本发明专利技术属于生物技术领域，具体公开了干扰素信号通路相关基因群及其体外诊断产品，以及其在用于进行乳腺癌复发风险评估和/或干扰素治疗指导中的应用。治疗指导中的应用。治疗指导中的应用。
【技术实现步骤摘要】
干扰素信号通路相关基因群及诊断产品和应用
[0001]本专利技术属于生物
，具体涉及干扰素信号通路相关基因群及其体外诊断产品和应用。
技术介绍
[0002]乳腺癌占我国妇女恶性肿瘤发病的第一位，并以每年4％左右的速度逐年增加。由于乳腺癌的高度异质性，目前国内外在乳腺癌术后的精准治疗和降低复发风险等方面仍面临很大挑战。乳腺癌远处转移是乳腺癌复发中最为严重的类型，是判断预后的重要指标，也是造成患者死亡的主要原因。因此，预测乳腺癌的远处转移风险，对评估和改善患者的预后尤其重要。基于乳腺癌组织中的多基因表达谱提出的乳腺癌分子分型，可将乳腺癌分为能反映肿瘤生物学行为的亚型，并可评估各亚型的复发风险，指导化疗、内分泌治疗或靶向治疗等治疗方案的应用，具有重要的临床治疗指导意义。
[0003]具有不同的分子生物学特征(例如，HER2、激素受体(ER/PR)或其他肿瘤标志物的表达情况)与临床和病理指标(例如，患者年龄、肿瘤的分期和淋巴结的有无等)的乳腺癌在恶性程度、对内分泌治疗、靶向治疗或化疗等治疗方案的敏感性及预后等方面均存在较大差异。HER2富集型和HER2阳性乳腺癌对于针对HER2的靶向治疗+化疗的治疗方案较为敏感，但其病程发展迅速且预后较差。目前有待开发可用于评估HER2富集型和HER2阳性乳腺癌的复发风险和指导其治疗方案的检测手段和产品。
技术实现思路
[0004]在一方面，本专利技术涉及用于进行乳腺癌复发风险评估和/或干扰素乳腺癌治疗指导的基因群。优选地，所述乳腺癌是HER2富集型或HER2阳性乳腺癌。优选地，所述干扰素是I型干扰素。
[0005]在一实施方案中，本专利技术的基因群包括以下基因(G1)中的至少1个：IFI35、IFIT3、OAS2、OASL、RTP4和SAMD9。
[0006]在一优选实施方案中，本专利技术的基因群包括SAMD9和以下基因(G1)中的至少1个：IFI35、IFIT3、OAS2、OASL和RTP4。
[0007]在另一实施方案中，本专利技术的基因群包括以下基因(G2)中的至少1个：OAS3、DDX58、SP110、IFIH1、DDX60和XAF1。
[0008]在另一实施方案中，本专利技术的基因群包括以下基因(R)中的至少1个：EIF2AK2、HERC5、HERC6、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、IFIT5、IFITM1、ISG15、MX1、MX2、OAS1、PLSCR1、RSAD2和USP18。
[0009]在又一实施方案中，本专利技术的基因群包括以下基因中的至少1个：IFI35、IFIT3、OAS2、OASL、RTP4和SAMD9，和/或以下基因中的至少1个：OAS3、DDX58、SP110、IFIH1、DDX60和XAF1；并且还包括以下基因中的至少1个：EIF2AK2、HERC5、HERC6、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、IFIT5、IFITM1、ISG15、MX1、MX2、OAS1、PLSCR1、RSAD2和USP18。
[0010]在进一步优选的实施方案中，本专利技术的基因群还包括参考基因。优选地，所述参考基因包括以下中的至少1个、更优选3个、最优选6个：GAPDH、GUSB、MRPL19、PSMC4、SF3A1、TFRC、ACTB、RPLP0。
[0011]在一具体实施方案中，本专利技术的基因群包括：IFI35、IFIT3、OAS2、OASL、RTP4和SAMD9；以及ACTB、GAPDH和RPLP0。
[0012]在又一具体实施方案中，本专利技术的基因群包括：OAS3、DDX58、SP110、IFIH1、DDX60和XAF1；以及ACTB、GAPDH和RPLP0。
[0013]在另一具体实施方案中，本专利技术的基因群包括：DDX58、DDX60、EIF2AK2、HERC5、HERC6、IFI27、IFI35、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIH1、IFIT1、IFIT3、IFIT5、IFITM1、ISG15、MX1、MX2、OAS1、OAS2、OAS3、OASL、PLSCR1、RSAD2、RTP4、SAMD9、SP110、USP18和XAF1；以及GAPDH、GUSB、MRPL19、PSMC4、SF3A1和TFRC。
[0014]在又一方面，本专利技术还涉及所述基因群在进行乳腺癌复发风险评估和/或干扰素乳腺癌治疗指导中的应用。
[0015]在另一方面，本专利技术提供一种用于检测本专利技术基因群中基因的表达水平的试剂，所述试剂用于进行乳腺癌复发风险评估和/或干扰素乳腺癌治疗指导。
[0016]在又一方面，本专利技术提供一种诊断产品，用于进行乳腺癌复发风险评估和/或干扰素乳腺癌治疗指导，其包含检测本专利技术的基因群中基因的表达水平的试剂。在一实施方案中，所述诊断产品为体外诊断产品的形式。在一具体实施方案中，所述诊断产品为诊断试剂盒的形式。在一具体实施方案中，所述诊断产品可以为二代测序试剂盒、实时荧光定量PCR检测试剂盒、基因芯片、蛋白质微阵列、ELISA诊断试剂盒或免疫组化(IHC)试剂盒。
[0017]在另一方面，本专利技术还涉及一种用于确定受试对象乳腺癌的复发风险和/或进行干扰素乳腺癌治疗指导的方法，所述方法包括：
[0018](1)提供受试对象的样本，
[0019](2)测定所述样本中本专利技术的基因群中基因的表达水平，任选地，根据所述表达水平计算干扰素指数，
[0020](3)判断(2)中所述表达水平或所述干扰素指数的强弱，
[0021](4)根据(3)中所述表达水平或所述干扰素指数的强弱确定所述受试对象的乳腺癌复发风险和/或进行干扰素乳腺癌治疗指导。
[0022]在又一方面，本专利技术还提供了本专利技术的基因群或本专利技术的试剂在制备诊断产品中的应用，所述诊断产品用于进行乳腺癌复发风险评估和/或干扰素乳腺癌治疗指导。
附图说明
[0023]图1表示在乳腺癌72基因分子分型中的HER2富集型乳腺癌病例中，基于基因群G1计算的干扰素指数的强弱对10年无远处转移生存率的影响。
[0024]图2表示在乳腺癌72基因分子分型中的基底细胞型、免疫增强型、管腔A型和管腔B型乳腺癌病例中，基于基因群G1计算的干扰素指数的强弱对10年无远处转移生存率的影响。
[0025]图3表示在乳腺癌72基因分子分型中的HER2富集型乳腺癌病例中，基于基因群G2、或者全部29个基因计算的干扰素指数的强弱分别对10年无远处转移生存率的影响。
[0026]图4表示在乳腺癌72基因分子分型中的HER2富集型乳腺癌病例中，基因群G1中各各基因表达水平的强弱对10年无远处转移生存率的影响。
[0027]图5表示在HER2阳性的乳腺癌病例中，基于基因群G1计算的干扰素指数的强弱对10年无远处转移生存率的影响(图5左)；在HER2阴性的乳腺癌病例中，基于基因群G1计算的干扰素指数的强弱对10年无远处转移生存率的影响(图5右)。
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【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一组用于进行乳腺癌复发风险评估和/或干扰素乳腺癌治疗指导的基因群，所述基因群包括：基因群G1中的至少1个基因，和/或基因群G2中的至少1个基因，和/或基因群R中的至少1个基因；所述基因群G1包括：IFI35、IFIT3、OAS2、OASL、RTP4和SAMD9，所述基因群G2包括：OAS3、DDX58、SP110、IFIH1、DDX60和XAF1，所述基因群R包括：EIF2AK2、HERC5、HERC6、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、IFIT5、IFITM1、ISG15、MX1、MX2、OAS1、PLSCR1、RSAD2和USP18。2.权利要求1的基因群，其中所述基因群包括SAMD9和以下基因中的至少1个：IFI35、IFIT3、OAS2、OASL和RTP4。3.权利要求1或2所述的基因群，其特征在于，所述基因群还包括参考基因；优选地，所述参考基因包括以下中的1个、更优选3个、最优选6个：GAPDH、GUSB、MRPL19、PSMC4、SF3A1、TFRC、ACTB和RPLP0。4.权利要求1-3中任一项所述的基因群，其特征在于，所述基因群包括：IFI35、IFIT3、OAS2、OASL、RTP4和SAMD9，并且还任选包括ACTB、GAPDH和RPLP0；或者所述基因群包括：OAS3、DDX58、SP110、IFIH1、DDX60和XAF1，并且还任选包括ACTB、GAPDH和RPLP0；或者所述基因群包括：DDX58、DDX60、EIF2AK2、HERC5、HERC6、IFI27、IFI35、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIH1、IFIT1、IFIT3、IFIT5、IFITM1、ISG15、MX1、MX2、OAS1、OAS2、OAS3、OASL、PLSCR1、RSAD2、RTP4、SAMD9、SP110、USP18和XAF1，并且还任选包括GAPDH、GUSB、MRPL19、PSMC4、SF3A1、TFRC。5.权利要求1-4中任一项所述的基因群，其特征在于，所述乳腺癌是HER2富集型或HER2阳性乳腺癌。6.权利要求1-5中任一项所述的基因群，其特征在于，所述干扰素是I型干扰素。7.用于检测权利要求1-6中任...
【专利技术属性】
技术研发人员：周彤，周伟庆，胡志元，马琳琳，陆俊欢，
申请(专利权)人：上海善准生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
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