用于诊断膀胱癌的核酸产品、试剂盒及应用制造技术

本发明专利技术涉及一种用于诊断膀胱癌的核酸产品、试剂盒及应用。本发明专利技术利用C1orf141基因CpG岛的甲基化与膀胱的发生的相关性，通过检测样本中C1orf141基因CpG岛中各区域的甲基化水平，其检测的灵敏度和特异性均较高，能够对膀胱癌进行较准确的诊断或辅助诊断，可以有效区分膀胱癌患者和健康人，有效地提高了早期膀胱癌的检出率。癌的检出率。

【技术实现步骤摘要】
用于诊断膀胱癌的核酸产品、试剂盒及应用


[0001]本专利技术涉及分子生物学领域，特别是涉及一种用于诊断膀胱癌的核酸产品、试剂盒及应用。

技术介绍

[0002]膀胱癌是泌尿系统最常见的恶性肿瘤，极易复发，严重危害人类的生命健康。膀胱癌的复发常呈周期性，肿瘤级别会进一步恶化，所以早诊断、早治疗和长期有效的监测对提高膀胱癌患者的生存率十分重要。
[0003]目前，常用的膀胱癌诊断方法包括尿脱落细胞学检查和膀胱镜检查。尿脱落细胞学检查虽然是无创的，且其检测特异性可达90％以上，但是其检测灵敏度较低，只有30％～40％。因此，某些患者不得不进行膀胱镜检查，膀胱镜检查费用较高，属于有创操作，在检查过程中会给患者带来较大的痛苦，且其结果受医师的经验和主观判断的影响，存在一定的误差。近年来有一些基于尿液的检测方法，如检测膀胱肿瘤抗原(bladder tumor antigen,BTA)和核基质蛋白22(nuclear matrix protein,NMP22)等，这些标记物的灵敏性相对较高，可达50％～70％，但特异性不佳，仅有60％～80％，所以未能广泛应用到临床中。
[0004]DNA甲基化是基因表达的重要表观遗传调控因子，在维持正常生物功能和疾病的发生发展中起着重要作用。肿瘤抑制相关基因甲基化程度的增加从而导致其活性降低或失活是多种肿瘤发生的早期事件，这种DNA甲基化模式的改变可能是最早可检测到的与肿瘤基因相关的变化之一。因此，DNA甲基化标志物被广泛地应用于常见癌症的诊断和预后，目前，研究人员发现了多种在膀胱癌中高甲基化的基因，其中一些已被开发为诊断产品，例如TWIST1和NID2或FGFR3和TERT等基因，然而这些甲基化标志物的诊断灵敏度和特异性仍然需要提高。

技术实现思路

[0005]本专利技术研究人员发现，尿液样本中存在着数量相当的脱落细胞的DNA可用于液体活检，脱落细胞DNA的CpG位点的甲基化可以成为检测或监测膀胱癌的标记物。而C1orf141(Chromosome 1Open Reading Frame 141)基因CpG岛的甲基化水平与膀胱癌的发生密切相关，且该基因DNA分子的异常甲基化频繁地发生在癌症早期。基于此，本申请提供一种用于诊断膀胱癌的核酸产品、试剂盒及应用。
[0006]一种检测C1orf141基因CpG岛甲基化水平的试剂在制备用于诊断膀胱癌的产品中的应用。
[0007]通过检测C1orf141基因CpG岛的甲基化水平，可以有效区分膀胱癌患者和健康人，其检测的灵敏度和特异性都较高，提高了膀胱癌的检出率。
[0008]在其中一个实施例中，以GRCh38.p13为参考基因组，所述试剂用于检测Chr1:67134645
‑
67135071正链和/或负链的全长或部分区域的甲基化水平。
[0009]在其中一个实施例中，所述试剂用于检测以下至少一个区域的全长或部分区域的
甲基化水平：
[0010]正链Chr1:67134645
‑
67134767、
[0011]正链Chr1:67134757
‑
67134897、
[0012]正链Chr1:67134910
‑
67135071、
[0013]负链Chr1:67135060
‑
67134936、
[0014]负链Chr1:67134912
‑
67134762、以及
[0015]负链Chr1:67134772
‑
67134653。
[0016]一种用于诊断膀胱癌的核酸产品，所述核酸产品用于检测C1orf141基因CpG岛的甲基化水平。
[0017]在其中一个实施例中，以GRCh38.p13为参考基因组，所述核酸产品包括检测Chr1:67134645
‑
67135071正链和/或负链的全长或部分区域的甲基化水平的引物对。
[0018]在其中一个实施例中，所述核酸产品包括检测以下至少一个区域的全长或部分区域的甲基化水平的引物对：
[0019]正链Chr1:67134645
‑
67134767、
[0020]正链Chr1:67134757
‑
67134897、
[0021]正链Chr1:67134910
‑
67135071、
[0022]负链Chr1:67135060
‑
67134936、
[0023]负链Chr1:67134912
‑
67134762、以及
[0024]负链Chr1:67134772
‑
67134653。
[0025]在其中一个实施例中，所述引物对包括核苷酸序列如SEQ ID NO:1～2所示的测序引物对、核苷酸序列如SEQ ID NO:3～4所示的测序引物对、核苷酸序列如SEQ ID NO:5～6所示的测序引物对、核苷酸序列如SEQ ID NO:7～8所示的测序引物对、核苷酸序列如SEQ ID NO:9～10所示的测序引物对、核苷酸序列如SEQ ID NO:11～12所示的测序引物对、核苷酸序列如SEQ ID NO:13～14所示的检测引物对、核苷酸序列如SEQ ID NO:16～17所示的检测引物对、核苷酸序列如SEQ ID NO:19～20所示的检测引物对、核苷酸序列如SEQ ID NO:22～23所示的检测引物对、核苷酸序列如SEQ ID NO:25～26所示的检测引物对和核苷酸序列如SEQ ID NO:28～29所示的检测引物对中的至少一对。
[0026]在其中一个实施例中，所述核酸产品还包括与所述检测引物对对应的检测探针，其中，与核苷酸序列如SEQ ID NO:13～14所示的检测引物对对应的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:15所示，与核苷酸序列如SEQ ID NO:16～17所示的检测引物对对应的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:18所示，与核苷酸序列如SEQ ID NO:19～20所示的检测引物对对应的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:21所示，与核苷酸序列如SEQ ID NO:22～23所示的检测引物对对应的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:24所示，与核苷酸序列如SEQ ID NO:25～26所示的检测引物对对应的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:27所示，与核苷酸序列如SEQ ID NO:28～29所示的检测引物对对应的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:30所示。
[0027]一种用于诊断膀胱癌的试剂盒，包括以上任一实施例所述的核酸产品。
[0028]在其中一个实施例中，所述试剂盒还包括核酸提取试剂、甲基化转化试剂、阳性对照品、阴性对照品、PCR反应试剂和测序试剂中的至少一种。
具体实施方式
[0029]为使本专利技术的上述目的、特征和优点本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种检测C1orf141基因CpG岛甲基化水平的试剂在制备用于诊断膀胱癌的产品中的应用。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，以GRCh38.p13为参考基因组，所述试剂用于检测Chr1:67134645
‑
67135071正链和/或负链的全长或部分区域的甲基化水平。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述试剂用于检测以下至少一个区域的全长或部分区域的甲基化水平：正链Chr1:67134645
‑
67134767、正链Chr1:67134757
‑
67134897、正链Chr1:67134910
‑
67135071、负链Chr1:67135060
‑
67134936、负链Chr1:67134912
‑
67134762、以及负链Chr1:67134772
‑
67134653。4.一种用于诊断膀胱癌的核酸产品，其特征在于，所述核酸产品用于检测C1orf141基因CpG岛的甲基化水平。5.根据权利要求4所述的核酸产品，其特征在于，以GRCh38.p13为参考基因组，所述核酸产品包括检测Chr1:67134645
‑
67135071正链和/或负链的全长或部分区域的甲基化水平的引物对。6.根据权利要求5所述的核酸产品，其特征在于，所述核酸产品包括检测以下至少一个区域的全长或部分区域的甲基化水平的引物对：正链Chr1:67134645
‑
67134767、正链Chr1:67134757
‑
67134897、正链Chr1:67134910
‑
67135071、负链Chr1:67135060
‑
67134936、负链Chr1:67134912
‑
67134762、以及负链Chr1:67134772
‑
67134653。7.根据权利要求6所述的...

【专利技术属性】
技术研发人员：蔡迪，董兰兰，张良禄，
申请(专利权)人：武汉艾米森生命科技有限公司，
类型：发明
国别省市：