扩增，检测或定量人类多瘤病毒BK病毒的组合物和方法技术

提供了寡聚核苷酸，组合物，方法，试剂盒和用途，用于检测或定量人多瘤病毒BK病毒(BKV)核酸(例如使用核酸扩增和杂交测定)。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】扩增，检测或定量人类多瘤病毒BK病毒的组合物和方法相关申请的交叉引用本申请要求于2018年十月22日提交的美国临时申请号62/748,998的优先权，其通过引用合并于此。序列表归档于537958_SeqListing_ST25.txt的序列表大小为18KB，创建于2019年9月24日，在此引用作为参考。
技术介绍
人类多瘤病毒BK病毒(BKV)是多瘤病毒家族的成员。BK病毒类似于另一种称为JC病毒(JCV)的病毒，具有75％的基因组序列相似性。BKV具有约5000个碱基对的双链DNA环状基因组。据认为，多达80％的人口包含这种病毒的潜伏形式，这种潜伏性直到身体经历某种形式的免疫抑制之前一直保持潜伏状态。病毒的检测对于肾脏和多器官移植患者尤其重要，其中临床表现包括肾功能不全。从1-10％的肾移植患者发展为BKV相关性肾病(BKVAN)，其中多达80％的患者失去了移植物。BKV还与输尿管狭窄和间质性肾炎有关。在骨髓移植受者中，BKV可引起出血性膀胱炎。
技术实现思路
描述了用于检测和/或定量样品中的人多瘤病毒BK病毒(BKV)本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.用于扩增BK多瘤病毒核酸序列的扩增引物，其特征在于，包括，/na)一个或多个第一扩增引物，其中，每个第一扩增引物的长度为18-30个碱基，并且包含与选自以下的核苷酸序列具有至少90％同一性的核苷酸序列：SEQ ID NO:1，SEQ ID NO:4，SEQ ID NO：7，SEQ ID NO:10，SEQ ID NO:13，SEQ ID NO:16，SEQ ID NO:21，SEQ ID NO:24，SEQ ID NO:25，SEQ ID NO:30，SEQ ID NO:31，SEQ ID NO:34，SEQ ID NO:35，SEQ IDNO:38，SEQ ID NO:39，SEQ ID...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20181022 US 62/748,9981.用于扩增BK多瘤病毒核酸序列的扩增引物，其特征在于，包括，
a)一个或多个第一扩增引物，其中，每个第一扩增引物的长度为18-30个碱基，并且包含与选自以下的核苷酸序列具有至少90％同一性的核苷酸序列：SEQIDNO:1，SEQIDNO:4，SEQIDNO：7，SEQIDNO:10，SEQIDNO:13，SEQIDNO:16，SEQIDNO:21，SEQIDNO:24，SEQIDNO:25，SEQIDNO:30，SEQIDNO:31，SEQIDNO:34，SEQIDNO:35，SEQIDNO:38，SEQIDNO:39，SEQIDNO:42，SEQIDNO:43，SEQIDNO:46和SEQIDNO:47，以及
b)一个或多个第二扩增引物，其中，每个第二扩增引物的长度为19-30个碱基，并且包含与选自以下的核苷酸序列具有至少90％同一性的核苷酸序列：SEQIDNO:2，SEQIDNO:5，SEQIDNO:9，SEQIDNO:12，SEQIDNO:14，SEQIDNO:18，SEQIDNO:19，SEQIDNO:22，SEQIDNO:26，SEQIDNO:28，SEQIDNO:29，SEQIDNO:32，SEQIDNO:33，SEQIDNO:36，SEQIDNO:37，SEQIDNO:40，SEQIDNO:41，SEQIDNO:44，SEQIDNO:45，SEQIDNO:48和SEQIDNO:49。


2.根据权利要求1所述的扩增引物，其中，所述第一扩增引物和/或所述第二扩增引物包含至少一个修饰核苷酸。


3.根据权利要求1或2的扩增引物，其中，所述修饰核苷酸包括：2'-O-甲基修饰核苷酸，2'-氟修饰核苷酸或5-甲基-2'-脱氧胞嘧啶。


4.根据权利要求3所述的扩增引物，其中，所述第一扩增引物和/或所述第二扩增引物中如果存在除了3'末端胞嘧啶以外的胞嘧啶，则每个胞嘧啶都是5-甲基-2'-脱氧胞嘧啶。


5.根据权利要求1-4中任一项所述的扩增引物，其中：
a)所述一个或多个第一扩增引物的每一个的核苷酸序列由选自以下的核苷酸序列组成：SEQIDNO:1，SEQIDNO:4，SEQIDNO:7，SEQIDNO:10，SEQIDNO:13，SEQIDNO:16，SEQIDNO:21，SEQIDNO:24，SEQIDNO:25，SEQIDNO:30，SEQIDNO:31，SEQIDNO:34，SEQIDNO：35，SEQIDNO:38，SEQIDNO:39，SEQIDNO:42，SEQIDNO:43，SEQIDNO:46和SEQIDNO:47，以及
b)所述一个或多个第二扩增引物的每一个的核苷酸序列由选自以下的核苷酸序列组成：SEQIDNO:2，SEQIDNO:5，SEQIDNO:9，SEQIDNO:12，SEQIDNO:NO：14，SEQIDNO:18，SEQIDNO:19，SEQIDNO:22，SEQIDNO:26，SEQIDNO:28，SEQIDNO:29，SEQIDNO:32，SEQIDNO:33，SEQIDNO:36，SEQIDNO:37，SEQIDNO:40，SEQIDNO:41，SEQIDNO:44，SEQIDNO:45，SEQIDNO:48和SEQIDNO:49。


6.权利要求1-5中任一项的扩增引物，其中：
a)第一扩增引物包含SEQIDNO:1的核苷酸序列，第二扩增引物包含SEQIDNO:2的核苷酸序列；
b)第一扩增引物包含SEQIDNO:4的核苷酸序列，第二扩增引物包含SEQIDNO:5的核苷酸序列；
c)第一扩增引物包含SEQIDNO:7的核苷酸序列，第二扩增引物包含SEQIDNO:9的核苷酸序列；
d)第一扩增引物包含SEQIDNO:10的核苷酸序列，第二扩增引物包含SEQIDNO:12的核苷酸序列；
e)第一扩增引物包含SEQIDNO:13的核苷酸序列，第二扩增引物包含SEQIDNO:14的核苷酸序列；
f)第一扩增引物包含SEQIDNO:16的核苷酸序列，第二扩增引物包含SEQIDNO:18的核苷酸序列；
g)第一扩增引物包含SEQIDNO:21的核苷酸序列，第二扩增引物包含SEQIDNO:19的核苷酸序列；
h)第一扩增引物包含SEQIDNO:24的核苷酸序列，第二扩增引物包含SEQIDNO:22的核苷酸序列；或者
i)第一扩增引物包含SEQIDNO:25的核苷酸序列，第二扩增引物包含SEQIDNO:26的核苷酸序列。


7.权利要求1-6中任一项的扩增引物，其中：
a)所述第一扩增引物包含SEQIDNO:13的核苷酸序列，并且所述一个或多个第二扩增引物包含至少一个包含SEQIDNO:36的核苷酸序列的扩增引物和至少一个包含SEQIDNO:37的核苷酸序列的扩增引物；
b)一个或多个第一扩增引物包含至少一个包含SEQIDNO:35的核苷酸序列的扩增引物和至少一个包含SEQIDNO:36的核苷酸序列的扩增引物，并且第二扩增引物包含SEQIDNO:14的核苷酸序列；
c)一个或多个第一扩增引物包含至少一个包含SEQIDNO:35的核苷酸序列的扩增引物并且至少一个包含SEQIDNO:36的核苷酸序列的扩增引物，并且一个或多个第二扩增引物包含至少一个包含SEQIDNO:36的核苷酸序列的扩增引物并且至少一个包含SEQIDNO:37的核苷酸序列的扩增引物；
d)所述第一扩增引物包含SEQIDNO:1的核苷酸序列，并且所述一个或多个第二扩增引物包含至少一个包含SEQIDNO:28的核苷酸序列的扩增引物和至少一个包含SEQIDNO:29的核苷酸序列的扩增引物；
e)所述第一扩增引物包含SEQIDNO:10的核苷酸序列，并且所述一个或多个第二扩增引物包含至少一个包含SEQIDNO:32的核苷酸序列的扩增引物和至少一个包含SEQIDNO:33的核苷酸序列的扩增引物；
f)一个或多个第一扩增引物包含至少一个包含SEQIDNO:30的核苷酸序列的扩增引物并且至少一个包含SEQIDNO:31的核苷酸序列的扩增引物，第二扩增引物包含SEQIDNO:12的核苷酸序列；
g)一个或多个第一扩增引物包含至少一个包含SEQIDNO:30的核苷酸序列的扩增引物和...

【专利技术属性】
技术研发人员：A·沙阿，M·亚达夫，
申请(专利权)人：简·探针公司，
类型：发明
国别省市：美国;US