【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于从治疗性组合物中去除材料的制造方法和装置
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本专利申请要求2019年8月9日提交的标题为“MICROFLUIDIC APPARATUS AND METHODS OF USE THEREOF”的美国临时专利申请第62/885,159号,以及2019年8月9日提交的标题为“METHODS AND APPARATUSES FOR MANUFACTURING THERAPEUTIC COMPOSITIONS”的美国临时专利申请第62/885,170号,和2019年10月11日提交的标题为“METHODS AND APPARATUSES FOR MANUFACTURING FOR REMOVING MATERIAL FROM A THERAPEUTIC COMPOSITION”的美国临时专利申请第62/914,374号的优先权,其中的每个都通过引用整体并入本文。
[0003]通过引用并入
[0004]本说明书中提及的所有出版物和专利申请都以引用的方式整体并入本文,其程度与每个单独的出版物或专利申请被具体地和单独地提到以引用的方式并入的程度相同。
[0005]本公开通常涉及用于快速、高产地制造基于多核苷酸的治疗剂的方法和系统。本公开可具体涉及自动化制造治疗性mRNA,包括疫苗,其可快速且有效地实施。此类治疗剂可以考虑患者的具体信息,并且可以按需、完全或部分地在护理点(例如,医院、诊所等)产生。
技术介绍
[0006]目前用于制造和配制多核苷酸治疗剂,特 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.使用包含多个流体贮库的系统制造治疗性多核苷酸的方法,所述多个流体贮库配置为在与一个或多个微流体路径装置的密封流体连通中拴牢,所述方法包括:在所述多个流体贮库的一个或多个流体贮库和所述一个或多个微流体路径装置上多个反应器之间在密封且封闭的流体路径中输送试剂以实施以下步骤,所述流体路径受保护而免于大气接触:形成合成模板、从所述模板实施体外转录以产生治疗性多核苷酸,以及纯化所述治疗性多核苷酸。2.根据权利要求1所述的方法,其中纯化所述治疗性多核苷酸包括在所述多个反应器中的一个或多个内对所述治疗性多核苷酸进行二维(2D)纯化。3.根据权利要求1所述的方法,其进一步包括在所述一个或多个微流体路径装置上的一个或多个反应器中用递送媒介物配制所述治疗性多核苷酸以形成治疗性多核苷酸组合物。4.根据权利要求3所述的方法,其进一步包括在所述一个或多个微流体路径装置中浓缩所述治疗性多核苷酸组合物。5.根据要求3所述的方法,其中所述递送媒介物包含两亲性纳米颗粒。6.根据权利要求5所述的方法,其中所述两亲性纳米颗粒包含氨基脂化拟肽。7.根据权利要求1所述的方法,其中纯化所述治疗性多核苷酸包括在所述一个或多个反应器内使用纤维素材料去除双链mRNA。8.根据权利要求1所述的方法,其中所述系统自动且连续地实施以下步骤:形成所述合成模板、从所述模板实施体外转录、以及用来自系统的一个或多个传感器的光反馈来纯化所述治疗性多核苷酸。9.根据权利要求1所述的方法,其中所述治疗性多核苷酸是mRNA。10.根据权利要求1所述的方法,其中所述治疗性多核苷酸是mRNA、环状RNA或自我复制RNA。11.根据权利要求1所述的方法,其中所述系统通过流体动力在所述一个或多个流体贮库和所述多个反应器之间输送所述试剂。12.根据权利要求11所述的方法,其中所述系统在所述一个或多个流体贮库和所述多个反应器之间气动地输送所述试剂。13.根据权利要求1所述的方法,其中所述系统通过偏转所述一个或多个微流体路径装置内的一个或多个弹性层来在所述一个或多个流体贮库和所述多个反应器之间输送所述试剂。14.根据权利要求1所述的方法,其中所述方法在护理位点实施。15.根据权利要求1所述的方法,其中所述系统自动且连续地实施以下步骤:形成合成模板、从所述模板实施体外转录以产生治疗性多核苷酸,以及在少于3天内纯化所述治疗性多核苷酸。16.根据权利要求1所述的方法,其进一步包括将所述流体贮库密封到所述一个或多个微流体路径装置并且在所述流体贮库与所述一个或多个微流体路径装置上的所述多个反应器之间输送所述试剂之前对所述流体贮库加压。17.根据权利要求1所述的方法,其进一步包括在与所制造的所述治疗性多核苷酸相关联的文件中记录在所述步骤的实施期间在所述一个或多个微流体路径装置内的流体移动。
18.使用根据权利要求1所述的方法制备的治疗性多核苷酸。19.使用包含多个流体贮库的系统制造治疗性RNA的方法,所述流体贮库配置为在与一个或多个微流体路径板装置的密封流体连通中拴牢,其中所述一个或多个微流体路径板装置包含多个反应器,所述方法包括:从一个或多个所述流体贮库递送模板前体材料到所述多个反应器的第一一个或多个反应器区域,并处理所述模板前体材料以从所述模板前体材料制备模板;转移所述模板到所述多个反应器的第二一个或多个反应器区域并通过体外转录处理所述模板以形成治疗性mRNA;和转移所述治疗性mRNA到所述多个反应器的第三一个或多个反应器区域,并通过在所述第三一个或多个反应器区域内的二维(2D)纯化来纯化所述治疗性mRNA;其中所有所述方法步骤都在不将所述模板和治疗性mRNA暴露于大气接触的情况下实施。20.使用包含与一个或多个微流体路径板装置密封流体连通的多个流体贮库的系统制造治疗性mRNA的方法,其中所述一个或多个微流体路径板装置包含多个反应器,所述方法包括:使用流体动力递送模板前体材料从一个或多个流体贮库到所述多个反应器的第一一个或多个反应器区域,并处理所述模板前体材料以从所述模板前体材料制备模板;使用流体动力转移所述模板到所述多个反应器的第二一个或多个反应器区域,并通过体外转录处理所述模板以形成治疗性mRNA;使用流体动力转移所述治疗性mRNA到所述多个反应器的第三一个或多个反应器区域,并通过在所述第三一个或多个反应器区域内的二维(2D)纯化来纯化所述治疗性mRNA;使用流体动力转移所述治疗性mRNA到所述多个反应器的第四一个或多个反应器区域,并用递送媒介物包囊所述治疗性mRNA以形成治疗性mRNA组合物;和使用流体动力在第五一个或多个流体贮库中浓缩所述治疗性mRNA组合物,其中所述所有方法步骤均在不将所述模板和所述治疗性mRNA暴露于大气接触的情况下实施。21.包含用于制造治疗性多核苷酸的指令的非暂时性计算机可读介质,所述指令当由包含多个流体贮库的系统的控制器执行时使所述控制器实施以下方法,所述流体贮库配置为在与一个或多个微流体路径装置密封的流体连通中拴牢:对与一个或多个微流体路径装置流体连通的所述多个流体贮库加压;在所述多个流体贮库的一个或多个流体贮库与所述一个或多个微流体路径装置上的多个反应器之间在密封且封闭的流体路径中输送试剂以实施以下步骤,所述流体路径受保护而免于大气接触:形成合成模板,从所述模板实施体外转录以产生治疗性多核苷酸,以及纯化所述治疗性多核苷酸。22.根据权利要求21所述的计算机可读介质,其中所述指令进一步使所述控制器自动且连续地实施以下步骤:形成所述合成模板、从所述模板实施体外转录以及基于来自所述系统的一个或多个光学传感器的光反馈来纯化所述治疗性多核苷酸。
23.根据权利要求21所述的计算机可读介质,其中所述指令进一步使所述控制器控制在所述多个反应器中的一个或多个内通过二维(2D)纯化来纯化所述治疗性多核苷酸。24.根据权利要求21所述的计算机可读介质,其中所述指令进一步使所述控制器在所述一个或多个微流体路径装置上的一个或多个反应器中用递送媒介物配制所述治疗性多核苷酸以形成治疗性多核苷酸组合物。25.根据权利要求21所述的计算机可读介质,其中所述指令进一步使所述控制器在所述一个或多个微流体路径装置中浓缩所述治疗性多核苷酸组合物。26.根据权利要求21所述的计算机可读介质,其中所述指令进一步使所述控制器通过流体动力在所述一个或多个流体贮库和所述多个反应器之间输送所述试剂。27.根据权利要求21所述的计算机可读介质,其中所述指令进一步使所述控制器通过偏转所述一个或多个微流体路径装置内的一个或多个弹性层来在所述一个或多个流体贮库和所述多个反应器之间输送所述试剂。28.根据权利要求21所述的计算机可读介质,其中所述指令进一步使所述控制器自动且连续地实施以下步骤:形成合成模板、从所述模板实施体外转录以产生治疗性多核苷酸,以及在少于5天内纯化所述治疗性多核苷酸。29.根据权利要求21所述的计算机可读介质,其中所述指令进一步使所述控制器在与所制造的所述治疗性多核苷酸相关联的文件中记录在实施所述步骤期间所述一个或多个微流体路径装置内的流体移动。30.使用封闭路径系统制备用于mRNA合成的合成双链DNA模板的自动化方法,所述封闭路径系统包含配置为与一个或多个微流体路径装置的密封流体连通中拴牢的多个流体贮库,所述方法包括:在所述多个流体贮库的一个或多个流体贮库与所述一个或多个微流体路径装置上的多个反应器之间在封闭的流体路径中输送试剂以组合所述试剂,所述封闭流体路径受保护而免于大气接触;和形成用于体外转录治疗性mRNA的所述合成双链DNA模板。31.根据权利要求30所述的方法,其中所述合成双链DNA模板不含细菌DNA且不含内毒素。32.根据权利要求30所述的方法,其进一步包括在用于所述封闭路径系统的控制器中接收来自所述封闭路径系统的一个或多个传感器的光学传感器数据,其中所述控制器基于所述光学传感器数据控制所述封闭路径系统的操作。33.根据权利要求30所述的方法,其进一步包括对所述流体贮库加压。34.根据权利要求30所述的方法,其中输送试剂包括将感兴趣的合成基因和合成的体外转录促进子盒从所述多个流体贮库中的一个或多个流体贮库输送至所述微流体路径装置中的第一一个或多个反应器,连接所述感兴趣的合成基因与所述合成的体外转录促进子盒以创建合成产物,从所述合成产物中去除未反应的材料,并扩增所述合成产物以生成所述合成的双链DNA模板。35.根据权利要求30所述的方法,其中所述一个或多个微流体路径装置包含位于所述封闭路径系统中的微流体路径板装置。36.使用封闭路径系统制备用于体外转录的合成双链DNA模板的自动化方法,所述封闭
路径系统包含在与微流体路径装置的密封流体连通中的多个流体贮库,所述方法包括:在封闭流体路径中从所述多个流体贮库中的一个或多个流体贮库输送包括感兴趣的合成基因和合成体外转录促进子盒的试剂到所述微流体路径装置中的第一一个或多个反应器,所述封闭流体路径受保护而免于大气接触;连接所述感兴趣的合成基因与所述合成的体外转录促进子盒以创建合成产物;输送所述微流体路径装置中的所述合成产物以从所述合成产物中去除未反应的感兴趣的合成基因和未反应的合成体外转录促进子盒;和输送在所述微流体路径装置中的所述合成产物并扩增所述合成产物以生成所述双链DNA模板。37.根据权利要求36所述的方法,其中扩增所述合成产物生成大于1mM的扩增的DNA模板。38.根据权利要求36所述的方法,其中所述合成双链DNA模板不含细菌DNA且不含内毒素。39.根据权利要求36所述的方法,其进一步包括在用于所述封闭路径系统的控制器中接收来自所述封闭路径系统的一个或多个传感器的光学传感器数据,其中所述控制器基于所述光学传感器数据控制所述封闭路径系统的操作。40.根据权利要求36所述的方法,其进一步包括对所述流体贮库加压。41.根据权利要求36所述的方法,其中所述输送步骤各自包括使用一个或多个流体动力回路在所述多个流体贮库与所述微流体路径装置之间或在所述微流体路径装置内移动材料。42.根据权利要求36所述的方法,其进一步包括转移所述扩增的DNA模板到所述微流体路径装置的一个或多个消化反应器,并酶促修饰扩增的合成产物以生成所述双链DNA模板。43.根据权利要求36所述的方法,其中连接所述感兴趣的合成基因与所述合成的体外转录促进子盒以创建合成产物包括创建合成的线性或环状连接产物。44.根据权利要求36所述的方法,其中扩增所述合成产物包括生成线性、分支或环状扩增的DNA产物,进一步包括线性化所述扩增的DNA产物以生成所述双链DNA模板。45.根据权利要求36所述的方法,其中连接包括用DNA连接酶连接。46.根据权利要求36所述的方法,其中连接包括退火或引物延伸。47.根据权利要求36所述的方法,其中扩增包括多重置换扩增(MDA)。48.根据权利要求36所述的方法,其中扩增包括聚合酶链式反应(PCR)扩增。49.根据权利要求36所述的方法,其中所述合成的体外转录促进子盒包含含有启动子的双链DNA模板;5'UTR;可切割的接头;3'UTR;以及编码包含连续的至少200个腺嘌呤残基或200个胸苷残基的polyA区域的部分。50.根据权利要求36所述的方法,其中所述双链DNA模板包括所述感兴趣的合成基因的3'末端的至少300bp长的polyA区域。51.根据权利要求36所述的方法,其中所述体外转录促进子盒的长度小于1kb。52.根据权利要求36所述的方法,其中所述合成的体外转录促进子盒不编码抗生素抗性基因。53.根据权利要求36所述的方法,其中所述体外转录促进子盒不具有复制起点(ORI)。
54.使用封闭路径系统制备用于体外转录的合成双链DNA模板的自动化方法,所述封闭路径系统包含在与微流体路径装置的密封流体连通中的多个流体贮库,所述方法包括:在封闭的流体路径中从所述多个流体贮库的一个或多个流体贮库输送包括感兴趣的合成基因和合成的体外转录(IVT)促进子盒的试剂到所述微流体路径装置中的第一一个或多个反应器,所述封闭流体路径受保护而免于大气接触;连接所述感兴趣的合成基因与所述第一一个或多个反应器中的所述合成IVT促进子盒以创建合成产物;输送所述合成产物到所述微流体路径装置中的第二一个或多个反应器以从所述合成产物中去除未反应的感兴趣合成基因和未反应的合成IVT促进子盒;输送所述合成产物到所述微流体路径装置中的第三一个或多个反应器,...
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