与梨果皮红色性状连锁的位点、分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术涉及与梨果皮红色性状连锁的位点、分子标记及其应用。位点的核苷酸序列包括位于

【技术实现步骤摘要】
与梨果皮红色性状连锁的位点、分子标记及其应用


[0001]本专利技术属于梨分子遗传育种领域，尤其涉及与梨果皮红色性状连锁的位点、分子标记及其应用。

技术介绍

[0002]梨(Pyrus L.)是一种重要的蔷薇科(Rosaceae)果树，为我国三大水果之一，据联合国粮农组织统计数据库(FAOSTAT)数据显示，2020年我国梨栽培面积为87万公顷，产量1610万吨，分别占世界总面积和产量的67％和70％，在果树产业中居重要地位。近年来，红梨因其诱人的外观和丰富的营养价值，越来越受消费者青睐。然而，在实际生产中，能够在我国栽培的红梨品种不多，尤其是我国主栽的梨品种为东方梨，缺少品质优良、着色稳定的红色品种，因此，红皮梨一直以来都是我国乃至全世界梨育种工作者的重要育种目标。
[0003]目前，杂交育种是梨育种中最常用的育种方式。由于梨为多年生果树，性状遗传机制复杂，杂交后代的优选率低，实生苗通常还需要渡过3
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5年甚至更长时间的童期才能开花结果，育种过程中需要大量的土地和人力、物力成本，育种成本高。
[0004]前人开发的标记多需要采用荧光定量PCR或普通PCR加聚丙烯酰胺凝胶电泳的方式才能区分不同供试样品的表型，分别具有成本高和实验程序繁琐等缺点。因此，开发能够用普通PCR加琼脂糖凝胶电泳就能成功区分不同样品表型的分子标记，则能极大地降低实验成本并提高育种效率。
[0005]分子标记辅助选择育种技术应用于梨育种的重要前提是开发与梨重要性状紧密连锁的分子标记。果皮红色作为梨果实重要的外观品质性状，该性状遗传机制复杂，不同红梨品种红色性状的形成机制不同，并且现有的分子标记存在准确率低的问题，需要开发更为广泛有效的标记位点，以应用于梨育种工作。
[0006]梨的染色体存在很多位点但是并非所有的位点都适合作为分子标记，也并非所有的分子标记都可以用于梨果皮红色/绿色性状辅助选择，因此，如何筛选出合适的分子标记，并能够进一步提高准确率及筛选效率、降低错误率是亟待解决的技术难点。

技术实现思路

[0007]鉴于现有技术所存在的问题，本专利技术提供与梨果皮红色性状连锁的位点、分子标记及其应用，上述位点、分子标记可以用于梨果皮红色/绿色性状辅助选择育种中，在杂交苗的幼苗期快速淘汰绿果皮单株，节省后续杂交苗维护和鉴定评价成本，显著提高红皮梨育种效率，具有适用品种广泛、准确率高、红株检出率高、错误率低、表型与带型一致率高等优点。
[0008]本专利技术解决上述技术问题的技术方案如下：
[0009]与梨果皮红色性状连锁的位点，位点的核苷酸序列包括位于
‘
中矮1号
’
梨参考基因组的Chr5的26527817碱基处的位点的核苷酸序列，参考基因组的GeneBank登录号：SMOL00000000。
[0010]本专利技术的有益效果：采用上述标记可以用于梨果皮红色/绿色性状辅助选择育种中，在杂交苗的幼苗期快速淘汰绿果皮单株，节省后续杂交苗维护和鉴定评价成本，显著提高红皮梨育种效率，具有适用品种广泛、准确率高、红株检出率高、错误率低、表型与带型一致率高等优点。
[0011]进一步，碱基处的碱基序列为ATAACTAGCAAAAATAAGACACGAAATGTTAAATACT或A。
[0012]本专利技术提供上述位点在梨果皮红色/绿色性状辅助选择育种中的应用。
[0013]本专利技术的有益效果：基于上述位点，可以开发标记引物等，可以用于梨果皮红色/绿色性状辅助选择育种中，在杂交苗的幼苗期快速淘汰绿果皮单株，节省后续杂交苗维护和鉴定评价成本，显著提高红皮梨育种效率，具有适用品种广泛、准确率高、红株检出率高、错误率低、表型与带型一致率高等优点。
[0014]本专利技术提供一种与梨果皮红色性状连锁的分子标记，上述位点位于分子标记扩增产物的内部。
[0015]进一步，分子标记的上游引物序列包括SEQ ID NO:1所示的序列，分子标记的下游引物序列包括SEQ ID NO:2所示的序列。
[0016]优选地，分子标记的上游引物序列为SEQ ID NO:1所示的序列，分子标记的下游引物序列为SEQ ID NO:2所示的序列。
[0017]本专利技术还提供上述的分子标记在梨果皮红色/绿色性状辅助选择育种中的应用。
[0018]本专利技术提供一种用于扩增上述分子标记的引物。
[0019]进一步，引物包括SEQ ID NO:1所示的序列和/或SEQ ID NO:2所示的序列。优选地，上游引物为SEQ ID NO:1所示的序列，下游引物为SEQ ID NO:2所示的序列。
[0020]采用上述技术方案的有益效果：采用上述引物可以实现梨果皮红色/绿色性状辅助选择育种，在杂交苗的幼苗期快速淘汰绿果皮单株，节省后续杂交苗维护和鉴定评价成本，显著提高红皮梨育种效率，具有适用品种广泛、准确率高、红株检出率高、错误率低、表型与带型一致率高等优点。
[0021]本专利技术提供上述的引物在梨果皮红色/绿色性状辅助选择育种中的应用。
[0022]本专利技术提供一种梨果皮颜色辅助选择育种试剂盒，包括上述引物。
[0023]采用上述技术方案的有益效果：采用上述试剂盒可以实现梨果皮红色/绿色性状辅助选择育种，在杂交苗的幼苗期快速淘汰绿果皮单株，节省后续杂交苗维护和鉴定评价成本，显著提高红皮梨育种效率，具有适用品种广泛、准确率高、红株检出率高、错误率低、表型与带型一致率高等优点。
[0024]进一步，所述试剂盒还包括：PCR扩增用酶、去离子水、阳性对照、阴性对照中的一种或几种的组合。
[0025]本专利技术提供上述的试剂盒在梨果皮红色/绿色性状辅助选择育种中的应用。
[0026]本专利技术提供一种在梨果皮红色/绿色性状辅助选择育种的方法，包括以下步骤：提取待选择育种的杂交苗或梨品种的DNA，采用上述引物进行PCR扩增。或者提取待选择育种的杂交苗或梨品种的DNA，采用上述的试剂盒进行PCR扩增。
[0027]进一步，包括以下步骤：提取待选择育种的杂交苗或梨品种的DNA，采用引物对进行PCR扩增，引物对包括SEQ ID NO:1所示的序列和SEQ ID NO:2所示的序列。
[0028]采用上述技术方案的有益效果：采用PCR扩增结合琼脂糖电泳的方法，实验操作简
Marker。
具体实施方式
[0041]以下结合附图对本专利技术的原理和特征进行描述，所举实例只用于解释本专利技术，并非用于限定本专利技术的范围。
[0042]本专利技术提供与梨果皮红色性状连锁的InDel位点及基于该位点的分子标记及其应用。
[0043]本专利技术提供的与梨果皮红色性状连锁的InDel位点，位于
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中矮1号
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梨参考基因组(GeneBank登录号：SMOL00000000)的Chr5的26527817碱基处，该处的碱基序列如SEQ ID NO:3所示，为5'
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ATAACTA本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.与梨果皮红色性状连锁的位点，其特征在于，位点的核苷酸序列包括位于
‘
中矮1号
’
梨参考基因组的Chr5的26527817碱基处的位点的核苷酸序列，参考基因组的GeneBank登录号：SMOL00000000。2.根据权利要求1所述位点，其特征在于，碱基处的碱基序列为ATAACTAGCAAAAATAAGACACGAAATGTTAAATACT或A。3.一种与梨果皮红色性状连锁的分子标记，其特征在于，权利要求1或2所述位点位于分子标记扩增产物的内部。4.根据权利要求3所述分子标记，其特征在于，分子标记的上游引物序列包括SEQ ID NO:1所示的序列，分子标记的下游引物序列包括SEQ ID NO:2所示的序列。5.一种用于扩增权...

【专利技术属性】
技术研发人员：欧春青，姜淑苓，王斐，张艳杰，马力，
申请(专利权)人：中国农业科学院果树研究所，
类型：发明
国别省市：