基于纳米孔测序的血液样本耐药/毒力基因检测方法技术

本申请涉及分子诊断技术领域，具体涉及一种血液感染样本的耐药/毒力检测方法，该方法基于靶向引物设计对血液宏基因组样本DNA进行靶向建库，结合纳米孔测序实现血液感染样本耐药/毒力的快速检测，具有灵敏度高、通量高和结果准确等优势。果准确等优势。果准确等优势。

【技术实现步骤摘要】
基于纳米孔测序的血液样本耐药/毒力基因检测方法


[0001]本申请涉及分子诊断
，具体涉及一种基于纳米孔测序技术的血液样本耐药/毒力基因检测方法。
技术背景
[0002]由于人们对抗生素使用的认知不足，近年来抗生素滥用情况日益严重，从而导致抗生素耐药以惊人的速度出现。从1929年发现青霉素开始，在往后的30年间逐步出现了耐甲氧西林葡萄球菌，耐万古霉素肠球菌等耐药菌株。80年代后细菌的耐药性更是逐步升级，从革兰氏阴性菌发展到革兰氏阳性菌，细菌产生的β
‑
内酰胺酶(可使抗生素失效的酶)从普通酶发展到超广谱酶。虽然目前应用于临床的抗生素已有不下200种之多，而且每年仍以10种以上的速度在增长，但是抗生素的研究与开发却远远跟不上细菌的耐药速度。细菌耐药的日益增多，多重耐药细菌的不断出现，治疗变的困难重重，这些问题共同导致了患者病程的延长，住院时间的延长以及更高的死亡率，尤其是在重症监护病房(ICU)。据统计，我国每年约有1亿患有感染性疾病的患者需要通过使用病原检测的方法来辅助治疗，其中重症感染人数超千万，针对这些较为复杂的危重感本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种基于纳米孔测序平台的血液感染宏基因组样本耐药/毒力基因建库的靶向引物组，其特征在于，所述引物针对11个β内酰胺类药物耐药基因，5个碳青霉烯类药物耐药基因，1对多黏菌素类药物耐药基因，2个万古霉素药物耐药基因和4个毒力因子基因。2.根据权利要求2所述的引物组，其特征在于，所述引物组针对的基因具体为：MecA，CTX
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M，OXA
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24，OXA
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23，blaTEM
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bs，CTX
‑
M
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group1，CTX
‑
M
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group9，CTX
‑
M
‑
group2，blaTEM
‑
esbl，SHV，orfx
‑
SCC，VIM，KPC，OXA
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48，IMP，NDM，MCR，vanA,vanB，iucA，rmpA，rmpA2和PVL。3.根据权利要求1
‑
2任一所述的引物组，其特征在于，所述引物组中的引物序列如SEQ ID NO.1
‑
38所示，或与SEQ ID NO.1
‑
46至少95％序列同一性。4.根据权利要求3所述的引物组，其特征在于，所述引物浓度比为：SEQ ID NO.1/2:SEQ ID NO.3/4:SEQ ID NO.5/6:SEQ ID NO.7/8:SEQ ID NO.9/10:SEQ ID NO.11/12：SEQ ID NO.13/14:SEQ ID NO.15/16:SEQ ID NO.17/18:SEQ ID NO....

【专利技术属性】
技术研发人员：苗卉，王磊，李杜衡，李立锋，田文佳，涂浩波，蒋智，贾雪峰，
申请(专利权)人：天津金匙医学科技有限公司金匙智造天津医疗科技有限公司，
类型：发明
国别省市：