【技术实现步骤摘要】
肿瘤乳酸微环境相关非编码小RNA分子谱及其应用
本专利技术属生物化学与分子生物学领域,具体涉及扩增和分析人类细胞编码的hsa-miR-9-5p,hsa-miR-210-3p,hsa-miR-7-5p,hsa-miR4521,hsa-miR-7974和tiRNAHisGUG,以及其表达情况,和应用于预测恶性淋巴瘤的预后效果和治疗。
技术介绍
现有技术公开了小分子RNA包括microRNA(miRNA)、转运RNA(tRNA)、Piwi蛋白相关RNA(piRNA)、小核仁RNA(snoRNA)、小核RNA(snRNA)和核糖体RNA(rRNA)等。miRNA是一类长度在18-25nt左右的非编码小RNA,在生物体内的表达具有时序性,保守性,组织特异性和疾病特异性,可通过与靶基因互补结合,负调控mRNA的表达,在细胞增殖分化、凋亡、胚胎发育、血管生成等多种生命活动中发挥作用,可作为肿瘤诊断性、治疗性、预测性的生物标记物。研究表明了肿瘤微环境(tumormicroenviroment,TME)是肿瘤细胞赖以生存的复杂内环境, ...
【技术保护点】
1.一种定量小分子RNA的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:/n(1)收集样本;样本处于含有乳酸的环境,乳酸的浓度范围是100-250U/L;/n(2)茎环法定量PCR;/n(3)获得目标miRNA分子或者5’-tiRNA分子。/n
【技术特征摘要】
1.一种定量小分子RNA的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:
(1)收集样本;样本处于含有乳酸的环境,乳酸的浓度范围是100-250U/L;
(2)茎环法定量PCR;
(3)获得目标miRNA分子或者5’-tiRNA分子。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的样本是离体的实体瘤样本,或者加入乳酸用于模拟肿瘤微环境的样本。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的样本是体外培养的恶性淋巴瘤细胞。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括深度测序的步骤。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述目标miRNA分子是hsa-miR-9-5p、hsa-miR-210-3p、hsa-miR-7-5p、hsa-miR4521或者hsa-miR-7974;
所述的5’-tiRNA分子是5’-tiRNAHisGUG。
6.一种肿瘤检测标志物,其特征在于,它通过权利要求1的方法获得。
7.如权利要求6所述的肿瘤检测标志物,其特征在于,它含有hsa-miR-9-5p、hsa-miR-210-3p、hsa-miR-7-5p、hsa-miR4521、hsa-miR-7974或者5’-tiRNAHisGUG中的一种或者几种,或者这些RNA相对应的DNA。
8.如权利要求6所述的肿瘤检测标志物,其特征在于,
hsa-miR-9-5p的成熟核苷酸序列如SEQIDNO1所示;
hsa-miR-210-3p的成熟核苷酸序列如SEQIDNO2所示;
hsa-miR-7-5p的成熟核苷酸序列如SEQIDNO3所示;
hsa-miR4521的成熟...
【专利技术属性】
技术研发人员:蔡启良,陈小亭,莫小辉,都树娟,朱彩霞,王玉燕,
申请(专利权)人:复旦大学,
类型:发明
国别省市:上海;31
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