生物样本中微生物RNA的快速分离和收集制造技术

微生物物种的检测和鉴定使用液相色谱作为从生物样本中快速分离并收集微生物RNA的粗过滤工艺。在各种实施方案中，来自生物样本的微生物RNA分子的基因测序通过以下而得到增强：获得生物样本并随后将生物样本制备为液相色谱的测试样品，所述液相色谱用于从测试样品中的RNA分子混合物中粗过滤微生物RNA分子，以在两个或更多个馏分输出中分离并收集微生物RNA分子，其中两个或更多个馏分输出中的至少一者是液相色谱的空隙体积内的馏分，制备一个或多个馏分输出用于基因测序，包括空隙体积内的馏分输出，并对一个或多个制备的输出进行基因测序以检测生物样本中的微生物RNA。因测序以检测生物样本中的微生物RNA。因测序以检测生物样本中的微生物RNA。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】生物样本中微生物RNA的快速分离和收集


[0001]本公开涉及从生物样本中分离核酸。更具体地，本公开涉及通过使用液相色谱作为从生物样本中快速分离并收集微生物RNA的粗过滤(bulk filtration)工艺，而更高效且有效地检测并鉴定微生物物种。

技术介绍

[0002]微生物物种的检测和鉴定对于诊断和治疗疾病，以及对于在各种临床、环境或生产环境中鉴别污染源和预防感染是重要的。微生物物种可以包括细菌、病毒、原生动物、真菌、藻类、变形虫和黏菌。
[0003]具体微生物物种的检测和鉴定可以用于患者和产品以及设施和环境(诸如，像医院或诊所的医疗相关设施和像制造厂或厨房的食品生产环境)的评估和治疗。例如，在医护办公室中利用具体微生物物种的检测，以便确定导致患者感染的病原体的存在和特征(identity)，从而允许适当的治疗和补救。同样的方法也用于医疗保健、食品行业、长期护理行业、酒店业、国土安全部、航空航天业，甚至私营部门。
[0004]不幸的是，从这样的临床、环境或生产背景中获得的生物样本中微生物物种的检测不同于在理论或研究背景中使用本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于增强对来自生物样本的微生物RNA分子的基因测序的方法，所述方法包括：(a)获得所述生物样本；(b)将所述生物样本制备为液相色谱的测试样品；(c)使用液相色谱从所述测试样品中的RNA分子的混合物中粗过滤微生物RNA分子，以在所述液相色谱的两个或更多个馏分输出中分离并收集所述微生物RNA分子，其中所述两个或更多个馏分输出中的至少一者是所述液相色谱的空隙体积内的馏分输出；(d)制备用于基因测序的一个或多个馏分输出，其中所述一个或多个馏分输出是所述空隙体积内的馏分输出；以及(e)对所述一个或多个制备的输出进行基因测序，以检测来自所述生物样本的微生物RNA。2.根据权利要求1所述的方法，其中所述生物样本是哺乳动物样本。3.根据权利要求1所述的方法，其中所述生物样本包括以下中的至少一者：大RNA分子、小RNA分子、tRNA分子、rRNA分子、mRNA分子、变性和非变性RNA分子、微生物RNA分子、非微生物RNA分子、基因组DNA分子、蛋白质分子和其他大分子。4.根据权利要求1所述的方法，其中制备所述生物样本包括通过使试剂与所述生物样本相互作用来消化所述生物样本以产生所述测试样品。5.根据权利要求4所述的方法，其中消化所述生物样本包括：(i)通过使所述生物样本与至少硫氰酸胍、N
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月桂酰肌氨酸和乙醇中的一者相互作用来裂解所述生物样本；(ii)通过使所述生物样本与至少氯化胍、乙醇、2
‑
氨基
‑2‑
(羟甲基)
‑
丙烷
‑
1,3
‑
二盐酸盐和乙二胺四乙酸二钠中的一者相互作用来洗涤所述生物样本；(iii)通过使所述生物样本与至少蛋白酶K、硫氰酸胍、N
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月桂酰肌氨酸、乙醇、2
‑
氨基
‑2‑
(羟甲基)丙烷
‑
1,3
‑
二盐酸盐和乙二胺四乙酸二钠中的一者相互作用来清洁所述生物样本；以及(iv)通过使所述生物样本与至少55％至85％硫氰酸胍、1％至20％N
‑
月桂酰肌氨酸、70％至100％乙醇、DNase I、2
‑
氨基
‑2‑
(羟甲基)
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丙烷
‑
1,3
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二盐酸盐和乙二胺四乙酸二钠中的一者相互作用来从所述生物样本中分离所述测试样品。6.根据权利要求4所述的方法，其中消化所述生物样本移除基因组DNA分子、蛋白质分子和其他大分子。7.根据权利要求5所述的方法，其中裂解所述生物样本通过使所述生物样本与至少55％至85％硫氰酸胍、1％至20％N
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月桂酰肌氨酸和70％至100％乙醇中的一者相互作用来完成；其中洗涤所述生物样本通过使所述生物样本与至少25％至55％氯化胍、70％至99％乙醇、12mg/m3至790mg/m
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【专利技术属性】
技术研发人员：R，
申请(专利权)人：污染源识别有限责任公司，
类型：发明
国别省市：