柴达木绒山羊羊绒弯曲度相关分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了柴达木绒山羊羊绒弯曲度相关分子标记，属于分子生物学技术领域，分子标记包括SNP位点，SNP位点位于山羊参考基因组CaprahircusARS1的6号染色体第11536713位核苷酸，SNP位点具有A或C多态性。利用该分子标记可实现不同羊绒弯曲度在柴达木绒山羊中的分子选育。子选育。子选育。

【技术实现步骤摘要】
柴达木绒山羊羊绒弯曲度相关分子标记及其应用


[0001]本专利技术属于分子生物学
，具体涉及柴达木绒山羊羊绒弯曲度相关分子标记及其应用。

技术介绍

[0002]柴达木绒山羊是经过长期的自然选择和人工选育获得的一类以生产山羊绒为主的山羊品种。山羊绒是由山羊皮肤中的次级毛囊形成的无髓毛纤维，具有轻便柔软、弹性好、光泽良好、保暖性强等特点，因而被称为“软黄金”，在纺织工业中具有重要作用。
[0003]生长迅速的长纤维和生长缓慢的短纤维容易发生粘连从而影响到纤维的长度，而羊毛弯曲度是羊毛发生粘连的主要原因，较低的弯曲度可以减少羊毛发生粘连；此外，卷曲度还影响羊毛的光泽度、保暖性、保型性，并且影响纱线中纤维之间的抱合力和摩擦力，影响纱线的可纺性。
[0004]因此，在分子水平进行羊绒弯曲度的基因型选择，对于培育优质、纯合、稳定遗传的柴达木绒山羊群体具有重要意义。

技术实现思路

[0005]本专利技术公开了柴达木绒山羊羊绒弯曲度相关分子标记，通过对chr6g.11536713的多态性进行鉴定，可为柴达木绒山羊的遗传改良提供理论依据及指导。
[0006]为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：
[0007]柴达木绒山羊羊绒弯曲度相关分子标记，该分子标记包括SNP位点，SNP位点位于山羊参考基因组Capra hircusARS1的6号染色体第11536713位核苷酸，SNP位点具有A或C多态性。
[0008]柴达木绒山羊羊绒弯曲度相关分子标记，核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，上述SNP位点位于分子标记5
’
端第164位碱基。
[0009]鉴定柴达木绒山羊羊绒弯曲度相关分子标记的引物，包括：
[0010]cur
‑
OF：5'
‑
AATTCACTCTCAGATGACCG
‑
3'，SEQ ID No.2；
[0011]cur
‑
OR：5'
‑
AGCTCCCACATAAATCTAGCG
‑
3'，SEQ ID No.3；
[0012]cur
‑
AF：5'
‑
CCGCCATCTTAAATTCTTGTCTGTAAGGA
‑
3'，SEQ ID No.4；
[0013]cur
‑
CR：5'
‑
CCAAAACCTATACTAGCATCCAAAG
‑
3'，SEQ ID No.5。
[0014]上述引物仅为本专利技术用于扩增分子标记的一种实现方式，在上述引物的基础上，本领域技术人员可以根据需要在其5'端或3'端进行若干碱基的增减，能够实现PCR扩增即可；基于本专利技术分子标记还可涉及其他引物，能够实现分子标记的扩增检测即可。
[0015]上述柴达木绒山羊羊绒弯曲度相关分子标记或上述引物在柴达木绒山羊选育中的应用。
[0016]优选地，培育低羊绒弯曲度群体时，选留CC型纯合个体，淘汰AA型纯合个体和AC型杂合体；
[0017]培育高羊绒弯曲度群体时，选留AA型纯合个体，淘汰CC型纯合个体和AC型杂合体。
[0018]利用上述柴达木绒山羊羊绒弯曲度相关分子标记进行分型检测的方法，包括如下步骤：
[0019](1)提取柴达木绒山羊基因组DNA；
[0020](2)以柴达木绒山羊基因组DNA为模板，利用上述引物进行T
‑
ARMS
‑
PCR扩增；
[0021](3)对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳鉴定，根据琼脂糖凝胶电泳结果进行基因型判定：
[0022]外引物扩增目的条带830bp；
[0023]含有695bp特征条带，不含188bp特征条带为AA型纯合体；
[0024]含有188bp特征条带，不含695bp特征条带为CC型纯合体；
[0025]同时存在695bp和188bp特征条带为AC型杂合体。
[0026]通过建立T
‑
ARMS
‑
PCR检测方法，使用常规仪器设备和分子手段即可进行分子标记检测，操作简单方便。
[0027]优选地，扩增体系为：
[0028]DNA模板2μL，引物cur
‑
OF、cur
‑
OR各0.2μL，引物cur
‑
AF、cur
‑
CR各0.3μL，rTaqPCRMix 10μL，ddH2O补齐至20μL；
[0029]其中，cur
‑
OF、cur
‑
OR、cur
‑
AF、cur
‑
CR工作浓度均为10μM。
[0030]优选地，扩增程序为：
[0031]预变性98℃、2min；
[0032]变性98℃、15s，退火56℃、30s，延伸72℃、45s，35个循环；
[0033]72℃延伸5min。
[0034]综上所述，本专利技术公开了柴达木绒山羊羊绒弯曲度性状相关分子标记chr6g.11536713，其可信度高，AA型可提高羊绒弯曲度，其弯曲度会显著高于CC型和AC型；CC型可降低羊绒弯曲度，其弯曲度会显著低于AA型和AC型。对柴达木绒山羊羊绒弯曲度进行分子选种时，可以根据选育目标进行选择。
附图说明
[0035]图1所示为羊绒弯曲度显著相关SNP标记的曼哈顿图；
[0036]图2所示为外引物PCR及T
‑
AMRS
‑
PCR的扩增产物部分琼脂糖凝胶电泳图；
[0037]其中，A为外引物PCR扩增结果；
[0038]B为T
‑
AMRS
‑
PCR扩增结果；
[0039]图3所示为外引物对柴达木绒山羊基因组DNA进行PCR扩增的扩增产物部分Sanger测序结果。
具体实施方式
[0040]下面对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本专利技术一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本专利技术中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本专利技术保护的范围。
[0041]实施例1柴达木绒山羊羊绒弯曲度相关分子标记的筛选
[0042]1、试验材料选择
[0043]选取自青海省海西州境内的都兰、乌兰、德令哈、格尔木、大柴旦五个地区的柴达木绒山羊群体33184头，在柴达木绒山羊体左侧肩胛骨后缘10cm和体中线交叉的部位，用弯剪贴皮肤剪取直径为3cm大小的绒毛，密封袋保存，记录好羊号、性别等相关信息。
[0044]采用光学纤维直径分析仪(Optical
‑
basedFibre DiameterAnalyser/OFDA2000)测定柴达木绒山羊羊绒弯曲本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.柴达木绒山羊羊绒弯曲度相关分子标记，其特征在于，所述分子标记包括SNP位点，所述SNP位点位于山羊参考基因组Capra hircusARS1的6号染色体第11536713位核苷酸，所述SNP位点具有A或C多态性。2.柴达木绒山羊羊绒弯曲度相关分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，权利要求1中的所述SNP位点位于所述分子标记5
’
端第164位碱基。3.鉴定柴达木绒山羊羊绒弯曲度相关分子标记的引物，其特征在于，包括：cur
‑
OF：5'
‑
AATTCACTCTCAGATGACCG
‑
3'，SEQ ID No.2；cur
‑
OR：5'
‑
AGCTCCCACATAAATCTAGCG
‑
3'，SEQ ID No.3；cur
‑
AF：5'
‑
CCGCCATCTTAAATTCTTGTCTGTAAGGA
‑
3'，SEQ ID No.4；cur
‑
CR：5'
‑
CCAAAACCTATACTAGCATCCAAAG
‑
3'，SEQ ID No.5。4.权利要求1或2所述的柴达木绒山羊羊绒弯曲度相关分子标记或权利要求3所述的引物在柴达木绒山羊选育中的应用。5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，培育低羊绒弯曲度群体时，选留CC型纯合...

【专利技术属性】
技术研发人员：晁生玉，王西峰，李登山，李桂香，马志杰，李锋杰，晁元刚，白长新，李金，王照忠，乌兰巴特尔，王启菊，王成林，张玉花，许显庆，吴新，张卫忠，雪雅妮，杨鹏，王传洋，耿刚，窦小荣，张永忠，巴文胜，王启辉，杨生忠，李国瑜，巴晓峰，拉亲，高尼，孟克达拉，卢秋霞，王顺霖，魏东林，韩赟，吕玉花，赵森，仁增旺姆，魏海芳，志更本，张志君，吴法平，钢巴特尔，尕藏当周，潘雪英，袁友贞，陈烁，沈玲玲，迎春，徐正全，赵海明，牟国月，赵延来，道海宝，康晓荣，王国泰，朱永成，陈兴国，卓玛措，周吉，桂香，乌云，才仁他拉，金花，
申请(专利权)人：海西州农牧业技术推广服务中心海西州农村经济经营服务站，柴达木生物研究所，
类型：发明
国别省市：