一种检测水稻Wx基因的SNP分子标记组合及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种检测水稻Wx基因的SNP分子标记组合，含有4个分子标记，分别为Wx01、K_060585、K_060586和K_060591；其中Wx01的多态性为G/T、K_060585的多态性为A/C、K_060586的多态性为T/C、K_060591的多态性为C/A。利用本发明专利技术提供的分子标记，可高效检测Wx基因，能用于Wx基因的不同单倍型及辅助选择育种，可以加快育种效率，降低育种成本，缩短选育周期，亦可进行有目的的多基因聚合，提高育种效率，带来巨大的社会经济效益。该标记应用KASP技术原理进行基因分型，不需要酶切、电泳及测序等，操作简便，利于高通量快速检测。利于高通量快速检测。

【技术实现步骤摘要】
一种检测水稻Wx基因的SNP分子标记组合及其应用


[0001]本专利技术属于分子生物学及作物育种
，具体涉及一种检测水稻Wx基因的SNP分子标记组合及其应用。

技术介绍

[0002]直链淀粉含量是影响稻米品质的关键因素，水稻Wx基因编码颗粒淀粉合成酶(granule
‑
bound starch synthase,GBSS)，是控制直链淀粉合成的主效基因，直接影响水稻胚乳和花粉中直链淀粉的含量(Amylose Content,AC)。非糯性基因(Wx)对糯性基因(wx)表现为不完全显性，存在较为明显的剂量效应。在非糯品种中，Wx基因分化为Wx
a
和Wx
b
两种等位基因，其中，野生稻全为Wx
a
，籼稻以Wx
a
为主，直链淀粉含量较高；粳稻基本为Wx
b
，直链淀粉含量较低。除了常见的这3中等位类型，Wx基因位点还有Wx
op
、Wx
mp
、Wx
in
、Wx
HH
、Wx<本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种SNP分子标记，包括以下四个分子标记的一个或多个：Wx01、K_060585、K_060586和K_060591；其中Wx01的多态性为G/T、K_060585的多态性为A/C、K_060586的多态性为T/C、K_060591的多态性为C/A。2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，所述Wx01的SNP位点位于水稻第6号染色体上第1765760位碱基；所述K_060585的SNP位点位于水稻第6号染色体上第1768006位碱基；所述K_060586的SNP位点位于水稻第6号染色体上第1768998位碱基；所述K_060591的SNP位点位于水稻第6号染色体上第1767032位碱基。3.一组引物，其特征在于，所述引物用于扩增权利要求1～2任一项所述SNP分子标记。4.根据权利要求3所述的引物，其特征在于，用于扩增Wx01的引物序列为：特异性引物：Primer X：5
’‑
CAGGAAGAACATCTGCAAGG
‑3’
(SEQ ID NO.1)；Primer Y：5
’‑
TCAGGAAGAACATCTGCAAGT
‑3’
(SEQ ID NO.2)；通用引物：Primer C：5
’‑
TCTGAATAAGAGGGGAAACAA
‑3’
(SEQ ID NO.3)；用于扩增K_060585的引物序列为：特异性引物：Primer X：5
’‑
GAGATCAATTRTAACTCACCAT
‑3’
(SEQ ID NO.4)；Primer Y：5
’‑
AGATCAATTRTAACTCACCAG
‑3’
(SEQ ID NO.5)；通用引物：Primer C：5
’‑
ACCTCAACAACAACCCATAC
‑3’
(SEQ ID NO.6)；用于扩增K_060586的引物序列为：特异性引物：Primer X：5
’‑
CTGGAGGAACA...

【专利技术属性】
技术研发人员：彭佩，李文博，吴云天，唐顺学，肖金华，田冰川，
申请(专利权)人：华智生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：