针对COVID-19的微生物的治疗和诊断用途制造技术

本发明专利技术在于发现某些细菌和病毒物种的存在和数量在已经感染有2019新型冠状病毒(SARS

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】针对COVID
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19的微生物的治疗和诊断用途
相关申请
[0001]本申请要求2020年4月28日提交的美国临时专利申请第63/016,759号、2020年5月15日提交的美国临时专利申请第63/025,310号和2020年8月12日提交的美国临时专利申请第63/064,821号的优先权，通过援引加入的方式将以上文献中每一个的整体内容并入本文，用于所有目的。专利技术背景
[0002]近年来，病毒和细菌感染在全世界变得越来越普遍，并构成了严重的公共健康威胁。例如，由严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS
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CoV
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2)引起的呼吸道疾病的冠状病毒
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2019(COVID
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19)全球流行病已经影响了全世界近1亿4千万人，其中接近3百万人死亡，并且由于大量的无症状携带者的负担而加剧。目前，针对COVID
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19的实验疫苗正在全球范围内进行测试，以试图预防该疾病或改善其对患者的损伤作用，而各种疗法正在出现并发展成熟，以用于治疗该疾病和控制其传播，尤其是由SARS
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CoV
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2的不断进化的变体引起的传播。因此，迫切需要新的和有意义的治疗方法来控制病毒和细菌感染以及减轻或除去它们相关的有害作用。本专利技术通过展示肠道微生物群改变和鉴定用于预防和治疗病毒和细菌感染的各种益生菌/益生元/治疗性微生物来满足这种和其它相关的需要。专利技术简述
[0003]本专利技术涉及用于治疗由新型冠状病毒SARS
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CoV
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2引起的COVID
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19病毒感染的新方法和组合物，如用于预防和治疗应用，包括用于促进疾病的恢复。具体而言，本申请的专利技术人发现，由于SARS
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CoV
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2的感染，某些微生物物种，尤其是某些细菌和病毒，在COVID
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19患者的胃肠道(GI)中的水平发生改变。可以通过调节患者肠道中相关微生物的水平(例如通过粪便微生物群移植(FMT)治疗或口服施用有益细菌和/或病毒物种)来实现健康益处，如预防和减轻COVID
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19症状和有害作用。这些发现还提供了指示患者中COVID
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19严重程度的新方法。因此，在第一方面，本专利技术提供了用于治疗COVID
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19、减轻COVID
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19症状和/或促进患者从COVID
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19中恢复的新方法，所述方法通过提高多氏拟杆菌(Bacteroides dorei)的水平，或者表4、5、6、9、13或18中指定的一种或多种细菌物种的水平或者属于表19和21中列出的任一种细菌分类群的一种或多种细菌物种的水平，或者通过提高表11中指定的一种或多种病毒物种的水平来进行。
[0004]在一些实施方案中，所述方法包括将有效量的多氏拟杆菌或者表4、5、6、9、13和18中列出的细菌物种或者属于表19和21中列出的任一种细菌分类群细菌物种中的一种或多种细菌物种，和/或有效量的表11中列出的一种或多种病毒物种引入个体的胃肠道中的步骤。例如，引入步骤包括向个体口服施用包含有效量的上文和本文指定的理想细菌物种或病毒物种的组合物。在一些情况下，引入步骤包括将包含有效量的一种或多种理想细菌物种和/或包含有效量的一种或多种理想病毒物种的组合物递送至个体的小肠、回肠或大肠。在一些实施方案中，引入步骤包括粪便微生物群移植(FMT)。例如，FMT包括向个体施用包含加工的供体粪便材料的组合物，所述施用可以通过口服摄入组合物或通过将组合物直接沉积到个体的胃肠道中进行。在一些情况下，引入步骤还包括向个体同时引入能有效治疗
COVID
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19的益生元或治疗剂。在一些实施方案中，将益生元或治疗剂引入包含有效量的理想细菌物种或病毒物种的同一组合物中。在一些实施方案中，所述组合物在食物摄取之前施用和/或与食物摄取一起施用，尤其是在组合物被配制和包装用于口服施用的情况下。在一些实施方案中，在引入步骤之前从个体获得的第一粪便样品中测定多氏拟杆菌，或者表4、5、6、9、13和18中列出的细菌物种或者属于表19和21中列出的任一种细菌分类群的细菌物种中的一种或多种细菌物种，或者表11中列出的一种或多种病毒物种的水平或相对丰度，然后稍后在引入步骤之后从个体获得的第二粪便样品中再次对其进行测定。在一些实施方案中，通过定量聚合酶链式反应(PCR)测定多氏拟杆菌，表4、5、6、9、13和18中列出的细菌物种和属于表19和21中列出的任一种细菌分类群的细菌物种中一种或多种细菌物种的水平，或者表11中列出的一种或多种病毒物种的水平。在一些实施方案中，一种或多种细菌物种包括青春双歧杆菌(Bifidobacterium adolescentis)、普氏粪杆菌(Faecalibacterium prausnitzii)、直肠真杆菌(Eubacterium rectale)、两歧双歧杆菌(Bifidobacterium bifidum)或长双歧杆菌(Bifidobacterium longum)或者它们的任何组合。
[0005]在第二方面，本专利技术提供了用于治疗COVID
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19、减轻COVID
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19症状和/或促进患者从COVID
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19中恢复的方法，所述方法通过降低个体胃肠道中表3、7、8、12和17中列出的一种或多种细菌物种或者属于表20中列出的任一种细菌分类群的一种或多种细菌物种或者表10中列出的一种或多种病毒物种的水平来进行。
[0006]在一些实施方案中，降低步骤包括用抗细菌剂或抗病毒剂治疗个体，所述抗细菌剂或抗病毒剂可以是广谱抗细菌剂或抗病毒剂，如广谱抗生素或抗病毒组合物，或者靶向一种或多种特定细菌/病毒物种的特异性抗细菌剂/抗病毒剂。在一些实施方案中，降低步骤包括FMT，其中将包含加工的供体粪便材料的物质施用至个体，例如通过口服施用或通过直接沉积到个体的胃肠道中。例如，所述材料已经过加工，如干燥、冷冻或冻干，并置于胶囊中用于口服摄入。在一些实施方案中，在用抗细菌剂或抗病毒剂治疗个体之后，将包含加工的供体粪便材料的组合物引入个体的胃肠道中。在一些实施方案中，所述方法还包括向个体同时施用能有效治疗COVID
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19的益生元或治疗剂的步骤，例如，口服施用益生元或治疗剂。在一些实施方案中，在降低步骤之前从个体获得的第一粪便样品中测定表3、7、8、12或17中列出的一种或多种细菌物种或者属于表20中列出的一种或多种细菌分类群的一种或多种细菌物种，和/或表10中列出的一种或多种病毒物种的水平或相对丰度，然后在稍后的时间在降低步骤之后从个体获得的第二粪便样品中对其进行再次测定。在一些实施方案中，通过定量聚合酶链式反应(qPCR)测定表3、7、8、12或17中列出的一种或多种细菌物种或者属于表20中列出的一种或多种细菌分类群的一种或多种细菌物种和/或表10中列出的一种或多种病本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.用于治疗被严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS
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CoV
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2)感染的人类个体的COVID
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19症状或促进所述人类个体从COVID
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19恢复的方法，所述方法包括向所述个体的胃肠道中引入有效量的(i)多氏拟杆菌(Bacteroides dorei)细菌物种，或者表4、5、6、9、13和18中列出的一种或多种细菌物种，或者属于表19和21中列出的任一种细菌分类群的一种或多种细菌物种；或者(ii)表11中列出的一种或多种病毒物种。2.如权利要求1所述的方法，其中引入步骤包括向所述个体口服施用包含有效量的所述细菌物种或病毒物种的组合物。3.如权利要求1所述的方法，其中引入步骤包括将包含有效量的所述细菌物种或病毒物种的组合物递送至所述个体的小肠、回肠或大肠。4.如权利要求1所述的方法，其中引入步骤包括粪便微生物群移植(FMT)。5.如权利要求4所述的方法，其中所述FMT包括向所述个体施用包含加工的供体粪便材料的组合物。6.如权利要求1所述的方法，其中引入步骤还包括向所述个体同时引入能有效治疗COVID
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19的益生元或治疗剂。7.如权利要求6所述的方法，其中将所述益生元或治疗剂引入包含有效量的所述细菌物种或病毒物种的同一组合物中。8.如权利要求2所述的方法，其中所述组合物在食物摄取之前施用和/或与食物摄取一起施用。9.如权利要求1所述的方法，其中在引入步骤之前从所述个体获得的第一粪便样品以及在引入步骤之后从所述个体获得的第二粪便样品中测定所述细菌物种或病毒物种的水平或相对丰度。10.如权利要求9所述的方法，其中通过定量聚合酶链式反应(PCR)测定所述细菌物种或病毒物种的水平。11.如权利要求1所述的方法，其中所述一种或多种细菌物种包括青春双歧杆菌(Bifidobacterium adolescentis)、普氏粪杆菌(Faecalibacterium prausnitzii)、直肠真杆菌(Eubacterium rectale)、两歧双歧杆菌(Bifidobacterium bifidum)或长双歧杆菌(Bifidobacterium longum)。12.用于治疗被SARS
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CoV
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2感染的人类个体的COVID
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19症状或促进所述人类个体从COVID
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19恢复的方法，所述方法包括降低所述个体的胃肠道中(i)表3、7、8、12和17中列出的一种或多种细菌物种或者属于表20中列出的任一种细菌分类群的一种或多种细菌物种的水平或相对丰度；或者(ii)表10中列出的一种或多种病毒物种的水平或相对丰度。13.如权利要求12所述的方法，其中所述降低步骤包括FMT。14.如权利要求13所述的方法，其中所述降低步骤包括用抗细菌剂或抗病毒剂治疗所述个体。15.如权利要求14所述的方法，其中在用所述抗细菌剂或抗病毒剂治疗所述个体之后，将包含加工的供体粪便材料的组合物引入所述个体的胃肠道中。16.如权利要求12所述的方法，所述方法还包括向所述个体同时施用能有效治疗COVID
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19的益生元或治疗剂。17.如权利要求16所述的方法，其中所述益生元或治疗剂是口服施用的。
18.如权利要求12所述的方法，其中在所述降低步骤之前从所述个体获得的第一粪便样品以及在所述降低步骤之后从所述个体获得的第二粪便样品中测定所述细菌物种或所述病毒物种的水平或相对丰度。19.如权利要求18所述的方法，其中通过定量聚合酶链式反应(PCR)测定所述细菌物种或病毒物种的水平。20.如权利要求12所述的方法，其中所述一种或多种细菌物种包括齿双歧杆菌(Bifidobacterium dentium)或瘤胃乳酸杆菌(Lactobacillus ruminis)。21.套装产品，所述套装产品包括：含有第一组合物的第一容器和含有第二组合物的第二容器，所述第一组合物包含(i)有效量的多氏拟杆菌(Bacteroides dorei)细菌物种，或者表4、5、6、9、13和18中列出的一种或多种细菌物种，或者属于表19和21中列出的任一种细菌分类群的一种或多种细菌物种，(ii)有效量的表11中列出的一种或多种病毒物种，(iii)有效量的抑制表3、7、8、12和17中列出的一种或多种细菌物种生长或者抑制属于表20中列出的细菌分类群中任一种的一种或多种细菌物种生长的抗细菌剂，或者(iv)有效量的抑制表10中列出的一种或多种病毒物种生长的抗病毒剂，所述第二组合物包含能有效治疗COVID
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19的益生元或治疗剂。22.如权利要求21所述的套装产品，其中所述第一组合物包含用于FMT的加工的供体粪便材料。23.如权利要求21或22所述的套装产品，其中所述第一组合物被配制用于口服施用。24.如权利要求21所述的套装产品，其中所述第二组合物被配制用于口服施用。25.如权利要求21所述的套装产品，其中所述第一组合物和所述第二组合物都被配制用于口服摄入。26.如权利要求23所述的套装产品，其中所述一种或多种细菌物种包括青春双歧杆菌(Bifidobacterium adolescentis)、普氏粪杆菌(Faecalibacterium prausnitzii)、直肠真杆菌(Eu...

【专利技术属性】
技术研发人员：黄秀娟，陈家亮，左涛，杨仁杰，
申请(专利权)人：香港中文大学，
类型：发明
国别省市：