上皮钙黏素特异性抗体制造技术

本发明专利技术涉及上皮钙黏素特异性抗体以及其在诊断和治疗诸如癌症等疾病中的用途。在诊断和治疗诸如癌症等疾病中的用途。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】是T或I；
[0009]或包含通过1、2或3个保守取代而不同于所述IKSKIDG X1T X2序列的氨基酸序列的重链可变区CDR2；
[0010]c.包含氨基酸序列TPGVGX1NX2PYYFDR的重链可变区CDR3，其中X1是A或T，并且其中X2是D或N；
[0011]或包含通过1、2或3个保守取代而不同于所述TPGVGX1NX2PYYFDR序列的氨基酸序列的重链可变区CDR3；
[0012]d.包含氨基酸序列QSVLCRSNNKNC的轻链可变区CDR1；
[0013]或包含通过1、2或3个保守取代而不同于所述QSVLCRSNNKNC序列的氨基酸序列的轻链可变区CDR1；
[0014]e.包含氨基酸序列WAX1的轻链可变区CDR2，其中X1是S或C；
[0015]或包含通过1、2或3个保守取代而不同于所述WAX1序列的氨基酸序列的轻链可变区CDR2；
[0016]f.包含氨基酸序列QQYSNTPQT的轻链可变区CDR3；
[0017]或包含通过1、2或3个保守取代而不同于所述QQYSNTPQT序列的氨基酸序列的轻链可变区CDR3。
[0018]在某些实施方案中，所述抗体或抗原结合片段包含重链可变区，所述重链可变区包含与选自由SEQ ID NO:1
‑
17组成的组的VH序列具有至少80％序列同一性的序列；和/或轻链可变区，所述轻链可变区包含与选自由SEQ ID NO:18
‑
22组成的组的VL序列具有至少80％序列同一性的序列，如表1中描绘。优选地，所述序列同一性是至少85％、更优选地至少86％、更优选地至少87％、更优选地至少88％、更优选地至少89％、更优选地至少90％、更优选地至少91％、更优选地至少92％、更优选地至少93％、更优选地至少94％、更优选地至少95％、更优选地至少96％、更优选地至少97％、更优选地至少98％、更优选地至少99％、更优选地100％。优选地，所述VH和/或VL区的所述序列变异位于CDR区之外。
[0019]在各种实施方案中，根据本专利技术的抗体或抗原结合片段是全长抗体。
[0020]在各种实施方案中，根据本专利技术的抗体或抗原结合片段是人抗体或其抗原结合片段。
[0021]在各种实施方案中，根据本专利技术的抗体或抗原结合片段是IgA同种型。在各种实施方案中，根据本专利技术的抗体或抗原结合片段是IgM同种型。在各种实施方案中，根据本专利技术的抗体或抗原结合片段是IgD同种型。在某些实施方案中，所述抗体或抗原结合片段是人IgA、IgM或IgD。
[0022]在各种实施方案中，根据本专利技术的抗体或抗原结合片段是IgG同种型。在某些实施方案中，所述抗体或抗原结合片段是IgG1、IgG2、IgG3或IgG4，优选地IgG1。在某些实施方案中，所述抗体或抗原结合片段是人IgG1、IgG2、IgG3或IgG4，优选地人IgG1。
[0023]在各种实施方案中，根据本专利技术的抗体或抗原结合片段是非岩藻糖基化的(afucosylated)。
[0024]某些实施方案提供了一种抗体或其抗原结合片段，其与选自由以下组成的组的抗体竞争结合O
‑
甘露糖基化E
‑
钙黏素、优选地与O
‑
甘露糖基化的截短的70kDa E
‑
钙黏素：AT1636、E
‑
C06、D
‑
H04、D
‑
A02、D
‑
E09、E
‑
A04、E
‑
B09、C
‑
A05、C
‑
A03、C
‑
B02、C
‑
D04
‑
A、C
‑
D04
‑
B、
F
‑
C08、D
‑
G03、D
‑
F10、C
‑
E08、D
‑
B06、D
‑
G05、D
‑
H08、C
‑
H01、D
‑
C12、D
‑
C11、E
‑
C10、AT1636
‑
I、AT1636
‑
Y、AT1636
‑
E、AT1636
‑
N、AT1636
‑
YN、AT1636
‑
IYN和AT1636
‑
IYEN。
[0025]在某些实施方案中，根据本专利技术的抗体或抗原结合片段具有以下特征中的一种或多种并且优选地每一种：
[0026]‑
与O
‑
甘露糖基化E
‑
钙黏素的细胞外3(EC3)结构域结合；
[0027]‑
与O
‑
甘露糖基化全长E
‑
钙黏素相比，更好地、至少2倍更好地、更优选地至少3倍更好地、更优选地至少4倍更好地、更优选地至少5倍更好地结合O
‑
甘露糖基化的截短的70kDa E
‑
钙黏素；以及
[0028]‑
结合共表达E
‑
钙黏素和O
‑
甘露糖基转移酶、优选地TMTC3的肿瘤细胞。
[0029]在一些实施方案中，所述抗体或抗原结合片段还包含以下特征中的至少一种：
[0030]‑
结合结肠癌亚型CMS1、CMS2、CMS3和CMS4；
[0031]‑
与健康的髓质胸腺上皮细胞或树突细胞或朗格汉斯细胞相比，更好地结合结肠癌细胞系SW948。
[0032]在某些实施方案中，根据本专利技术的抗体或抗原结合片段与另一种化合物偶联。在某些实施方案中，所述另一种化合物是治疗化合物。在某些实施方案中，所述另一种化合物是选自由以下组成的组的化合物：免疫调节化合物、T细胞结合化合物、自然杀伤细胞(NK细胞)结合化合物、自然杀伤T细胞(NKT细胞)结合化合物、γ
‑
δT细胞结合化合物、CD3特异性结合化合物、TGFβ特异性结合化合物、细胞因子、第二抗体或其抗原结合部分、可检测标记、药物、化疗药物、细胞毒性剂、毒性部分、激素、酶和放射性化合物。在一些实施方案中，所述免疫调节化合物不是根据本专利技术的抗体的Fc尾部。在一些实施方案中，所述免疫调节化合物是非天然免疫调节化合物。
[0033]与治疗化合物直接或间接偶联的根据本专利技术的抗体或抗原结合片段在本文中也被称为根据本专利技术的抗体
‑
药物缀合物(ADC)。
[0034]本专利技术还提供了一种能够结合O
‑
甘露糖基化E
‑
钙黏素的双特异性或多特异性结合化合物，优选地双特异性或多特异性抗体或其抗原结合片段，其包含：
[0035]‑
根据本专利技术的抗体或抗原结合片本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种抗体或其抗原结合片段，其特异性结合E
‑
钙黏素的一个或多个O
‑
甘露糖基化苏氨酸残基，其中所述一个或多个O
‑
甘露糖基化苏氨酸残基存在于如图1A中描绘的E
‑
钙黏素序列的氨基酸位置467
‑
472内。2.根据权利要求1所述的抗体或抗原结合片段，其中所述抗体或抗原结合片段与所述E
‑
钙黏素的结合依赖于如图1A中描绘的E
‑
钙黏素序列的位置467处O
‑
甘露糖基化苏氨酸残基、位置468处O
‑
甘露糖基化苏氨酸残基、位置470处O
‑
甘露糖基化苏氨酸残基、位置472处O
‑
甘露糖基化苏氨酸残基、位置463处谷氨酸残基、位置465处丝氨酸残基、位置469处丝氨酸残基和/或位置477处缬氨酸残基的存在。3.根据权利要求1或2所述的抗体或抗原结合片段，其中所述抗体或抗原结合片段与所述E
‑
钙黏素的结合依赖于如图1A中描绘的E
‑
钙黏素序列的位置467处O
‑
甘露糖基化苏氨酸残基、和/或位置468处O
‑
甘露糖基化苏氨酸残基、和/或位置470处O
‑
甘露糖基化苏氨酸残基的存在。4.根据权利要求1
‑
3中任一项所述的抗体或抗原结合片段，其特征在于，与O
‑
甘露糖基化全长E
‑
钙黏素相比，所述抗体或抗原结合片段更好地结合O
‑
甘露糖基化的截短的70kDa E
‑
钙黏素。5.一种抗体或其抗原结合片段，其能够结合O
‑
甘露糖基化E
‑
钙黏素，其中所述抗体或抗原结合片段包含以下中的一个或多个并且任选地每一个：a.包含氨基酸序列GFX1FSX2AW的重链可变区CDR1，其中X1是T或I，并且其中X2是N或Y；或包含通过1、2或3个保守取代而不同于所述GFX1FSX2AW序列的氨基酸序列的重链可变区CDR1；b.包含氨基酸序列IKSKIDG X1T X2的重链可变区CDR2，其中X1是G或E，并且其中X2是T或I；或包含通过1、2或3个保守取代而不同于所述IKSKIDG X1T X2序列的氨基酸序列的重链可变区CDR2；c.包含氨基酸序列TPGVGX1NX2PYYFDR的重链可变区CDR3，其中X1是A或T，并且其中X2是D或N；或包含通过1、2或3个保守取代而不同于所述TPGVGX1NX2PYYFDR序列的氨基酸序列的重链可变区CDR3；d.包含氨基酸序列QSVLCRSNNKNC的轻链可变区CDR1；或包含通过1、2或3个保守取代而不同于所述QSVLCRSNNKNC序列的氨基酸序列的轻链可变区CDR1；e.包含氨基酸序列WAX1的轻链可变区CDR2，其中X1是S或C；或包含通过1、2或3个保守取代而不同于所述WAX1序列的氨基酸序列的轻链可变区CDR2；f.包含氨基酸序列QQYSNTPQT的轻链可变区CDR3；或包含通过1、2或3个保守取代而不同于所述QQYSNTPQT序列的氨基酸序列的轻链可变区CDR3。6.根据权利要求1
‑
5中任一项所述的抗体或抗原结合片段，其包含：a.包含序列GFTFSNAW的重链CDR1、和包含序列IKSKIDGGTT的重链CDR2、和包含序列
TPGVGANDPYYFDR的重链CDR3、和包含序列QSVLCRSNNKNC的轻链CDR1、和包含序列WAS的轻链CDR2、和包含序列QQYSNTPQT的轻链CDR3；或b.包含序列GFIFSNAW的重链CDR1、和包含序列IKSKIDGGTT的重链CDR2、和包含序列TPGVGANDPYYFDR的重链CDR3、和包含序列QSVLCRSNNKNC的轻链CDR1、和包含序列WAS的轻链CDR2、和包含序列QQYSNTPQT的轻链CDR3；或c.包含序列GFIFSNAW的重链CDR1、和包含序列IKSKIDGETT的重链CDR2、和包含序列TPGVGANDPYYFDR的重链CDR3、和包含序列QSVLCRSNNKNC的轻链CDR1、和包含序列WAS的轻链CDR2、和包含序列QQYSNTPQT的轻链CDR3；或d.包含序列GFTFSNAW的重链CDR1、和包含序列IKSKIDGETT的重链CDR2、和包含序列TPGVGANDPYYFDR的重链CDR3、和包含序列QSVLCRSNNKNC的轻链CDR1、和包含序列WAS的轻链CDR2、和包含序列QQYSNTPQT的轻链CDR3；或e.包含序列GFTFSNAW的重链CDR1、和包含序列IKSKIDGETT的重链CDR2、和包含序列TPGVGANNPYYFDR的重链CDR3、和包含序列QSVLCRSNNKNC的轻链CDR1、和包含序列WAS的轻链CDR2、和包含序列QQYSNTPQT的轻链CDR3；或f.包含序列GFTFSNAW的重链CDR1、和包含序列IKSKIDGETT的重链CDR2、和包含序列TPGVGANNPYYFDR的重链CDR3、和包含序列QSVLCRSNNKNC的轻链CDR1、和包含序列WAC的轻链CDR2、和包含序列QQYSNTPQT的轻链CDR3；或g.包含序列GFTFSNAW的重链CDR1、和包含序列IKSKIDGGTT的重链CDR2、和包含序列TPGVGANNPYYFDR的重链CDR3、和包含序列QSVLCRSNNKNC的轻链CDR1、和包含序列WAS的轻链CDR2、和包含序列QQYSNTPQT的轻链CDR3；或h.包含序列GFTFSNAW的重链CDR1、和包含序列IKSKIDGGTT的重链CDR2、和包含序列TPGVGTNNPYYFDR的重链CDR3、和包含序列QSVLCRSNNKNC的轻链CDR1、和包含序列WAS的轻链CDR2、和包含序列QQYSNTPQT的轻链CDR3；或i.包含序列GFTFSYAW的重链CDR1、和包含序列IKSKIDGGTT的重链CDR2、和包含序列TPGVGANDPYYFDR的重链CDR3、和包含序列QSVLCRSNNKNC的轻链CDR1、和包含序列WAS的轻链CDR2、和包含序列QQYSNTPQT的轻链CDR3；或j.包含序列GFTFSNAW的重链CDR1、和包含序列IKSKIDGGTI的重链CDR2、和包含序列TPGVGANDPYYFDR的重链CDR3、和包含序列QSVLCRSNNKNC的轻链CDR1、和包含序列WAS的轻链CDR2、和包含序列QQYSNTPQT的轻链CDR3；或k.包含序列GFTFSYAW的重链CDR1、和包含序列IKSKIDGGTT的重链CDR2、和包含序列TPGVGANNPYYFDR的重链CDR3、和包含序列QSVLCRSNNKNC的轻链CDR1、和包含序列WAS的轻链CDR2、和包含序列QQYSNTPQT的轻链CDR3；或l.包含序列GFIFSYAW的重链CDR1、和包含序列IKSKIDGGTT的重链CDR2、和包含序列TPGVGANNPYYFDR的重链CDR3、和包含序列QSVLCRSNNKNC的轻链CDR1、和包含序列WAS的轻链CDR2、和包含序列QQYSNTPQT的轻链CDR3；或m.包含序列GFIFSYAW的重链CDR1、和包含序列IKSKIDGETT的重链CDR2、和包含序列TPGVGANNPYYFDR的重链CDR3、和包含序列QSVLCRSNNKNC的轻链CDR1、和包含序列WAS的轻链CDR2、和包含序列QQYSNTPQT的轻链CDR3。7.根据权利要求1
‑
6中任一项所述的抗体或抗原结合片段，其包含：
‑
包含与选自由SEQ ID NO:1
‑
17组成的组的VH序列具有至少80％序列同一性的序列的重链可变区；和/或
‑
包含与选自由SEQ ID NO:18
‑
22组成的组的VL序列具有至少80％序列同一性的序列的轻链可变区。8.根据权利要求1
‑
7中任一项所述的抗体或抗原结合片段，其包含：
‑
如SEQ ID NO:1中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:18中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:1中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:22中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:2中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:18中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:3中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:18中描绘的VL序列，或与其具有至少90％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:4中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:19中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:5中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:18中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:6中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:18中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:6中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:20中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:7中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:18中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:8中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:18中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:9中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:18中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:10中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:18中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:10中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:21中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:11中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:18中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:12中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:18中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:13中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:18中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:14中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:18中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:15中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:18中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:16中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:18中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列；或
‑
如SEQ ID NO:17中描绘的VH序列和如SEQ ID NO:18中描绘的VL序列，或与其具有至少80％序列同一性的序列。9.根据权利要求1
‑
8中任一项所述的抗体或抗原结合片段，其是人抗体或其抗原结合片段。10.根据权利要求1
‑
9中任一项所述的抗体或抗原结合片段，其中所述抗体是IgG同种型，优选地是IgG1。11.根据权利要求1
‑
10中任一项所述的抗体或抗原结合片段，其是非岩藻糖基化的。12.一种抗体或其抗原结合片段，其与根据权利要求1
‑
11中任一项所述的抗体竞争结合O
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甘露糖基化E
‑
钙黏素、优选地与O
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甘露糖基化的截短的70kDa E
‑
钙黏素。13.根据权利要求1
‑
12中任一项所述的抗体或抗原结合片段，其中所述抗体或抗原结合片段具有以下特征中的一种或多种并且优选地每一种：
‑
与O
‑
甘露糖基化E
‑
钙黏素的细胞外(EC)3结构域结合；
‑
与O
‑
甘露糖基化全长E
‑
钙黏素相比，更好地结合O
‑
甘露糖基化的截短的70kDa E
‑
钙黏素；
‑
结合共表达E
‑
钙黏素和O
‑
甘露糖基转移酶、优选地TMTC3的肿瘤细胞。14.根据权利要求1
‑
13中任一项所述的抗体或抗原结合片段，其与另一种化合物、优选地与选自由以下组成的组的化合物偶联：免疫调节化合物、T细胞结合化合物、自然杀伤细胞(NK细胞)结合化合物、自然杀伤T细胞(NKT细胞)结合化合物、γ
‑
δT细胞结合化合物、CD3特异性结合化合物、TGFβ特异性结合化合物、细胞因子、第二抗体或其抗原结合部分、可检测标记、药物、化疗药物、细胞毒性剂、毒性部分、激素、酶和放射性化合物。15.一种能够结合O
‑
甘露糖基化E
‑
钙黏素的双特异性或多特异性结合化合物，优选地双特异性或多特异性抗体或其抗原结合片段，其包含：
‑
根据权利要求1
‑
13中任一项所述的抗体或抗原结合片段；和
‑
免疫调节化合物。16.一种抗体
‑
药物缀合物，其包含根据权利要求1
‑
13中任一项所述的抗体或抗原结合片段和治疗化合物。17.根据权利要求14所述的抗体或抗原结合片段、或根据权利要求15所述的双特异性或多特异性抗体或其抗原结合片段、或根据权利要求16所述的抗体
‑
药物缀合物，其中根据权利要求1
‑
13中任一项所述的抗体或抗原结合片段与CD3特异性结合化合物或TGFβ特异性结合化合物偶联。18.一种能够结合O
‑
甘露糖基化E
‑
钙黏素的双特异性抗体或其抗原结合片段，其包含：
‑
根据权利要求1
‑
13中任一项所述的抗体或抗原结合片段的一个Fab片段；和
‑
对T细胞、自然杀伤细胞(NK细胞)、自然杀伤T细胞(NKT细胞)或γ
‑
δT细胞具有特异性、优选地对CD3具有特异性的另一种抗体的一个Fab片段。19.一种能够结合O
‑
甘露糖基化E
‑
钙黏素的双特异性抗体或其抗原结合片段，其包含：
‑
根据权利要求1
‑
13中任一项所述的抗体或抗原结合片段的一个Fa...

【专利技术属性】
技术研发人员：T，
申请(专利权)人：科凌生物医疗有限公司，
类型：发明
国别省市：