一种用于遗传改良鸡生长性状的SNP位点及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种用于遗传改良鸡生长性状的SNP位点及其应用，属于生物育种技术领域。本发明专利技术公开一种与鸡生长性状相关的SNP位点，所述SNP位点为如SEQ ID No.1所示序列中的第600处的C/T突变位点，该位点处基因型为TT时鸡生长性状最佳。本发明专利技术提供了一种高效筛选生长性状的优良的地方鸡种的方法，检测方法周期短，速度快，从拿到待检个体血样到决定被检个体的选淘只需要2天时间，每人每天至少可以完成216个体的检测。本发明专利技术是检测与生长性状紧密连锁的突变的基因型，因此可以做到100％准确，能够在地方鸡种生长性状选育改良方面推广应用，具有重大的商业价值，能产生巨大的经济效益。效益。效益。

【技术实现步骤摘要】
一种用于遗传改良鸡生长性状的SNP位点及其应用


[0001]本专利技术涉及生物育种
，特别是涉及一种用于遗传改良鸡生长性状的SNP位点及其应用。

技术介绍

[0002]鸡肉是消费水平仅次于猪肉的第二大肉类，人均蛋消费量也在逐年提升。因此，加快优质肉鸡、蛋鸡品种的遗传改良具有重大的经济效益。与引进的白羽肉鸡品种相比，尽管地方鸡种特色鲜明、肉质优良，并且同时具备对饲养环境要求低、抗病力强、成活率高等优点，但由于没有经过高强度的系统选育，存在生长缓慢、体重低等缺陷，导致生产效率低下，制约了地方鸡种的规模化生产和产业化应用。而生长是一个综合性状且遗传力都偏低，传统育种难以得到好的改良效果。因此，研究生长性状的遗传学基础，对改善鸡生长具有重要意义。
[0003]为了改善鸡生长性状，一般使用选育方法来筛选生长性状好的鸡，但是传统的选育方法是通过家系选择的方法，进展缓慢；严重限制了鸡生长性状的改善。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的是提供一种用于遗传改良鸡生长性状的SNP位点及其应用，以解决上述现有技术存在的问题，本专利技术首次发现与鸡生长性状相关的SNP位点，并以该位点发现了SEQ ID NO.1序列中的第600位TT基因型的地方鸡种生长性状较好，为本领域技术人员提供了一种高效筛选生长性状的优良的地方鸡种的方法。
[0005]为实现上述目的，本专利技术提供了如下方案：
[0006]本专利技术提供一种与鸡生长性状相关的SNP位点，所述SNP位点位于如SEQ ID NO.1所示序列中的第600处的碱基，碱基突变为C或T。
[0007]本专利技术还提供一种检测所述的与鸡生长性状相关的SNP位点的引物对，所述引物对核苷酸序列如SEQ ID NO.2
‑
3所示。
[0008]本专利技术还提供一种检测鸡生长性状的方法，利用上述引物对进行PCR扩增，检测待测鸡在所述SNP位点处基因型，基因型为TT时生长性状最佳，基因型为CT时生长性状为中等，基因型为CC时生长性状最差；所述生长性状包括宰前活重、平均日增重、屠体重、屠宰率、半净膛重、全净膛重、胸肌重、腿重、体斜长、胸围、胸深中的至少一种。
[0009]进一步地，PCR扩增反应体系包括：2X PCR MIX 15μl，上下游引物各1μl，DNA模板1μl，补充ddH2O至30μl。
[0010]进一步地，PCR扩增反应程序包括：95℃，3min，35个循环94℃，20s，58℃，20s，72℃，40s，72℃，5min。
[0011]本专利技术还提供一种鸡生长性状遗传改良的方法，利用所述引物对检测种群中个体在所述SNP位点处基因型，保留基因型为TT或CT的个体，淘汰基因型为CC的个体，以逐代提高种群中该位点处等位基因T的频率；所述生长性状包括宰前活重、平均日增重、屠体重、屠
宰率、半净膛重、全净膛重、胸肌重、腿重、体斜长、胸围、胸深中的至少一种。
[0012]进一步地，利用所述引物对检测种群中个体在所述SNP位点处基因型，仅保留基因型为TT个体，淘汰基因型为CT或CC的个体。
[0013]本专利技术还提供一种所述的SNP位点或者所述的引物对在鸡生长性状选育中的应用。
[0014]本专利技术公开了以下技术效果：
[0015]鸡生长性状为重要的经济性状，而体重、屠体重、体斜长和胸围等是生长性状的重要指标。本专利技术首次发现与鸡生长性状相关的SNP位点，并以该位点发现了SEQ ID No.1所述序列中的第600位TT基因型的地方鸡种生长性状较好，为本领域技术人员提供了一种高效筛选生长性状优良的地方鸡种的方法，该检测方法周期短，速度快，从拿到待检个体血样到决定被检个体的选淘只需要2天时间，每人每天至少可以完成216个体的检测。另外，该方法是检测与生长性状紧密连锁的突变的基因型，因此该方法可以做到100％准确，能够在地方鸡种生长性状选育改良方面推广应用，具有重大的商业价值，能够产生巨大的经济效益。
附图说明
[0016]为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
[0017]图1为本专利技术SNP位点基因分型图。
具体实施方式
[0018]现详细说明本专利技术的多种示例性实施方式，该详细说明不应认为是对本专利技术的限制，而应理解为是对本专利技术的某些方面、特性和实施方案的更详细的描述。
[0019]应理解本专利技术中所述的术语仅仅是为描述特别的实施方式，并非用于限制本专利技术。另外，对于本专利技术中的数值范围，应理解为还具体公开了该范围的上限和下限之间的每个中间值。在任何陈述值或陈述范围内的中间值以及任何其他陈述值或在所述范围内的中间值之间的每个较小的范围也包括在本专利技术内。这些较小范围的上限和下限可独立地包括或排除在范围内。
[0020]除非另有说明，否则本文使用的所有技术和科学术语具有本专利技术所述领域的常规技术人员通常理解的相同含义。虽然本专利技术仅描述了优选的方法和材料，但是在本专利技术的实施或测试中也可以使用与本文所述相似或等同的任何方法和材料。本说明书中提到的所有文献通过引用并入，用以公开和描述与所述文献相关的方法和/或材料。在与任何并入的文献冲突时，以本说明书的内容为准。
[0021]在不背离本专利技术的范围或精神的情况下，可对本专利技术说明书的具体实施方式做多种改进和变化，这对本领域技术人员而言是显而易见的。由本专利技术的说明书得到的其他实施方式对技术人员而言是显而易见得的。本专利技术说明书和实施例仅是示例性的。
[0022]关于本文中所使用的“包含”、“包括”、“具有”、“含有”等等，均为开放性的用语，即意指包含但不限于。
[0023]实施例1
[0024]一、引物设计：根据鸡的参考基因组中PHKG1基因序列设计一对引物，引物序列(5
’→3’
)如下所示：
[0025]F：TAAAGACTCCGAAACTCACT(SEQ ID NO.2)
[0026]R：ACGCACCATAGACTCATT(SEQ ID NO.3)
[0027]二、PCR扩增：以鸡DNA为模板，以上述引物进行PCR扩增。扩增程序：95℃，3min，35个循环(94℃，20s，58℃，20s，72℃，40s)，72℃，5min，4℃保存。扩增体系：2X PCR MIX，15μl，上下游引物各1μl，DNA模板1μl，最后补充ddH2O至30μl。
[0028]三、测序筛选多态位点：将PCR产物送上海捷瑞生物工程有限公司进行测序，序列如SEQ ID NO.1所示：
[0029]TTTGATGTGATATGAAAATAGATTGAGCGTAAAGACTCCGAAACTCACTTTGGGCTAAACTTAAAACACATAATTCTGGGATCTGCTTTGAGAAG本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与鸡生长性状相关的SNP位点，其特征在于，所述SNP位点位于如SEQ ID NO.1所示序列中的第600处的碱基，碱基突变为C或T。2.一种检测权利要求1所述的与鸡生长性状相关的SNP位点的引物对，其特征在于，所述引物对核苷酸序列如SEQ ID NO.2
‑
3所示。3.一种检测鸡生长性状的方法，其特征在于，利用权利要求2所述引物对进行PCR扩增，检测待测鸡在权利要求1所述SNP位点处基因型，基因型为TT时生长性状最佳，基因型为CT时生长性状为中等，基因型为CC时生长性状最差；所述生长性状包括宰前活重、平均日增重、屠体重、屠宰率、半净膛重、全净膛重、胸肌重、腿重、体斜长、胸围、胸深中的至少一种。4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，PCR扩增反应体系包括：2X PCR MIX 15μl，上下游引物各1μl，DNA模板1μl，补充ddH2O至30...

【专利技术属性】
技术研发人员：熊信威，涂序堂，饶友生，周敏，朱学农，谭玉文，贡继尚，王樟凤，许继国，
申请(专利权)人：南昌师范学院，
类型：发明
国别省市：