急性腹泻标志基因及其应用制造技术

本发明专利技术提出了一种急性腹泻基因标志物及其应用，该急性腹泻基因标志物包括第一基因集，因此，进一步提出了一种试剂盒，包括适于检测第一基因集中的至少一种基因的试剂，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1

【技术实现步骤摘要】
急性腹泻标志基因及其应用


[0001]本专利技术涉及生物
，具体的，本专利技术涉及急性腹泻标志基因及其应用，更具体的，本专利技术涉及一种试剂盒、试剂在制备试剂盒中的用途、用于预防或者治疗急性腹泻的药物组合物或者食品组合物、确定个体是否患有急性腹泻的方法、确定个体是否患有急性腹泻的装置、一种装置、一种筛选药物的方法。

技术介绍

[0002]急性腹泻(Acute Diarrhea)是一种发生非常频繁的病症，在热带和亚热带国家比在温带国家发生的概率更高，急性腹泻可能与严重的消化系统或全身并发症有关，尤其是身体虚弱的幼儿、老年人、免疫功能低下等人群。
[0003]每人每天大约摄入2升食物或液体，另外7
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9升液体通过唾液腺、胃、胆汁、胰腺和肠粘膜分泌。液体的主要吸收发生在小肠中，因此每天只有大约2升进入大肠，并在那里浓缩成大约100毫升的粪便体积。流体运动主要基于电解质的主动传输，然后是水的被动传输，如果传输平衡被打破，就会发生腹泻，而急性腹泻的发作通常具有传染性并且是自限性的。
[0004]随着人体基因组测序完成及高通量测序技术的快速发展，探索疾病与肠道微生物之间的关系为急性腹泻的诊断提供了新的方向，对于发现急性腹泻潜在人群进行急性腹泻的早筛、预防和治疗具有非常重要的作用。

技术实现思路

[0005]本专利技术旨在至少在一定程度上解决上述技术问题之一或至少提供一种商业选择。
[0006]依据本专利技术的第一方面，提供一种试剂盒，包括适于检测第一基因集中至少一种基因的试剂，所述第一基因集由以下基因组成：GI_0066549、GI_0066550、GI_0066551、GI_0066552、GI_0066553和 GI_0062833，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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6所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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6中的序列具有不小于90％的同一性。根据本专利技术具体实施例的试剂盒，可以准确的检测生物样品中是否含有所述第一基因集中的至少一种基因的试剂，更进一步地，也可以准确区分或诊断急性腹泻患者和健康个体。
[0007]在本专利技术的第二方面，本专利技术提出了试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂适于检测第一基因集中的至少一种基因。根据本专利技术的实施例，所述试剂盒用于诊断急性腹泻或检测急性腹泻的治疗效果，所述第一基因集由以下基因组成：GI_0066549、GI_0066550、GI_0066551、GI_0066552、GI_0066553和 GI_0062833，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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6所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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6中的序列具有不小于90％的同一性。根据本专利技术具体实施例的试剂制备的试剂盒，可以准确的检测生物样品中是否含有所述第一基因集中的至少一种基因，更进一步地，也可以极准确的区分急性腹泻患者和健康个体，由此，可以有效的在早期进行急性腹泻诊断，
或用于检测治疗过程中急性腹泻的变化。
[0008]在本专利技术的第三方面，本专利技术提出了一种用于预防或者治疗急性腹泻的药物组合物或者食品组合物。根据本专利技术的实施例，含有提高所述第二基因集中的至少一种基因丰度的物质，所述第二基因集由以下基因组成：GI_0003561、GI_0004803、GI_0006046、GI_0007244和GI_0010144，其中，所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO：7
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11所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的 SEQ ID NO：7
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11所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。根据本专利技术实施例的急性腹泻标志基因中第二基因集的基因可以非侵入性的在早期发现或辅助检测急性腹泻，确定个体患有急性腹泻的概率高低或者个体处于健康状态的概率高低；同时，提高急性腹泻高风险人群或已急性腹泻患者肠道内微生物的所述第二基因集中的各种基因的丰度，可以降低患急性腹泻的概率或减缓、治愈急性腹泻，因此，所述包含提高所述第二基因集中的至少一种基因丰度的药物或者食品组合物能够有效预防或治疗急性腹泻。
[0009]在本专利技术的第四方面，本专利技术提出了一种确定个体是否患有急性腹泻的方法。根据本专利技术的实施例，包括：(1)确定所述个体的粪便样本中标志基因的丰度，所述标志基因包括第一基因集和第二基因集中的至少一种基因；(2)将步骤(1)中得到的所述丰度与预定的阈值进行比较，以便确定所述个体是否患有急性腹泻；其中，所述第一基因集由以下基因组成：GI_0066549、GI_0066550、GI_0066551、 GI_0066552、GI_0066553和GI_0062833，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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6所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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6中的序列具有不小于90％的同一性，所述第二基因集由以下基因组成：GI_0003561、GI_0004803、GI_0006046、GI_0007244和 GI_0010144，其中，所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO：7
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11所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：7
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11所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。根据本专利技术实施例的方法可以依据个体的粪便样本中的所述标志基因的丰度确定个体是否患有急性腹泻，所述标志基因是专利技术人对大量已知状态的粪便样本进行验证，通过差异比较分析各种肠道微生物的基因在急性腹泻组和健康组粪便样本中的丰度，而确定下来的。
[0010]在本专利技术的第五方面，本专利技术提出了一种确定个体是否患有急性腹泻的装置。根据本专利技术的实施例，包括：丰度确定单元，用于确定所述个体的粪便样本中标志基因的丰度，所述标志基因包括第一基因集和第二基因集中的至少一种基因；比较单元，用于将所得到的所述丰度与预定的阈值进行比较，以便确定所述个体是否患有急性腹泻；其中，所述第一基因集由以下基因组成：GI_0066549、GI_0066550、 GI_0066551、GI_0066552、GI_0066553和GI_0062833，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO： 1
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6所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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6中的序列具有不小于90％的同一性，所述第二基因集由以下基因组成：GI_0003561、GI_0004803、GI_0006046、GI_0007244 和GI_0010144，其中，所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO：7
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11所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：7
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11所示的核酸序列具有不小于90本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种试剂盒，其特征在于，包括适于检测第一基因集中的至少一个基因的试剂，所述第一基因集由以下基因组成：GI_0066549、GI_0066550、GI_0066551、GI_0066552、GI_0066553和GI_0062833，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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6所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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6中的序列具有不小于90％的同一性。2.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，进一步包括适于检测第二基因集中的至少一个基因的试剂，所述第二基因集由以下基因组成：GI_0003561、GI_0004803、GI_0006046、GI_0007244和GI_0010144，其中，所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO：7
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11所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：7
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11所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。3.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，包括适于检测所述第一基因集中全部所述基因的试剂。4.根据权利要求2所述的试剂盒，其特征在于，包括适于检测所述第二基因集中全部所述基因的试剂。5.试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂适于检测第一基因集中的至少一种基因，所述试剂盒用于诊断急性腹泻或者检测急性腹泻的治疗效果，所述第一基因集由以下基因组成：GI_0066549、GI_0066550、GI_0066551、GI_0066552、GI_0066553和GI_0062833，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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6所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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6中的序列具有不小于90％的同一性。6.根据权利要求5所述的用途，其特征在于，所述试剂进一步适于检测第二基因集中的至少一种基因，所述第二基因集由以下基因组成：GI_0003561、GI_0004803、GI_0006046、GI_0007244和GI_0010144，其中，所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO：7
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11所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：7
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11所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。7.一种用于预防或者治疗急性腹泻的药物组合物或者食品组合物，其特征在于，含有提高第二基因集中的至少一种基因丰度的物质，所述第二基因集由以下基因组成：GI_0003561、GI_0004803、GI_0006046、GI_0007244和GI_0010144，其中，所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO：7
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11所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：7
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11所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。8.一种确定个体是否患有急性腹泻的方法，其特征在于，包括：(1)确定所述个体的粪便样本中标志基因的丰度，所述标志基因包括第一基因集和第二基因集中的至少一种基因；(2)将步骤(1)中得到的所述丰度与预定的阈值进行比较，以便确定所述个体是否患有急性腹泻；其中，所述第一基因集由以下基因组成：GI_0066549、GI_0066550、GI_0066551、GI_0066552、GI_0066553和GI_0062833，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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6所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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6中的序列具有不小于9...

【专利技术属性】
技术研发人员：王广冬，谢秋瑾，马玮，
申请(专利权)人：上海锐翌生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：