图像配准和模板构建方法、装置、电子设备及存储介质制造方法及图纸

技术编号:35207926 阅读:19 留言:0更新日期:2022-10-15 10:19
本申请实施例提供了一种图像配准和模板构建方法、装置、电子设备及存储介质,属于图像处理技术领域。该方法包括:获取待配准的原始荧光图像;对原始荧光图像进行第一图像配准处理,得到第一荧光图像;对第一荧光图像进行第二图像配准处理,得到第二荧光图像;对第二荧光图像进行色差校正处理,得到目标荧光图像;对目标荧光图像的荧光点进行坐标提取,得到荧光坐标数据;根据荧光坐标数据对荧光点进行聚合处理,得到测序模板;通过测序模板对预获取的DNA序列进行亮度提取,得到目标亮点对应的目标亮度值。本申请实施例能够提高图像配准和模板构建的准确性。模板构建的准确性。模板构建的准确性。

【技术实现步骤摘要】
图像配准和模板构建方法、装置、电子设备及存储介质


[0001]本申请涉及图像处理
,尤其涉及一种图像配准和模板构建方法、装置、电子设备及存储介质。

技术介绍

[0002]目前的图像配准和模板构建方法在对不同通道的荧光图像进行色差校正和在不同周期的荧光图像进行图像配准时均存在着精度不高的问题,影响DNA测序的精确性,因此,如何提高图像配准和模板构建的准确性,成为了亟待解决的技术问题。

技术实现思路

[0003]本申请实施例的主要目的在于提出一种图像配准和模板构建方法、装置、电子设备及存储介质,旨在提高图像配准和模板构建的准确性。
[0004]为实现上述目的,本申请实施例的第一方面提出了一种图像配准和模板构建方法,所述方法包括:
[0005]获取待配准的原始荧光图像;
[0006]对所述原始荧光图像进行第一图像配准处理,得到第一荧光图像;
[0007]对所述第一荧光图像进行第二图像配准处理,得到第二荧光图像;
[0008]对所述第二荧光图像进行色差校正处理,得到目标荧光图像;
[0009]对所述目标荧光图像的荧光点进行坐标提取,得到荧光坐标数据;
[0010]根据所述荧光坐标数据对所述荧光点进行聚合处理,得到测序模板;
[0011]通过所述测序模板对预获取的DNA序列进行亮度提取,得到目标亮点对应的目标亮度值。
[0012]在一些实施例,所述对所述原始荧光图像进行第一图像配准处理,得到第一荧光图像的步骤,包括:
[0013]对原始荧光图像进行二值化图像重建,得到二值化重心重建图,并对二值化重心重建图进行傅里叶变换,得到图像平移参数;
[0014]根据图像平移参数对原始荧光图像进行平移变换,得到第一荧光图像。
[0015]在一些实施例,所述对所述第一荧光图像进行第二图像配准处理,得到第二荧光图像的步骤,包括:
[0016]根据预设的第一半径参数对所述第一荧光图像的荧光点进行配对处理,得到第一荧光点对;
[0017]通过最小二乘法对所述第一荧光点对进行仿射计算,得到仿射矩阵;
[0018]通过所述仿射矩阵对所述第一荧光图像进行仿射变换,得到所述第二荧光图像。
[0019]在一些实施例,所述对所述第二荧光图像进行色差校正处理,得到目标荧光图像的步骤,包括:
[0020]根据预设的第二半径参数对所述第二荧光图像的目标区域的荧光点进行配对处
理,得到第二荧光点对;
[0021]对所述第二荧光点对进行校正处理,得到目标荧光点对;
[0022]通过最小二乘法对所述目标荧光点对进行全局投影计算,得到全局投影变换矩阵;
[0023]通过所述全局投影变换矩阵对所述第二荧光图像进行透视变换矫正,得到所述目标荧光图像。
[0024]在一些实施例,所述根据所述荧光坐标数据对所述荧光点进行聚合处理,得到测序模板的步骤,包括:
[0025]根据所述荧光坐标数据,计算每两个所述荧光点之间的距离值;
[0026]根据所述距离值和预设距离阈值,对所述荧光点进行聚合处理,得到公共亮点,并根据所述公共亮点构建所述测序模板。
[0027]在一些实施例,所述根据所述距离值和预设距离阈值,对所述荧光点进行聚合处理,得到公共亮点,并根据所述公共亮点构建所述测序模板的步骤,包括:
[0028]比对所述距离值和预设距离阈值,得到比对结果;
[0029]根据预设的聚类算法和所述比对结果对所述荧光点进行聚合处理,得到所述公共亮点;
[0030]根据所述公共亮点构建DNA单链,并根据所述DNA单链构建所述测序模板。
[0031]在一些实施例,所述通过所述测序模板对预获取的DNA序列进行亮度提取,得到目标亮点对应的目标亮度值的步骤,包括:
[0032]通过所述测序模板对所述预获取的DNA序列进行亮度提取,得到目标亮点;
[0033]通过双线性插值法提取所述目标亮点的重心亮度值,得到所述目标亮度值。
[0034]为实现上述目的,本申请实施例的第二方面提出了一种图像配准和模板构建装置,所述装置包括:
[0035]图像获取模块,用于获取待配准的原始荧光图像;
[0036]第一图像配准模块,用于对所述原始荧光图像进行第一图像配准处理,得到第一荧光图像;
[0037]第二图像配准模块,用于对所述第一荧光图像进行第二图像配准处理,得到第二荧光图像;
[0038]色差校正模块,用于对所述第二荧光图像进行色差校正处理,得到目标荧光图像;
[0039]坐标提取模块,用于对所述目标荧光图像的荧光点进行坐标提取,得到荧光坐标数据;
[0040]聚合模块,用于根据所述荧光坐标数据对所述荧光点进行聚合处理,得到测序模板;
[0041]亮度提取模块,用于通过所述测序模板对预获取的DNA序列进行亮度提取,得到目标亮点对应的目标亮度值。
[0042]为实现上述目的,本申请实施例的第三方面提出了一种电子设备,所述电子设备包括存储器、处理器、存储在所述存储器上并可在所述处理器上运行的程序以及用于实现所述处理器和所述存储器之间的连接通信的数据总线,所述程序被所述处理器执行时实现上述第一方面所述的方法。
[0043]为实现上述目的,本申请实施例的第四方面提出了一种存储介质,所述存储介质为计算机可读存储介质,用于计算机可读存储,所述存储介质存储有一个或者多个程序,所述一个或者多个程序可被一个或者多个处理器执行,以实现上述第一方面所述的方法。
[0044]本申请提出的图像配准和模板构建方法、装置、电子设备及存储介质,其通过获取待配准的原始荧光图像,通过对原始荧光图像进行第一图像配准处理,得到第一荧光图像,并对第一荧光图像进行第二图像配准处理,得到第二荧光图像,能够通过两次图像配准,能够对原始荧光图像进行不同像素级别的图像配准,由浅至深,提高不同周期中同一个荧光通道内的图像配准精度。进一步地,对第二荧光图像进行色差校正处理,得到目标荧光图像,能够更加准确地对不同通道的色差进行估计,提高色差校正的准确性。最后,对目标荧光图像的荧光点进行坐标提取,得到荧光坐标数据;根据荧光坐标数据对荧光点进行聚合处理,得到测序模板;通过测序模板对预获取的DNA序列进行亮度提取,得到目标亮点对应的目标亮度值,这一方式能够基于多个周期的荧光点和荧光坐标数据进行模板构建,提高测序模板的全面性和准确性,同时,通过测序模板对预获取的DNA序列进行亮度提取能够有效地提高光强提取的效率和精度,本申请实施例通过对图像配准阶段、色差校正阶段、模板构建阶段以及光强提取阶段进行优化,能够从整体上优化DNA测序的过程。
附图说明
[0045]图1是本申请实施例提供的图像配准和模板构建方法的流程图;
[0046]图2是图1中的步骤S102的流程图;
[0047]图3是图1中的步骤S103的流程图;
[0048]本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种图像配准和模板构建方法,其特征在于,所述方法包括:获取待配准的原始荧光图像;对所述原始荧光图像进行第一图像配准处理,得到第一荧光图像;对所述第一荧光图像进行第二图像配准处理,得到第二荧光图像;对所述第二荧光图像进行色差校正处理,得到目标荧光图像;对所述目标荧光图像的荧光点进行坐标提取,得到荧光坐标数据;根据所述荧光坐标数据对所述荧光点进行聚合处理,得到测序模板;通过所述测序模板对预获取的DNA序列进行亮度提取,得到目标亮点对应的目标亮度值。2.根据权利要求1所述的图像配准和模板构建方法,其特征在于,所述对所述原始荧光图像进行第一图像配准处理,得到第一荧光图像的步骤,包括:对所述原始荧光图像进行二值化图像重建,得到二值化重心重建图,并对所述二值化重心重建图进行傅里叶变换,得到图像平移参数;根据所述图像平移参数对所述原始荧光图像进行平移变换,得到所述第一荧光图像。3.根据权利要求1所述的图像配准和模板构建方法,其特征在于,所述对所述第一荧光图像进行第二图像配准处理,得到第二荧光图像的步骤,包括:根据预设的第一半径参数对所述第一荧光图像的荧光点进行配对处理,得到第一荧光点对;通过最小二乘法对所述第一荧光点对进行仿射计算,得到仿射矩阵;通过所述仿射矩阵对所述第一荧光图像进行仿射变换,得到所述第二荧光图像。4.根据权利要求1所述的图像配准和模板构建方法,其特征在于,所述对所述第二荧光图像进行色差校正处理,得到目标荧光图像的步骤,包括:根据预设的第二半径参数对所述第二荧光图像的目标区域的荧光点进行配对处理,得到第二荧光点对;对所述第二荧光点对进行校正处理,得到目标荧光点对;通过最小二乘法对所述目标荧光点对进行全局投影计算,得到全局投影变换矩阵;通过所述全局投影变换矩阵对所述第二荧光图像进行透视变换矫正,得到所述目标荧光图像。5.根据权利要求1所述的图像配准和模板构建方法,其特征在于,所述根据所述荧光坐标数据对所述荧光点进行聚合处理,得到测序模板的步骤,包括:根据所述荧光坐标数据,计算每两个所述荧光点之间的距离值;根据所述距离值和预设距离阈值,对所述荧光点进行聚合处理,得到公共亮点,...

【专利技术属性】
技术研发人员:陈伟王谷丰
申请(专利权)人:深圳赛陆医疗科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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