键参与者,其中包括转移、血管生成、代谢和免疫抑制,2019年的一项荟萃分析发现,在非小细胞肺癌中,血清LDH水平可以预测对免疫检查点抑制剂治疗的反应——治疗前LDH水平高的患者无进展生存期和总生存期显著缩短。Brand等人发现,肿瘤LDHA的表达不仅与T细胞激活标志物呈负相关,而且与黑色素瘤患者的存活率也呈负相关。然而,乳酸代谢是一个复杂的生物过程本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一组用于预测头颈鳞癌预后的标志物,其特征在于:所述的标志物由如下16个与乳酸代谢相关的基因组成:PYGL、DARS2、YARS2、DNAJC19、ISCA1、IRAK1、SPP1、SLC25A4、FLI1、TANGO2、UQCRC2、USB1、LDHA、LDHB、HIBCH、CHCHD10。2.如权利要求1所述的标志物在构建用于预测头颈鳞癌预后的生存模型中的应用。3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于:所述的用于预测头颈鳞癌预后的生存模型的风险评分关系式为:Risk score =PYGL*0.1536+DARS2*0.0340+YARS2*0.0468+DNAJC19*0.0889+ISCA1*0.0756+IRAK1*0.0685+SPP1*0.0208+SLC25A4*0.1961

FLI1*0.1677+TANGO2*0.0997+UQCRC2*0.0211+USB1*0.0996+LDHA*0.1218+LDHB*0.0123

HIBCH*0.2195+CHCHD10*0.0295;其中,所述的PYGL、DARS2、YARS2、DNAJC19、ISCA1、IRAK1、SPP1、SLC25A4、FLI1、TANGO2、UQCRC2、USB1、LDHA、LDHB、HIBCH、CHCHD10分别表示各基因在头颈鳞癌参试样本中的mRNA表达量;Risk score表示风险评分;风险评分与患者的生存期相关,风险评分高的患者生存期短、预后差,风险评分低的患者生存...

【专利技术属性】
技术研发人员:邱素芳陈晓川黄宗伟
申请(专利权)人:福建省肿瘤医院福建省肿瘤研究所福建省癌症防治中心
类型:发明
国别省市:

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