用于诊断神经胶质瘤或预测预后的组合物以及提供其相关信息的方法技术

本发明专利技术涉及一种包括用于检测靶基因变异的制剂的用于诊断神经胶质瘤或预测预后的组合物、生物标志物组合和试剂盒、提供与神经胶质瘤的诊断或预测预后有关信息的方法、用于神经胶质瘤的个性化医疗的生物标志物组合和提供用于个性化治疗的信息的方法。根据本发明专利技术一方面，当检测选自由SAMD11、KLHL21、FAM167B、HPCAL4、GPBP1L1、LPHN2、GPR88、ZNF599、C19ORF33、B9D2、BCAM、CABP5、SIGLEC11、ERVV

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于诊断神经胶质瘤或预测预后的组合物以及提供其相关信息的方法


[0001]本专利技术涉及一种包括用于检测靶基因变异的制剂的用于诊断神经胶质瘤(glioma)或预测预后的组合物、生物标志物组合和试剂盒、提供与神经胶质瘤的诊断或预测预后有关信息的方法以及用于神经胶质瘤的个性化医疗的生物标志物组合和提供用于个性化治疗的信息的方法。

技术介绍

[0002]另一方面，肿瘤(Tumor)是由于异常细胞过多而导致细胞不受控制、无序增殖的产物，当这些肿瘤具有破坏性的增殖性、侵袭性和转移性时，就被归类为恶性肿瘤(malignant tumor)。尤其，从分子生物学的角度来看，其可以说是一种基因变异引起的基因疾病。
[0003]其中，神经胶质瘤(glioma)起源于神经元和神经胶质细胞，大部分渗透到周围正常组织并生长，由于细胞生长失控而呈现快速生长，并且难以通过手术完全去除。尤其，神经胶质瘤在组织学和分子学上分为几种分类，但为了准确诊断这一点，到目前为止，正在确认IDH1/2的体细胞突变、EGFR的基因组扩增以及染色体1p和19q臂的共缺失。然而，IDH1/2突变通常主要在低级别神经胶质瘤和继发性胶质母细胞瘤中发现，众所周知，其与患者的长期生存密切相关。另外，约50％的胶质母细胞瘤中发现了EGFR的局部扩增。另外，由于已知EGFR基因扩增可以促进细胞增殖，因此为了治疗癌症，经常进行EGFR抑制剂的临床试验。
[0004]因此，为了有效诊断神经胶质瘤，免疫组化法(immunohistochemistry:IHC)和荧光原位杂交法(fluorescence in situ hybridization:FISH)常用于被认为所述神经胶质瘤增殖的重要基因的IDH1靶向突变与EGFR局部扩增的病理诊断，但以更方便的方式有效诊断所述神经胶质瘤的需求日益增长。

技术实现思路

[0005]技术问题
[0006]本专利技术的一方面涉及一种用于诊断神经胶质瘤(glioma)或预测预后的组合物和生物标志物组合，其包括用于测量选自SAMD11、KLHL21、FAM167B、HPCAL4、GPBP1L1、LPHN2、GPR88、ZNF599、C19ORF33、B9D2、BCAM、CABP5、SIGLEC11、ERVV
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2、ZNF865、MZF1、MRTO4、LRIG2、BSND和SLC30A2中的至少一种基因的变异的制剂。
[0007]本专利技术的一方面涉及一种试剂盒，其包括用于检测选自SAMD11、KLHL21、FAM167B、HPCAL4、GPBP1L1、LPHN2、GPR88、ZNF599、C19ORF33、B9D2、BCAM、CABP5、SIGLEC11、ERVV
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2、ZNF865、MZF1、MRTO4、LRIG2、BSND和SLC30A2中的至少一种基因的变异的制剂。
[0008]本专利技术另一方面涉及一种提供与神经胶质瘤的诊断或预测预后有关信息的方法，其包括：从个体的生物试料获得核酸试料；从获得的试料中检测选自SAMD11、KLHL21、FAM167B、HPCAL4、GPBP1L1、LPHN2、GPR88、ZNF599、C19ORF33、B9D2、BCAM、CABP5、SIGLEC11、ERVV
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2、ZNF865、MZF1、MRTO4、LRIG2、BSND和SLC30A2中的至少一种靶基因中的基因变异；以
及将检测到的基因的变异水平与正常试料的水平进行比较和分析。
[0009]本专利技术另一方面还涉及一种用于神经胶质瘤的个性化医疗的生物标志物组合，其包括用于检测选自SAMD11、KLHL21、FAM167B、HPCAL4、GPBP1L1、LPHN2、GPR88、ZNF599、C19ORF33、B9D2、BCAM、CABP5、SIGLEC11、ERVV
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2、ZNF865、MZF1、MRTO4、LRIG2、BSND和SLC30A2中的至少一种基因的变异的制剂。
[0010]本专利技术另一方面还涉及一种提供用于个性化治疗的信息的方法，其包括：从个体分离的生物试料中检测选自SAMD11、KLHL21、FAM167B、HPCAL4、GPBP1L1、LPHN2、GPR88、ZNF599、C19ORF33、B9D2、BCAM、CABP5、SIGLEC11、ERVV
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2、ZNF865、MZF1、MRTO4、LRIG2、BSND和SLC30A2中的至少一种靶基因中的基因变异；以及将从所述检测结果中检测到基因变异的所述个体设置为治疗目标。
[0011]技术方案
[0012]本专利技术的一方面提供一种用于诊断神经胶质瘤(glioma)或预测预后的组合物和生物标志物组合，其包括用于测量选自SAMD11、KLHL21、FAM167B、HPCAL4、GPBP1L1、LPHN2、GPR88、ZNF599、C19ORF33、B9D2、BCAM、CABP5、SIGLEC11、ERVV
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2、ZNF865、MZF1、MRTO4、LRIG2、BSND和SLC30A2中的至少一种基因的变异的制剂。
[0013]神经胶质瘤为起源于大脑和脊髓内部的神经胶质细胞的肿瘤，根据组成肿瘤的主要细胞，其可以分为星形细胞肿瘤、少突胶质细胞肿瘤和室管膜肿瘤等，可以通过一方面的组合物诊断或预测预后的组合物例如可以为选自星形细胞肿瘤(Astrocytic tumours)、少突胶质细胞肿瘤(Oligodendroglial tumours)、混合性神经胶质瘤(mixed gliomas)和室管膜肿瘤(Ependymal tumours)中的至少一种。
[0014]术语“诊断”是指确定病理状况的存在或特征。就目的而言，这是为了确定神经胶质瘤是否已经发展。术语“预后”是指确定神经胶质瘤的例如该个体未来的存活率、治疗后该个体的复发、转移、药物反应性、耐药性等。这意味着，通过从个体的试料中确认根据一方面的选自SAMD11、KLHL21、FAM167B、HPCAL4、GPBP1L1、LPHN2、GPR88、ZNF599、C19ORF33、B9D2、BCAM、CABP5、SIGLEC11、ERVV
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2、ZNF865、MZF1、MRTO4、LRIG2、BSND和SLC30A2中的至少一种基因的变异水平，不仅可以预测该个体是否患有神经胶质瘤，还可以预测该个体未来的生存预后是否良好。
[0015]已知患有神经胶质瘤的个体与染色体1号短臂(1p)和19号长臂(19q)的共缺失密切相关，并且已知在患有神经胶质瘤的个体中具有1p和19q共缺失的个体与抗癌药物敏感性和存活率增的加密切相关，从而可以通过1p和19q的共缺失有效预测个体的预后。由此可以确认，本专利技术的一方面的制剂通过有效检测所述1p和19q的共缺失来确定20种用于准确诊断神经胶质瘤和预测预后的靶基因，并且通过检测所述20种基因的变异水平，可以高精度、高灵敏地预测患有神经胶质瘤的个体本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于诊断神经胶质瘤或预测预后的组合物，其包括用于检测选自SAMD11、KLHL21、FAM167B、HPCAL4、GPBP1L1、LPHN2、GPR88、ZNF599、C19ORF33、B9D2、BCAM、CABP5、SIGLEC11、ERVV
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2、ZNF865、MZF1、MRTO4、LRIG2、BSND和SLC30A2中的至少一种基因的变异的制剂。2.根据权利要求1所述的用于诊断神经胶质瘤或预测预后的组合物，其中，所述神经胶质瘤为选自星形细胞肿瘤、少突胶质细胞肿瘤、混合性神经胶质瘤和室管膜肿瘤中的至少一种。3.根据权利要求1所述的用于诊断神经胶质瘤或预测预后的组合物，其中，所述制剂检测基因1p和19q染色体共缺失。4.根据权利要求1所述的用于诊断神经胶质瘤或预测预后的组合物，其中，所述基因的变异为碱基序列中的1)单碱基序列变异；2)1个至50个核苷酸的碱基序列区域的缺失或插入；3)拷贝数变异；或4)选自所述1)至3)中的至少两种的组合。5.根据权利要求1所述的用于诊断神经胶质瘤或预测预后的组合物，其中，所述制剂包括引物、探针或反义核苷酸。6.一种用于诊断神经胶质瘤或预测预后的生物标志物组合，其包括用于测量选自SAMD11、KLHL21、FAM167B、HPCAL4、GPBP1L1、LPHN2、GPR88、ZNF599、C19ORF33、B9D2、BCAM、CABP5、SIGLEC11、ERVV
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2、ZNF865、MZF1、MRTO4、LRIG2、BSND和SLC30A2中的至少一种基因的变异的制剂。7.一种试剂盒，其包括用于检测选自SAMD11、KLHL21、FAM167B、HPCAL4、GPBP1L1、LPHN2、GPR88、ZNF599、C19ORF33、B9D2、BCAM、CABP5、SIGLEC11、ERVV
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2、ZNF865、MZF1、MRTO4、LRIG2、BSND和SLC30A2中的至少一种基因的变异的制剂。8.一种提供与神经胶质瘤的诊断或预测预后有关信息的方法，其包括：1)从个体的生物试料获得核酸试料；2)从获得的试料中检测选自SAMD11、KLHL21、FAM167B、HPCAL4、GPBP1L1、LPHN2、GPR88、ZNF599、C19ORF33、B9D2、BCAM、CABP5、SIGLEC11、ERVV
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2、ZNF865、MZF1、MRTO4、LRIG2、BSND和SLC30A2中的至少一种靶基因中的基因变异；以及3)将检测到...

【专利技术属性】
技术研发人员：南都铉，杰森，
申请(专利权)人：社会福祉法人三星生命公益财团，
类型：发明
国别省市：